Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VGM5

Protein Details
Accession A0A1Y1VGM5    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
207-232DFTITNKKGNKKNTRKSVNKKPLSTDHydrophilic
585-611GNNDAPKSLRSRKPRKNSVKAKLVEKSHydrophilic
648-700SADPTPSSTKRSKRKSSNPRKVSTTANKGKSSTTNTKRRSSKNSKIDNNDTNSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
213-223KKGNKKNTRKS
593-604LRSRKPRKNSVK
657-670KRSKRKSSNPRKVS
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011993  PH-like_dom_sf  
IPR013719  RTT106/SPT16-like_middle_dom  
Pfam View protein in Pfam  
PF08512  Rtt106  
Amino Acid Sequences MDIDNLSYLQSPLKEKVQQLLNQSSLNDDQKYTINEVLDYFTKKLQQCEEKFNINILNNIDDTILVNGELIHNSKKRPFNSMVQESDDAMAIDSIPVTPISNKLSSFINLPIGKKPLFKSYLYNVNYIIHDVSFMNPRRLFNLVMTQECFIVIYPKEENNIELVIPYEAISEIICVPVPETATKKWCVSMVVDKNYQPKIIKKPPIDFTITNKKGNKKNTRKSVNKKPLSTDDTNPPPTVTATNHEIYIFKFDDNKSLNIFETNSSGVATDQDILDNFGLKKVDPAICNKKYLFDLFKKYIWPNSEKEILEPNPSIFVSKKKSMSSHTKNKTHTFHINCYYKAKEGYLFLLNEGIFFGAKKPSLYFPMNNVLSIKVTNVTSRTFNLNIRRLQYTAESQELLSKKIKLDKENSQQQQQQQQQQQEEEEQQQQQQNNTEEENYEFSMIDSVEFDAIMDYIKKHKTEWSTNRNGEFGMNTEEMENTEQQNDEADSKDEDKRSNNKKSVKGKANSNGRNDELQNIMTFVDEDESNDEDYNPDDDSDSEDSDEDSDIDLDKNQEKIDMENDKEVLKSMNEGNKNIEESDGNNDAPKSLRSRKPRKNSVKAKLVEKSEENDTPLSPMMEDKPEVGEDEEISAISSNVEEISLSSADPTPSSTKRSKRKSSNPRKVSTTANKGKSSTTNTKRRSSKNSKIDNNDTNSSSQEKSIRNTTTTTTTTTTTTTTNSSSNNDNNKKKQLTISDLFNKTANKNKISSSIQIEHEDEDEEEDEILFE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.36
3 0.43
4 0.48
5 0.49
6 0.52
7 0.55
8 0.52
9 0.48
10 0.46
11 0.42
12 0.4
13 0.4
14 0.34
15 0.28
16 0.26
17 0.29
18 0.33
19 0.32
20 0.3
21 0.26
22 0.25
23 0.25
24 0.27
25 0.26
26 0.26
27 0.24
28 0.24
29 0.3
30 0.32
31 0.37
32 0.42
33 0.49
34 0.5
35 0.58
36 0.61
37 0.6
38 0.59
39 0.57
40 0.54
41 0.45
42 0.44
43 0.36
44 0.33
45 0.26
46 0.26
47 0.22
48 0.16
49 0.16
50 0.13
51 0.11
52 0.08
53 0.08
54 0.07
55 0.08
56 0.1
57 0.11
58 0.17
59 0.2
60 0.24
61 0.32
62 0.4
63 0.41
64 0.47
65 0.5
66 0.53
67 0.6
68 0.64
69 0.6
70 0.57
71 0.57
72 0.5
73 0.45
74 0.36
75 0.25
76 0.18
77 0.14
78 0.08
79 0.07
80 0.06
81 0.05
82 0.06
83 0.06
84 0.07
85 0.08
86 0.11
87 0.16
88 0.18
89 0.18
90 0.19
91 0.22
92 0.22
93 0.23
94 0.22
95 0.26
96 0.27
97 0.28
98 0.31
99 0.34
100 0.34
101 0.37
102 0.37
103 0.37
104 0.38
105 0.38
106 0.4
107 0.41
108 0.49
109 0.47
110 0.46
111 0.38
112 0.37
113 0.36
114 0.31
115 0.26
116 0.15
117 0.15
118 0.13
119 0.14
120 0.2
121 0.22
122 0.28
123 0.3
124 0.31
125 0.32
126 0.34
127 0.33
128 0.28
129 0.35
130 0.31
131 0.31
132 0.32
133 0.3
134 0.27
135 0.25
136 0.23
137 0.13
138 0.14
139 0.12
140 0.14
141 0.16
142 0.17
143 0.2
144 0.2
145 0.21
146 0.18
147 0.18
148 0.15
149 0.12
150 0.12
151 0.09
152 0.09
153 0.09
154 0.07
155 0.06
156 0.07
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.07
165 0.09
166 0.1
167 0.14
168 0.17
169 0.22
170 0.25
171 0.25
172 0.26
173 0.26
174 0.25
175 0.25
176 0.31
177 0.35
178 0.38
179 0.4
180 0.42
181 0.47
182 0.46
183 0.46
184 0.39
185 0.38
186 0.42
187 0.49
188 0.55
189 0.54
190 0.6
191 0.61
192 0.63
193 0.61
194 0.53
195 0.51
196 0.54
197 0.52
198 0.52
199 0.52
200 0.56
201 0.57
202 0.65
203 0.69
204 0.69
205 0.75
206 0.79
207 0.84
208 0.87
209 0.9
210 0.91
211 0.9
212 0.87
213 0.8
214 0.76
215 0.74
216 0.71
217 0.65
218 0.58
219 0.56
220 0.55
221 0.54
222 0.48
223 0.4
224 0.33
225 0.3
226 0.28
227 0.21
228 0.18
229 0.2
230 0.2
231 0.2
232 0.2
233 0.19
234 0.17
235 0.21
236 0.18
237 0.14
238 0.17
239 0.17
240 0.24
241 0.26
242 0.27
243 0.24
244 0.24
245 0.24
246 0.21
247 0.22
248 0.15
249 0.14
250 0.13
251 0.11
252 0.1
253 0.1
254 0.09
255 0.08
256 0.08
257 0.07
258 0.06
259 0.07
260 0.07
261 0.08
262 0.08
263 0.09
264 0.09
265 0.1
266 0.1
267 0.1
268 0.11
269 0.14
270 0.17
271 0.17
272 0.25
273 0.33
274 0.35
275 0.38
276 0.37
277 0.36
278 0.34
279 0.36
280 0.34
281 0.3
282 0.36
283 0.35
284 0.37
285 0.38
286 0.38
287 0.38
288 0.36
289 0.35
290 0.3
291 0.31
292 0.36
293 0.32
294 0.32
295 0.34
296 0.31
297 0.3
298 0.28
299 0.24
300 0.2
301 0.19
302 0.19
303 0.14
304 0.18
305 0.2
306 0.25
307 0.28
308 0.28
309 0.31
310 0.36
311 0.46
312 0.49
313 0.54
314 0.58
315 0.62
316 0.64
317 0.69
318 0.66
319 0.61
320 0.6
321 0.54
322 0.51
323 0.53
324 0.52
325 0.47
326 0.47
327 0.42
328 0.36
329 0.32
330 0.27
331 0.19
332 0.17
333 0.18
334 0.18
335 0.17
336 0.15
337 0.16
338 0.15
339 0.13
340 0.12
341 0.09
342 0.06
343 0.06
344 0.07
345 0.06
346 0.07
347 0.07
348 0.09
349 0.1
350 0.15
351 0.18
352 0.18
353 0.19
354 0.27
355 0.27
356 0.26
357 0.25
358 0.2
359 0.18
360 0.17
361 0.14
362 0.08
363 0.08
364 0.09
365 0.1
366 0.1
367 0.11
368 0.12
369 0.15
370 0.16
371 0.19
372 0.25
373 0.29
374 0.3
375 0.32
376 0.32
377 0.29
378 0.28
379 0.26
380 0.23
381 0.19
382 0.18
383 0.16
384 0.14
385 0.19
386 0.18
387 0.18
388 0.17
389 0.16
390 0.17
391 0.23
392 0.26
393 0.25
394 0.3
395 0.37
396 0.44
397 0.52
398 0.54
399 0.53
400 0.54
401 0.53
402 0.57
403 0.53
404 0.52
405 0.47
406 0.49
407 0.46
408 0.43
409 0.4
410 0.34
411 0.31
412 0.26
413 0.24
414 0.21
415 0.22
416 0.25
417 0.25
418 0.24
419 0.27
420 0.26
421 0.24
422 0.23
423 0.21
424 0.18
425 0.18
426 0.18
427 0.13
428 0.11
429 0.1
430 0.09
431 0.09
432 0.09
433 0.08
434 0.06
435 0.06
436 0.05
437 0.05
438 0.05
439 0.04
440 0.04
441 0.04
442 0.04
443 0.05
444 0.09
445 0.12
446 0.13
447 0.13
448 0.19
449 0.25
450 0.35
451 0.44
452 0.49
453 0.56
454 0.6
455 0.6
456 0.55
457 0.49
458 0.39
459 0.3
460 0.22
461 0.17
462 0.14
463 0.13
464 0.12
465 0.12
466 0.12
467 0.14
468 0.13
469 0.09
470 0.1
471 0.1
472 0.09
473 0.1
474 0.1
475 0.1
476 0.1
477 0.1
478 0.11
479 0.14
480 0.18
481 0.19
482 0.2
483 0.25
484 0.34
485 0.42
486 0.5
487 0.55
488 0.58
489 0.66
490 0.72
491 0.76
492 0.76
493 0.73
494 0.71
495 0.73
496 0.75
497 0.72
498 0.69
499 0.63
500 0.55
501 0.53
502 0.45
503 0.39
504 0.3
505 0.25
506 0.19
507 0.16
508 0.14
509 0.1
510 0.1
511 0.07
512 0.07
513 0.06
514 0.07
515 0.09
516 0.1
517 0.11
518 0.11
519 0.11
520 0.09
521 0.11
522 0.11
523 0.09
524 0.08
525 0.08
526 0.08
527 0.12
528 0.13
529 0.13
530 0.12
531 0.12
532 0.12
533 0.12
534 0.12
535 0.08
536 0.07
537 0.07
538 0.07
539 0.07
540 0.08
541 0.1
542 0.11
543 0.13
544 0.12
545 0.14
546 0.14
547 0.15
548 0.21
549 0.24
550 0.24
551 0.25
552 0.26
553 0.24
554 0.24
555 0.23
556 0.18
557 0.12
558 0.13
559 0.16
560 0.22
561 0.24
562 0.26
563 0.29
564 0.3
565 0.31
566 0.28
567 0.24
568 0.18
569 0.17
570 0.21
571 0.2
572 0.18
573 0.18
574 0.18
575 0.17
576 0.18
577 0.19
578 0.21
579 0.27
580 0.36
581 0.45
582 0.56
583 0.66
584 0.75
585 0.84
586 0.87
587 0.89
588 0.92
589 0.91
590 0.9
591 0.84
592 0.81
593 0.76
594 0.69
595 0.63
596 0.55
597 0.48
598 0.44
599 0.41
600 0.36
601 0.3
602 0.26
603 0.24
604 0.22
605 0.19
606 0.14
607 0.14
608 0.14
609 0.16
610 0.16
611 0.15
612 0.16
613 0.16
614 0.17
615 0.16
616 0.14
617 0.12
618 0.12
619 0.12
620 0.1
621 0.1
622 0.09
623 0.07
624 0.07
625 0.06
626 0.05
627 0.05
628 0.05
629 0.05
630 0.05
631 0.08
632 0.08
633 0.08
634 0.09
635 0.11
636 0.11
637 0.11
638 0.14
639 0.17
640 0.2
641 0.26
642 0.33
643 0.41
644 0.51
645 0.62
646 0.69
647 0.74
648 0.82
649 0.88
650 0.91
651 0.93
652 0.92
653 0.88
654 0.84
655 0.77
656 0.76
657 0.75
658 0.74
659 0.72
660 0.7
661 0.67
662 0.62
663 0.62
664 0.58
665 0.57
666 0.57
667 0.57
668 0.6
669 0.63
670 0.72
671 0.77
672 0.79
673 0.81
674 0.81
675 0.81
676 0.81
677 0.86
678 0.86
679 0.86
680 0.86
681 0.83
682 0.79
683 0.73
684 0.65
685 0.56
686 0.49
687 0.44
688 0.36
689 0.32
690 0.33
691 0.32
692 0.34
693 0.41
694 0.42
695 0.4
696 0.42
697 0.41
698 0.41
699 0.39
700 0.38
701 0.32
702 0.3
703 0.29
704 0.28
705 0.26
706 0.21
707 0.22
708 0.21
709 0.21
710 0.22
711 0.24
712 0.25
713 0.3
714 0.37
715 0.45
716 0.52
717 0.59
718 0.64
719 0.71
720 0.71
721 0.69
722 0.68
723 0.65
724 0.65
725 0.6
726 0.62
727 0.62
728 0.61
729 0.58
730 0.54
731 0.51
732 0.46
733 0.51
734 0.49
735 0.44
736 0.44
737 0.46
738 0.5
739 0.51
740 0.52
741 0.51
742 0.5
743 0.49
744 0.51
745 0.49
746 0.42
747 0.39
748 0.34
749 0.26
750 0.22
751 0.19
752 0.15
753 0.14