FuNGI

A0A1Y1VCN6

Protein Details

Accession

A0A1Y1VCN6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
156-179	INDNKDKEKKFEKRPSNISRKGNV	Hydrophilic
587-606	IDLCRPTSNRYKNNFFKPVR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
168-168	K

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto_nucl 11.5, cyto 4, mito 2, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR030390 MeTrfase_TrmA_AS IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR029063 SAM-dependent_MTases_sf IPR045850 TRM2_met IPR010280 U5_MeTrfase_fam
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0008173 F:RNA methyltransferase activity GO:0006396 P:RNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1 PF05958 tRNA_U5-meth_tr
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM PS51687 SAM_MT_RNA_M5U PS01230 TRMA_1
CDD	cd02440 AdoMet_MTases

Amino Acid Sequences

MEETNKRILDNSSPEVENNDAKKVKIDVESSVENSSNNEVSMTNVEESSSVEASNTEVTEASNTVETTIEETDNNEEDKEQQTEFKIKIEKLPQYINIPDLRKIFQKYELRFWKCKTNLKWDFAFASFKSEEERQDAINKLNGLKIKTSNIVVIPINDNKDKEKKFEKRPSNISRKGNVKEPEPEDTRTPNEKLMDQVTPFWRFEYKKQIFKKARINKKVLSAMVRTFNQKGRYMEDKQKSQLGWVKEASDANRGLICPLDEVVKSPVLTHYRNKCEFTIGHDFEGQRTIGFLLGLFREGVTVVLGIDECVHVPEKAKAVVKHFQEYIRKSDLDAFSRKGHKGFWRLLTTRFYKTGEDMIIIQVHPQDLSRERIEQEKKNLVTFFTDLMEKIPDLHISSLLFQESDEVSNGATEKAEMEVLMGSKYAHENLLGINFRISPNAFFQVNTDATELLYTTIRDWCIDSVGKDKKIVLLDLCCGTGTIGICMAQYFKRIVGIELCEQAVVDARYNAETNNIKNVEYICAKIEDAMKGVFNKIGRDEEVVAVLDPPRTGVHGSVIQAIRECAGLKHLIYVSCDANAAIQNFIDLCRPTSNRYKNNFFKPVRARPFDLFPQTRHCELVIDFKRD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.37
2	0.38
3	0.39
4	0.38
5	0.33
6	0.36
7	0.33
8	0.33
9	0.36
10	0.35
11	0.37
12	0.35
13	0.35
14	0.3
15	0.34
16	0.37
17	0.36
18	0.36
19	0.32
20	0.26
21	0.26
22	0.26
23	0.21
24	0.18
25	0.16
26	0.14
27	0.15
28	0.18
29	0.19
30	0.16
31	0.15
32	0.15
33	0.14
34	0.16
35	0.17
36	0.14
37	0.12
38	0.11
39	0.11
40	0.12
41	0.14
42	0.13
43	0.1
44	0.09
45	0.1
46	0.11
47	0.12
48	0.12
49	0.11
50	0.11
51	0.11
52	0.12
53	0.11
54	0.13
55	0.14
56	0.13
57	0.12
58	0.14
59	0.17
60	0.18
61	0.19
62	0.16
63	0.15
64	0.16
65	0.2
66	0.21
67	0.18
68	0.19
69	0.23
70	0.28
71	0.28
72	0.32
73	0.34
74	0.33
75	0.4
76	0.45
77	0.47
78	0.46
79	0.5
80	0.48
81	0.46
82	0.47
83	0.43
84	0.42
85	0.38
86	0.38
87	0.36
88	0.35
89	0.36
90	0.38
91	0.37
92	0.4
93	0.46
94	0.46
95	0.53
96	0.61
97	0.63
98	0.65
99	0.65
100	0.66
101	0.64
102	0.69
103	0.65
104	0.66
105	0.67
106	0.67
107	0.66
108	0.59
109	0.55
110	0.47
111	0.46
112	0.34
113	0.32
114	0.27
115	0.25
116	0.26
117	0.25
118	0.25
119	0.25
120	0.27
121	0.22
122	0.27
123	0.29
124	0.27
125	0.28
126	0.28
127	0.24
128	0.26
129	0.27
130	0.24
131	0.26
132	0.26
133	0.26
134	0.27
135	0.27
136	0.26
137	0.23
138	0.25
139	0.21
140	0.21
141	0.21
142	0.22
143	0.25
144	0.25
145	0.25
146	0.27
147	0.36
148	0.36
149	0.38
150	0.45
151	0.51
152	0.6
153	0.69
154	0.73
155	0.73
156	0.82
157	0.86
158	0.86
159	0.86
160	0.82
161	0.78
162	0.76
163	0.7
164	0.69
165	0.61
166	0.54
167	0.53
168	0.49
169	0.49
170	0.45
171	0.44
172	0.39
173	0.4
174	0.41
175	0.38
176	0.37
177	0.34
178	0.32
179	0.3
180	0.3
181	0.29
182	0.26
183	0.22
184	0.25
185	0.26
186	0.27
187	0.27
188	0.25
189	0.28
190	0.27
191	0.31
192	0.37
193	0.39
194	0.45
195	0.5
196	0.59
197	0.61
198	0.66
199	0.73
200	0.71
201	0.76
202	0.76
203	0.77
204	0.69
205	0.7
206	0.67
207	0.59
208	0.53
209	0.45
210	0.39
211	0.38
212	0.36
213	0.32
214	0.3
215	0.32
216	0.32
217	0.34
218	0.32
219	0.33
220	0.38
221	0.4
222	0.47
223	0.49
224	0.49
225	0.46
226	0.49
227	0.43
228	0.42
229	0.41
230	0.34
231	0.31
232	0.28
233	0.27
234	0.25
235	0.27
236	0.23
237	0.22
238	0.2
239	0.17
240	0.17
241	0.15
242	0.13
243	0.12
244	0.11
245	0.07
246	0.07
247	0.08
248	0.07
249	0.09
250	0.11
251	0.11
252	0.11
253	0.11
254	0.15
255	0.17
256	0.2
257	0.26
258	0.32
259	0.39
260	0.42
261	0.44
262	0.4
263	0.39
264	0.37
265	0.36
266	0.38
267	0.32
268	0.3
269	0.3
270	0.29
271	0.26
272	0.28
273	0.21
274	0.11
275	0.1
276	0.09
277	0.06
278	0.06
279	0.06
280	0.05
281	0.05
282	0.06
283	0.05
284	0.05
285	0.05
286	0.05
287	0.05
288	0.04
289	0.04
290	0.03
291	0.03
292	0.03
293	0.03
294	0.03
295	0.03
296	0.03
297	0.04
298	0.05
299	0.05
300	0.06
301	0.08
302	0.09
303	0.12
304	0.16
305	0.17
306	0.21
307	0.27
308	0.27
309	0.28
310	0.28
311	0.3
312	0.33
313	0.33
314	0.34
315	0.31
316	0.29
317	0.27
318	0.32
319	0.31
320	0.28
321	0.29
322	0.27
323	0.28
324	0.32
325	0.33
326	0.27
327	0.28
328	0.3
329	0.33
330	0.35
331	0.37
332	0.4
333	0.4
334	0.43
335	0.45
336	0.42
337	0.39
338	0.36
339	0.32
340	0.25
341	0.25
342	0.25
343	0.2
344	0.17
345	0.14
346	0.13
347	0.13
348	0.12
349	0.11
350	0.09
351	0.08
352	0.08
353	0.07
354	0.09
355	0.1
356	0.15
357	0.15
358	0.17
359	0.18
360	0.26
361	0.32
362	0.34
363	0.38
364	0.42
365	0.41
366	0.42
367	0.42
368	0.34
369	0.31
370	0.27
371	0.21
372	0.15
373	0.14
374	0.11
375	0.12
376	0.12
377	0.09
378	0.09
379	0.09
380	0.09
381	0.09
382	0.1
383	0.1
384	0.09
385	0.11
386	0.1
387	0.1
388	0.09
389	0.07
390	0.09
391	0.08
392	0.09
393	0.08
394	0.08
395	0.07
396	0.08
397	0.09
398	0.07
399	0.06
400	0.05
401	0.05
402	0.06
403	0.06
404	0.05
405	0.05
406	0.06
407	0.06
408	0.06
409	0.06
410	0.05
411	0.06
412	0.08
413	0.08
414	0.07
415	0.07
416	0.07
417	0.08
418	0.13
419	0.13
420	0.12
421	0.12
422	0.13
423	0.13
424	0.15
425	0.15
426	0.11
427	0.14
428	0.17
429	0.17
430	0.15
431	0.17
432	0.2
433	0.2
434	0.2
435	0.17
436	0.14
437	0.14
438	0.14
439	0.12
440	0.08
441	0.08
442	0.07
443	0.08
444	0.1
445	0.11
446	0.11
447	0.13
448	0.12
449	0.14
450	0.16
451	0.16
452	0.22
453	0.28
454	0.29
455	0.29
456	0.29
457	0.3
458	0.3
459	0.31
460	0.25
461	0.2
462	0.21
463	0.21
464	0.21
465	0.17
466	0.15
467	0.13
468	0.13
469	0.11
470	0.08
471	0.08
472	0.08
473	0.08
474	0.08
475	0.1
476	0.09
477	0.1
478	0.11
479	0.11
480	0.14
481	0.15
482	0.16
483	0.18
484	0.21
485	0.22
486	0.23
487	0.22
488	0.18
489	0.17
490	0.16
491	0.16
492	0.13
493	0.12
494	0.11
495	0.12
496	0.14
497	0.14
498	0.14
499	0.17
500	0.2
501	0.2
502	0.28
503	0.28
504	0.27
505	0.28
506	0.29
507	0.28
508	0.26
509	0.26
510	0.19
511	0.19
512	0.19
513	0.2
514	0.22
515	0.18
516	0.18
517	0.18
518	0.18
519	0.18
520	0.19
521	0.19
522	0.18
523	0.19
524	0.2
525	0.22
526	0.22
527	0.24
528	0.25
529	0.23
530	0.23
531	0.21
532	0.18
533	0.16
534	0.16
535	0.13
536	0.11
537	0.11
538	0.1
539	0.11
540	0.12
541	0.12
542	0.15
543	0.18
544	0.19
545	0.26
546	0.26
547	0.25
548	0.25
549	0.25
550	0.21
551	0.18
552	0.18
553	0.1
554	0.13
555	0.15
556	0.14
557	0.18
558	0.2
559	0.21
560	0.23
561	0.25
562	0.23
563	0.21
564	0.22
565	0.16
566	0.16
567	0.18
568	0.17
569	0.15
570	0.13
571	0.13
572	0.13
573	0.14
574	0.16
575	0.14
576	0.15
577	0.22
578	0.25
579	0.3
580	0.4
581	0.5
582	0.55
583	0.62
584	0.7
585	0.72
586	0.8
587	0.85
588	0.77
589	0.77
590	0.77
591	0.8
592	0.8
593	0.77
594	0.73
595	0.67
596	0.71
597	0.69
598	0.69
599	0.63
600	0.56
601	0.59
602	0.59
603	0.57
604	0.51
605	0.43
606	0.36
607	0.33
608	0.41

A0A1Y1VCN6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer