Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VDM2

Protein Details
Accession A0A1Y1VDM2    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
167-211VKEIAKTDRKSKKSKKEGHDKKKTSKKHHRHHRHHHKKDKESESGBasic
237-269YDRDRRNDRRSRSRSRSRERGRDKYRNERRDRDBasic
281-301SDYHRRRSPSRSSSRNRRSNEHydrophilic
303-360SDYYRKRRSSSRSSSRNRDRSRSRYENKERTTDHLSRKRTRSRSNSRSKTKNDDKYKYHydrophilic
385-406KKKEEEEKKKKMLEKQKKLEEMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
163-206NPLRVKEIAKTDRKSKKSKKEGHDKKKTSKKHHRHHRHHHKKDK
241-277RRNDRRSRSRSRSRERGRDKYRNERRDRDSYSRNKRS
284-298HRRRSPSRSSSRNRR
307-351RKRRSSSRSSSRNRDRSRSRYENKERTTDHLSRKRTRSRSNSRSK
385-402KKKEEEEKKKKMLEKQKK
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019339  CIR_N_dom  
IPR022209  CWC25  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF10197  Cir_N  
PF12542  CWC25  
Amino Acid Sequences MGGGDLNLKKSWHPATIHNQEKVWLAERRAEEEKKKMEQLLKEKKEEQEMQELLALQAAAGTGKKRKIDRGLDWMYTAGTNNQNELNEDREAYLLGTKKIDKLLDSKSNNDELSANGGVFGKKNAMYGLSANTYRDTQNKIRDDPLLMIKKREQEALKRIMANPLRVKEIAKTDRKSKKSKKEGHDKKKTSKKHHRHHRHHHKKDKESESGTDSDNSSESENEKNTSVKKINETQIYDRDRRNDRRSRSRSRSRERGRDKYRNERRDRDSYSRNKRSNETSDYHRRRSPSRSSSRNRRSNETSDYYRKRRSSSRSSSRNRDRSRSRYENKERTTDHLSRKRTRSRSNSRSKTKNDDKYKYERNSSSDRHTTNSNNNKKIDEEEIKKKEEEEKKKKMLEKQKKLEEMMQNAKDWEAERKQRVETNKIRDQNIYEKEEEERMLANKKREAMGFSGKNTTGIDFIKDLQKATFLSTNSSAADMVKRKRTFVQREGEIYDKH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.48
3 0.57
4 0.64
5 0.6
6 0.57
7 0.52
8 0.52
9 0.47
10 0.43
11 0.38
12 0.32
13 0.36
14 0.37
15 0.42
16 0.46
17 0.5
18 0.5
19 0.54
20 0.59
21 0.58
22 0.61
23 0.61
24 0.6
25 0.61
26 0.66
27 0.68
28 0.68
29 0.68
30 0.69
31 0.67
32 0.69
33 0.66
34 0.59
35 0.57
36 0.5
37 0.45
38 0.42
39 0.38
40 0.29
41 0.24
42 0.2
43 0.1
44 0.09
45 0.08
46 0.06
47 0.07
48 0.11
49 0.15
50 0.2
51 0.26
52 0.3
53 0.38
54 0.47
55 0.55
56 0.58
57 0.62
58 0.64
59 0.59
60 0.57
61 0.49
62 0.4
63 0.32
64 0.26
65 0.21
66 0.21
67 0.2
68 0.21
69 0.23
70 0.23
71 0.24
72 0.25
73 0.24
74 0.19
75 0.19
76 0.18
77 0.16
78 0.15
79 0.14
80 0.16
81 0.15
82 0.16
83 0.18
84 0.19
85 0.21
86 0.24
87 0.25
88 0.22
89 0.25
90 0.32
91 0.38
92 0.4
93 0.42
94 0.42
95 0.46
96 0.43
97 0.39
98 0.32
99 0.23
100 0.25
101 0.21
102 0.17
103 0.13
104 0.14
105 0.14
106 0.14
107 0.14
108 0.11
109 0.11
110 0.12
111 0.12
112 0.12
113 0.12
114 0.13
115 0.15
116 0.16
117 0.16
118 0.16
119 0.17
120 0.18
121 0.19
122 0.21
123 0.25
124 0.27
125 0.36
126 0.4
127 0.42
128 0.43
129 0.43
130 0.41
131 0.38
132 0.4
133 0.4
134 0.36
135 0.37
136 0.38
137 0.42
138 0.41
139 0.44
140 0.39
141 0.38
142 0.45
143 0.48
144 0.48
145 0.45
146 0.44
147 0.47
148 0.46
149 0.44
150 0.42
151 0.37
152 0.36
153 0.34
154 0.35
155 0.3
156 0.36
157 0.38
158 0.4
159 0.42
160 0.49
161 0.57
162 0.63
163 0.7
164 0.71
165 0.74
166 0.77
167 0.83
168 0.83
169 0.85
170 0.9
171 0.9
172 0.91
173 0.88
174 0.87
175 0.87
176 0.87
177 0.86
178 0.86
179 0.86
180 0.86
181 0.89
182 0.91
183 0.92
184 0.94
185 0.95
186 0.95
187 0.95
188 0.95
189 0.93
190 0.91
191 0.9
192 0.85
193 0.8
194 0.71
195 0.63
196 0.56
197 0.48
198 0.4
199 0.31
200 0.25
201 0.18
202 0.16
203 0.14
204 0.11
205 0.1
206 0.1
207 0.12
208 0.12
209 0.13
210 0.13
211 0.15
212 0.16
213 0.21
214 0.23
215 0.22
216 0.25
217 0.3
218 0.35
219 0.37
220 0.39
221 0.37
222 0.41
223 0.44
224 0.44
225 0.4
226 0.42
227 0.45
228 0.5
229 0.55
230 0.55
231 0.58
232 0.66
233 0.72
234 0.76
235 0.77
236 0.8
237 0.81
238 0.82
239 0.85
240 0.83
241 0.85
242 0.83
243 0.84
244 0.83
245 0.82
246 0.8
247 0.81
248 0.83
249 0.82
250 0.81
251 0.78
252 0.75
253 0.74
254 0.74
255 0.7
256 0.69
257 0.69
258 0.73
259 0.74
260 0.73
261 0.67
262 0.64
263 0.63
264 0.6
265 0.56
266 0.48
267 0.47
268 0.53
269 0.56
270 0.57
271 0.53
272 0.5
273 0.49
274 0.52
275 0.54
276 0.54
277 0.57
278 0.62
279 0.69
280 0.77
281 0.83
282 0.84
283 0.78
284 0.75
285 0.72
286 0.67
287 0.65
288 0.6
289 0.56
290 0.57
291 0.61
292 0.6
293 0.62
294 0.59
295 0.56
296 0.58
297 0.59
298 0.6
299 0.63
300 0.67
301 0.7
302 0.75
303 0.82
304 0.84
305 0.87
306 0.81
307 0.8
308 0.78
309 0.76
310 0.79
311 0.79
312 0.74
313 0.75
314 0.8
315 0.81
316 0.76
317 0.75
318 0.67
319 0.62
320 0.63
321 0.6
322 0.6
323 0.58
324 0.62
325 0.63
326 0.7
327 0.75
328 0.75
329 0.77
330 0.78
331 0.81
332 0.83
333 0.86
334 0.88
335 0.87
336 0.88
337 0.84
338 0.84
339 0.83
340 0.82
341 0.81
342 0.78
343 0.75
344 0.75
345 0.79
346 0.74
347 0.72
348 0.66
349 0.61
350 0.61
351 0.59
352 0.58
353 0.56
354 0.52
355 0.46
356 0.47
357 0.47
358 0.49
359 0.56
360 0.57
361 0.56
362 0.56
363 0.55
364 0.52
365 0.5
366 0.47
367 0.45
368 0.43
369 0.47
370 0.5
371 0.52
372 0.51
373 0.49
374 0.51
375 0.53
376 0.57
377 0.57
378 0.62
379 0.67
380 0.74
381 0.78
382 0.78
383 0.8
384 0.8
385 0.8
386 0.8
387 0.81
388 0.8
389 0.76
390 0.75
391 0.7
392 0.67
393 0.66
394 0.58
395 0.5
396 0.45
397 0.42
398 0.36
399 0.3
400 0.3
401 0.29
402 0.35
403 0.4
404 0.44
405 0.47
406 0.51
407 0.56
408 0.59
409 0.59
410 0.6
411 0.63
412 0.65
413 0.64
414 0.62
415 0.6
416 0.6
417 0.58
418 0.54
419 0.46
420 0.41
421 0.41
422 0.41
423 0.36
424 0.28
425 0.23
426 0.22
427 0.29
428 0.33
429 0.36
430 0.37
431 0.4
432 0.42
433 0.41
434 0.41
435 0.39
436 0.44
437 0.43
438 0.41
439 0.44
440 0.41
441 0.4
442 0.38
443 0.32
444 0.26
445 0.22
446 0.22
447 0.17
448 0.2
449 0.25
450 0.25
451 0.25
452 0.22
453 0.24
454 0.22
455 0.25
456 0.28
457 0.22
458 0.26
459 0.28
460 0.29
461 0.27
462 0.27
463 0.22
464 0.19
465 0.26
466 0.28
467 0.33
468 0.41
469 0.42
470 0.45
471 0.53
472 0.62
473 0.64
474 0.65
475 0.68
476 0.65
477 0.69
478 0.7