FuNGI

A0A1Y1VJU2

Protein Details

Accession

A0A1Y1VJU2

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
591-627	RSSKTNTSSNKRQSRRSRSRSRNHSRHRNRSNSVSSN	Hydrophilic
648-723	ISTSHNRRERARERNREKDRNGRHKRDSSTRHYSTSSRHSSQSRRQRSRSRSSYNNSHSKSKSRSRSPHSNHSNES	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
598-619	SSNKRQSRRSRSRSRNHSRHRN
654-675	RRERARERNREKDRNGRHKRDS
692-696	RQRSR
707-713	KSKSRSR

Subcellular Location(s)

nucl 26, cyto_nucl 14.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR034772 CPSF6/7 IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12372 RRM_CFIm68_CFIm59

Amino Acid Sequences

MADDENFDLYGDDNFENGDDGDMDNLYDDLLENEDIPEIATNTYDDDDELNYDDVDPEINGDNDKDAVNDKKEEIEEEVKENIENNINNIEDNIDTNDNNTMDVDKKSTFNKNEINNSNNHSNNINNNHNNYNSSHSHPVQTLDTFENKSNQKMNENQGYGGKKNKGSNIFPMMRNNNGITKAVYVGGLNWWTTDEDLRQVSLKAGVLNKLVAKEITFHEYKVNGKSRGIAYLEFEDIESAEVFSKYVEANEIQGKKAEIRFVSPQQHGNPFRIIPKDPKEMRAEAAARNEQMGNVNMPRINHNNFNNMNMHSGRGRPYAKPGMNGRGNMSMMGPNGGNLRPPPFPQPGFNFPEQDFYGPMNGYEPMHGSFGPRPFMGNNGMGRGFGRGQGVMPGPFAPPHNDGGFPDQPFNGRNMNMNNNTSNSNNGIHVNRMNSNNSINGNNMHGNRMNSSNNNNNNNSNNNNNNNFNGHMKFFDGQNGGNSNNNNNSNNNRDQMDYQMNDDNMSDTSKDNNNRWEHGNHENQEFRHSNGPRNYQNRNRSFNNSRNNNESREGNYQNQSSKSDANDNFENNSMNGMNGNTSKSEKRESRSSKTNTSSNKRQSRRSRSRSRNHSRHRNRSNSVSSNEENNDKNDIDNENESDNPNVISTSHNRRERARERNREKDRNGRHKRDSSTRHYSTSSRHSSQSRRQRSRSRSSYNNSHSKSKSRSRSPHSNHSNESRSRSRSYSRSRSRSVSRSTSRSENKKHSLTASSGNGGNTSNSSTKHYRSEHSRITGRKHSSSFVSNSVTIAGIGSKDSKSRMASDSKTSSGRDSTLERRRERHGK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.11
2	0.11
3	0.12
4	0.11
5	0.11
6	0.08
7	0.08
8	0.09
9	0.09
10	0.09
11	0.08
12	0.08
13	0.07
14	0.06
15	0.06
16	0.06
17	0.08
18	0.08
19	0.08
20	0.09
21	0.1
22	0.09
23	0.1
24	0.1
25	0.09
26	0.09
27	0.09
28	0.09
29	0.1
30	0.12
31	0.11
32	0.1
33	0.11
34	0.11
35	0.12
36	0.14
37	0.13
38	0.12
39	0.12
40	0.12
41	0.11
42	0.11
43	0.09
44	0.09
45	0.1
46	0.11
47	0.12
48	0.12
49	0.13
50	0.13
51	0.14
52	0.13
53	0.16
54	0.21
55	0.24
56	0.26
57	0.26
58	0.3
59	0.3
60	0.31
61	0.32
62	0.32
63	0.3
64	0.31
65	0.32
66	0.27
67	0.27
68	0.26
69	0.23
70	0.23
71	0.21
72	0.2
73	0.22
74	0.22
75	0.21
76	0.21
77	0.19
78	0.14
79	0.15
80	0.16
81	0.15
82	0.14
83	0.16
84	0.19
85	0.18
86	0.18
87	0.17
88	0.15
89	0.16
90	0.17
91	0.2
92	0.18
93	0.21
94	0.26
95	0.35
96	0.36
97	0.41
98	0.46
99	0.5
100	0.58
101	0.62
102	0.6
103	0.55
104	0.57
105	0.58
106	0.52
107	0.47
108	0.39
109	0.36
110	0.41
111	0.44
112	0.48
113	0.45
114	0.47
115	0.5
116	0.49
117	0.48
118	0.42
119	0.41
120	0.35
121	0.35
122	0.38
123	0.35
124	0.37
125	0.36
126	0.36
127	0.33
128	0.31
129	0.28
130	0.24
131	0.27
132	0.26
133	0.27
134	0.31
135	0.3
136	0.34
137	0.36
138	0.36
139	0.38
140	0.42
141	0.48
142	0.5
143	0.49
144	0.46
145	0.47
146	0.48
147	0.45
148	0.45
149	0.43
150	0.39
151	0.42
152	0.48
153	0.48
154	0.47
155	0.52
156	0.53
157	0.53
158	0.51
159	0.56
160	0.52
161	0.48
162	0.48
163	0.42
164	0.37
165	0.33
166	0.31
167	0.24
168	0.21
169	0.2
170	0.17
171	0.16
172	0.11
173	0.1
174	0.12
175	0.12
176	0.1
177	0.1
178	0.1
179	0.1
180	0.11
181	0.12
182	0.1
183	0.13
184	0.14
185	0.14
186	0.14
187	0.14
188	0.14
189	0.15
190	0.15
191	0.14
192	0.16
193	0.17
194	0.17
195	0.18
196	0.19
197	0.17
198	0.17
199	0.15
200	0.13
201	0.13
202	0.15
203	0.18
204	0.17
205	0.17
206	0.19
207	0.21
208	0.24
209	0.3
210	0.35
211	0.32
212	0.32
213	0.36
214	0.34
215	0.36
216	0.34
217	0.27
218	0.22
219	0.22
220	0.22
221	0.18
222	0.17
223	0.12
224	0.11
225	0.11
226	0.08
227	0.06
228	0.07
229	0.06
230	0.07
231	0.06
232	0.07
233	0.06
234	0.07
235	0.08
236	0.07
237	0.1
238	0.17
239	0.18
240	0.18
241	0.19
242	0.19
243	0.21
244	0.23
245	0.24
246	0.18
247	0.21
248	0.26
249	0.31
250	0.37
251	0.36
252	0.39
253	0.39
254	0.47
255	0.45
256	0.42
257	0.38
258	0.33
259	0.35
260	0.34
261	0.33
262	0.32
263	0.36
264	0.43
265	0.42
266	0.46
267	0.46
268	0.44
269	0.42
270	0.41
271	0.37
272	0.3
273	0.34
274	0.31
275	0.26
276	0.26
277	0.25
278	0.19
279	0.19
280	0.17
281	0.14
282	0.12
283	0.14
284	0.14
285	0.14
286	0.18
287	0.21
288	0.23
289	0.28
290	0.29
291	0.35
292	0.34
293	0.37
294	0.35
295	0.31
296	0.32
297	0.25
298	0.25
299	0.18
300	0.19
301	0.19
302	0.23
303	0.24
304	0.21
305	0.28
306	0.35
307	0.35
308	0.39
309	0.39
310	0.42
311	0.43
312	0.43
313	0.38
314	0.33
315	0.31
316	0.26
317	0.23
318	0.16
319	0.13
320	0.13
321	0.1
322	0.08
323	0.1
324	0.09
325	0.1
326	0.09
327	0.12
328	0.13
329	0.14
330	0.19
331	0.22
332	0.24
333	0.27
334	0.31
335	0.35
336	0.38
337	0.38
338	0.35
339	0.3
340	0.33
341	0.29
342	0.25
343	0.19
344	0.15
345	0.15
346	0.13
347	0.12
348	0.09
349	0.09
350	0.09
351	0.08
352	0.09
353	0.08
354	0.09
355	0.09
356	0.1
357	0.13
358	0.15
359	0.16
360	0.15
361	0.15
362	0.14
363	0.16
364	0.17
365	0.17
366	0.16
367	0.16
368	0.16
369	0.15
370	0.15
371	0.15
372	0.12
373	0.1
374	0.1
375	0.08
376	0.08
377	0.1
378	0.11
379	0.1
380	0.1
381	0.09
382	0.08
383	0.09
384	0.1
385	0.11
386	0.12
387	0.14
388	0.14
389	0.14
390	0.14
391	0.2
392	0.22
393	0.19
394	0.18
395	0.16
396	0.17
397	0.17
398	0.18
399	0.14
400	0.12
401	0.14
402	0.16
403	0.22
404	0.24
405	0.25
406	0.24
407	0.23
408	0.25
409	0.22
410	0.2
411	0.16
412	0.14
413	0.13
414	0.15
415	0.14
416	0.14
417	0.15
418	0.16
419	0.17
420	0.19
421	0.19
422	0.18
423	0.19
424	0.19
425	0.19
426	0.18
427	0.15
428	0.14
429	0.15
430	0.17
431	0.16
432	0.16
433	0.17
434	0.17
435	0.17
436	0.2
437	0.2
438	0.19
439	0.23
440	0.29
441	0.34
442	0.38
443	0.39
444	0.38
445	0.39
446	0.4
447	0.38
448	0.35
449	0.34
450	0.34
451	0.36
452	0.34
453	0.33
454	0.31
455	0.3
456	0.27
457	0.23
458	0.19
459	0.16
460	0.16
461	0.16
462	0.14
463	0.17
464	0.15
465	0.14
466	0.15
467	0.17
468	0.16
469	0.17
470	0.18
471	0.16
472	0.2
473	0.23
474	0.22
475	0.23
476	0.26
477	0.29
478	0.31
479	0.31
480	0.27
481	0.25
482	0.25
483	0.27
484	0.28
485	0.23
486	0.23
487	0.23
488	0.22
489	0.21
490	0.21
491	0.17
492	0.12
493	0.12
494	0.1
495	0.08
496	0.11
497	0.16
498	0.2
499	0.22
500	0.3
501	0.32
502	0.33
503	0.36
504	0.34
505	0.33
506	0.37
507	0.42
508	0.37
509	0.38
510	0.39
511	0.36
512	0.41
513	0.38
514	0.32
515	0.33
516	0.32
517	0.36
518	0.39
519	0.46
520	0.47
521	0.52
522	0.59
523	0.59
524	0.68
525	0.68
526	0.68
527	0.65
528	0.66
529	0.68
530	0.67
531	0.69
532	0.66
533	0.62
534	0.63
535	0.62
536	0.57
537	0.52
538	0.46
539	0.41
540	0.4
541	0.4
542	0.37
543	0.38
544	0.38
545	0.38
546	0.38
547	0.35
548	0.31
549	0.3
550	0.27
551	0.32
552	0.3
553	0.32
554	0.32
555	0.32
556	0.3
557	0.29
558	0.28
559	0.19
560	0.19
561	0.14
562	0.11
563	0.1
564	0.09
565	0.1
566	0.1
567	0.11
568	0.11
569	0.14
570	0.17
571	0.19
572	0.27
573	0.3
574	0.34
575	0.44
576	0.5
577	0.54
578	0.61
579	0.64
580	0.65
581	0.65
582	0.66
583	0.65
584	0.66
585	0.69
586	0.69
587	0.74
588	0.71
589	0.76
590	0.8
591	0.82
592	0.85
593	0.85
594	0.86
595	0.86
596	0.91
597	0.93
598	0.93
599	0.93
600	0.92
601	0.93
602	0.93
603	0.93
604	0.93
605	0.91
606	0.85
607	0.83
608	0.81
609	0.76
610	0.68
611	0.64
612	0.55
613	0.51
614	0.48
615	0.44
616	0.36
617	0.32
618	0.32
619	0.26
620	0.25
621	0.22
622	0.22
623	0.2
624	0.21
625	0.21
626	0.19
627	0.2
628	0.21
629	0.19
630	0.17
631	0.15
632	0.12
633	0.11
634	0.1
635	0.12
636	0.17
637	0.27
638	0.35
639	0.41
640	0.44
641	0.49
642	0.59
643	0.64
644	0.7
645	0.7
646	0.73
647	0.76
648	0.84
649	0.9
650	0.89
651	0.87
652	0.86
653	0.86
654	0.86
655	0.88
656	0.86
657	0.85
658	0.83
659	0.84
660	0.84
661	0.81
662	0.79
663	0.78
664	0.72
665	0.67
666	0.62
667	0.58
668	0.54
669	0.55
670	0.55
671	0.47
672	0.49
673	0.53
674	0.59
675	0.65
676	0.7
677	0.71
678	0.73
679	0.79
680	0.83
681	0.85
682	0.87
683	0.87
684	0.85
685	0.83
686	0.82
687	0.83
688	0.82
689	0.83
690	0.76
691	0.74
692	0.7
693	0.69
694	0.7
695	0.69
696	0.7
697	0.71
698	0.76
699	0.77
700	0.84
701	0.83
702	0.85
703	0.85
704	0.82
705	0.78
706	0.76
707	0.76
708	0.7
709	0.7
710	0.67
711	0.62
712	0.59
713	0.59
714	0.58
715	0.59
716	0.64
717	0.68
718	0.7
719	0.74
720	0.75
721	0.77
722	0.79
723	0.77
724	0.75
725	0.74
726	0.71
727	0.69
728	0.69
729	0.71
730	0.72
731	0.73
732	0.74
733	0.74
734	0.74
735	0.73
736	0.71
737	0.65
738	0.61
739	0.54
740	0.53
741	0.47
742	0.41
743	0.39
744	0.35
745	0.32
746	0.28
747	0.25
748	0.19
749	0.19
750	0.19
751	0.19
752	0.25
753	0.29
754	0.32
755	0.4
756	0.42
757	0.46
758	0.52
759	0.6
760	0.62
761	0.65
762	0.69
763	0.67
764	0.71
765	0.73
766	0.71
767	0.68
768	0.63
769	0.58
770	0.55
771	0.56
772	0.52
773	0.48
774	0.45
775	0.38
776	0.36
777	0.33
778	0.28
779	0.21
780	0.18
781	0.13
782	0.09
783	0.1
784	0.12
785	0.13
786	0.15
787	0.18
788	0.22
789	0.24
790	0.28
791	0.32
792	0.37
793	0.4
794	0.46
795	0.49
796	0.49
797	0.5
798	0.48
799	0.46
800	0.41
801	0.39
802	0.34
803	0.35
804	0.41
805	0.46
806	0.54
807	0.56
808	0.57

A0A1Y1VJU2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer