Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VNQ9

Protein Details
Accession A0A1Y1VNQ9    Localization Confidence High Confidence Score 21.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-29MLRTIKPKNARSKRALKAREPKVEENPKQHydrophilic
241-263KEATKIPKEKQAKKVKNVSHNEIHydrophilic
277-303FDTLQTRKMKALKKKFKKDEDDNEGPAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-22KPKNARSKRALKAREPK
283-295RKMKALKKKFKKD
303-308ASKKAK
Subcellular Location(s) nucl 21, mito_nucl 13.333, cyto_nucl 11.833, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR039770  Rpf2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0008097  F:5S rRNA binding  
GO:0008312  F:7S RNA binding  
GO:1902626  P:assembly of large subunit precursor of preribosome  
GO:0000466  P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MLRTIKPKNARSKRALKAREPKVEENPKQAIFIRGSSTNQVVNTALSDLCSIKKPYSTMFSKKNVIHPFEDQSSLEFFSQKNDASLFCIGSSSKKRPNNLVFVRMFDYQVLDMIELGIENFKSLHEFKSSKSSIGMKPLFIFNGELFEQREEYKKLKNMLLDFFRDEVAESVNLKGLEYIISVTAEPVANPTDLGKIFFRVYTIQMKKSGTKQPRIELEEMGPSFDFVFRRNRFAGEDVMKEATKIPKEKQAKKVKNVSHNEIGDKMGRIHMKKQNFDTLQTRKMKALKKKFKKDEDDNEGPASKKAKAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.86
3 0.85
4 0.85
5 0.85
6 0.86
7 0.83
8 0.8
9 0.8
10 0.83
11 0.77
12 0.74
13 0.71
14 0.62
15 0.57
16 0.52
17 0.47
18 0.38
19 0.35
20 0.31
21 0.28
22 0.29
23 0.3
24 0.3
25 0.28
26 0.25
27 0.25
28 0.21
29 0.18
30 0.17
31 0.15
32 0.12
33 0.1
34 0.11
35 0.11
36 0.12
37 0.16
38 0.17
39 0.18
40 0.21
41 0.21
42 0.24
43 0.3
44 0.36
45 0.4
46 0.45
47 0.49
48 0.54
49 0.55
50 0.61
51 0.6
52 0.57
53 0.52
54 0.49
55 0.48
56 0.43
57 0.42
58 0.33
59 0.28
60 0.25
61 0.23
62 0.2
63 0.16
64 0.14
65 0.15
66 0.17
67 0.16
68 0.15
69 0.14
70 0.14
71 0.16
72 0.17
73 0.15
74 0.12
75 0.13
76 0.12
77 0.17
78 0.23
79 0.27
80 0.34
81 0.39
82 0.42
83 0.5
84 0.55
85 0.59
86 0.57
87 0.59
88 0.51
89 0.48
90 0.49
91 0.41
92 0.35
93 0.25
94 0.22
95 0.13
96 0.14
97 0.11
98 0.08
99 0.07
100 0.06
101 0.06
102 0.04
103 0.04
104 0.04
105 0.03
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.07
110 0.08
111 0.1
112 0.15
113 0.16
114 0.17
115 0.26
116 0.27
117 0.25
118 0.26
119 0.3
120 0.26
121 0.34
122 0.34
123 0.25
124 0.25
125 0.25
126 0.23
127 0.18
128 0.18
129 0.09
130 0.11
131 0.11
132 0.11
133 0.11
134 0.11
135 0.11
136 0.11
137 0.14
138 0.14
139 0.15
140 0.19
141 0.22
142 0.25
143 0.26
144 0.28
145 0.28
146 0.3
147 0.3
148 0.28
149 0.25
150 0.22
151 0.21
152 0.17
153 0.15
154 0.11
155 0.09
156 0.08
157 0.08
158 0.07
159 0.09
160 0.09
161 0.09
162 0.08
163 0.07
164 0.07
165 0.06
166 0.06
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.08
179 0.09
180 0.09
181 0.11
182 0.11
183 0.12
184 0.12
185 0.12
186 0.13
187 0.12
188 0.15
189 0.22
190 0.25
191 0.26
192 0.29
193 0.31
194 0.34
195 0.39
196 0.45
197 0.43
198 0.49
199 0.51
200 0.54
201 0.59
202 0.61
203 0.56
204 0.49
205 0.42
206 0.4
207 0.35
208 0.3
209 0.22
210 0.18
211 0.16
212 0.17
213 0.16
214 0.11
215 0.21
216 0.22
217 0.27
218 0.28
219 0.29
220 0.29
221 0.31
222 0.36
223 0.3
224 0.31
225 0.28
226 0.3
227 0.28
228 0.25
229 0.26
230 0.25
231 0.27
232 0.29
233 0.29
234 0.37
235 0.47
236 0.55
237 0.62
238 0.68
239 0.72
240 0.77
241 0.84
242 0.82
243 0.82
244 0.81
245 0.79
246 0.76
247 0.69
248 0.63
249 0.54
250 0.48
251 0.41
252 0.34
253 0.28
254 0.25
255 0.28
256 0.28
257 0.36
258 0.41
259 0.47
260 0.52
261 0.56
262 0.61
263 0.57
264 0.6
265 0.6
266 0.6
267 0.61
268 0.62
269 0.58
270 0.54
271 0.6
272 0.63
273 0.64
274 0.68
275 0.7
276 0.74
277 0.84
278 0.88
279 0.91
280 0.92
281 0.92
282 0.91
283 0.9
284 0.86
285 0.78
286 0.72
287 0.65
288 0.56
289 0.49
290 0.42