Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VHK6

Protein Details
Accession A0A1Y1VHK6    Localization Confidence Low Confidence Score 8.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-35FIPHIPVKHDNRSNNKKNYKAFNSTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto 9.5, cyto_mito 7, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010736  SHIPPO-rpt  
Pfam View protein in Pfam  
PF07004  SHIPPO-rpt  
Amino Acid Sequences MDIGISCINLFIPHIPVKHDNRSNNKKNYKAFNSTAPRFLKSNNDLPGPGYYVDEKDDNYFIFSNKGFGVGFTSSDKRFKNENLYNVGPGKYKIEKLNQYYDNQKTISLKNFKSRIAGTIIPEPTPGPSDYNSVKSEKALLGPNYDKKMNYTFKSRTPRFSKDRHSLPAPGYYKINEEERKPSAISSFKSSGRKKAYSTIIDGPGPGSYFQEQESFNLETKNNGKLVLGLVADKADTSKRRKDVNLGPGYYDIRSGSKISEIINGIKKGQSFTNSKRFSSSDNNIPGPGYYQPINDLRHSFNNNNYHQWI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.24
3 0.32
4 0.39
5 0.48
6 0.54
7 0.58
8 0.65
9 0.75
10 0.8
11 0.82
12 0.85
13 0.83
14 0.83
15 0.84
16 0.82
17 0.79
18 0.72
19 0.71
20 0.72
21 0.67
22 0.67
23 0.6
24 0.55
25 0.48
26 0.47
27 0.46
28 0.42
29 0.47
30 0.43
31 0.42
32 0.4
33 0.4
34 0.39
35 0.32
36 0.27
37 0.21
38 0.18
39 0.17
40 0.19
41 0.18
42 0.17
43 0.17
44 0.18
45 0.16
46 0.17
47 0.17
48 0.15
49 0.17
50 0.16
51 0.16
52 0.14
53 0.16
54 0.13
55 0.12
56 0.15
57 0.12
58 0.14
59 0.15
60 0.19
61 0.2
62 0.26
63 0.27
64 0.26
65 0.3
66 0.32
67 0.39
68 0.42
69 0.45
70 0.46
71 0.47
72 0.47
73 0.45
74 0.42
75 0.33
76 0.28
77 0.27
78 0.23
79 0.25
80 0.27
81 0.33
82 0.38
83 0.42
84 0.5
85 0.48
86 0.48
87 0.52
88 0.5
89 0.45
90 0.38
91 0.36
92 0.31
93 0.31
94 0.36
95 0.36
96 0.36
97 0.41
98 0.43
99 0.42
100 0.42
101 0.39
102 0.33
103 0.31
104 0.3
105 0.24
106 0.27
107 0.27
108 0.23
109 0.23
110 0.2
111 0.17
112 0.17
113 0.15
114 0.1
115 0.1
116 0.14
117 0.16
118 0.2
119 0.21
120 0.2
121 0.2
122 0.18
123 0.2
124 0.16
125 0.17
126 0.18
127 0.17
128 0.19
129 0.22
130 0.26
131 0.26
132 0.27
133 0.24
134 0.22
135 0.28
136 0.3
137 0.28
138 0.32
139 0.32
140 0.39
141 0.49
142 0.49
143 0.5
144 0.52
145 0.57
146 0.56
147 0.6
148 0.61
149 0.58
150 0.61
151 0.58
152 0.53
153 0.49
154 0.44
155 0.46
156 0.39
157 0.33
158 0.29
159 0.25
160 0.24
161 0.23
162 0.28
163 0.22
164 0.22
165 0.26
166 0.27
167 0.29
168 0.27
169 0.25
170 0.23
171 0.24
172 0.24
173 0.24
174 0.26
175 0.29
176 0.38
177 0.4
178 0.44
179 0.47
180 0.48
181 0.44
182 0.47
183 0.49
184 0.43
185 0.46
186 0.43
187 0.39
188 0.36
189 0.34
190 0.27
191 0.21
192 0.19
193 0.14
194 0.11
195 0.09
196 0.1
197 0.1
198 0.13
199 0.13
200 0.13
201 0.17
202 0.17
203 0.17
204 0.19
205 0.19
206 0.2
207 0.22
208 0.24
209 0.21
210 0.19
211 0.18
212 0.16
213 0.17
214 0.15
215 0.13
216 0.1
217 0.1
218 0.1
219 0.09
220 0.08
221 0.09
222 0.11
223 0.17
224 0.23
225 0.31
226 0.36
227 0.42
228 0.45
229 0.52
230 0.56
231 0.61
232 0.63
233 0.56
234 0.52
235 0.49
236 0.48
237 0.4
238 0.32
239 0.23
240 0.16
241 0.17
242 0.16
243 0.14
244 0.15
245 0.17
246 0.16
247 0.2
248 0.21
249 0.25
250 0.31
251 0.31
252 0.3
253 0.3
254 0.3
255 0.28
256 0.29
257 0.3
258 0.31
259 0.38
260 0.47
261 0.49
262 0.49
263 0.51
264 0.49
265 0.49
266 0.5
267 0.49
268 0.48
269 0.51
270 0.51
271 0.47
272 0.46
273 0.41
274 0.33
275 0.28
276 0.23
277 0.17
278 0.17
279 0.21
280 0.27
281 0.3
282 0.32
283 0.34
284 0.36
285 0.42
286 0.49
287 0.48
288 0.51
289 0.57
290 0.56