Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1Y1VF11

Protein Details
Accession A0A1Y1VF11    Localization Confidence High Confidence Score 18.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
519-548KTSLDKKAPVDNEKKKKKSSMDDLFKKTKAHydrophilic
570-593NEERIKSRERLRERERESKRSRRYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
532-536KKKKK
573-593RIKSRERLRERERESKRSRRY
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034257  Acinus_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR032552  RSB_motif  
IPR003034  SAP_dom  
IPR036361  SAP_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF16294  RSB_motif  
PF02037  SAP  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS50800  SAP  
CDD cd12432  RRM_ACINU  
Amino Acid Sequences MEYIKLKVTELKELLTKRGLTTKGLKADLIERLEKDDLTKKNSKTEDAKNPTEEISNTSSEEKIEKNITNSKKESTTGEMKPGQETPIKNNETEIPGNQKDNKDIQNKEKIVDPQSEPIENDKKSEISKEIKTKDQLIVEEIKKPIESEDNKIESENKKESDKNINKIKKDSNEEKLNKSEINKEDSKNDKDIQEQKKDIINEINSNIPKTEQIEKKDSNVSKKEEISKTTPQIQIVGTSQKENENGNANSKKRPLNTDDTSEESSKKKKTDDSDNISQIKTTAPKDTILINNFVRPLIVRSVKELVAQYGEVKSFWMDSIKSHAYVTYTSIESAEAASKGIHGIKFPEETGKILSVEYISEEESKERIKKEEEKILSVSIPGVGSKSLGSTPIRGRFDTLYASRIGIPIKTSRLNQENSKKSDLSSFSVSPSTTISPSSIARAAASQSIKIIGKNKDLESISISSSPIKEVYASLEVDRIVQSKVSSRYKRTRETSEVSFLHNSQAQDKSKNQDDANKTSLDKKAPVDNEKKKKKSSMDDLFKKTKATPIIYYKPLSEEEVKQKEMRENEERIKSRERLRERERESKRSRRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.4
3 0.39
4 0.33
5 0.39
6 0.38
7 0.37
8 0.43
9 0.46
10 0.48
11 0.48
12 0.45
13 0.4
14 0.43
15 0.44
16 0.41
17 0.37
18 0.31
19 0.34
20 0.35
21 0.33
22 0.33
23 0.34
24 0.35
25 0.39
26 0.46
27 0.44
28 0.51
29 0.55
30 0.57
31 0.57
32 0.62
33 0.65
34 0.65
35 0.69
36 0.63
37 0.61
38 0.55
39 0.5
40 0.41
41 0.35
42 0.31
43 0.26
44 0.25
45 0.26
46 0.24
47 0.22
48 0.25
49 0.21
50 0.22
51 0.26
52 0.27
53 0.3
54 0.39
55 0.44
56 0.49
57 0.51
58 0.51
59 0.48
60 0.47
61 0.45
62 0.43
63 0.45
64 0.4
65 0.45
66 0.45
67 0.43
68 0.44
69 0.41
70 0.38
71 0.35
72 0.34
73 0.34
74 0.39
75 0.4
76 0.37
77 0.38
78 0.38
79 0.38
80 0.38
81 0.34
82 0.33
83 0.34
84 0.39
85 0.42
86 0.4
87 0.4
88 0.44
89 0.49
90 0.49
91 0.52
92 0.55
93 0.6
94 0.59
95 0.55
96 0.55
97 0.52
98 0.48
99 0.47
100 0.42
101 0.38
102 0.4
103 0.41
104 0.35
105 0.37
106 0.41
107 0.35
108 0.35
109 0.3
110 0.29
111 0.29
112 0.31
113 0.3
114 0.29
115 0.36
116 0.43
117 0.45
118 0.49
119 0.51
120 0.51
121 0.5
122 0.47
123 0.4
124 0.35
125 0.39
126 0.34
127 0.36
128 0.33
129 0.29
130 0.26
131 0.25
132 0.23
133 0.24
134 0.26
135 0.26
136 0.34
137 0.36
138 0.36
139 0.37
140 0.4
141 0.35
142 0.38
143 0.38
144 0.32
145 0.34
146 0.36
147 0.41
148 0.46
149 0.5
150 0.53
151 0.58
152 0.62
153 0.61
154 0.65
155 0.67
156 0.63
157 0.65
158 0.63
159 0.62
160 0.65
161 0.66
162 0.64
163 0.61
164 0.56
165 0.5
166 0.45
167 0.44
168 0.37
169 0.4
170 0.4
171 0.37
172 0.42
173 0.47
174 0.48
175 0.45
176 0.44
177 0.39
178 0.41
179 0.49
180 0.49
181 0.5
182 0.47
183 0.45
184 0.47
185 0.46
186 0.41
187 0.37
188 0.32
189 0.27
190 0.26
191 0.3
192 0.26
193 0.26
194 0.24
195 0.19
196 0.18
197 0.18
198 0.25
199 0.25
200 0.29
201 0.36
202 0.37
203 0.4
204 0.47
205 0.47
206 0.46
207 0.47
208 0.47
209 0.43
210 0.46
211 0.51
212 0.46
213 0.47
214 0.45
215 0.45
216 0.44
217 0.47
218 0.45
219 0.37
220 0.35
221 0.31
222 0.27
223 0.23
224 0.24
225 0.18
226 0.17
227 0.17
228 0.17
229 0.19
230 0.18
231 0.18
232 0.2
233 0.2
234 0.26
235 0.32
236 0.31
237 0.33
238 0.37
239 0.39
240 0.35
241 0.39
242 0.37
243 0.39
244 0.41
245 0.42
246 0.4
247 0.4
248 0.4
249 0.36
250 0.33
251 0.27
252 0.29
253 0.28
254 0.28
255 0.26
256 0.29
257 0.33
258 0.42
259 0.48
260 0.51
261 0.54
262 0.57
263 0.57
264 0.51
265 0.46
266 0.35
267 0.28
268 0.24
269 0.18
270 0.15
271 0.15
272 0.15
273 0.16
274 0.19
275 0.21
276 0.19
277 0.22
278 0.19
279 0.19
280 0.19
281 0.18
282 0.15
283 0.11
284 0.11
285 0.13
286 0.16
287 0.14
288 0.17
289 0.19
290 0.2
291 0.21
292 0.19
293 0.15
294 0.12
295 0.12
296 0.11
297 0.09
298 0.09
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.06
303 0.06
304 0.07
305 0.06
306 0.07
307 0.13
308 0.14
309 0.14
310 0.14
311 0.14
312 0.14
313 0.14
314 0.16
315 0.12
316 0.11
317 0.1
318 0.11
319 0.1
320 0.09
321 0.09
322 0.08
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.07
328 0.08
329 0.08
330 0.07
331 0.09
332 0.11
333 0.12
334 0.12
335 0.15
336 0.13
337 0.14
338 0.15
339 0.14
340 0.13
341 0.12
342 0.12
343 0.09
344 0.08
345 0.08
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.08
350 0.08
351 0.1
352 0.13
353 0.16
354 0.16
355 0.19
356 0.23
357 0.32
358 0.36
359 0.44
360 0.43
361 0.43
362 0.43
363 0.41
364 0.35
365 0.27
366 0.21
367 0.13
368 0.11
369 0.08
370 0.07
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.07
375 0.06
376 0.09
377 0.1
378 0.14
379 0.19
380 0.27
381 0.29
382 0.28
383 0.31
384 0.29
385 0.3
386 0.3
387 0.26
388 0.2
389 0.18
390 0.19
391 0.17
392 0.17
393 0.16
394 0.12
395 0.13
396 0.14
397 0.18
398 0.2
399 0.21
400 0.27
401 0.32
402 0.35
403 0.42
404 0.49
405 0.53
406 0.55
407 0.58
408 0.52
409 0.46
410 0.49
411 0.43
412 0.37
413 0.34
414 0.3
415 0.27
416 0.28
417 0.27
418 0.22
419 0.21
420 0.18
421 0.14
422 0.14
423 0.13
424 0.13
425 0.14
426 0.16
427 0.16
428 0.14
429 0.14
430 0.14
431 0.14
432 0.17
433 0.18
434 0.15
435 0.14
436 0.17
437 0.18
438 0.19
439 0.25
440 0.24
441 0.3
442 0.34
443 0.34
444 0.37
445 0.37
446 0.35
447 0.32
448 0.3
449 0.25
450 0.22
451 0.22
452 0.18
453 0.17
454 0.18
455 0.14
456 0.13
457 0.11
458 0.11
459 0.14
460 0.15
461 0.16
462 0.15
463 0.16
464 0.16
465 0.16
466 0.17
467 0.14
468 0.12
469 0.12
470 0.12
471 0.17
472 0.26
473 0.35
474 0.4
475 0.47
476 0.57
477 0.64
478 0.73
479 0.73
480 0.73
481 0.71
482 0.71
483 0.67
484 0.66
485 0.59
486 0.54
487 0.5
488 0.42
489 0.38
490 0.36
491 0.31
492 0.27
493 0.33
494 0.33
495 0.36
496 0.4
497 0.43
498 0.47
499 0.52
500 0.5
501 0.51
502 0.54
503 0.55
504 0.54
505 0.5
506 0.44
507 0.44
508 0.47
509 0.42
510 0.4
511 0.36
512 0.41
513 0.46
514 0.54
515 0.58
516 0.64
517 0.71
518 0.77
519 0.81
520 0.79
521 0.81
522 0.8
523 0.8
524 0.8
525 0.8
526 0.8
527 0.82
528 0.84
529 0.83
530 0.75
531 0.68
532 0.59
533 0.54
534 0.5
535 0.46
536 0.45
537 0.48
538 0.54
539 0.56
540 0.57
541 0.51
542 0.48
543 0.45
544 0.42
545 0.37
546 0.37
547 0.42
548 0.47
549 0.49
550 0.48
551 0.5
552 0.52
553 0.52
554 0.52
555 0.5
556 0.51
557 0.57
558 0.65
559 0.65
560 0.64
561 0.67
562 0.65
563 0.67
564 0.69
565 0.7
566 0.7
567 0.75
568 0.8
569 0.8
570 0.84
571 0.84
572 0.84
573 0.85