Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VF09

Protein Details
Accession A0A1Y1VF09    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-55LDLKIIKTRKCIKRLKVERGFLFHydrophilic
79-106PPQIVKVEEKHQKKKQKNIDPLAPKKPAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
186-197SKGKIKGRTKGK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.833, cyto 6, cyto_pero 3.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MTKTLSQEEQKYKRKYEELFKKLQDLEENNKTLDLKIIKTRKCIKRLKVERGFLFEKLEKIKKPTDFDSDDSEIENNPPPQIVKVEEKHQKKKQKNIDPLAPKKPANAFFRFCQLQRKDLKSQIKNEDSSNSDITKILSNKWKELPQEKKQIDYDMYEIDKARYEKELEAYNINSEHKKGITSPLSKGKIKGRTKGKGSINATSKIRMNSISTTDDNIDDSMNSVNDNQTENSFNNANNNDDEDEMQVDDIDDVDAAVAATASDSKNKLFNEKQQDEDQPINDENNYSRSTSVEYSGETAQSNVDSNLDDTNTNDHDEDNEEEEDDDEEEEEEDNDDDDHENHGTNIMTGRMGKKFSIDSQDEIEENHDDVDSNTVEEEDEEVEEEEDDETEDIDEDTQLEEEEEEDDDDENKDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.73
3 0.74
4 0.75
5 0.73
6 0.74
7 0.71
8 0.7
9 0.65
10 0.61
11 0.58
12 0.54
13 0.54
14 0.54
15 0.53
16 0.46
17 0.46
18 0.43
19 0.35
20 0.36
21 0.3
22 0.26
23 0.33
24 0.42
25 0.44
26 0.52
27 0.63
28 0.65
29 0.71
30 0.77
31 0.76
32 0.79
33 0.85
34 0.87
35 0.86
36 0.86
37 0.8
38 0.78
39 0.71
40 0.61
41 0.58
42 0.49
43 0.44
44 0.43
45 0.46
46 0.41
47 0.44
48 0.5
49 0.49
50 0.52
51 0.52
52 0.53
53 0.51
54 0.5
55 0.52
56 0.47
57 0.42
58 0.38
59 0.34
60 0.26
61 0.24
62 0.26
63 0.19
64 0.17
65 0.17
66 0.16
67 0.17
68 0.19
69 0.21
70 0.24
71 0.26
72 0.35
73 0.43
74 0.52
75 0.61
76 0.67
77 0.73
78 0.73
79 0.8
80 0.82
81 0.84
82 0.85
83 0.83
84 0.84
85 0.84
86 0.84
87 0.82
88 0.77
89 0.67
90 0.61
91 0.59
92 0.57
93 0.53
94 0.52
95 0.47
96 0.43
97 0.49
98 0.48
99 0.42
100 0.45
101 0.41
102 0.42
103 0.47
104 0.52
105 0.51
106 0.57
107 0.65
108 0.62
109 0.68
110 0.69
111 0.66
112 0.62
113 0.57
114 0.52
115 0.45
116 0.42
117 0.37
118 0.28
119 0.23
120 0.21
121 0.21
122 0.22
123 0.2
124 0.21
125 0.26
126 0.28
127 0.31
128 0.35
129 0.38
130 0.38
131 0.46
132 0.51
133 0.51
134 0.6
135 0.57
136 0.57
137 0.54
138 0.52
139 0.45
140 0.37
141 0.3
142 0.22
143 0.22
144 0.19
145 0.18
146 0.15
147 0.18
148 0.16
149 0.16
150 0.15
151 0.17
152 0.16
153 0.18
154 0.21
155 0.19
156 0.2
157 0.2
158 0.19
159 0.18
160 0.19
161 0.17
162 0.14
163 0.14
164 0.12
165 0.13
166 0.12
167 0.17
168 0.23
169 0.25
170 0.28
171 0.35
172 0.4
173 0.4
174 0.43
175 0.43
176 0.46
177 0.48
178 0.51
179 0.52
180 0.54
181 0.57
182 0.62
183 0.59
184 0.57
185 0.56
186 0.55
187 0.5
188 0.47
189 0.44
190 0.37
191 0.35
192 0.28
193 0.26
194 0.2
195 0.18
196 0.15
197 0.17
198 0.19
199 0.17
200 0.17
201 0.17
202 0.16
203 0.15
204 0.14
205 0.11
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.07
214 0.09
215 0.09
216 0.09
217 0.12
218 0.12
219 0.14
220 0.15
221 0.14
222 0.17
223 0.18
224 0.18
225 0.16
226 0.18
227 0.16
228 0.15
229 0.15
230 0.11
231 0.1
232 0.09
233 0.08
234 0.06
235 0.06
236 0.05
237 0.05
238 0.04
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.03
245 0.02
246 0.02
247 0.02
248 0.04
249 0.04
250 0.07
251 0.08
252 0.09
253 0.14
254 0.14
255 0.22
256 0.24
257 0.32
258 0.4
259 0.42
260 0.45
261 0.45
262 0.47
263 0.44
264 0.43
265 0.36
266 0.28
267 0.27
268 0.24
269 0.2
270 0.18
271 0.16
272 0.17
273 0.17
274 0.14
275 0.14
276 0.13
277 0.16
278 0.17
279 0.18
280 0.15
281 0.14
282 0.16
283 0.17
284 0.17
285 0.14
286 0.13
287 0.11
288 0.11
289 0.11
290 0.09
291 0.09
292 0.08
293 0.09
294 0.1
295 0.1
296 0.1
297 0.1
298 0.14
299 0.14
300 0.15
301 0.15
302 0.13
303 0.14
304 0.16
305 0.18
306 0.17
307 0.16
308 0.15
309 0.15
310 0.15
311 0.15
312 0.12
313 0.1
314 0.07
315 0.07
316 0.07
317 0.08
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.07
324 0.08
325 0.08
326 0.11
327 0.1
328 0.11
329 0.1
330 0.12
331 0.11
332 0.11
333 0.12
334 0.1
335 0.11
336 0.13
337 0.17
338 0.19
339 0.21
340 0.2
341 0.22
342 0.25
343 0.28
344 0.34
345 0.33
346 0.32
347 0.34
348 0.36
349 0.33
350 0.3
351 0.28
352 0.21
353 0.18
354 0.16
355 0.13
356 0.11
357 0.11
358 0.14
359 0.12
360 0.11
361 0.1
362 0.1
363 0.1
364 0.1
365 0.11
366 0.08
367 0.08
368 0.09
369 0.1
370 0.1
371 0.1
372 0.1
373 0.09
374 0.08
375 0.09
376 0.07
377 0.07
378 0.07
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.08
383 0.07
384 0.08
385 0.08
386 0.08
387 0.08
388 0.08
389 0.08
390 0.08
391 0.09
392 0.09
393 0.09
394 0.1
395 0.11