Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VNH3

Protein Details
Accession A0A1Y1VNH3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
941-964LNSLLKSSPIRRNKRIKMLYEQINHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000547  Clathrin_H-chain/VPS_repeat  
IPR007810  Pep3_Vps18  
IPR019453  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_2  
IPR001841  Znf_RING  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF00637  Clathrin  
PF05131  Pep3_Vps18  
PF10367  Vps39_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50236  CHCR  
CDD cd16462  RING-H2_Pep3p-like  
Amino Acid Sequences MNHFDEEISIIPIINEVEDYPDYIPTSKLDINTQPSTSLLESSLIKPTELKLEEAPIFTLDKVQYQFPGEIGALQVSNNILAVVINKNRILRIDLGEIYQVEDIEIIQKKTGDAIKKIFLDPTGKHLIIVTESEDTYYLYEKWKKPKLMSKFRGINIQSIAWRGKPSLNDNSTGLILIGTNNGKIFEAEIQPTDEFFKREERYFKQVYSFNDEMLSITGLRFEAFPTDPRKYVVIVATPIKLYQFIGDISSDVDNNEGGMFSELFQNNTPNEKEIISFHKNSECHFRSQFHENGWPSIPKQFVWTTGKGMYTGELIFGSQKSGGSVINNSRLVSYPEEYVKAENKVTKPVESIPLSVAITQFHTLLLYKKKIKAMCNLDDSIIYEEDIPLEQDEKILGLKMDFIKDSYWLFTTHSLYEILITDEDRNVWQIYLKQKMFDAALSFTKNESQKDKVLTSQADYYYSQQRYNLSAEYYAQIHSISFEEIVLRFINKNENDALRIFLIRKLEKLKNQDGIQKTLICTWLVEIFINKINQISNKIEDENLAYETLKKLSDSSEEKLANAKNQIERMEEDKKMIQDEFKSFMHANKNYLDKKAIYQIISSHGRMEELLMFAELVKDYERMLVYYLQEKNYEKVISILNKQSNLDLYYKFSPVLMECMPYETVNMWIHEPKLNPRHLIPSLLKYDPKKSFGKEGIEGKNQAIRYLNYVIQNLHNTDMTIHNYLLFLYAKQATNEDCAELLEFLMHENRPAYYDLQYALRICTQNRIIHACVYLYSEMRLYEQAVNLALKHNDIDLAKYNADKVEDNDILRKKLWINIVKYVIEENKDIKMALQLLKSCELLKISDILPYFPDFVLIEDFKDEICETLEEYNVHIDELKKEMDEATKSAEDIRFDIRELKNKHTIIPVNELCRICNKTLLTRQFYIFPCQHLFHADCLLNSLLKSSPIRRNKRIKMLYEQINEISKKLNSNGMDFLMNDNSDDDDDNANNSSGLGVFNLIKSGGRSDEEKESAYNAKKLDKLKDELQELVTSECPLCGDTMISSIDIPFLDNVKESELIASWEI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.09
3 0.07
4 0.11
5 0.12
6 0.14
7 0.13
8 0.15
9 0.16
10 0.17
11 0.18
12 0.15
13 0.2
14 0.22
15 0.23
16 0.27
17 0.32
18 0.38
19 0.41
20 0.4
21 0.35
22 0.33
23 0.35
24 0.3
25 0.25
26 0.18
27 0.17
28 0.19
29 0.2
30 0.27
31 0.23
32 0.23
33 0.23
34 0.23
35 0.3
36 0.28
37 0.29
38 0.24
39 0.3
40 0.32
41 0.32
42 0.31
43 0.23
44 0.23
45 0.2
46 0.24
47 0.18
48 0.21
49 0.22
50 0.23
51 0.24
52 0.26
53 0.26
54 0.21
55 0.23
56 0.18
57 0.17
58 0.16
59 0.15
60 0.12
61 0.11
62 0.12
63 0.09
64 0.09
65 0.09
66 0.07
67 0.06
68 0.06
69 0.08
70 0.14
71 0.17
72 0.2
73 0.23
74 0.24
75 0.26
76 0.27
77 0.29
78 0.26
79 0.27
80 0.29
81 0.28
82 0.28
83 0.29
84 0.27
85 0.25
86 0.21
87 0.17
88 0.11
89 0.1
90 0.09
91 0.14
92 0.17
93 0.16
94 0.17
95 0.18
96 0.18
97 0.23
98 0.28
99 0.28
100 0.3
101 0.34
102 0.39
103 0.42
104 0.43
105 0.39
106 0.37
107 0.36
108 0.32
109 0.34
110 0.35
111 0.32
112 0.31
113 0.3
114 0.28
115 0.24
116 0.24
117 0.2
118 0.14
119 0.14
120 0.15
121 0.14
122 0.13
123 0.13
124 0.14
125 0.12
126 0.18
127 0.27
128 0.32
129 0.42
130 0.5
131 0.56
132 0.61
133 0.7
134 0.73
135 0.76
136 0.77
137 0.77
138 0.77
139 0.73
140 0.75
141 0.66
142 0.6
143 0.52
144 0.48
145 0.39
146 0.35
147 0.35
148 0.27
149 0.28
150 0.24
151 0.25
152 0.27
153 0.32
154 0.38
155 0.38
156 0.39
157 0.39
158 0.38
159 0.35
160 0.3
161 0.23
162 0.13
163 0.11
164 0.08
165 0.11
166 0.1
167 0.1
168 0.1
169 0.11
170 0.11
171 0.11
172 0.12
173 0.13
174 0.15
175 0.16
176 0.17
177 0.19
178 0.19
179 0.2
180 0.22
181 0.2
182 0.18
183 0.18
184 0.25
185 0.26
186 0.31
187 0.39
188 0.4
189 0.46
190 0.49
191 0.49
192 0.47
193 0.48
194 0.47
195 0.48
196 0.43
197 0.36
198 0.33
199 0.31
200 0.25
201 0.21
202 0.18
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.08
207 0.09
208 0.08
209 0.07
210 0.1
211 0.11
212 0.16
213 0.22
214 0.25
215 0.26
216 0.28
217 0.28
218 0.26
219 0.28
220 0.26
221 0.23
222 0.23
223 0.24
224 0.24
225 0.23
226 0.22
227 0.19
228 0.17
229 0.14
230 0.11
231 0.1
232 0.09
233 0.1
234 0.1
235 0.1
236 0.1
237 0.11
238 0.1
239 0.09
240 0.09
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.05
245 0.05
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.14
250 0.14
251 0.15
252 0.16
253 0.19
254 0.18
255 0.23
256 0.23
257 0.18
258 0.19
259 0.18
260 0.19
261 0.19
262 0.26
263 0.27
264 0.28
265 0.28
266 0.33
267 0.33
268 0.34
269 0.41
270 0.36
271 0.36
272 0.38
273 0.39
274 0.37
275 0.43
276 0.44
277 0.37
278 0.42
279 0.38
280 0.37
281 0.37
282 0.35
283 0.29
284 0.3
285 0.28
286 0.2
287 0.24
288 0.21
289 0.26
290 0.29
291 0.3
292 0.29
293 0.3
294 0.3
295 0.26
296 0.25
297 0.19
298 0.15
299 0.13
300 0.1
301 0.08
302 0.08
303 0.09
304 0.08
305 0.09
306 0.08
307 0.08
308 0.07
309 0.08
310 0.09
311 0.09
312 0.13
313 0.16
314 0.22
315 0.23
316 0.23
317 0.22
318 0.23
319 0.24
320 0.23
321 0.21
322 0.17
323 0.18
324 0.19
325 0.19
326 0.21
327 0.21
328 0.2
329 0.22
330 0.24
331 0.24
332 0.3
333 0.31
334 0.29
335 0.28
336 0.28
337 0.33
338 0.28
339 0.28
340 0.21
341 0.22
342 0.21
343 0.2
344 0.18
345 0.12
346 0.12
347 0.11
348 0.11
349 0.08
350 0.08
351 0.08
352 0.13
353 0.18
354 0.23
355 0.27
356 0.31
357 0.37
358 0.41
359 0.44
360 0.48
361 0.5
362 0.5
363 0.5
364 0.47
365 0.42
366 0.38
367 0.35
368 0.28
369 0.2
370 0.15
371 0.1
372 0.09
373 0.09
374 0.08
375 0.07
376 0.05
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.06
381 0.06
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.05
386 0.08
387 0.09
388 0.11
389 0.1
390 0.11
391 0.11
392 0.12
393 0.13
394 0.11
395 0.11
396 0.1
397 0.11
398 0.14
399 0.15
400 0.14
401 0.15
402 0.14
403 0.13
404 0.13
405 0.12
406 0.1
407 0.08
408 0.08
409 0.08
410 0.07
411 0.08
412 0.07
413 0.08
414 0.08
415 0.08
416 0.08
417 0.12
418 0.17
419 0.25
420 0.25
421 0.24
422 0.24
423 0.25
424 0.24
425 0.21
426 0.17
427 0.11
428 0.14
429 0.14
430 0.14
431 0.13
432 0.18
433 0.19
434 0.2
435 0.21
436 0.22
437 0.24
438 0.27
439 0.28
440 0.26
441 0.28
442 0.26
443 0.24
444 0.24
445 0.21
446 0.2
447 0.2
448 0.2
449 0.24
450 0.25
451 0.24
452 0.22
453 0.23
454 0.23
455 0.24
456 0.22
457 0.15
458 0.14
459 0.14
460 0.14
461 0.13
462 0.11
463 0.09
464 0.08
465 0.07
466 0.08
467 0.07
468 0.06
469 0.06
470 0.05
471 0.06
472 0.06
473 0.07
474 0.07
475 0.07
476 0.07
477 0.08
478 0.15
479 0.14
480 0.16
481 0.17
482 0.17
483 0.18
484 0.18
485 0.18
486 0.12
487 0.13
488 0.12
489 0.12
490 0.16
491 0.14
492 0.17
493 0.22
494 0.26
495 0.3
496 0.36
497 0.38
498 0.39
499 0.41
500 0.45
501 0.41
502 0.4
503 0.37
504 0.31
505 0.27
506 0.23
507 0.22
508 0.16
509 0.13
510 0.1
511 0.1
512 0.09
513 0.09
514 0.07
515 0.08
516 0.1
517 0.11
518 0.1
519 0.09
520 0.1
521 0.11
522 0.14
523 0.15
524 0.14
525 0.16
526 0.16
527 0.15
528 0.15
529 0.15
530 0.12
531 0.11
532 0.09
533 0.08
534 0.08
535 0.09
536 0.09
537 0.08
538 0.07
539 0.07
540 0.08
541 0.13
542 0.16
543 0.17
544 0.23
545 0.23
546 0.23
547 0.26
548 0.26
549 0.23
550 0.22
551 0.23
552 0.19
553 0.21
554 0.22
555 0.2
556 0.2
557 0.23
558 0.25
559 0.22
560 0.22
561 0.22
562 0.21
563 0.21
564 0.2
565 0.17
566 0.15
567 0.17
568 0.19
569 0.17
570 0.19
571 0.18
572 0.22
573 0.28
574 0.26
575 0.26
576 0.26
577 0.33
578 0.31
579 0.33
580 0.31
581 0.24
582 0.24
583 0.28
584 0.28
585 0.22
586 0.2
587 0.2
588 0.24
589 0.26
590 0.24
591 0.19
592 0.16
593 0.16
594 0.15
595 0.15
596 0.1
597 0.08
598 0.08
599 0.06
600 0.06
601 0.06
602 0.06
603 0.05
604 0.05
605 0.05
606 0.05
607 0.05
608 0.08
609 0.08
610 0.08
611 0.09
612 0.11
613 0.11
614 0.17
615 0.19
616 0.18
617 0.21
618 0.22
619 0.22
620 0.23
621 0.22
622 0.16
623 0.16
624 0.18
625 0.19
626 0.21
627 0.26
628 0.25
629 0.26
630 0.27
631 0.25
632 0.23
633 0.22
634 0.21
635 0.15
636 0.17
637 0.18
638 0.18
639 0.18
640 0.16
641 0.15
642 0.13
643 0.16
644 0.12
645 0.11
646 0.11
647 0.13
648 0.13
649 0.12
650 0.13
651 0.09
652 0.13
653 0.13
654 0.14
655 0.13
656 0.14
657 0.16
658 0.18
659 0.19
660 0.23
661 0.29
662 0.31
663 0.31
664 0.31
665 0.35
666 0.34
667 0.38
668 0.32
669 0.3
670 0.32
671 0.33
672 0.36
673 0.32
674 0.39
675 0.37
676 0.4
677 0.38
678 0.36
679 0.41
680 0.42
681 0.44
682 0.42
683 0.46
684 0.47
685 0.47
686 0.46
687 0.39
688 0.38
689 0.33
690 0.29
691 0.24
692 0.18
693 0.19
694 0.2
695 0.23
696 0.21
697 0.22
698 0.22
699 0.22
700 0.24
701 0.21
702 0.2
703 0.16
704 0.14
705 0.15
706 0.16
707 0.16
708 0.16
709 0.15
710 0.14
711 0.13
712 0.13
713 0.14
714 0.12
715 0.09
716 0.1
717 0.13
718 0.14
719 0.14
720 0.16
721 0.15
722 0.17
723 0.18
724 0.15
725 0.12
726 0.11
727 0.11
728 0.1
729 0.09
730 0.06
731 0.05
732 0.06
733 0.08
734 0.08
735 0.08
736 0.09
737 0.09
738 0.11
739 0.13
740 0.14
741 0.13
742 0.14
743 0.14
744 0.16
745 0.17
746 0.16
747 0.16
748 0.18
749 0.18
750 0.17
751 0.23
752 0.26
753 0.27
754 0.3
755 0.33
756 0.3
757 0.3
758 0.31
759 0.24
760 0.2
761 0.2
762 0.18
763 0.14
764 0.13
765 0.12
766 0.12
767 0.12
768 0.13
769 0.12
770 0.13
771 0.13
772 0.14
773 0.14
774 0.14
775 0.14
776 0.16
777 0.14
778 0.12
779 0.12
780 0.11
781 0.12
782 0.12
783 0.15
784 0.16
785 0.18
786 0.19
787 0.19
788 0.2
789 0.18
790 0.2
791 0.18
792 0.16
793 0.2
794 0.22
795 0.23
796 0.29
797 0.31
798 0.31
799 0.31
800 0.31
801 0.25
802 0.27
803 0.35
804 0.35
805 0.36
806 0.41
807 0.45
808 0.42
809 0.42
810 0.41
811 0.35
812 0.3
813 0.28
814 0.22
815 0.2
816 0.2
817 0.2
818 0.16
819 0.17
820 0.19
821 0.2
822 0.22
823 0.22
824 0.24
825 0.26
826 0.27
827 0.24
828 0.21
829 0.19
830 0.16
831 0.15
832 0.15
833 0.13
834 0.16
835 0.16
836 0.15
837 0.15
838 0.16
839 0.17
840 0.14
841 0.15
842 0.12
843 0.13
844 0.17
845 0.15
846 0.14
847 0.13
848 0.14
849 0.12
850 0.13
851 0.12
852 0.08
853 0.09
854 0.09
855 0.1
856 0.11
857 0.13
858 0.12
859 0.13
860 0.15
861 0.14
862 0.14
863 0.14
864 0.14
865 0.14
866 0.17
867 0.17
868 0.14
869 0.14
870 0.16
871 0.19
872 0.19
873 0.18
874 0.21
875 0.21
876 0.21
877 0.25
878 0.25
879 0.22
880 0.22
881 0.25
882 0.2
883 0.21
884 0.29
885 0.29
886 0.36
887 0.39
888 0.44
889 0.48
890 0.48
891 0.5
892 0.5
893 0.51
894 0.46
895 0.52
896 0.49
897 0.44
898 0.5
899 0.47
900 0.4
901 0.42
902 0.42
903 0.33
904 0.34
905 0.33
906 0.35
907 0.44
908 0.52
909 0.51
910 0.51
911 0.51
912 0.53
913 0.52
914 0.51
915 0.44
916 0.4
917 0.38
918 0.36
919 0.35
920 0.34
921 0.33
922 0.28
923 0.32
924 0.28
925 0.24
926 0.25
927 0.25
928 0.21
929 0.19
930 0.19
931 0.13
932 0.17
933 0.21
934 0.25
935 0.34
936 0.44
937 0.53
938 0.61
939 0.72
940 0.77
941 0.84
942 0.85
943 0.81
944 0.8
945 0.8
946 0.8
947 0.73
948 0.67
949 0.59
950 0.57
951 0.52
952 0.43
953 0.38
954 0.3
955 0.3
956 0.29
957 0.32
958 0.27
959 0.3
960 0.32
961 0.29
962 0.29
963 0.26
964 0.27
965 0.23
966 0.21
967 0.18
968 0.16
969 0.16
970 0.15
971 0.16
972 0.15
973 0.14
974 0.15
975 0.16
976 0.17
977 0.16
978 0.15
979 0.13
980 0.12
981 0.09
982 0.09
983 0.08
984 0.08
985 0.09
986 0.09
987 0.1
988 0.1
989 0.11
990 0.12
991 0.14
992 0.15
993 0.16
994 0.19
995 0.22
996 0.29
997 0.31
998 0.31
999 0.29
1000 0.3
1001 0.35
1002 0.37
1003 0.37
1004 0.32
1005 0.36
1006 0.4
1007 0.45
1008 0.51
1009 0.5
1010 0.52
1011 0.56
1012 0.6
1013 0.58
1014 0.56
1015 0.52
1016 0.45
1017 0.39
1018 0.35
1019 0.29
1020 0.23
1021 0.2
1022 0.17
1023 0.15
1024 0.13
1025 0.12
1026 0.1
1027 0.1
1028 0.09
1029 0.11
1030 0.12
1031 0.12
1032 0.12
1033 0.11
1034 0.12
1035 0.11
1036 0.12
1037 0.11
1038 0.12
1039 0.12
1040 0.13
1041 0.14
1042 0.16
1043 0.17
1044 0.16
1045 0.16
1046 0.15