Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VAJ8

Protein Details
Accession A0A1Y1VAJ8    Localization Confidence High Confidence Score 21.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-29MDRIYPYRSRAPNKNFKEKIEKAKQSSFYHydrophilic
113-141LELRDARLRKSKKTHHKNKEKDKENDDSEBasic
229-253QNINNKMKSKKYKEKEKKLNHYGYIHydrophilic
438-465NSYPELDEKKNKKKKKEANKELNNNSSDHydrophilic
534-553SSTINRPKSKNNGSNNNDDAHydrophilic
567-593SSTSCSSRSRSKSDIKKSKSKTKINTKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
119-133RLRKSKKTHHKNKEK
236-245KSKKYKEKEK
446-454KKNKKKKKE
581-589IKKSKSKTK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 12, mito 5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR007527  Znf_SWIM  
IPR000433  Znf_ZZ  
IPR043145  Znf_ZZ_sf  
IPR039903  Zswim2  
Gene Ontology GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04434  SWIM  
PF13639  zf-RING_2  
PF00569  ZZ  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50016  ZF_PHD_2  
PS50089  ZF_RING_2  
PS50966  ZF_SWIM  
PS50135  ZF_ZZ_2  
CDD cd16494  RING-CH-C4HC3_ZSWM2  
Amino Acid Sequences MDRIYPYRSRAPNKNFKEKIEKAKQSSFYIIQELGPLAFIVREDKFISEKKQKGIKYRVSLGEHQICTCGSFQSEKDICVHLLWIMLKYYGINEDNEILYQLSLINREINLLLELRDARLRKSKKTHHKNKEKDKENDDSENDMDKYNSKVKQREIEDDQICPICQETFKDSPTPVTFCRLSCGNNIHVNCMKMVMEHQLSTNSADDMIKCPLCRNNFNTVKEFKKELQNINNKMKSKKYKEKEKKLNHYGYICHHCSVNPIHGKCHKCTSCKNYYLCDNCFLKGNHSEHTFKGRLSKKDLWELSVRYIESTLPEGLIQNLQNRELSEEDYNTLLLLDQKVIQGSIPLHVINSFPTKKVKYGDKDKYSCVICNTTVKMNEIIRKLPCQHNFHQNCIDKWLLHTRSTCPICGLAAYSSIIKDDSEDSIPNMESNIYKANSYPELDEKKNKKKKKEANKELNNNSSDNTASSSSDKKNETKNLFICGNSAIKFEDIIEDNNLNKKGQKIRSNHHEKSLINNKLSKEDSLDILEINSSTINRPKSKNNGSNNNDDANNNNNNSSGSSSSSSTSCSSRSRSKSDIKKSKSKTKINTK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.8
3 0.79
4 0.81
5 0.79
6 0.8
7 0.8
8 0.8
9 0.76
10 0.8
11 0.78
12 0.72
13 0.7
14 0.63
15 0.54
16 0.49
17 0.42
18 0.33
19 0.3
20 0.26
21 0.19
22 0.16
23 0.13
24 0.09
25 0.08
26 0.08
27 0.11
28 0.11
29 0.14
30 0.14
31 0.17
32 0.21
33 0.26
34 0.34
35 0.4
36 0.45
37 0.51
38 0.57
39 0.6
40 0.66
41 0.72
42 0.72
43 0.7
44 0.72
45 0.72
46 0.7
47 0.7
48 0.69
49 0.67
50 0.59
51 0.51
52 0.45
53 0.37
54 0.33
55 0.28
56 0.21
57 0.14
58 0.16
59 0.16
60 0.25
61 0.26
62 0.25
63 0.27
64 0.28
65 0.27
66 0.24
67 0.24
68 0.14
69 0.17
70 0.16
71 0.15
72 0.13
73 0.13
74 0.13
75 0.12
76 0.13
77 0.14
78 0.15
79 0.15
80 0.15
81 0.17
82 0.17
83 0.17
84 0.17
85 0.12
86 0.1
87 0.09
88 0.1
89 0.09
90 0.1
91 0.11
92 0.12
93 0.11
94 0.13
95 0.13
96 0.12
97 0.12
98 0.12
99 0.11
100 0.12
101 0.12
102 0.13
103 0.18
104 0.17
105 0.2
106 0.3
107 0.34
108 0.4
109 0.5
110 0.59
111 0.65
112 0.76
113 0.83
114 0.84
115 0.91
116 0.93
117 0.94
118 0.95
119 0.93
120 0.9
121 0.85
122 0.82
123 0.77
124 0.72
125 0.63
126 0.56
127 0.48
128 0.44
129 0.38
130 0.31
131 0.26
132 0.21
133 0.23
134 0.26
135 0.29
136 0.32
137 0.36
138 0.41
139 0.49
140 0.52
141 0.55
142 0.55
143 0.59
144 0.53
145 0.49
146 0.46
147 0.39
148 0.34
149 0.26
150 0.21
151 0.12
152 0.12
153 0.13
154 0.17
155 0.2
156 0.22
157 0.24
158 0.24
159 0.28
160 0.3
161 0.31
162 0.26
163 0.27
164 0.28
165 0.25
166 0.28
167 0.24
168 0.23
169 0.25
170 0.27
171 0.27
172 0.32
173 0.32
174 0.34
175 0.34
176 0.33
177 0.28
178 0.25
179 0.2
180 0.14
181 0.15
182 0.15
183 0.14
184 0.14
185 0.14
186 0.15
187 0.15
188 0.16
189 0.16
190 0.11
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.11
195 0.14
196 0.14
197 0.13
198 0.16
199 0.2
200 0.24
201 0.29
202 0.31
203 0.38
204 0.45
205 0.48
206 0.51
207 0.51
208 0.5
209 0.48
210 0.47
211 0.4
212 0.41
213 0.44
214 0.45
215 0.5
216 0.55
217 0.59
218 0.65
219 0.67
220 0.62
221 0.59
222 0.6
223 0.61
224 0.61
225 0.64
226 0.64
227 0.7
228 0.78
229 0.86
230 0.88
231 0.89
232 0.89
233 0.89
234 0.86
235 0.78
236 0.69
237 0.61
238 0.57
239 0.54
240 0.44
241 0.35
242 0.29
243 0.25
244 0.26
245 0.26
246 0.27
247 0.26
248 0.25
249 0.3
250 0.36
251 0.39
252 0.38
253 0.45
254 0.42
255 0.4
256 0.47
257 0.5
258 0.52
259 0.56
260 0.56
261 0.49
262 0.53
263 0.53
264 0.47
265 0.45
266 0.37
267 0.3
268 0.33
269 0.3
270 0.26
271 0.28
272 0.28
273 0.25
274 0.28
275 0.29
276 0.26
277 0.32
278 0.3
279 0.23
280 0.31
281 0.34
282 0.33
283 0.39
284 0.44
285 0.4
286 0.47
287 0.47
288 0.41
289 0.39
290 0.37
291 0.31
292 0.28
293 0.25
294 0.17
295 0.17
296 0.14
297 0.12
298 0.12
299 0.1
300 0.07
301 0.08
302 0.08
303 0.08
304 0.1
305 0.1
306 0.12
307 0.13
308 0.13
309 0.14
310 0.14
311 0.15
312 0.14
313 0.15
314 0.12
315 0.12
316 0.12
317 0.12
318 0.11
319 0.09
320 0.08
321 0.06
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.08
331 0.08
332 0.08
333 0.08
334 0.08
335 0.08
336 0.08
337 0.09
338 0.09
339 0.15
340 0.15
341 0.15
342 0.2
343 0.22
344 0.24
345 0.29
346 0.35
347 0.37
348 0.47
349 0.55
350 0.59
351 0.61
352 0.6
353 0.6
354 0.53
355 0.47
356 0.39
357 0.32
358 0.25
359 0.26
360 0.26
361 0.25
362 0.25
363 0.24
364 0.25
365 0.25
366 0.29
367 0.27
368 0.29
369 0.27
370 0.3
371 0.33
372 0.37
373 0.42
374 0.43
375 0.46
376 0.53
377 0.54
378 0.55
379 0.59
380 0.55
381 0.48
382 0.46
383 0.42
384 0.32
385 0.32
386 0.37
387 0.3
388 0.3
389 0.32
390 0.3
391 0.38
392 0.4
393 0.37
394 0.28
395 0.26
396 0.22
397 0.21
398 0.19
399 0.1
400 0.1
401 0.1
402 0.1
403 0.09
404 0.09
405 0.09
406 0.08
407 0.08
408 0.09
409 0.1
410 0.11
411 0.12
412 0.12
413 0.14
414 0.14
415 0.13
416 0.12
417 0.11
418 0.09
419 0.11
420 0.15
421 0.13
422 0.14
423 0.14
424 0.18
425 0.19
426 0.2
427 0.21
428 0.24
429 0.29
430 0.33
431 0.42
432 0.48
433 0.56
434 0.65
435 0.7
436 0.72
437 0.77
438 0.84
439 0.85
440 0.88
441 0.88
442 0.89
443 0.93
444 0.93
445 0.89
446 0.86
447 0.77
448 0.66
449 0.56
450 0.46
451 0.36
452 0.26
453 0.21
454 0.15
455 0.15
456 0.17
457 0.22
458 0.24
459 0.29
460 0.33
461 0.35
462 0.42
463 0.5
464 0.52
465 0.54
466 0.53
467 0.53
468 0.51
469 0.46
470 0.39
471 0.33
472 0.32
473 0.24
474 0.23
475 0.18
476 0.17
477 0.17
478 0.16
479 0.16
480 0.14
481 0.15
482 0.17
483 0.18
484 0.2
485 0.26
486 0.27
487 0.24
488 0.24
489 0.29
490 0.35
491 0.43
492 0.49
493 0.51
494 0.59
495 0.7
496 0.78
497 0.75
498 0.73
499 0.71
500 0.63
501 0.65
502 0.66
503 0.62
504 0.56
505 0.57
506 0.51
507 0.51
508 0.52
509 0.43
510 0.38
511 0.33
512 0.31
513 0.29
514 0.28
515 0.21
516 0.2
517 0.19
518 0.14
519 0.12
520 0.11
521 0.09
522 0.12
523 0.18
524 0.24
525 0.3
526 0.35
527 0.43
528 0.52
529 0.62
530 0.68
531 0.72
532 0.76
533 0.75
534 0.8
535 0.76
536 0.69
537 0.6
538 0.52
539 0.45
540 0.41
541 0.42
542 0.35
543 0.31
544 0.28
545 0.27
546 0.27
547 0.27
548 0.22
549 0.2
550 0.21
551 0.22
552 0.23
553 0.23
554 0.24
555 0.23
556 0.23
557 0.23
558 0.27
559 0.32
560 0.4
561 0.46
562 0.51
563 0.57
564 0.65
565 0.71
566 0.77
567 0.81
568 0.79
569 0.83
570 0.85
571 0.87
572 0.87
573 0.87