Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1V5X9

Protein Details
Accession A0A1Y1V5X9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-56HNNNYQRQKMKNSNMMNRNDSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
492-506EKKETSKKDIPKKEP
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045117  ATXN2-like  
IPR009604  LsmAD_domain  
IPR025852  SM_dom_ATX  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06741  LsmAD  
PF14438  SM-ATX  
Amino Acid Sequences MNTRKSNNGNERMQGGRSRGNQRKDHFREGGMNSFHNNNYQRQKMKNSNMMNRNDSFSKSQERYENKDSDFPALGETPDRRMHDRLLFVIMNMVGTKVEVTTKNGTVIEGILHGTNTESELGVCLKMAKNITGENSQNNSYIPNLIIMGKDLAQISVTNLELNKQERMSSRDTFKTDLAISGKTGEIFERQLQKWEPEKDNYDVSLELTDDGNEKWDQFATNEKLFGITTDYDEEIYTTALDRTKADFKKREQEAIKIAAEIEKASTENIHLAEERGQLIDDADIDEEDRYGAVIRKPGKYVPPNLRKQMEANKQSNKQNTFEQKKDKDSKAKTEQKSNDNKNKSTTTTNTSTTTTTTSNNTNNKDTESKTASVNASSNNNTNASAVKGPLAKIEKKTNYNEASNKSGTNQNNIQEELINHFRQFSKKEKEHLQQKKQAIMKKEKEGIFSEFKLFSESFKLPELKDLPSDKDLLDSADKTGKELYKANIEKEKKETSKKDIPKKEPANNKQPNLKKSITIPPNNDDSLNNNVTLSASAASTNTTKQNSSSKSVKTPVSAQASSALGKTDSKNESADQKNKNNNDMTVSASVNSTASTESKSTSFKFNIEAREFKPNPSATEFVPSKNLSQKGSSQSSNEKGNIFNKRNQKGNISIHSIFVKGFLKTNNQNTKNNNANINQGSATWNYGSKPFKSQFSVSYDDAMYQPMDQQFGYYIQPIPYQGHPVIRRPYIPISMQPGYPVNYVPAPAYAAPMTHNRPVYPPNMMGPPMAARIYQGPVIVPTYPTEMIPQFSNTVMIPQQPIVIDPGMIPTAQGMPQVYIADQMMAEVPPEQQQQS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.45
3 0.44
4 0.47
5 0.55
6 0.59
7 0.65
8 0.69
9 0.71
10 0.78
11 0.78
12 0.79
13 0.72
14 0.67
15 0.67
16 0.64
17 0.65
18 0.57
19 0.51
20 0.44
21 0.44
22 0.41
23 0.4
24 0.39
25 0.39
26 0.44
27 0.51
28 0.56
29 0.58
30 0.68
31 0.7
32 0.76
33 0.77
34 0.77
35 0.79
36 0.8
37 0.81
38 0.77
39 0.68
40 0.64
41 0.57
42 0.52
43 0.45
44 0.42
45 0.45
46 0.41
47 0.45
48 0.48
49 0.53
50 0.57
51 0.61
52 0.63
53 0.57
54 0.61
55 0.56
56 0.52
57 0.47
58 0.38
59 0.34
60 0.28
61 0.25
62 0.24
63 0.24
64 0.25
65 0.28
66 0.32
67 0.33
68 0.35
69 0.4
70 0.41
71 0.43
72 0.39
73 0.39
74 0.36
75 0.32
76 0.32
77 0.25
78 0.2
79 0.17
80 0.15
81 0.09
82 0.09
83 0.09
84 0.06
85 0.11
86 0.12
87 0.17
88 0.21
89 0.23
90 0.26
91 0.26
92 0.25
93 0.21
94 0.2
95 0.16
96 0.12
97 0.12
98 0.09
99 0.09
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.07
106 0.07
107 0.09
108 0.1
109 0.09
110 0.09
111 0.11
112 0.12
113 0.15
114 0.17
115 0.17
116 0.18
117 0.21
118 0.24
119 0.27
120 0.29
121 0.31
122 0.33
123 0.33
124 0.31
125 0.29
126 0.27
127 0.22
128 0.21
129 0.15
130 0.13
131 0.12
132 0.12
133 0.12
134 0.12
135 0.12
136 0.11
137 0.12
138 0.12
139 0.11
140 0.1
141 0.1
142 0.1
143 0.12
144 0.11
145 0.11
146 0.11
147 0.13
148 0.16
149 0.18
150 0.2
151 0.18
152 0.22
153 0.24
154 0.29
155 0.33
156 0.34
157 0.38
158 0.41
159 0.43
160 0.43
161 0.39
162 0.38
163 0.32
164 0.31
165 0.27
166 0.22
167 0.2
168 0.18
169 0.18
170 0.15
171 0.15
172 0.12
173 0.12
174 0.14
175 0.19
176 0.25
177 0.25
178 0.31
179 0.32
180 0.38
181 0.43
182 0.48
183 0.48
184 0.45
185 0.49
186 0.46
187 0.46
188 0.41
189 0.35
190 0.27
191 0.23
192 0.18
193 0.14
194 0.12
195 0.1
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.11
200 0.1
201 0.1
202 0.1
203 0.11
204 0.11
205 0.11
206 0.19
207 0.22
208 0.23
209 0.23
210 0.22
211 0.22
212 0.21
213 0.21
214 0.16
215 0.11
216 0.11
217 0.13
218 0.13
219 0.13
220 0.13
221 0.13
222 0.09
223 0.09
224 0.08
225 0.06
226 0.08
227 0.09
228 0.1
229 0.11
230 0.14
231 0.23
232 0.28
233 0.36
234 0.41
235 0.45
236 0.54
237 0.56
238 0.61
239 0.54
240 0.55
241 0.52
242 0.5
243 0.45
244 0.35
245 0.33
246 0.25
247 0.23
248 0.18
249 0.13
250 0.08
251 0.08
252 0.08
253 0.08
254 0.07
255 0.09
256 0.09
257 0.1
258 0.09
259 0.1
260 0.13
261 0.14
262 0.14
263 0.12
264 0.11
265 0.1
266 0.1
267 0.09
268 0.07
269 0.06
270 0.05
271 0.05
272 0.06
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.04
277 0.04
278 0.05
279 0.08
280 0.09
281 0.14
282 0.18
283 0.2
284 0.22
285 0.25
286 0.32
287 0.35
288 0.42
289 0.47
290 0.53
291 0.58
292 0.63
293 0.62
294 0.55
295 0.55
296 0.57
297 0.56
298 0.54
299 0.54
300 0.55
301 0.6
302 0.64
303 0.67
304 0.6
305 0.52
306 0.52
307 0.55
308 0.55
309 0.55
310 0.59
311 0.56
312 0.62
313 0.67
314 0.65
315 0.65
316 0.62
317 0.66
318 0.67
319 0.72
320 0.67
321 0.68
322 0.68
323 0.68
324 0.74
325 0.74
326 0.73
327 0.69
328 0.67
329 0.62
330 0.59
331 0.52
332 0.47
333 0.41
334 0.37
335 0.35
336 0.36
337 0.33
338 0.31
339 0.29
340 0.25
341 0.24
342 0.19
343 0.17
344 0.17
345 0.19
346 0.24
347 0.29
348 0.31
349 0.31
350 0.31
351 0.32
352 0.33
353 0.31
354 0.3
355 0.28
356 0.26
357 0.24
358 0.26
359 0.24
360 0.22
361 0.21
362 0.18
363 0.17
364 0.17
365 0.18
366 0.16
367 0.16
368 0.15
369 0.15
370 0.13
371 0.12
372 0.11
373 0.1
374 0.1
375 0.11
376 0.1
377 0.14
378 0.18
379 0.19
380 0.22
381 0.29
382 0.32
383 0.36
384 0.39
385 0.42
386 0.41
387 0.43
388 0.44
389 0.39
390 0.39
391 0.35
392 0.33
393 0.27
394 0.31
395 0.27
396 0.27
397 0.27
398 0.26
399 0.27
400 0.27
401 0.26
402 0.2
403 0.19
404 0.18
405 0.2
406 0.16
407 0.15
408 0.16
409 0.17
410 0.18
411 0.22
412 0.26
413 0.31
414 0.34
415 0.39
416 0.46
417 0.53
418 0.61
419 0.67
420 0.67
421 0.66
422 0.65
423 0.66
424 0.63
425 0.59
426 0.56
427 0.55
428 0.52
429 0.5
430 0.54
431 0.49
432 0.47
433 0.45
434 0.42
435 0.36
436 0.32
437 0.28
438 0.22
439 0.21
440 0.21
441 0.19
442 0.15
443 0.17
444 0.16
445 0.15
446 0.17
447 0.19
448 0.16
449 0.21
450 0.22
451 0.19
452 0.22
453 0.23
454 0.23
455 0.23
456 0.24
457 0.19
458 0.18
459 0.17
460 0.14
461 0.13
462 0.11
463 0.11
464 0.14
465 0.14
466 0.14
467 0.17
468 0.16
469 0.17
470 0.19
471 0.19
472 0.25
473 0.27
474 0.29
475 0.34
476 0.36
477 0.36
478 0.39
479 0.45
480 0.41
481 0.48
482 0.49
483 0.49
484 0.57
485 0.63
486 0.68
487 0.7
488 0.71
489 0.73
490 0.76
491 0.76
492 0.77
493 0.76
494 0.77
495 0.75
496 0.72
497 0.71
498 0.69
499 0.65
500 0.61
501 0.55
502 0.45
503 0.42
504 0.48
505 0.47
506 0.47
507 0.47
508 0.43
509 0.46
510 0.45
511 0.41
512 0.32
513 0.27
514 0.27
515 0.24
516 0.21
517 0.17
518 0.16
519 0.15
520 0.15
521 0.12
522 0.06
523 0.05
524 0.06
525 0.06
526 0.07
527 0.08
528 0.1
529 0.13
530 0.14
531 0.14
532 0.17
533 0.24
534 0.26
535 0.31
536 0.36
537 0.35
538 0.39
539 0.43
540 0.42
541 0.37
542 0.37
543 0.38
544 0.39
545 0.36
546 0.31
547 0.29
548 0.28
549 0.27
550 0.23
551 0.16
552 0.11
553 0.13
554 0.13
555 0.17
556 0.18
557 0.19
558 0.2
559 0.21
560 0.29
561 0.34
562 0.42
563 0.43
564 0.49
565 0.56
566 0.57
567 0.61
568 0.55
569 0.48
570 0.44
571 0.37
572 0.32
573 0.27
574 0.24
575 0.19
576 0.17
577 0.16
578 0.13
579 0.12
580 0.09
581 0.07
582 0.07
583 0.09
584 0.1
585 0.11
586 0.13
587 0.16
588 0.17
589 0.22
590 0.23
591 0.22
592 0.27
593 0.3
594 0.36
595 0.37
596 0.4
597 0.37
598 0.46
599 0.46
600 0.42
601 0.45
602 0.38
603 0.37
604 0.37
605 0.36
606 0.26
607 0.34
608 0.33
609 0.27
610 0.31
611 0.29
612 0.28
613 0.33
614 0.35
615 0.29
616 0.31
617 0.35
618 0.37
619 0.41
620 0.39
621 0.36
622 0.4
623 0.42
624 0.44
625 0.41
626 0.35
627 0.34
628 0.39
629 0.46
630 0.43
631 0.46
632 0.51
633 0.54
634 0.6
635 0.59
636 0.57
637 0.56
638 0.59
639 0.58
640 0.56
641 0.51
642 0.46
643 0.44
644 0.39
645 0.3
646 0.26
647 0.22
648 0.16
649 0.18
650 0.18
651 0.25
652 0.31
653 0.42
654 0.49
655 0.52
656 0.58
657 0.59
658 0.65
659 0.66
660 0.63
661 0.59
662 0.5
663 0.52
664 0.47
665 0.45
666 0.36
667 0.28
668 0.26
669 0.21
670 0.22
671 0.15
672 0.15
673 0.14
674 0.21
675 0.24
676 0.23
677 0.31
678 0.32
679 0.36
680 0.4
681 0.41
682 0.4
683 0.43
684 0.46
685 0.38
686 0.38
687 0.33
688 0.3
689 0.27
690 0.23
691 0.18
692 0.12
693 0.16
694 0.14
695 0.15
696 0.13
697 0.13
698 0.14
699 0.15
700 0.16
701 0.14
702 0.16
703 0.16
704 0.18
705 0.19
706 0.2
707 0.2
708 0.24
709 0.25
710 0.31
711 0.33
712 0.39
713 0.44
714 0.44
715 0.44
716 0.43
717 0.46
718 0.43
719 0.42
720 0.39
721 0.4
722 0.39
723 0.38
724 0.36
725 0.33
726 0.31
727 0.3
728 0.25
729 0.2
730 0.19
731 0.2
732 0.18
733 0.16
734 0.15
735 0.14
736 0.16
737 0.14
738 0.13
739 0.15
740 0.21
741 0.25
742 0.28
743 0.3
744 0.28
745 0.32
746 0.36
747 0.37
748 0.36
749 0.33
750 0.31
751 0.33
752 0.33
753 0.29
754 0.27
755 0.26
756 0.23
757 0.22
758 0.18
759 0.15
760 0.18
761 0.2
762 0.2
763 0.18
764 0.15
765 0.16
766 0.18
767 0.18
768 0.16
769 0.15
770 0.18
771 0.18
772 0.18
773 0.21
774 0.2
775 0.21
776 0.22
777 0.23
778 0.2
779 0.19
780 0.21
781 0.16
782 0.19
783 0.19
784 0.19
785 0.19
786 0.18
787 0.2
788 0.18
789 0.19
790 0.19
791 0.17
792 0.15
793 0.13
794 0.15
795 0.14
796 0.13
797 0.12
798 0.1
799 0.12
800 0.13
801 0.15
802 0.13
803 0.13
804 0.16
805 0.17
806 0.15
807 0.15
808 0.14
809 0.13
810 0.12
811 0.11
812 0.11
813 0.1
814 0.1
815 0.09
816 0.1
817 0.14