Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VA72

Protein Details
Accession A0A1Y1VA72    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
102-121FPGKCCLKDKRNTINENNKYHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040204  UBR7  
IPR047506  UBR7-like_UBR-box  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR003126  Znf_UBR  
Gene Ontology GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00628  PHD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01359  ZF_PHD_1  
PS50016  ZF_PHD_2  
PS51157  ZF_UBR  
CDD cd15542  PHD_UBR7  
cd19677  UBR-box_UBR7  
Amino Acid Sequences MEDNKSKSDNENDNKENYVTAVDYLLKQEELEKEAKEVLSKKFDKCTYDLGYIKQQVYVCLTCTNGNAGFCYSCSIACHSQHDVRELFSKRNFRCDCGNSKFPGKCCLKDKRNTINENNKYGQNFIGRFCWCNKEYNPDEDELMFQCNICEEWYHISCITENKEKISEDFDDYICRDCVDKYKFIKKYKFMKKLYFIPYNENKINENNIIEQNDSRDKKRKFDVIDSKDEDTNNHIDTNKRIKDEFKKEMNCIKTNEFENKIEKNGVKSIDTANEKILKNIDENPVDVVNDDEECLLNLSSMNEFELNQRYDVFCNDKFNTIFCKCNNCKEEYIKNNLNFLIEDDLTYEPEEDDDLDGTLFERGVKVLNHASRVPLIECISGYNKLKDKLTDYFKEFAEQKKVVTDEDIKYFFDNFNA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.53
3 0.44
4 0.34
5 0.28
6 0.19
7 0.16
8 0.15
9 0.14
10 0.15
11 0.17
12 0.18
13 0.16
14 0.15
15 0.19
16 0.19
17 0.22
18 0.24
19 0.22
20 0.22
21 0.25
22 0.26
23 0.27
24 0.29
25 0.31
26 0.38
27 0.42
28 0.44
29 0.5
30 0.53
31 0.53
32 0.51
33 0.53
34 0.48
35 0.51
36 0.5
37 0.45
38 0.5
39 0.5
40 0.47
41 0.44
42 0.38
43 0.33
44 0.36
45 0.33
46 0.26
47 0.22
48 0.23
49 0.2
50 0.21
51 0.23
52 0.19
53 0.19
54 0.18
55 0.18
56 0.17
57 0.16
58 0.18
59 0.14
60 0.13
61 0.14
62 0.18
63 0.22
64 0.24
65 0.28
66 0.3
67 0.35
68 0.37
69 0.4
70 0.35
71 0.32
72 0.37
73 0.36
74 0.37
75 0.38
76 0.46
77 0.42
78 0.52
79 0.52
80 0.47
81 0.53
82 0.53
83 0.56
84 0.54
85 0.59
86 0.52
87 0.58
88 0.59
89 0.52
90 0.55
91 0.5
92 0.49
93 0.51
94 0.58
95 0.59
96 0.64
97 0.72
98 0.73
99 0.77
100 0.78
101 0.8
102 0.8
103 0.78
104 0.76
105 0.69
106 0.62
107 0.53
108 0.47
109 0.4
110 0.35
111 0.3
112 0.25
113 0.28
114 0.26
115 0.27
116 0.28
117 0.32
118 0.27
119 0.32
120 0.32
121 0.36
122 0.38
123 0.42
124 0.41
125 0.35
126 0.35
127 0.29
128 0.29
129 0.21
130 0.19
131 0.13
132 0.11
133 0.1
134 0.09
135 0.09
136 0.08
137 0.07
138 0.07
139 0.12
140 0.13
141 0.15
142 0.15
143 0.15
144 0.16
145 0.19
146 0.22
147 0.23
148 0.23
149 0.23
150 0.25
151 0.25
152 0.25
153 0.25
154 0.23
155 0.19
156 0.2
157 0.19
158 0.18
159 0.18
160 0.2
161 0.16
162 0.14
163 0.12
164 0.1
165 0.18
166 0.2
167 0.26
168 0.29
169 0.39
170 0.46
171 0.53
172 0.59
173 0.59
174 0.67
175 0.71
176 0.75
177 0.71
178 0.71
179 0.68
180 0.7
181 0.69
182 0.66
183 0.56
184 0.54
185 0.54
186 0.53
187 0.49
188 0.42
189 0.36
190 0.3
191 0.32
192 0.25
193 0.21
194 0.17
195 0.17
196 0.17
197 0.16
198 0.15
199 0.15
200 0.21
201 0.22
202 0.23
203 0.31
204 0.32
205 0.36
206 0.4
207 0.43
208 0.4
209 0.48
210 0.55
211 0.51
212 0.58
213 0.56
214 0.53
215 0.49
216 0.45
217 0.36
218 0.28
219 0.25
220 0.18
221 0.16
222 0.16
223 0.15
224 0.2
225 0.29
226 0.29
227 0.29
228 0.29
229 0.34
230 0.42
231 0.5
232 0.52
233 0.51
234 0.51
235 0.53
236 0.59
237 0.59
238 0.53
239 0.48
240 0.42
241 0.38
242 0.38
243 0.4
244 0.37
245 0.34
246 0.35
247 0.33
248 0.32
249 0.33
250 0.31
251 0.27
252 0.27
253 0.26
254 0.22
255 0.22
256 0.22
257 0.24
258 0.26
259 0.24
260 0.24
261 0.29
262 0.28
263 0.28
264 0.28
265 0.23
266 0.22
267 0.26
268 0.28
269 0.22
270 0.23
271 0.23
272 0.22
273 0.21
274 0.18
275 0.14
276 0.09
277 0.09
278 0.08
279 0.07
280 0.06
281 0.06
282 0.07
283 0.07
284 0.06
285 0.06
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.08
290 0.08
291 0.08
292 0.11
293 0.17
294 0.18
295 0.18
296 0.19
297 0.19
298 0.2
299 0.23
300 0.25
301 0.21
302 0.27
303 0.28
304 0.31
305 0.3
306 0.31
307 0.36
308 0.33
309 0.36
310 0.32
311 0.41
312 0.4
313 0.49
314 0.51
315 0.48
316 0.51
317 0.53
318 0.61
319 0.56
320 0.63
321 0.61
322 0.58
323 0.57
324 0.52
325 0.45
326 0.35
327 0.3
328 0.26
329 0.18
330 0.16
331 0.15
332 0.15
333 0.15
334 0.15
335 0.14
336 0.09
337 0.09
338 0.1
339 0.08
340 0.09
341 0.08
342 0.08
343 0.07
344 0.07
345 0.08
346 0.08
347 0.07
348 0.06
349 0.06
350 0.06
351 0.1
352 0.1
353 0.14
354 0.22
355 0.25
356 0.29
357 0.29
358 0.31
359 0.3
360 0.32
361 0.29
362 0.25
363 0.23
364 0.21
365 0.2
366 0.22
367 0.22
368 0.27
369 0.29
370 0.32
371 0.36
372 0.38
373 0.41
374 0.41
375 0.43
376 0.46
377 0.51
378 0.51
379 0.51
380 0.51
381 0.48
382 0.51
383 0.49
384 0.47
385 0.48
386 0.42
387 0.38
388 0.4
389 0.41
390 0.36
391 0.39
392 0.39
393 0.34
394 0.4
395 0.41
396 0.35
397 0.36
398 0.36