Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VJ46

Protein Details
Accession A0A1Y1VJ46    Localization Confidence High Confidence Score 15.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-36LKRRANDNSLNLKKNKKKRRIEKTLPPKIESLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-27KKNKKKRRIEK
Subcellular Location(s) nucl 22, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019835  SWIB_domain  
IPR036885  SWIB_MDM2_dom_sf  
IPR003121  SWIB_MDM2_domain  
Gene Ontology GO:0016586  C:RSC-type complex  
GO:0016514  C:SWI/SNF complex  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF02201  SWIB  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51925  SWIB_MDM2  
CDD cd10568  SWIB_like  
Amino Acid Sequences MNQDLKRRANDNSLNLKKNKKKRRIEKTLPPKIESLIPESKLYTQLHEFEKKMDATIMRKRLDIQEAMSKPIKTKKTLRIFVSNTTSEQNKNIMNINDISLDNISTPSWILKIEGKLLDNSPGKKNMIIDKKFSSFVKRVIVELDRDQTLYPEGNIIEWNKEHGTPEIDGFEIKRTGDTDVNARILIEMDYAPHKYKLSEDLSKLLNIKLDTKTNIIMALWQYIKYHKLQDSDDKRIINNDEELKKIFKVNQITFPQMPELINYHLLPPDPIVIDYKIKVGERQIDEAEYAYDVEVEVDDSIRNRISSVVSVLQENTKEYMDMDEKISKIIQAINNCKLKRDFMMSFVNDPVTFINQWVASQARDYEVILGESHINKEESRHSEFFKKPWIKEAIFHYLNAKTHEKYNELVNQQQH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.72
3 0.78
4 0.78
5 0.81
6 0.83
7 0.82
8 0.84
9 0.87
10 0.92
11 0.93
12 0.93
13 0.94
14 0.94
15 0.94
16 0.89
17 0.81
18 0.71
19 0.62
20 0.58
21 0.49
22 0.45
23 0.41
24 0.37
25 0.36
26 0.36
27 0.36
28 0.36
29 0.35
30 0.31
31 0.28
32 0.31
33 0.37
34 0.41
35 0.4
36 0.36
37 0.41
38 0.36
39 0.34
40 0.32
41 0.29
42 0.3
43 0.39
44 0.44
45 0.4
46 0.4
47 0.42
48 0.44
49 0.46
50 0.41
51 0.35
52 0.37
53 0.37
54 0.41
55 0.43
56 0.38
57 0.37
58 0.43
59 0.44
60 0.41
61 0.49
62 0.54
63 0.6
64 0.67
65 0.68
66 0.7
67 0.68
68 0.68
69 0.66
70 0.57
71 0.48
72 0.44
73 0.41
74 0.33
75 0.32
76 0.29
77 0.23
78 0.23
79 0.27
80 0.24
81 0.25
82 0.24
83 0.23
84 0.22
85 0.2
86 0.19
87 0.14
88 0.14
89 0.11
90 0.11
91 0.09
92 0.07
93 0.08
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.09
98 0.12
99 0.14
100 0.18
101 0.2
102 0.21
103 0.22
104 0.23
105 0.28
106 0.28
107 0.3
108 0.3
109 0.32
110 0.31
111 0.31
112 0.33
113 0.35
114 0.4
115 0.4
116 0.41
117 0.41
118 0.42
119 0.44
120 0.41
121 0.39
122 0.32
123 0.34
124 0.36
125 0.32
126 0.3
127 0.31
128 0.32
129 0.28
130 0.28
131 0.26
132 0.2
133 0.2
134 0.19
135 0.16
136 0.16
137 0.13
138 0.1
139 0.09
140 0.09
141 0.09
142 0.11
143 0.11
144 0.11
145 0.11
146 0.13
147 0.13
148 0.13
149 0.14
150 0.13
151 0.15
152 0.14
153 0.14
154 0.13
155 0.12
156 0.11
157 0.11
158 0.11
159 0.1
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.11
164 0.13
165 0.13
166 0.15
167 0.16
168 0.17
169 0.16
170 0.15
171 0.13
172 0.11
173 0.11
174 0.08
175 0.05
176 0.06
177 0.07
178 0.09
179 0.1
180 0.1
181 0.11
182 0.1
183 0.11
184 0.17
185 0.21
186 0.24
187 0.24
188 0.26
189 0.26
190 0.27
191 0.27
192 0.21
193 0.18
194 0.14
195 0.17
196 0.15
197 0.17
198 0.17
199 0.17
200 0.17
201 0.15
202 0.15
203 0.11
204 0.11
205 0.09
206 0.11
207 0.1
208 0.1
209 0.1
210 0.11
211 0.14
212 0.14
213 0.18
214 0.18
215 0.21
216 0.22
217 0.32
218 0.37
219 0.42
220 0.44
221 0.41
222 0.38
223 0.38
224 0.37
225 0.29
226 0.26
227 0.25
228 0.23
229 0.24
230 0.25
231 0.24
232 0.22
233 0.23
234 0.22
235 0.21
236 0.27
237 0.28
238 0.35
239 0.37
240 0.4
241 0.39
242 0.37
243 0.33
244 0.26
245 0.24
246 0.16
247 0.15
248 0.13
249 0.14
250 0.14
251 0.14
252 0.13
253 0.13
254 0.13
255 0.11
256 0.11
257 0.09
258 0.1
259 0.11
260 0.11
261 0.13
262 0.13
263 0.15
264 0.15
265 0.15
266 0.16
267 0.17
268 0.24
269 0.24
270 0.27
271 0.26
272 0.24
273 0.24
274 0.23
275 0.2
276 0.12
277 0.1
278 0.07
279 0.06
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.04
285 0.05
286 0.05
287 0.06
288 0.08
289 0.09
290 0.09
291 0.08
292 0.1
293 0.11
294 0.12
295 0.14
296 0.17
297 0.16
298 0.17
299 0.18
300 0.19
301 0.19
302 0.19
303 0.17
304 0.13
305 0.13
306 0.12
307 0.16
308 0.16
309 0.16
310 0.18
311 0.2
312 0.2
313 0.21
314 0.21
315 0.17
316 0.16
317 0.2
318 0.21
319 0.26
320 0.33
321 0.4
322 0.47
323 0.47
324 0.5
325 0.47
326 0.46
327 0.41
328 0.42
329 0.35
330 0.32
331 0.41
332 0.39
333 0.39
334 0.38
335 0.36
336 0.28
337 0.27
338 0.24
339 0.18
340 0.16
341 0.15
342 0.16
343 0.14
344 0.15
345 0.17
346 0.17
347 0.14
348 0.15
349 0.16
350 0.14
351 0.15
352 0.15
353 0.15
354 0.15
355 0.15
356 0.14
357 0.14
358 0.15
359 0.16
360 0.17
361 0.17
362 0.17
363 0.17
364 0.2
365 0.27
366 0.3
367 0.36
368 0.38
369 0.4
370 0.49
371 0.53
372 0.53
373 0.56
374 0.59
375 0.52
376 0.58
377 0.61
378 0.54
379 0.55
380 0.58
381 0.57
382 0.5
383 0.49
384 0.45
385 0.42
386 0.43
387 0.43
388 0.41
389 0.33
390 0.39
391 0.43
392 0.41
393 0.37
394 0.42
395 0.45
396 0.45