FuNGI

A0A1Y1UYY8

Protein Details

Accession

A0A1Y1UYY8

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
34-57	NDKVRTFLSKKPKSEKFNPDKFVN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 14, cyto 8.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045867 DNA-dir_RpoC_beta_prime IPR007081 RNA_pol_Rpb1_5
Gene Ontology	GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF04998 RNA_pol_Rpb1_5

Amino Acid Sequences

MESLSEIEINCICDKISKNFEKDEKLQPYISEINDKVRTFLSKKPKSEKFNPDKFVNYIIQKIEDKKIKSNTHVGILAAQSIGEPVTQLALSYFHKLNGDKDNIDGVKELHNITKNKVDYDVVEFYLKSKDYDSNLKKKILNSMRYIALNDVVLDVVYDGFCLRFFLCKQAIFKYKIHPKIIFNCIKEYLEKTGNSISKWDSIVNLTELYIEFSQPASKLLDWLDENQVEYIVDMEILCIFKPNINKNKIKVDETGETNDNSPDISYSDNDDDSNSNELQNTAKNELIINYLNNNKIKFEDKGKYYLLNSDFVELNNNGIKKILNNVVLSGTKGVIKVVPKHYNDEFIIEVTGTNLGPLFENEYVDKDRSRYIVYGNLMDVDFESRKKNILKQLQKIVNNGSSCKNQHIELLTNFMCQDNKILSMSRFGMKNDNFSFMSKLSFEDPYNKLLNTKLIEYHI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.28
3	0.37
4	0.42
5	0.46
6	0.54
7	0.6
8	0.63
9	0.64
10	0.67
11	0.64
12	0.6
13	0.57
14	0.49
15	0.49
16	0.46
17	0.43
18	0.4
19	0.34
20	0.38
21	0.43
22	0.43
23	0.39
24	0.36
25	0.4
26	0.36
27	0.44
28	0.47
29	0.49
30	0.57
31	0.66
32	0.72
33	0.75
34	0.81
35	0.84
36	0.84
37	0.84
38	0.82
39	0.76
40	0.72
41	0.64
42	0.59
43	0.54
44	0.46
45	0.41
46	0.36
47	0.37
48	0.36
49	0.39
50	0.42
51	0.43
52	0.43
53	0.47
54	0.55
55	0.56
56	0.57
57	0.62
58	0.56
59	0.54
60	0.52
61	0.44
62	0.37
63	0.32
64	0.27
65	0.18
66	0.15
67	0.1
68	0.09
69	0.09
70	0.05
71	0.05
72	0.04
73	0.06
74	0.05
75	0.06
76	0.06
77	0.09
78	0.1
79	0.15
80	0.16
81	0.16
82	0.2
83	0.21
84	0.25
85	0.3
86	0.33
87	0.29
88	0.29
89	0.34
90	0.31
91	0.3
92	0.27
93	0.2
94	0.2
95	0.21
96	0.22
97	0.2
98	0.26
99	0.27
100	0.29
101	0.36
102	0.32
103	0.31
104	0.32
105	0.28
106	0.24
107	0.28
108	0.27
109	0.21
110	0.21
111	0.2
112	0.19
113	0.22
114	0.21
115	0.15
116	0.15
117	0.18
118	0.2
119	0.31
120	0.38
121	0.44
122	0.48
123	0.52
124	0.53
125	0.51
126	0.57
127	0.55
128	0.53
129	0.48
130	0.47
131	0.45
132	0.43
133	0.43
134	0.33
135	0.25
136	0.19
137	0.15
138	0.11
139	0.08
140	0.07
141	0.06
142	0.05
143	0.04
144	0.04
145	0.04
146	0.03
147	0.04
148	0.04
149	0.05
150	0.05
151	0.08
152	0.09
153	0.15
154	0.18
155	0.21
156	0.23
157	0.29
158	0.35
159	0.36
160	0.38
161	0.41
162	0.47
163	0.52
164	0.54
165	0.51
166	0.49
167	0.52
168	0.59
169	0.56
170	0.49
171	0.45
172	0.42
173	0.39
174	0.36
175	0.31
176	0.26
177	0.24
178	0.22
179	0.21
180	0.25
181	0.26
182	0.24
183	0.24
184	0.21
185	0.19
186	0.2
187	0.18
188	0.13
189	0.13
190	0.14
191	0.13
192	0.11
193	0.09
194	0.09
195	0.08
196	0.1
197	0.09
198	0.08
199	0.07
200	0.07
201	0.08
202	0.08
203	0.09
204	0.08
205	0.08
206	0.09
207	0.09
208	0.11
209	0.11
210	0.13
211	0.14
212	0.13
213	0.13
214	0.12
215	0.12
216	0.09
217	0.08
218	0.07
219	0.04
220	0.04
221	0.03
222	0.03
223	0.04
224	0.04
225	0.04
226	0.05
227	0.05
228	0.07
229	0.12
230	0.2
231	0.28
232	0.35
233	0.39
234	0.41
235	0.5
236	0.51
237	0.49
238	0.44
239	0.4
240	0.37
241	0.35
242	0.36
243	0.28
244	0.26
245	0.24
246	0.21
247	0.16
248	0.12
249	0.1
250	0.07
251	0.06
252	0.07
253	0.06
254	0.09
255	0.11
256	0.11
257	0.11
258	0.12
259	0.12
260	0.13
261	0.15
262	0.12
263	0.11
264	0.11
265	0.12
266	0.12
267	0.14
268	0.15
269	0.14
270	0.14
271	0.14
272	0.15
273	0.15
274	0.16
275	0.14
276	0.12
277	0.13
278	0.16
279	0.2
280	0.22
281	0.22
282	0.2
283	0.21
284	0.23
285	0.23
286	0.27
287	0.29
288	0.3
289	0.34
290	0.35
291	0.35
292	0.33
293	0.36
294	0.31
295	0.27
296	0.25
297	0.23
298	0.22
299	0.19
300	0.22
301	0.16
302	0.16
303	0.16
304	0.16
305	0.14
306	0.14
307	0.14
308	0.11
309	0.16
310	0.19
311	0.2
312	0.2
313	0.21
314	0.23
315	0.23
316	0.23
317	0.19
318	0.14
319	0.12
320	0.11
321	0.11
322	0.11
323	0.14
324	0.21
325	0.29
326	0.36
327	0.37
328	0.42
329	0.43
330	0.45
331	0.42
332	0.38
333	0.3
334	0.22
335	0.21
336	0.15
337	0.14
338	0.09
339	0.1
340	0.07
341	0.06
342	0.06
343	0.06
344	0.07
345	0.07
346	0.11
347	0.1
348	0.12
349	0.13
350	0.16
351	0.19
352	0.2
353	0.21
354	0.18
355	0.21
356	0.21
357	0.23
358	0.21
359	0.21
360	0.25
361	0.26
362	0.27
363	0.24
364	0.24
365	0.21
366	0.2
367	0.18
368	0.15
369	0.15
370	0.15
371	0.18
372	0.16
373	0.22
374	0.26
375	0.32
376	0.38
377	0.47
378	0.55
379	0.6
380	0.7
381	0.73
382	0.73
383	0.7
384	0.66
385	0.62
386	0.54
387	0.49
388	0.43
389	0.42
390	0.4
391	0.42
392	0.38
393	0.33
394	0.35
395	0.36
396	0.38
397	0.32
398	0.37
399	0.32
400	0.31
401	0.3
402	0.27
403	0.24
404	0.18
405	0.21
406	0.15
407	0.17
408	0.18
409	0.21
410	0.2
411	0.25
412	0.27
413	0.28
414	0.29
415	0.29
416	0.37
417	0.35
418	0.43
419	0.4
420	0.42
421	0.39
422	0.38
423	0.4
424	0.31
425	0.32
426	0.24
427	0.24
428	0.22
429	0.24
430	0.24
431	0.28
432	0.3
433	0.32
434	0.35
435	0.33
436	0.32
437	0.31
438	0.36
439	0.31
440	0.32

A0A1Y1UYY8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer