Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1V4I0

Protein Details
Accession A0A1Y1V4I0    Localization Confidence High Confidence Score 20.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
115-141NEAKRIEREKEEKRQRNKLQVEKELERBasic
370-392IDAMLDKKRKKKEKKVEEEENIPBasic
781-800TNNNNNKRKFDKHIEPNSTKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
118-143KRIEREKEEKRQRNKLQVEKELERKK
376-384KKRKKKEKK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 15, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0042134  F:rRNA primary transcript binding  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0034462  P:small-subunit processome assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12565  RRM1_MRD1  
cd12320  RRM6_RBM19_RRM5_MRD1  
Amino Acid Sequences MFYCQEIFFNNIHLNNLPKHLTAERFREHFVAKGEITDSKLAFTRDGVFRRFGFIGYKSEKEAKKAVKYFDNTYIDTSKIKVEIAKTIGDATLVRPWSKYSQGSSAYMKKINEENEAKRIEREKEEKRQRNKLQVEKELERKKKFLSEIYGDETDEKLQEYLNVMKPRSHAKTWTNDDGSKQDDATIRGKPKIQAIAVPNKKPGGEGLLVTKTHLTFDDSDDEYEDIPKKTEESNKEEKNESNDINDNNEMDIEDNPEIEKKSTISHMDFLRSKMRKKEEEEEEKDDDDDENDSSEESSSNEDSDSSDDSSDNDDSDDSDEDESEDDSNDDEDESEDDKKEKEAGNDDNEIIPDKKVDLFDSDDEEEKDIDAMLDKKRKKKEKKVEEEENIPPAQLIADTGRLFVKNLSFACTEDDLRNLFEKFGPLSEIHIPITKETKQSRGYAFILYLLPEHAINAYMSLDGKIFQGRILDIRPGKEKPMKKEEIDENTPYKKQQLLKKKASAGSDFNWNSLFMNMDSIAQSMAQKLDVQKSDILDKEADNMAVRLALAETHIINETKKYLEDEGVSLNAFEQGQKKRSNTVILVKNIPANTEESELYNLWSKFGSLGRIVLPPAKTIALVEFLEPNEAKNAFRNLAFTKFKHLPLYLEWAPIGTFKDKFDPSKAKKIPLKVLKEDTHDVNAVNNDDISSDNVTLFVKNLNFDTTTEGLTKAFKHLKGMRTARVSMKPNKKTGKPLSMGFGFVEFDTKENAMSALKSMQGFALDGHALSLKFSHGASSTNNNNNKRKFDKHIEPNSTKLIVRNIPFEATKKDLRELFSTYGQIKSLRLPKKFDGSHRGFGFIDFLTKQEAKNVFENLTNTHLYGRHLVLEWAEDDDSIEAIREKTDKSFSKNILFYIYNIIYIYT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.29
3 0.33
4 0.32
5 0.27
6 0.31
7 0.34
8 0.39
9 0.41
10 0.47
11 0.49
12 0.49
13 0.51
14 0.51
15 0.47
16 0.44
17 0.41
18 0.39
19 0.32
20 0.31
21 0.3
22 0.28
23 0.3
24 0.3
25 0.26
26 0.22
27 0.25
28 0.24
29 0.22
30 0.22
31 0.26
32 0.29
33 0.34
34 0.35
35 0.36
36 0.35
37 0.4
38 0.39
39 0.33
40 0.3
41 0.28
42 0.34
43 0.35
44 0.37
45 0.36
46 0.44
47 0.45
48 0.45
49 0.51
50 0.5
51 0.54
52 0.58
53 0.6
54 0.6
55 0.63
56 0.64
57 0.65
58 0.61
59 0.53
60 0.51
61 0.47
62 0.4
63 0.37
64 0.32
65 0.26
66 0.22
67 0.22
68 0.21
69 0.2
70 0.25
71 0.26
72 0.27
73 0.24
74 0.24
75 0.23
76 0.2
77 0.19
78 0.14
79 0.18
80 0.19
81 0.19
82 0.18
83 0.22
84 0.25
85 0.31
86 0.33
87 0.31
88 0.36
89 0.4
90 0.43
91 0.47
92 0.49
93 0.48
94 0.49
95 0.45
96 0.41
97 0.43
98 0.42
99 0.44
100 0.45
101 0.44
102 0.47
103 0.51
104 0.48
105 0.47
106 0.5
107 0.47
108 0.48
109 0.52
110 0.54
111 0.61
112 0.72
113 0.76
114 0.8
115 0.85
116 0.85
117 0.87
118 0.87
119 0.86
120 0.84
121 0.83
122 0.82
123 0.77
124 0.79
125 0.78
126 0.78
127 0.72
128 0.66
129 0.61
130 0.6
131 0.57
132 0.53
133 0.51
134 0.48
135 0.48
136 0.51
137 0.48
138 0.41
139 0.39
140 0.33
141 0.26
142 0.2
143 0.17
144 0.11
145 0.1
146 0.11
147 0.13
148 0.18
149 0.25
150 0.3
151 0.3
152 0.32
153 0.34
154 0.42
155 0.44
156 0.41
157 0.41
158 0.43
159 0.52
160 0.57
161 0.63
162 0.59
163 0.55
164 0.54
165 0.5
166 0.47
167 0.38
168 0.31
169 0.26
170 0.24
171 0.26
172 0.26
173 0.29
174 0.3
175 0.32
176 0.35
177 0.34
178 0.36
179 0.39
180 0.36
181 0.36
182 0.38
183 0.46
184 0.5
185 0.51
186 0.48
187 0.44
188 0.43
189 0.37
190 0.32
191 0.26
192 0.2
193 0.18
194 0.2
195 0.23
196 0.23
197 0.23
198 0.24
199 0.19
200 0.18
201 0.18
202 0.16
203 0.13
204 0.16
205 0.2
206 0.19
207 0.2
208 0.2
209 0.2
210 0.17
211 0.19
212 0.2
213 0.15
214 0.15
215 0.15
216 0.15
217 0.2
218 0.27
219 0.3
220 0.36
221 0.45
222 0.5
223 0.53
224 0.54
225 0.52
226 0.5
227 0.49
228 0.42
229 0.36
230 0.35
231 0.32
232 0.33
233 0.31
234 0.25
235 0.2
236 0.19
237 0.15
238 0.12
239 0.11
240 0.11
241 0.1
242 0.1
243 0.1
244 0.12
245 0.13
246 0.12
247 0.13
248 0.1
249 0.12
250 0.16
251 0.2
252 0.2
253 0.24
254 0.24
255 0.3
256 0.31
257 0.31
258 0.37
259 0.37
260 0.4
261 0.44
262 0.5
263 0.51
264 0.56
265 0.62
266 0.63
267 0.69
268 0.7
269 0.68
270 0.63
271 0.56
272 0.5
273 0.41
274 0.31
275 0.22
276 0.17
277 0.11
278 0.09
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.08
283 0.07
284 0.07
285 0.09
286 0.09
287 0.09
288 0.09
289 0.09
290 0.09
291 0.11
292 0.12
293 0.1
294 0.1
295 0.1
296 0.11
297 0.14
298 0.13
299 0.12
300 0.1
301 0.09
302 0.09
303 0.11
304 0.1
305 0.08
306 0.08
307 0.08
308 0.08
309 0.09
310 0.08
311 0.07
312 0.07
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.07
321 0.08
322 0.09
323 0.1
324 0.11
325 0.11
326 0.11
327 0.15
328 0.15
329 0.16
330 0.2
331 0.24
332 0.27
333 0.28
334 0.28
335 0.25
336 0.23
337 0.23
338 0.18
339 0.14
340 0.1
341 0.09
342 0.11
343 0.11
344 0.11
345 0.11
346 0.13
347 0.14
348 0.17
349 0.18
350 0.17
351 0.17
352 0.17
353 0.15
354 0.12
355 0.11
356 0.07
357 0.06
358 0.06
359 0.09
360 0.13
361 0.2
362 0.25
363 0.32
364 0.42
365 0.52
366 0.61
367 0.69
368 0.75
369 0.79
370 0.86
371 0.88
372 0.89
373 0.83
374 0.78
375 0.69
376 0.61
377 0.5
378 0.38
379 0.29
380 0.19
381 0.15
382 0.09
383 0.07
384 0.05
385 0.08
386 0.08
387 0.09
388 0.1
389 0.1
390 0.1
391 0.11
392 0.11
393 0.11
394 0.11
395 0.13
396 0.13
397 0.14
398 0.16
399 0.16
400 0.17
401 0.14
402 0.15
403 0.13
404 0.13
405 0.15
406 0.12
407 0.11
408 0.1
409 0.11
410 0.1
411 0.09
412 0.1
413 0.08
414 0.11
415 0.13
416 0.14
417 0.13
418 0.15
419 0.15
420 0.15
421 0.18
422 0.17
423 0.21
424 0.21
425 0.27
426 0.27
427 0.3
428 0.3
429 0.31
430 0.31
431 0.26
432 0.24
433 0.2
434 0.17
435 0.14
436 0.12
437 0.08
438 0.07
439 0.06
440 0.06
441 0.04
442 0.05
443 0.04
444 0.05
445 0.05
446 0.05
447 0.05
448 0.05
449 0.05
450 0.05
451 0.06
452 0.06
453 0.06
454 0.06
455 0.07
456 0.07
457 0.08
458 0.09
459 0.13
460 0.13
461 0.15
462 0.19
463 0.19
464 0.23
465 0.29
466 0.33
467 0.35
468 0.43
469 0.45
470 0.43
471 0.49
472 0.5
473 0.5
474 0.49
475 0.46
476 0.4
477 0.39
478 0.39
479 0.33
480 0.28
481 0.25
482 0.27
483 0.32
484 0.39
485 0.46
486 0.53
487 0.58
488 0.62
489 0.61
490 0.58
491 0.54
492 0.46
493 0.38
494 0.4
495 0.34
496 0.3
497 0.26
498 0.23
499 0.2
500 0.17
501 0.16
502 0.07
503 0.08
504 0.08
505 0.08
506 0.08
507 0.07
508 0.07
509 0.07
510 0.07
511 0.06
512 0.06
513 0.06
514 0.07
515 0.09
516 0.13
517 0.14
518 0.15
519 0.16
520 0.17
521 0.2
522 0.19
523 0.19
524 0.15
525 0.14
526 0.15
527 0.15
528 0.14
529 0.11
530 0.1
531 0.09
532 0.08
533 0.07
534 0.05
535 0.04
536 0.04
537 0.04
538 0.05
539 0.05
540 0.06
541 0.07
542 0.07
543 0.08
544 0.09
545 0.1
546 0.1
547 0.1
548 0.11
549 0.11
550 0.12
551 0.13
552 0.13
553 0.13
554 0.13
555 0.12
556 0.1
557 0.09
558 0.08
559 0.08
560 0.08
561 0.13
562 0.17
563 0.22
564 0.27
565 0.28
566 0.31
567 0.34
568 0.37
569 0.34
570 0.39
571 0.41
572 0.39
573 0.41
574 0.37
575 0.38
576 0.33
577 0.3
578 0.22
579 0.17
580 0.16
581 0.15
582 0.15
583 0.13
584 0.15
585 0.14
586 0.15
587 0.18
588 0.17
589 0.15
590 0.15
591 0.14
592 0.14
593 0.15
594 0.16
595 0.11
596 0.13
597 0.14
598 0.15
599 0.15
600 0.17
601 0.16
602 0.14
603 0.15
604 0.14
605 0.12
606 0.11
607 0.12
608 0.11
609 0.11
610 0.11
611 0.12
612 0.11
613 0.14
614 0.14
615 0.13
616 0.13
617 0.14
618 0.14
619 0.16
620 0.19
621 0.17
622 0.18
623 0.21
624 0.2
625 0.28
626 0.32
627 0.28
628 0.33
629 0.35
630 0.37
631 0.38
632 0.36
633 0.3
634 0.28
635 0.36
636 0.3
637 0.27
638 0.24
639 0.21
640 0.2
641 0.19
642 0.19
643 0.13
644 0.13
645 0.13
646 0.2
647 0.23
648 0.25
649 0.31
650 0.4
651 0.43
652 0.53
653 0.55
654 0.58
655 0.6
656 0.64
657 0.67
658 0.65
659 0.66
660 0.62
661 0.66
662 0.61
663 0.62
664 0.59
665 0.51
666 0.45
667 0.38
668 0.32
669 0.26
670 0.24
671 0.2
672 0.17
673 0.14
674 0.11
675 0.11
676 0.11
677 0.11
678 0.11
679 0.1
680 0.09
681 0.11
682 0.11
683 0.11
684 0.11
685 0.12
686 0.11
687 0.12
688 0.13
689 0.14
690 0.15
691 0.15
692 0.2
693 0.17
694 0.18
695 0.18
696 0.18
697 0.16
698 0.17
699 0.17
700 0.19
701 0.24
702 0.23
703 0.31
704 0.36
705 0.41
706 0.49
707 0.54
708 0.54
709 0.53
710 0.56
711 0.54
712 0.56
713 0.58
714 0.58
715 0.63
716 0.63
717 0.67
718 0.71
719 0.7
720 0.72
721 0.74
722 0.74
723 0.67
724 0.63
725 0.6
726 0.53
727 0.49
728 0.39
729 0.31
730 0.22
731 0.18
732 0.18
733 0.12
734 0.11
735 0.13
736 0.12
737 0.11
738 0.11
739 0.12
740 0.1
741 0.1
742 0.11
743 0.1
744 0.13
745 0.13
746 0.13
747 0.13
748 0.12
749 0.12
750 0.11
751 0.12
752 0.1
753 0.09
754 0.1
755 0.11
756 0.1
757 0.1
758 0.11
759 0.08
760 0.09
761 0.1
762 0.11
763 0.1
764 0.12
765 0.15
766 0.22
767 0.29
768 0.37
769 0.45
770 0.52
771 0.6
772 0.64
773 0.68
774 0.69
775 0.67
776 0.68
777 0.7
778 0.72
779 0.74
780 0.79
781 0.81
782 0.77
783 0.74
784 0.7
785 0.63
786 0.53
787 0.46
788 0.43
789 0.39
790 0.38
791 0.37
792 0.34
793 0.34
794 0.35
795 0.35
796 0.33
797 0.33
798 0.36
799 0.35
800 0.39
801 0.4
802 0.41
803 0.42
804 0.41
805 0.4
806 0.38
807 0.39
808 0.35
809 0.33
810 0.31
811 0.29
812 0.25
813 0.29
814 0.35
815 0.39
816 0.42
817 0.47
818 0.5
819 0.59
820 0.63
821 0.64
822 0.65
823 0.64
824 0.69
825 0.63
826 0.61
827 0.51
828 0.46
829 0.4
830 0.3
831 0.27
832 0.18
833 0.17
834 0.21
835 0.22
836 0.22
837 0.27
838 0.31
839 0.3
840 0.35
841 0.37
842 0.32
843 0.35
844 0.37
845 0.31
846 0.32
847 0.29
848 0.25
849 0.25
850 0.25
851 0.24
852 0.26
853 0.25
854 0.23
855 0.23
856 0.23
857 0.21
858 0.21
859 0.19
860 0.17
861 0.16
862 0.13
863 0.13
864 0.12
865 0.12
866 0.1
867 0.1
868 0.09
869 0.09
870 0.12
871 0.13
872 0.15
873 0.19
874 0.28
875 0.33
876 0.38
877 0.47
878 0.5
879 0.57
880 0.57
881 0.54
882 0.51
883 0.47
884 0.41
885 0.4
886 0.35
887 0.28