Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VEE0

Protein Details
Accession A0A1Y1VEE0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
425-444NTNNKPLKPNEMKNRGRNQEHydrophilic
556-579YQTYERRIQFRQQKKRAREMDVIDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12, mito 2, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014891  DWNN_domain  
IPR033489  RBBP6  
IPR003613  Ubox_domain  
IPR025829  Zn_knuckle_CX2CX3GHX4C  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
Pfam View protein in Pfam  
PF08783  DWNN  
PF04564  U-box  
PF13696  zf-CCHC_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51282  DWNN  
PS50158  ZF_CCHC  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd16620  vRING-HC-C4C4_RBBP6  
Amino Acid Sequences MSVIYYKFKSAKDYDTVTFDGISLSVFDLKHEIMISKKLGKGTDFDLSVYNAQTGEEYTDDLATIPRNTSIIVRRVPPERPGKGNAQKYLSASGPSTHIIGRRVANTTKPAVGKSKAVAISKPNQSNGIKTSEETLEGLTEEERINAMFQKSGEHWKQLQDEMANAKSVPFRPHFTGSHPSNSTPGSKPSSSNPTPTIQKIPNPTYVCFRCRQKGHFISDCPTLGDKEFDRPKLKRTTGIPKCFLKAVDTKQASEGGVMVTQNGELVVVQPNEQEWKKMTSKVGTVFGEDIYNSVPVPDNLRCSLCEKLFKDAVSIPCCSESYCDECIRNHLLKESNSRMECPNCHQEQSPDNLVPNKTLRQAVEQYLLEFTNKKSEDKNNNSNKNETSTNPSINNKNTNNINNNKNNINQKPLKANGKNTVRPNTNNKPLKPNEMKNRGRNQEGKPKHNYYQNNNQYNMNFNNNNYKNGINMQNDYNKMIPTYMNDNNYRMFPDYNNGWNTGSWDGVPGIMMNNSNRPMMNQMINPQNMGMNMRNNNIYNQMNPEYPMTRGQKVYQTYERRIQFRQQKKRAREMDVIDITDKKAKH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.45
3 0.45
4 0.38
5 0.34
6 0.28
7 0.22
8 0.16
9 0.13
10 0.09
11 0.09
12 0.12
13 0.11
14 0.12
15 0.14
16 0.14
17 0.16
18 0.16
19 0.16
20 0.16
21 0.21
22 0.25
23 0.28
24 0.31
25 0.32
26 0.34
27 0.33
28 0.34
29 0.33
30 0.34
31 0.29
32 0.27
33 0.26
34 0.26
35 0.27
36 0.24
37 0.21
38 0.14
39 0.14
40 0.13
41 0.12
42 0.12
43 0.1
44 0.1
45 0.1
46 0.11
47 0.1
48 0.1
49 0.11
50 0.12
51 0.12
52 0.12
53 0.13
54 0.13
55 0.14
56 0.19
57 0.24
58 0.28
59 0.31
60 0.34
61 0.38
62 0.42
63 0.45
64 0.48
65 0.51
66 0.5
67 0.51
68 0.52
69 0.58
70 0.63
71 0.67
72 0.65
73 0.59
74 0.56
75 0.53
76 0.52
77 0.43
78 0.35
79 0.28
80 0.24
81 0.22
82 0.2
83 0.19
84 0.17
85 0.19
86 0.19
87 0.23
88 0.24
89 0.25
90 0.29
91 0.3
92 0.32
93 0.33
94 0.34
95 0.35
96 0.33
97 0.34
98 0.35
99 0.35
100 0.34
101 0.3
102 0.34
103 0.34
104 0.34
105 0.34
106 0.34
107 0.4
108 0.45
109 0.48
110 0.42
111 0.44
112 0.43
113 0.44
114 0.42
115 0.38
116 0.31
117 0.27
118 0.29
119 0.23
120 0.23
121 0.2
122 0.17
123 0.12
124 0.12
125 0.12
126 0.08
127 0.09
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.11
134 0.12
135 0.12
136 0.12
137 0.15
138 0.17
139 0.26
140 0.27
141 0.29
142 0.31
143 0.34
144 0.37
145 0.35
146 0.36
147 0.27
148 0.28
149 0.27
150 0.26
151 0.21
152 0.18
153 0.18
154 0.19
155 0.21
156 0.23
157 0.22
158 0.25
159 0.29
160 0.34
161 0.34
162 0.35
163 0.42
164 0.4
165 0.44
166 0.42
167 0.38
168 0.36
169 0.36
170 0.35
171 0.28
172 0.3
173 0.27
174 0.27
175 0.28
176 0.31
177 0.38
178 0.36
179 0.38
180 0.36
181 0.35
182 0.38
183 0.39
184 0.4
185 0.34
186 0.37
187 0.4
188 0.4
189 0.44
190 0.43
191 0.42
192 0.43
193 0.44
194 0.43
195 0.42
196 0.44
197 0.43
198 0.46
199 0.48
200 0.51
201 0.54
202 0.58
203 0.57
204 0.54
205 0.49
206 0.48
207 0.44
208 0.35
209 0.29
210 0.22
211 0.17
212 0.18
213 0.15
214 0.2
215 0.24
216 0.27
217 0.33
218 0.34
219 0.4
220 0.46
221 0.47
222 0.45
223 0.46
224 0.52
225 0.55
226 0.61
227 0.6
228 0.53
229 0.53
230 0.49
231 0.43
232 0.36
233 0.32
234 0.29
235 0.33
236 0.32
237 0.31
238 0.31
239 0.32
240 0.28
241 0.22
242 0.18
243 0.09
244 0.08
245 0.08
246 0.06
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.04
251 0.04
252 0.03
253 0.04
254 0.07
255 0.07
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.12
260 0.13
261 0.13
262 0.11
263 0.16
264 0.18
265 0.21
266 0.23
267 0.22
268 0.24
269 0.26
270 0.29
271 0.24
272 0.23
273 0.2
274 0.18
275 0.16
276 0.13
277 0.11
278 0.07
279 0.06
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.09
285 0.1
286 0.12
287 0.13
288 0.14
289 0.14
290 0.16
291 0.2
292 0.18
293 0.24
294 0.22
295 0.26
296 0.27
297 0.26
298 0.26
299 0.26
300 0.29
301 0.25
302 0.24
303 0.2
304 0.19
305 0.19
306 0.18
307 0.15
308 0.12
309 0.15
310 0.17
311 0.18
312 0.19
313 0.19
314 0.23
315 0.26
316 0.26
317 0.22
318 0.22
319 0.25
320 0.26
321 0.32
322 0.33
323 0.34
324 0.33
325 0.35
326 0.35
327 0.34
328 0.33
329 0.32
330 0.35
331 0.3
332 0.32
333 0.31
334 0.31
335 0.31
336 0.35
337 0.33
338 0.25
339 0.26
340 0.28
341 0.27
342 0.26
343 0.25
344 0.22
345 0.21
346 0.23
347 0.22
348 0.23
349 0.26
350 0.26
351 0.28
352 0.25
353 0.23
354 0.22
355 0.22
356 0.18
357 0.16
358 0.14
359 0.17
360 0.18
361 0.19
362 0.23
363 0.32
364 0.42
365 0.49
366 0.59
367 0.61
368 0.69
369 0.7
370 0.69
371 0.61
372 0.55
373 0.48
374 0.4
375 0.38
376 0.33
377 0.34
378 0.35
379 0.37
380 0.39
381 0.4
382 0.47
383 0.4
384 0.41
385 0.43
386 0.46
387 0.5
388 0.51
389 0.55
390 0.53
391 0.55
392 0.52
393 0.52
394 0.55
395 0.49
396 0.51
397 0.48
398 0.45
399 0.49
400 0.52
401 0.56
402 0.53
403 0.56
404 0.57
405 0.61
406 0.64
407 0.64
408 0.66
409 0.61
410 0.62
411 0.65
412 0.64
413 0.66
414 0.67
415 0.64
416 0.65
417 0.63
418 0.68
419 0.67
420 0.68
421 0.68
422 0.71
423 0.76
424 0.76
425 0.82
426 0.77
427 0.75
428 0.74
429 0.71
430 0.71
431 0.71
432 0.7
433 0.68
434 0.69
435 0.68
436 0.68
437 0.69
438 0.66
439 0.69
440 0.71
441 0.69
442 0.65
443 0.62
444 0.55
445 0.53
446 0.49
447 0.45
448 0.37
449 0.32
450 0.41
451 0.4
452 0.42
453 0.38
454 0.34
455 0.29
456 0.32
457 0.38
458 0.3
459 0.31
460 0.33
461 0.37
462 0.39
463 0.39
464 0.36
465 0.29
466 0.26
467 0.24
468 0.2
469 0.17
470 0.23
471 0.26
472 0.3
473 0.32
474 0.34
475 0.34
476 0.35
477 0.34
478 0.29
479 0.25
480 0.2
481 0.24
482 0.26
483 0.31
484 0.32
485 0.31
486 0.3
487 0.28
488 0.3
489 0.25
490 0.22
491 0.15
492 0.15
493 0.13
494 0.12
495 0.11
496 0.09
497 0.09
498 0.1
499 0.12
500 0.12
501 0.18
502 0.19
503 0.21
504 0.2
505 0.21
506 0.23
507 0.26
508 0.29
509 0.26
510 0.31
511 0.38
512 0.39
513 0.38
514 0.34
515 0.3
516 0.27
517 0.28
518 0.25
519 0.25
520 0.28
521 0.3
522 0.34
523 0.34
524 0.34
525 0.37
526 0.35
527 0.3
528 0.33
529 0.34
530 0.31
531 0.31
532 0.33
533 0.28
534 0.28
535 0.34
536 0.33
537 0.35
538 0.36
539 0.39
540 0.42
541 0.46
542 0.52
543 0.53
544 0.56
545 0.58
546 0.64
547 0.67
548 0.64
549 0.64
550 0.66
551 0.67
552 0.7
553 0.74
554 0.76
555 0.79
556 0.83
557 0.89
558 0.87
559 0.84
560 0.82
561 0.76
562 0.76
563 0.7
564 0.64
565 0.56
566 0.49
567 0.44