Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1V7N7

Protein Details
Accession A0A1Y1V7N7    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-40DENRPNIRKVAKKSSDRLKVPKHSKKTKEQIEKTSIIHydrophilic
92-111GYPLCSKKTQQLKGKYRLSSHydrophilic
269-291LSNKENRTNKNSQKKNNKEKIVSHydrophilic
411-436MNKAYHASSRKRNNNKKKGKNGDVFYHydrophilic
510-533TEMTKEEAKKKQKKKLVPNLSLFGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-31RKVAKKSSDRLKVPKHSKKTK
420-430RKRNNNKKKGK
518-524KKKQKKK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11.833, cyto 5, cyto_mito 3.833, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039693  Rtr1/RPAP2  
IPR007308  Rtr1/RPAP2_dom  
IPR038534  Rtr1/RPAP2_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0017018  F:myosin phosphatase activity  
GO:0043175  F:RNA polymerase core enzyme binding  
GO:0008420  F:RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat phosphatase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF04181  RPAP2_Rtr1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51479  ZF_RTR1  
Amino Acid Sequences MLSDENRPNIRKVAKKSSDRLKVPKHSKKTKEQIEKTSIIEKAKWELTIMELQEKMFETPVTIEYMKYISKYFQPAHYEEVVLERKSLNICGYPLCSKKTQQLKGKYRLSSSKKKIFDITELKSYCGSDCMISSRYFASQLLDEPIYLRNLEKTKEADVIPLGVNIENWISKENDKLNTFTERSIDIYVKSMMKSLPNLNQNLVIHEHFENNKNNSNAIQPIIEKSSFQYDSIEGFQYKPQNTDQMNNRKPSTIILDKEILSSNISLNLSNKENRTNKNSQKKNNKEKIVSSVIMNKEDADKFNELYEQYSRNQKKEKELAEKKLLNDKNKTERNEITDNVKEITDNLHNLDINGKNEKILDENSNSKDEKLSRKKSVGILKKSNSVSKENLKVRFNEDPSIKIIETKEEMNKAYHASSRKRNNNKKKGKNGDVFYSYDVIEKSSVKKEVKESNAEIQKTENLEKNNDLIKENKEIVNTENKDSKENDPEKKIKTLFEMNKDLEKIIKITEMTKEEAKKKQKKKLVPNLSLFGKIWTNISSMITKETKLFLNNKIDEDELNELLLVDDEIMNTRKDILITNIMKSYSSIKLEHEIVLSIEDELILLIKSLIVSETMVVLSSVEYWILTVVFLKALTKRIKIIEEEITEEKWNQMMEAVDIPSYQLNEFVNLFN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.73
3 0.79
4 0.82
5 0.83
6 0.83
7 0.84
8 0.83
9 0.84
10 0.86
11 0.88
12 0.88
13 0.88
14 0.89
15 0.9
16 0.9
17 0.9
18 0.91
19 0.89
20 0.88
21 0.85
22 0.8
23 0.72
24 0.68
25 0.61
26 0.53
27 0.47
28 0.4
29 0.37
30 0.36
31 0.33
32 0.27
33 0.24
34 0.24
35 0.27
36 0.27
37 0.25
38 0.23
39 0.23
40 0.24
41 0.25
42 0.22
43 0.18
44 0.16
45 0.13
46 0.14
47 0.15
48 0.18
49 0.17
50 0.16
51 0.16
52 0.19
53 0.19
54 0.18
55 0.18
56 0.16
57 0.21
58 0.28
59 0.29
60 0.34
61 0.39
62 0.4
63 0.44
64 0.43
65 0.38
66 0.31
67 0.36
68 0.34
69 0.28
70 0.27
71 0.22
72 0.22
73 0.23
74 0.25
75 0.2
76 0.18
77 0.19
78 0.2
79 0.24
80 0.28
81 0.31
82 0.32
83 0.34
84 0.35
85 0.42
86 0.5
87 0.55
88 0.58
89 0.65
90 0.71
91 0.77
92 0.82
93 0.77
94 0.74
95 0.75
96 0.74
97 0.74
98 0.73
99 0.73
100 0.69
101 0.68
102 0.68
103 0.61
104 0.61
105 0.59
106 0.54
107 0.54
108 0.5
109 0.48
110 0.43
111 0.4
112 0.31
113 0.25
114 0.21
115 0.12
116 0.13
117 0.15
118 0.17
119 0.16
120 0.17
121 0.17
122 0.17
123 0.18
124 0.17
125 0.15
126 0.14
127 0.15
128 0.18
129 0.16
130 0.15
131 0.15
132 0.16
133 0.15
134 0.15
135 0.14
136 0.16
137 0.18
138 0.2
139 0.23
140 0.23
141 0.25
142 0.28
143 0.28
144 0.24
145 0.22
146 0.23
147 0.19
148 0.18
149 0.16
150 0.12
151 0.11
152 0.1
153 0.1
154 0.08
155 0.09
156 0.1
157 0.11
158 0.11
159 0.17
160 0.21
161 0.26
162 0.27
163 0.29
164 0.3
165 0.34
166 0.35
167 0.3
168 0.27
169 0.22
170 0.23
171 0.23
172 0.22
173 0.16
174 0.17
175 0.19
176 0.19
177 0.18
178 0.17
179 0.16
180 0.17
181 0.2
182 0.22
183 0.26
184 0.3
185 0.32
186 0.31
187 0.34
188 0.32
189 0.31
190 0.29
191 0.23
192 0.2
193 0.19
194 0.22
195 0.2
196 0.25
197 0.29
198 0.3
199 0.35
200 0.33
201 0.33
202 0.3
203 0.3
204 0.27
205 0.21
206 0.19
207 0.14
208 0.16
209 0.18
210 0.17
211 0.15
212 0.14
213 0.2
214 0.19
215 0.19
216 0.18
217 0.16
218 0.18
219 0.19
220 0.2
221 0.14
222 0.14
223 0.17
224 0.21
225 0.21
226 0.22
227 0.21
228 0.26
229 0.27
230 0.33
231 0.39
232 0.44
233 0.49
234 0.51
235 0.51
236 0.45
237 0.44
238 0.39
239 0.37
240 0.32
241 0.28
242 0.26
243 0.28
244 0.27
245 0.28
246 0.27
247 0.2
248 0.14
249 0.14
250 0.11
251 0.12
252 0.12
253 0.11
254 0.12
255 0.14
256 0.16
257 0.19
258 0.2
259 0.25
260 0.3
261 0.34
262 0.4
263 0.47
264 0.54
265 0.61
266 0.68
267 0.69
268 0.75
269 0.81
270 0.85
271 0.84
272 0.82
273 0.75
274 0.69
275 0.66
276 0.6
277 0.5
278 0.4
279 0.37
280 0.32
281 0.3
282 0.27
283 0.21
284 0.19
285 0.19
286 0.19
287 0.16
288 0.15
289 0.14
290 0.15
291 0.16
292 0.13
293 0.14
294 0.15
295 0.14
296 0.15
297 0.24
298 0.27
299 0.29
300 0.36
301 0.36
302 0.42
303 0.47
304 0.52
305 0.53
306 0.57
307 0.6
308 0.62
309 0.61
310 0.55
311 0.58
312 0.55
313 0.49
314 0.47
315 0.46
316 0.47
317 0.51
318 0.52
319 0.48
320 0.46
321 0.47
322 0.45
323 0.41
324 0.36
325 0.32
326 0.29
327 0.25
328 0.22
329 0.17
330 0.14
331 0.15
332 0.12
333 0.11
334 0.11
335 0.11
336 0.11
337 0.11
338 0.16
339 0.15
340 0.15
341 0.16
342 0.15
343 0.14
344 0.15
345 0.15
346 0.12
347 0.12
348 0.13
349 0.14
350 0.19
351 0.21
352 0.24
353 0.23
354 0.22
355 0.23
356 0.24
357 0.32
358 0.37
359 0.42
360 0.44
361 0.46
362 0.49
363 0.53
364 0.58
365 0.57
366 0.55
367 0.56
368 0.53
369 0.57
370 0.55
371 0.53
372 0.47
373 0.41
374 0.38
375 0.36
376 0.43
377 0.42
378 0.46
379 0.44
380 0.43
381 0.44
382 0.46
383 0.42
384 0.39
385 0.34
386 0.3
387 0.3
388 0.32
389 0.26
390 0.22
391 0.21
392 0.18
393 0.18
394 0.19
395 0.2
396 0.19
397 0.2
398 0.18
399 0.19
400 0.18
401 0.18
402 0.2
403 0.23
404 0.27
405 0.34
406 0.43
407 0.53
408 0.62
409 0.72
410 0.79
411 0.84
412 0.89
413 0.9
414 0.91
415 0.91
416 0.9
417 0.86
418 0.78
419 0.74
420 0.66
421 0.57
422 0.48
423 0.39
424 0.3
425 0.23
426 0.2
427 0.15
428 0.13
429 0.13
430 0.15
431 0.17
432 0.24
433 0.23
434 0.26
435 0.32
436 0.38
437 0.42
438 0.44
439 0.43
440 0.46
441 0.51
442 0.48
443 0.42
444 0.36
445 0.34
446 0.31
447 0.32
448 0.27
449 0.23
450 0.25
451 0.26
452 0.28
453 0.29
454 0.27
455 0.25
456 0.25
457 0.25
458 0.28
459 0.29
460 0.27
461 0.24
462 0.24
463 0.25
464 0.31
465 0.31
466 0.3
467 0.33
468 0.32
469 0.34
470 0.36
471 0.38
472 0.38
473 0.43
474 0.46
475 0.48
476 0.54
477 0.54
478 0.59
479 0.56
480 0.47
481 0.46
482 0.49
483 0.47
484 0.48
485 0.51
486 0.46
487 0.48
488 0.47
489 0.42
490 0.34
491 0.29
492 0.22
493 0.17
494 0.17
495 0.14
496 0.15
497 0.2
498 0.21
499 0.23
500 0.27
501 0.32
502 0.36
503 0.44
504 0.53
505 0.58
506 0.65
507 0.72
508 0.76
509 0.8
510 0.84
511 0.87
512 0.87
513 0.86
514 0.82
515 0.78
516 0.71
517 0.64
518 0.53
519 0.44
520 0.35
521 0.26
522 0.22
523 0.17
524 0.16
525 0.15
526 0.16
527 0.15
528 0.15
529 0.2
530 0.19
531 0.19
532 0.2
533 0.21
534 0.21
535 0.25
536 0.29
537 0.31
538 0.39
539 0.41
540 0.41
541 0.4
542 0.39
543 0.33
544 0.32
545 0.29
546 0.19
547 0.17
548 0.15
549 0.13
550 0.12
551 0.12
552 0.08
553 0.05
554 0.05
555 0.05
556 0.08
557 0.1
558 0.1
559 0.1
560 0.11
561 0.11
562 0.12
563 0.14
564 0.15
565 0.24
566 0.26
567 0.28
568 0.29
569 0.29
570 0.28
571 0.28
572 0.27
573 0.23
574 0.24
575 0.23
576 0.23
577 0.27
578 0.29
579 0.3
580 0.26
581 0.21
582 0.18
583 0.18
584 0.16
585 0.12
586 0.09
587 0.08
588 0.07
589 0.06
590 0.06
591 0.05
592 0.04
593 0.04
594 0.05
595 0.05
596 0.05
597 0.05
598 0.05
599 0.06
600 0.06
601 0.07
602 0.07
603 0.07
604 0.07
605 0.07
606 0.06
607 0.07
608 0.07
609 0.06
610 0.06
611 0.06
612 0.06
613 0.06
614 0.06
615 0.06
616 0.07
617 0.08
618 0.08
619 0.1
620 0.13
621 0.2
622 0.26
623 0.27
624 0.31
625 0.35
626 0.39
627 0.4
628 0.42
629 0.43
630 0.4
631 0.42
632 0.4
633 0.38
634 0.36
635 0.33
636 0.29
637 0.23
638 0.21
639 0.16
640 0.16
641 0.14
642 0.14
643 0.17
644 0.17
645 0.15
646 0.15
647 0.16
648 0.16
649 0.16
650 0.14
651 0.14
652 0.13
653 0.16