Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1Y1VGC3

Protein Details
Accession A0A1Y1VGC3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-44SNNIRERGDRRNDRERRGPRDRSPNGRRIPNSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-41RGDRRNDRERRGPRDRSPNGRRI
Subcellular Location(s) plas 14, nucl 10.5, cyto_nucl 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018499  Tetraspanin/Peripherin  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF00335  Tetraspanin  
Amino Acid Sequences MDPRGVYSNYNASNNIRERGDRRNDRERRGPRDRSPNGRRIPNSPGSYRRDDPRSENYRGNRRDMDNSQMQQVHIKENSYNKQYNNNSSSLNNSSSNLIQSPFQNPYKIDSNSNKTTNINDPSKDRLETYAKLKKISPVKFYISVIIAVILTATLAIIGIIVIKNNGLTASNLRDVTVGVAQGYLFYCGFMLLAIGTGVLAFIRKWNNLLVTYCSFLFVSCLYICYFISDLANVKTNCVEVMNTRWKEDFNSSVKASIENQFSCCGYYNEDDDPVETDDCQKSQSFKRSIIGGYDDTTPYYYNASLHKRKVAEENGCAKAIESHVSSHMTMYIIIFSILLILNIVAVVVTILDIKQYAEILKELSNPFA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.44
3 0.38
4 0.39
5 0.41
6 0.49
7 0.57
8 0.58
9 0.62
10 0.68
11 0.74
12 0.77
13 0.83
14 0.83
15 0.82
16 0.82
17 0.84
18 0.82
19 0.85
20 0.85
21 0.86
22 0.85
23 0.85
24 0.83
25 0.83
26 0.76
27 0.7
28 0.7
29 0.68
30 0.64
31 0.62
32 0.62
33 0.59
34 0.63
35 0.63
36 0.62
37 0.59
38 0.58
39 0.57
40 0.6
41 0.6
42 0.58
43 0.61
44 0.62
45 0.66
46 0.66
47 0.66
48 0.62
49 0.58
50 0.61
51 0.57
52 0.56
53 0.54
54 0.51
55 0.5
56 0.46
57 0.42
58 0.39
59 0.38
60 0.36
61 0.29
62 0.29
63 0.27
64 0.34
65 0.4
66 0.42
67 0.45
68 0.41
69 0.49
70 0.53
71 0.58
72 0.54
73 0.49
74 0.44
75 0.4
76 0.43
77 0.37
78 0.35
79 0.27
80 0.24
81 0.24
82 0.23
83 0.24
84 0.19
85 0.16
86 0.15
87 0.15
88 0.18
89 0.22
90 0.23
91 0.24
92 0.23
93 0.27
94 0.33
95 0.33
96 0.36
97 0.37
98 0.43
99 0.47
100 0.49
101 0.46
102 0.4
103 0.42
104 0.41
105 0.41
106 0.38
107 0.33
108 0.34
109 0.38
110 0.39
111 0.37
112 0.3
113 0.28
114 0.29
115 0.3
116 0.36
117 0.37
118 0.36
119 0.37
120 0.37
121 0.39
122 0.43
123 0.45
124 0.41
125 0.39
126 0.42
127 0.42
128 0.42
129 0.37
130 0.29
131 0.24
132 0.19
133 0.15
134 0.1
135 0.07
136 0.06
137 0.04
138 0.03
139 0.02
140 0.02
141 0.02
142 0.02
143 0.02
144 0.02
145 0.02
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.03
150 0.03
151 0.03
152 0.03
153 0.04
154 0.04
155 0.05
156 0.07
157 0.1
158 0.12
159 0.12
160 0.12
161 0.12
162 0.12
163 0.12
164 0.11
165 0.08
166 0.06
167 0.06
168 0.05
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.04
176 0.05
177 0.04
178 0.04
179 0.02
180 0.03
181 0.02
182 0.02
183 0.02
184 0.02
185 0.02
186 0.02
187 0.02
188 0.02
189 0.06
190 0.08
191 0.08
192 0.1
193 0.11
194 0.13
195 0.14
196 0.16
197 0.17
198 0.16
199 0.17
200 0.16
201 0.16
202 0.14
203 0.12
204 0.12
205 0.08
206 0.09
207 0.08
208 0.09
209 0.08
210 0.1
211 0.1
212 0.1
213 0.1
214 0.08
215 0.09
216 0.08
217 0.09
218 0.1
219 0.16
220 0.14
221 0.15
222 0.15
223 0.15
224 0.14
225 0.13
226 0.13
227 0.08
228 0.16
229 0.25
230 0.25
231 0.27
232 0.27
233 0.27
234 0.29
235 0.31
236 0.31
237 0.25
238 0.29
239 0.28
240 0.3
241 0.3
242 0.29
243 0.27
244 0.26
245 0.27
246 0.23
247 0.24
248 0.23
249 0.23
250 0.22
251 0.22
252 0.17
253 0.16
254 0.17
255 0.18
256 0.18
257 0.2
258 0.18
259 0.17
260 0.18
261 0.17
262 0.15
263 0.13
264 0.16
265 0.16
266 0.16
267 0.17
268 0.17
269 0.2
270 0.27
271 0.36
272 0.36
273 0.37
274 0.4
275 0.41
276 0.41
277 0.39
278 0.36
279 0.28
280 0.25
281 0.25
282 0.22
283 0.2
284 0.2
285 0.17
286 0.14
287 0.14
288 0.13
289 0.13
290 0.2
291 0.28
292 0.35
293 0.38
294 0.44
295 0.43
296 0.46
297 0.52
298 0.54
299 0.51
300 0.52
301 0.56
302 0.53
303 0.52
304 0.48
305 0.4
306 0.34
307 0.29
308 0.25
309 0.18
310 0.17
311 0.19
312 0.22
313 0.22
314 0.19
315 0.19
316 0.16
317 0.15
318 0.13
319 0.12
320 0.09
321 0.09
322 0.08
323 0.06
324 0.08
325 0.07
326 0.07
327 0.06
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.03
333 0.03
334 0.03
335 0.02
336 0.03
337 0.04
338 0.04
339 0.05
340 0.05
341 0.06
342 0.07
343 0.08
344 0.09
345 0.1
346 0.12
347 0.13
348 0.15
349 0.21