Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VB96

Protein Details
Accession A0A1Y1VB96    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
325-352VEKYDQIDKKVKKKREEEEKKAQKKNNKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
333-352KKVKKKREEEEKKAQKKNNK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 13, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017351  PINCH_1-4-like  
IPR001781  Znf_LIM  
Gene Ontology GO:0110165  C:cellular anatomical entity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00412  LIM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00478  LIM_DOMAIN_1  
PS50023  LIM_DOMAIN_2  
CDD cd08368  LIM  
Amino Acid Sequences MATVVEPSIDNFEIDTICPICKEKVLEGMTKGKKSYHNDCFVCHQCLMPFPEGSNIFENENGLYCEYDNSVLFGNRCGKCGQIILGKCLTAMNMTWHSEHFTCEECGNLLENMPFINRNGKPYCKPCIALIKQQEEKLRKEACGKCKKPIAAEDLLILKGIRYHAFHFPCTVCKTILGADCVEYEGKLYCPKDYEIVTAPVCYTCRRPIFGPSITALGRDFHTEHFVCFKCEKRFDDSVFYEYQDKPYCMLHYNELTQSNCGRCKHPASGKVITAMNKKWCQNHFTCFGCNLDFNITKAPFFEWDLKPLCKQCYDHLPSSVKKSVEKYDQIDKKVKKKREEEEKKAQKKNNK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.16
3 0.13
4 0.13
5 0.14
6 0.17
7 0.17
8 0.2
9 0.22
10 0.21
11 0.29
12 0.32
13 0.35
14 0.37
15 0.46
16 0.48
17 0.49
18 0.47
19 0.44
20 0.48
21 0.51
22 0.57
23 0.57
24 0.6
25 0.58
26 0.6
27 0.63
28 0.61
29 0.58
30 0.48
31 0.4
32 0.31
33 0.35
34 0.37
35 0.31
36 0.26
37 0.23
38 0.29
39 0.28
40 0.3
41 0.28
42 0.25
43 0.22
44 0.22
45 0.22
46 0.16
47 0.16
48 0.14
49 0.12
50 0.11
51 0.1
52 0.11
53 0.11
54 0.12
55 0.11
56 0.11
57 0.12
58 0.13
59 0.13
60 0.17
61 0.25
62 0.24
63 0.25
64 0.25
65 0.24
66 0.23
67 0.25
68 0.24
69 0.22
70 0.23
71 0.26
72 0.27
73 0.26
74 0.24
75 0.23
76 0.19
77 0.12
78 0.12
79 0.12
80 0.14
81 0.16
82 0.17
83 0.17
84 0.2
85 0.2
86 0.2
87 0.17
88 0.16
89 0.16
90 0.15
91 0.15
92 0.12
93 0.13
94 0.13
95 0.11
96 0.1
97 0.08
98 0.09
99 0.08
100 0.09
101 0.09
102 0.08
103 0.16
104 0.16
105 0.22
106 0.26
107 0.31
108 0.37
109 0.41
110 0.46
111 0.41
112 0.42
113 0.39
114 0.46
115 0.44
116 0.46
117 0.48
118 0.49
119 0.49
120 0.51
121 0.54
122 0.48
123 0.47
124 0.47
125 0.42
126 0.36
127 0.43
128 0.46
129 0.5
130 0.57
131 0.56
132 0.55
133 0.58
134 0.58
135 0.52
136 0.5
137 0.45
138 0.36
139 0.34
140 0.29
141 0.25
142 0.23
143 0.2
144 0.15
145 0.09
146 0.08
147 0.09
148 0.08
149 0.08
150 0.11
151 0.18
152 0.2
153 0.21
154 0.22
155 0.22
156 0.24
157 0.25
158 0.24
159 0.17
160 0.16
161 0.16
162 0.16
163 0.17
164 0.15
165 0.13
166 0.12
167 0.12
168 0.12
169 0.11
170 0.08
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.1
175 0.1
176 0.1
177 0.12
178 0.13
179 0.15
180 0.15
181 0.17
182 0.15
183 0.18
184 0.17
185 0.16
186 0.16
187 0.14
188 0.14
189 0.13
190 0.14
191 0.17
192 0.19
193 0.21
194 0.22
195 0.27
196 0.32
197 0.32
198 0.31
199 0.26
200 0.27
201 0.24
202 0.24
203 0.19
204 0.14
205 0.12
206 0.13
207 0.13
208 0.11
209 0.16
210 0.16
211 0.16
212 0.21
213 0.21
214 0.23
215 0.24
216 0.3
217 0.31
218 0.37
219 0.39
220 0.4
221 0.45
222 0.44
223 0.48
224 0.44
225 0.41
226 0.36
227 0.34
228 0.31
229 0.27
230 0.3
231 0.26
232 0.24
233 0.22
234 0.23
235 0.24
236 0.23
237 0.24
238 0.23
239 0.23
240 0.25
241 0.27
242 0.29
243 0.28
244 0.27
245 0.29
246 0.29
247 0.31
248 0.31
249 0.3
250 0.32
251 0.36
252 0.43
253 0.47
254 0.49
255 0.51
256 0.54
257 0.53
258 0.51
259 0.49
260 0.45
261 0.43
262 0.41
263 0.42
264 0.43
265 0.45
266 0.49
267 0.49
268 0.52
269 0.51
270 0.52
271 0.5
272 0.48
273 0.47
274 0.41
275 0.4
276 0.34
277 0.3
278 0.26
279 0.26
280 0.24
281 0.22
282 0.28
283 0.26
284 0.24
285 0.25
286 0.25
287 0.2
288 0.23
289 0.3
290 0.24
291 0.3
292 0.35
293 0.37
294 0.41
295 0.44
296 0.44
297 0.41
298 0.42
299 0.42
300 0.48
301 0.52
302 0.51
303 0.53
304 0.56
305 0.54
306 0.6
307 0.59
308 0.5
309 0.48
310 0.49
311 0.49
312 0.52
313 0.55
314 0.52
315 0.57
316 0.62
317 0.63
318 0.68
319 0.68
320 0.69
321 0.72
322 0.76
323 0.76
324 0.78
325 0.82
326 0.84
327 0.87
328 0.86
329 0.88
330 0.9
331 0.91
332 0.9