Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VK86

Protein Details
Accession A0A1Y1VK86    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
115-139IKERAENKSKSKRRISQSSRVRRSFHydrophilic
210-231IQMKSDKDTKRERRRSVRSIQSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
119-128AENKSKSKRR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040366  Nab2/ZC3H14  
IPR000571  Znf_CCCH  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0008143  F:poly(A) binding  
GO:1900364  P:negative regulation of mRNA polyadenylation  
GO:0043488  P:regulation of mRNA stability  
Pfam View protein in Pfam  
PF14608  zf-CCCH_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MTDISIEIPSVVMNSKQKFNQRLITSITQKLRNCKIVSTPEDVNKIVNLLNEGKNREQLTEEITTMFADDKDKIKSSFIDWLIGYSNACCNNSTTEIETEELKSPSIMSEKASSIKERAENKSKSKRRISQSSRVRRSFIDSTPLSPPPSPPRSSKASSVCSSDYEKSQKNIYHQKRLSRSANTLDLTSQVQSEIMAQTLALAAAAAVDIQMKSDKDTKRERRRSVRSIQSIRSRKSSFSSVKEEDTSRIRCQYWPTCNRGDQCKFWHPKELCKKFPNCPNGDNCLFIHPATTNPSKPQSPYHRRVSQSSTTPPDLSSSNERVAVECKYGSNCTRVDCKFSHPSPAVAKLNKQQSKTAAASESKNSKSNVPCHYYPNCKNADCPYMHPNSTPKNESVNVACRYGSACTRQDCHFLHPGNRRV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.3
3 0.36
4 0.45
5 0.5
6 0.55
7 0.59
8 0.55
9 0.56
10 0.57
11 0.6
12 0.57
13 0.58
14 0.59
15 0.57
16 0.58
17 0.63
18 0.64
19 0.63
20 0.58
21 0.54
22 0.55
23 0.57
24 0.58
25 0.55
26 0.53
27 0.5
28 0.53
29 0.5
30 0.43
31 0.33
32 0.3
33 0.26
34 0.21
35 0.19
36 0.2
37 0.26
38 0.3
39 0.34
40 0.35
41 0.4
42 0.4
43 0.37
44 0.34
45 0.29
46 0.29
47 0.27
48 0.25
49 0.2
50 0.19
51 0.18
52 0.16
53 0.15
54 0.11
55 0.1
56 0.12
57 0.15
58 0.19
59 0.22
60 0.22
61 0.23
62 0.24
63 0.25
64 0.31
65 0.29
66 0.28
67 0.25
68 0.26
69 0.25
70 0.24
71 0.22
72 0.14
73 0.17
74 0.17
75 0.17
76 0.17
77 0.16
78 0.19
79 0.23
80 0.24
81 0.22
82 0.21
83 0.21
84 0.22
85 0.22
86 0.2
87 0.21
88 0.19
89 0.17
90 0.15
91 0.14
92 0.15
93 0.16
94 0.14
95 0.12
96 0.15
97 0.17
98 0.21
99 0.23
100 0.23
101 0.22
102 0.26
103 0.3
104 0.34
105 0.4
106 0.45
107 0.5
108 0.58
109 0.67
110 0.71
111 0.73
112 0.77
113 0.78
114 0.77
115 0.81
116 0.8
117 0.79
118 0.82
119 0.84
120 0.84
121 0.78
122 0.71
123 0.61
124 0.6
125 0.55
126 0.45
127 0.42
128 0.33
129 0.34
130 0.36
131 0.37
132 0.32
133 0.27
134 0.29
135 0.29
136 0.34
137 0.35
138 0.34
139 0.36
140 0.41
141 0.43
142 0.47
143 0.45
144 0.45
145 0.43
146 0.43
147 0.4
148 0.36
149 0.37
150 0.31
151 0.29
152 0.29
153 0.3
154 0.28
155 0.32
156 0.32
157 0.36
158 0.45
159 0.47
160 0.52
161 0.53
162 0.59
163 0.6
164 0.65
165 0.63
166 0.56
167 0.54
168 0.47
169 0.48
170 0.41
171 0.35
172 0.28
173 0.24
174 0.2
175 0.17
176 0.13
177 0.08
178 0.07
179 0.07
180 0.07
181 0.06
182 0.05
183 0.05
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.03
189 0.02
190 0.02
191 0.02
192 0.02
193 0.02
194 0.02
195 0.02
196 0.02
197 0.03
198 0.05
199 0.05
200 0.07
201 0.14
202 0.16
203 0.22
204 0.32
205 0.43
206 0.53
207 0.63
208 0.7
209 0.73
210 0.8
211 0.82
212 0.81
213 0.8
214 0.78
215 0.74
216 0.72
217 0.71
218 0.7
219 0.64
220 0.62
221 0.54
222 0.46
223 0.43
224 0.46
225 0.41
226 0.39
227 0.44
228 0.39
229 0.4
230 0.41
231 0.38
232 0.33
233 0.33
234 0.32
235 0.26
236 0.28
237 0.27
238 0.27
239 0.33
240 0.38
241 0.42
242 0.45
243 0.48
244 0.49
245 0.52
246 0.54
247 0.57
248 0.53
249 0.47
250 0.48
251 0.52
252 0.53
253 0.5
254 0.57
255 0.48
256 0.54
257 0.61
258 0.63
259 0.61
260 0.63
261 0.67
262 0.65
263 0.72
264 0.71
265 0.64
266 0.61
267 0.58
268 0.57
269 0.53
270 0.48
271 0.4
272 0.33
273 0.3
274 0.24
275 0.21
276 0.14
277 0.15
278 0.18
279 0.21
280 0.2
281 0.23
282 0.28
283 0.28
284 0.3
285 0.37
286 0.43
287 0.49
288 0.55
289 0.61
290 0.64
291 0.65
292 0.68
293 0.66
294 0.62
295 0.58
296 0.57
297 0.54
298 0.49
299 0.47
300 0.42
301 0.37
302 0.31
303 0.28
304 0.28
305 0.26
306 0.25
307 0.27
308 0.27
309 0.26
310 0.28
311 0.25
312 0.21
313 0.18
314 0.18
315 0.17
316 0.22
317 0.23
318 0.25
319 0.24
320 0.26
321 0.33
322 0.33
323 0.36
324 0.33
325 0.38
326 0.43
327 0.43
328 0.49
329 0.42
330 0.45
331 0.44
332 0.5
333 0.5
334 0.44
335 0.48
336 0.47
337 0.56
338 0.56
339 0.54
340 0.51
341 0.48
342 0.52
343 0.48
344 0.45
345 0.4
346 0.38
347 0.39
348 0.42
349 0.45
350 0.41
351 0.44
352 0.42
353 0.43
354 0.47
355 0.51
356 0.52
357 0.52
358 0.51
359 0.54
360 0.61
361 0.64
362 0.63
363 0.64
364 0.63
365 0.56
366 0.57
367 0.56
368 0.56
369 0.48
370 0.47
371 0.46
372 0.47
373 0.47
374 0.47
375 0.48
376 0.49
377 0.54
378 0.53
379 0.48
380 0.48
381 0.48
382 0.49
383 0.48
384 0.47
385 0.43
386 0.4
387 0.37
388 0.31
389 0.32
390 0.31
391 0.3
392 0.28
393 0.31
394 0.35
395 0.39
396 0.41
397 0.48
398 0.46
399 0.47
400 0.49
401 0.48
402 0.53