Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VIR6

Protein Details
Accession A0A1Y1VIR6    Localization Confidence High Confidence Score 18.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-31MDEPIIFKKRGKKNIHKRKKVSLEQDNENEEHydrophilic
286-310AKELVEKLKERKKRIEEREKAVQETBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-20KKRGKKNIHKRKK
294-299KERKKR
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039971  CWC24-like  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR017907  Znf_RING_CS  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF13920  zf-C3HC4_3  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
PS00518  ZF_RING_1  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd16539  RING-HC_RNF113A_B  
Amino Acid Sequences MDEPIIFKKRGKKNIHKRKKVSLEQDNENEEETVIIKKKRENNTSLNSISSGLSKEEREKRKKEMIDVTFKSTGLATSNLPKDMGATHTIEIDTDVKNDAVALLEKQLNMTEDELNSGTYKGSSAYKHYIKKKDNVTGNAATSKIRAGPQRAPTNVRVTCRFDYQPDICKDYKETGYCGYGDSCKFLHDRGDYKSGWQLDREWEEKQKRLANEEEELNNYLIGEDSEEDSDEELPFACLICREDFVNPIKTKCGHYFCEKCAIENHAKTKKCFACNAYTYGQFNYAKELVEKLKERKKRIEEREKAVQETMKEQNEEWKENSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.92
3 0.93
4 0.91
5 0.92
6 0.92
7 0.9
8 0.89
9 0.88
10 0.84
11 0.82
12 0.8
13 0.73
14 0.63
15 0.55
16 0.44
17 0.34
18 0.27
19 0.19
20 0.18
21 0.2
22 0.22
23 0.24
24 0.31
25 0.4
26 0.49
27 0.56
28 0.58
29 0.61
30 0.65
31 0.69
32 0.64
33 0.56
34 0.47
35 0.41
36 0.34
37 0.27
38 0.21
39 0.16
40 0.17
41 0.18
42 0.26
43 0.34
44 0.44
45 0.51
46 0.55
47 0.6
48 0.67
49 0.69
50 0.68
51 0.69
52 0.66
53 0.67
54 0.65
55 0.64
56 0.56
57 0.52
58 0.44
59 0.34
60 0.27
61 0.18
62 0.17
63 0.13
64 0.18
65 0.2
66 0.2
67 0.2
68 0.19
69 0.18
70 0.17
71 0.18
72 0.14
73 0.14
74 0.14
75 0.15
76 0.15
77 0.14
78 0.14
79 0.14
80 0.11
81 0.1
82 0.11
83 0.1
84 0.1
85 0.09
86 0.08
87 0.07
88 0.07
89 0.07
90 0.09
91 0.1
92 0.1
93 0.11
94 0.11
95 0.11
96 0.11
97 0.13
98 0.11
99 0.1
100 0.12
101 0.12
102 0.11
103 0.11
104 0.1
105 0.08
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.1
110 0.1
111 0.14
112 0.21
113 0.28
114 0.35
115 0.43
116 0.51
117 0.53
118 0.59
119 0.61
120 0.61
121 0.61
122 0.57
123 0.55
124 0.48
125 0.45
126 0.39
127 0.33
128 0.26
129 0.19
130 0.16
131 0.12
132 0.13
133 0.15
134 0.18
135 0.23
136 0.31
137 0.37
138 0.38
139 0.4
140 0.4
141 0.45
142 0.43
143 0.4
144 0.36
145 0.35
146 0.35
147 0.35
148 0.33
149 0.26
150 0.29
151 0.29
152 0.33
153 0.3
154 0.33
155 0.29
156 0.29
157 0.3
158 0.28
159 0.28
160 0.21
161 0.21
162 0.18
163 0.19
164 0.18
165 0.17
166 0.15
167 0.14
168 0.13
169 0.14
170 0.12
171 0.12
172 0.13
173 0.12
174 0.16
175 0.16
176 0.2
177 0.22
178 0.27
179 0.25
180 0.26
181 0.3
182 0.28
183 0.26
184 0.24
185 0.21
186 0.22
187 0.26
188 0.27
189 0.25
190 0.3
191 0.34
192 0.36
193 0.4
194 0.4
195 0.37
196 0.4
197 0.41
198 0.36
199 0.35
200 0.35
201 0.3
202 0.28
203 0.28
204 0.24
205 0.19
206 0.16
207 0.13
208 0.09
209 0.08
210 0.06
211 0.05
212 0.06
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.08
217 0.09
218 0.08
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.09
227 0.1
228 0.1
229 0.11
230 0.12
231 0.17
232 0.21
233 0.29
234 0.29
235 0.29
236 0.32
237 0.33
238 0.37
239 0.4
240 0.41
241 0.36
242 0.44
243 0.49
244 0.47
245 0.55
246 0.5
247 0.44
248 0.42
249 0.45
250 0.44
251 0.44
252 0.51
253 0.49
254 0.53
255 0.53
256 0.6
257 0.6
258 0.56
259 0.57
260 0.52
261 0.53
262 0.53
263 0.57
264 0.5
265 0.47
266 0.44
267 0.39
268 0.41
269 0.33
270 0.3
271 0.31
272 0.28
273 0.25
274 0.24
275 0.27
276 0.25
277 0.3
278 0.37
279 0.4
280 0.48
281 0.56
282 0.62
283 0.68
284 0.74
285 0.78
286 0.82
287 0.84
288 0.84
289 0.84
290 0.88
291 0.82
292 0.74
293 0.68
294 0.6
295 0.51
296 0.49
297 0.49
298 0.43
299 0.4
300 0.38
301 0.43
302 0.46
303 0.48