Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1V546

Protein Details
Accession A0A1Y1V546    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-26SGSTSKSEEKPKIKKTPSSSNVRTHydrophilic
42-95KGSKLTFKPKIPTRRKQIKVEDEEKPKKTKERKGKKSFKDKERKPRGRPTYEPSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
42-89KGSKLTFKPKIPTRRKQIKVEDEEKPKKTKERKGKKSFKDKERKPRGR
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007811  RPC4  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
Pfam View protein in Pfam  
PF05132  RNA_pol_Rpc4  
Amino Acid Sequences MDSGSTSKSEEKPKIKKTPSSSNVRTFGTIGSTEPGKIGSLKGSKLTFKPKIPTRRKQIKVEDEEKPKKTKERKGKKSFKDKERKPRGRPTYEPSALSGPFAQGAARPGVKREYGSSRTFSGVSSGSSGIRVEEDTQSDVKPKVESLKFKNLNDENEEEFYEEDENTTRPVSLVDLTQELNEKMEKIKLEEKNFTFKKIKFENEKVEVKSENDEQLPKDTDNMEIEQSAAVEDENETYNYPASELLRNDIKPENNILFFQFPSVLPEIINNNKMDTDNKYDSNKVKIETSDGKLANVNLDTNNDAPEGKIGKLVIYKSGKMKIKFGDILFDVNPGTDCNFYQNAFSFNTENQEGYILGDIRKRYICTPDIESLLK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.79
3 0.82
4 0.81
5 0.83
6 0.81
7 0.82
8 0.8
9 0.78
10 0.75
11 0.68
12 0.61
13 0.51
14 0.43
15 0.36
16 0.29
17 0.21
18 0.2
19 0.18
20 0.17
21 0.16
22 0.16
23 0.13
24 0.13
25 0.13
26 0.18
27 0.21
28 0.22
29 0.27
30 0.3
31 0.34
32 0.38
33 0.47
34 0.47
35 0.49
36 0.57
37 0.61
38 0.69
39 0.74
40 0.79
41 0.8
42 0.83
43 0.85
44 0.86
45 0.87
46 0.86
47 0.85
48 0.82
49 0.8
50 0.8
51 0.81
52 0.76
53 0.72
54 0.66
55 0.66
56 0.69
57 0.71
58 0.71
59 0.74
60 0.8
61 0.85
62 0.91
63 0.92
64 0.93
65 0.93
66 0.93
67 0.93
68 0.92
69 0.92
70 0.93
71 0.93
72 0.9
73 0.91
74 0.9
75 0.87
76 0.84
77 0.8
78 0.79
79 0.72
80 0.64
81 0.56
82 0.49
83 0.41
84 0.35
85 0.28
86 0.18
87 0.14
88 0.13
89 0.11
90 0.08
91 0.1
92 0.12
93 0.14
94 0.14
95 0.16
96 0.19
97 0.2
98 0.2
99 0.22
100 0.27
101 0.3
102 0.33
103 0.33
104 0.32
105 0.32
106 0.32
107 0.27
108 0.21
109 0.17
110 0.14
111 0.14
112 0.13
113 0.11
114 0.11
115 0.11
116 0.09
117 0.09
118 0.09
119 0.09
120 0.1
121 0.11
122 0.12
123 0.13
124 0.14
125 0.16
126 0.16
127 0.15
128 0.14
129 0.14
130 0.2
131 0.24
132 0.3
133 0.34
134 0.44
135 0.48
136 0.48
137 0.56
138 0.51
139 0.49
140 0.46
141 0.43
142 0.34
143 0.3
144 0.29
145 0.21
146 0.18
147 0.15
148 0.13
149 0.09
150 0.08
151 0.07
152 0.07
153 0.08
154 0.08
155 0.07
156 0.06
157 0.06
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.08
163 0.09
164 0.09
165 0.1
166 0.09
167 0.09
168 0.09
169 0.08
170 0.08
171 0.1
172 0.1
173 0.11
174 0.19
175 0.24
176 0.27
177 0.33
178 0.33
179 0.41
180 0.41
181 0.43
182 0.42
183 0.39
184 0.43
185 0.42
186 0.48
187 0.46
188 0.51
189 0.53
190 0.53
191 0.56
192 0.48
193 0.46
194 0.4
195 0.34
196 0.31
197 0.26
198 0.21
199 0.18
200 0.19
201 0.17
202 0.19
203 0.21
204 0.18
205 0.17
206 0.16
207 0.16
208 0.16
209 0.16
210 0.13
211 0.11
212 0.11
213 0.1
214 0.09
215 0.07
216 0.05
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.05
221 0.06
222 0.06
223 0.07
224 0.07
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.09
230 0.13
231 0.13
232 0.16
233 0.2
234 0.2
235 0.23
236 0.25
237 0.25
238 0.23
239 0.26
240 0.26
241 0.23
242 0.23
243 0.22
244 0.19
245 0.18
246 0.17
247 0.14
248 0.11
249 0.14
250 0.15
251 0.13
252 0.12
253 0.14
254 0.18
255 0.2
256 0.24
257 0.21
258 0.19
259 0.2
260 0.21
261 0.22
262 0.21
263 0.26
264 0.26
265 0.3
266 0.33
267 0.37
268 0.39
269 0.44
270 0.42
271 0.35
272 0.34
273 0.31
274 0.35
275 0.36
276 0.36
277 0.37
278 0.35
279 0.34
280 0.33
281 0.33
282 0.29
283 0.23
284 0.21
285 0.14
286 0.15
287 0.16
288 0.15
289 0.16
290 0.14
291 0.13
292 0.12
293 0.16
294 0.16
295 0.14
296 0.16
297 0.15
298 0.16
299 0.2
300 0.21
301 0.25
302 0.26
303 0.3
304 0.33
305 0.41
306 0.46
307 0.44
308 0.49
309 0.45
310 0.48
311 0.5
312 0.45
313 0.43
314 0.36
315 0.38
316 0.32
317 0.3
318 0.22
319 0.18
320 0.18
321 0.13
322 0.13
323 0.11
324 0.11
325 0.15
326 0.17
327 0.17
328 0.2
329 0.21
330 0.22
331 0.23
332 0.25
333 0.23
334 0.22
335 0.27
336 0.25
337 0.24
338 0.21
339 0.2
340 0.18
341 0.16
342 0.19
343 0.15
344 0.16
345 0.2
346 0.21
347 0.24
348 0.28
349 0.29
350 0.29
351 0.35
352 0.37
353 0.38
354 0.43
355 0.43