Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VHL2

Protein Details
Accession A0A1Y1VHL2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
130-152YKIYTKVIKKEKRKKTDPWTPDKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
138-144KKEKRKK
Subcellular Location(s) mito_nucl 13.333, nucl 13, mito 12.5, cyto_nucl 7.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR026502  SLBP1/SLBP2  
IPR029344  SLBP_RNA_bind  
IPR038294  SLBP_RNA_bind_sf  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF15247  SLBP_RNA_bind  
Amino Acid Sequences MYKNKERKINYPHQKTVVTSTIVRTQNFNNSELLRVNHSIIDSKSSRSNSNNSIHVINHRANNNIQQILNSNSINHSHNNSGNNQNLNRNNILKSKNSKEIKQGTQPSSEERRLEQRQKQIEYGKNTIGYKIYTKVIKKEKRKKTDPWTPDKYTKCSKRCWDGMVRSWRRQLHNWDPVSDDTMKMNIDQTNDTLTMTTFNTNDNSITNNINITTTTINSNNNINSNNDNDNTNTSNATTIKTIIP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.66
3 0.62
4 0.56
5 0.49
6 0.4
7 0.37
8 0.4
9 0.41
10 0.4
11 0.36
12 0.34
13 0.4
14 0.41
15 0.38
16 0.34
17 0.3
18 0.33
19 0.32
20 0.31
21 0.26
22 0.25
23 0.25
24 0.22
25 0.22
26 0.23
27 0.2
28 0.25
29 0.22
30 0.23
31 0.28
32 0.29
33 0.33
34 0.33
35 0.38
36 0.39
37 0.43
38 0.44
39 0.4
40 0.39
41 0.36
42 0.36
43 0.36
44 0.32
45 0.32
46 0.31
47 0.31
48 0.31
49 0.36
50 0.36
51 0.34
52 0.3
53 0.25
54 0.27
55 0.27
56 0.29
57 0.23
58 0.19
59 0.17
60 0.2
61 0.21
62 0.2
63 0.19
64 0.19
65 0.23
66 0.25
67 0.27
68 0.3
69 0.33
70 0.35
71 0.34
72 0.38
73 0.38
74 0.39
75 0.38
76 0.35
77 0.33
78 0.35
79 0.35
80 0.34
81 0.38
82 0.39
83 0.45
84 0.47
85 0.46
86 0.49
87 0.54
88 0.52
89 0.54
90 0.56
91 0.49
92 0.49
93 0.48
94 0.45
95 0.43
96 0.42
97 0.34
98 0.29
99 0.35
100 0.37
101 0.45
102 0.45
103 0.47
104 0.5
105 0.51
106 0.54
107 0.52
108 0.51
109 0.48
110 0.45
111 0.39
112 0.35
113 0.33
114 0.3
115 0.24
116 0.19
117 0.16
118 0.15
119 0.17
120 0.18
121 0.19
122 0.26
123 0.35
124 0.43
125 0.52
126 0.6
127 0.68
128 0.73
129 0.79
130 0.81
131 0.81
132 0.83
133 0.8
134 0.79
135 0.77
136 0.73
137 0.74
138 0.69
139 0.65
140 0.64
141 0.65
142 0.6
143 0.6
144 0.61
145 0.61
146 0.6
147 0.6
148 0.59
149 0.56
150 0.61
151 0.64
152 0.64
153 0.6
154 0.63
155 0.63
156 0.59
157 0.59
158 0.59
159 0.58
160 0.6
161 0.58
162 0.52
163 0.49
164 0.46
165 0.43
166 0.35
167 0.26
168 0.17
169 0.17
170 0.16
171 0.14
172 0.16
173 0.14
174 0.15
175 0.15
176 0.15
177 0.17
178 0.17
179 0.16
180 0.14
181 0.12
182 0.12
183 0.12
184 0.13
185 0.11
186 0.12
187 0.14
188 0.14
189 0.15
190 0.14
191 0.15
192 0.15
193 0.17
194 0.16
195 0.15
196 0.15
197 0.14
198 0.14
199 0.14
200 0.13
201 0.13
202 0.16
203 0.18
204 0.2
205 0.21
206 0.25
207 0.26
208 0.28
209 0.28
210 0.27
211 0.28
212 0.3
213 0.33
214 0.3
215 0.29
216 0.27
217 0.3
218 0.3
219 0.28
220 0.25
221 0.21
222 0.24
223 0.23
224 0.24
225 0.2