FuNGI

A0A1Y1VN60

Protein Details

Accession

A0A1Y1VN60

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
3-22	DSFHHRSSLKQTNKPFKSKF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
24-39	SKGELKIKNKGKVNRS
44-59	AKRNEISKADRRNAAK

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto_nucl 12.5, mito 4, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012948 AARP2CN IPR039761 Bms1/Tsr1 IPR007034 BMS1_TSR1_C IPR030387 G_Bms1/Tsr1_dom
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005730 C:nucleolus GO:0030688 C:preribosome, small subunit precursor GO:0043021 F:ribonucleoprotein complex binding GO:0000461 P:endonucleolytic cleavage to generate mature 3'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
Pfam	View protein in Pfam PF08142 AARP2CN PF04950 RIBIOP_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS51714 G_BMS1

Amino Acid Sequences

MSDSFHHRSSLKQTNKPFKSKFTSKGELKIKNKGKVNRSIQYSAKRNEISKADRRNAAKIAQNKKRQEIININRLFSGTNGTPKIIAVVPLCTDVNSIDVTKKFYEAVEKEYPVDNDGRPITLKVERFKQKVQFIQCRRNVNEILDSIKVADYVMFLVSAEEEVDRFGELVLLTIKSQGVPTVLTVVQHLEKIQQKKKSEIKKALTNYMEYHFPGEQKIFSASEKNDCLTLLRQVTMQTPKQLVWREKYSYLLSDNIEYDSNEGVLKVTGNLRGQQLSVNSLVYLNNYGNFQIKKIEEDIRHDHSNKNGMSVDENAFKRTLFPDPNIQENLISENEPDPFEGEQTWPTEEELMEAEERSVITGAKDIRKVPKGTSTYQAAWIVDSEDEEGSDDDYSDNDINMEINQDSINNRISEWQSTMNTNEEIEPEFNENDEEFEELELPNKDDLFDAQIDEEEEERAYKEFVEKKNQANMDLEFPDEIDTPLDVPARERFQKYRGLRSFRTSPWDPYENLPVDYSRIFQFENFKRTKARIFKAMNNISDEDEDKFYVQPGRRISIYINNVPKSLYDNYNPKKPFIVFSLLPHEQKMCVVNYVVTKHADCEEVVKAKDPVVVHCGFRKFVMRPIYSSNTRGGTNNVHKAERFLQPGRSTIATAYAPITYGPAPVLMFKYNENENIEFPTLIATGSLLNMDTNRIVAKKIVLTGYPFKIHRKSAVIRYMFFNPDDINWFKPIQLTTKYGHVGHIRESIGTHGYMKCIFDGLINQQDTVCMNLYKRIFPKWNTQIYNDENVDGEYLETKEDEEMEM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.71
2	0.79
3	0.84
4	0.79
5	0.77
6	0.78
7	0.79
8	0.77
9	0.75
10	0.77
11	0.72
12	0.77
13	0.78
14	0.78
15	0.74
16	0.75
17	0.75
18	0.73
19	0.77
20	0.76
21	0.74
22	0.75
23	0.79
24	0.76
25	0.74
26	0.72
27	0.71
28	0.73
29	0.74
30	0.67
31	0.67
32	0.63
33	0.57
34	0.58
35	0.58
36	0.57
37	0.57
38	0.63
39	0.61
40	0.65
41	0.66
42	0.65
43	0.61
44	0.59
45	0.57
46	0.56
47	0.6
48	0.63
49	0.69
50	0.69
51	0.72
52	0.73
53	0.69
54	0.69
55	0.69
56	0.68
57	0.69
58	0.65
59	0.59
60	0.52
61	0.49
62	0.4
63	0.3
64	0.27
65	0.2
66	0.24
67	0.25
68	0.25
69	0.25
70	0.25
71	0.27
72	0.21
73	0.22
74	0.15
75	0.16
76	0.17
77	0.19
78	0.19
79	0.16
80	0.16
81	0.13
82	0.13
83	0.12
84	0.13
85	0.15
86	0.16
87	0.2
88	0.2
89	0.21
90	0.2
91	0.2
92	0.28
93	0.25
94	0.31
95	0.33
96	0.34
97	0.35
98	0.38
99	0.37
100	0.3
101	0.32
102	0.25
103	0.24
104	0.24
105	0.23
106	0.21
107	0.21
108	0.23
109	0.25
110	0.3
111	0.3
112	0.39
113	0.46
114	0.5
115	0.56
116	0.6
117	0.62
118	0.65
119	0.69
120	0.7
121	0.7
122	0.76
123	0.75
124	0.76
125	0.71
126	0.7
127	0.63
128	0.55
129	0.51
130	0.42
131	0.39
132	0.31
133	0.28
134	0.22
135	0.19
136	0.16
137	0.11
138	0.1
139	0.07
140	0.07
141	0.07
142	0.06
143	0.06
144	0.06
145	0.06
146	0.06
147	0.06
148	0.05
149	0.05
150	0.05
151	0.06
152	0.06
153	0.06
154	0.05
155	0.06
156	0.06
157	0.07
158	0.08
159	0.08
160	0.08
161	0.1
162	0.1
163	0.09
164	0.09
165	0.09
166	0.08
167	0.08
168	0.08
169	0.11
170	0.11
171	0.11
172	0.12
173	0.13
174	0.13
175	0.14
176	0.14
177	0.16
178	0.22
179	0.31
180	0.38
181	0.43
182	0.45
183	0.54
184	0.62
185	0.66
186	0.7
187	0.71
188	0.71
189	0.72
190	0.73
191	0.73
192	0.66
193	0.58
194	0.5
195	0.42
196	0.38
197	0.29
198	0.28
199	0.21
200	0.19
201	0.19
202	0.18
203	0.16
204	0.15
205	0.17
206	0.15
207	0.15
208	0.2
209	0.19
210	0.24
211	0.25
212	0.24
213	0.22
214	0.21
215	0.22
216	0.18
217	0.22
218	0.18
219	0.17
220	0.17
221	0.18
222	0.23
223	0.27
224	0.28
225	0.26
226	0.26
227	0.27
228	0.32
229	0.38
230	0.38
231	0.38
232	0.42
233	0.42
234	0.42
235	0.44
236	0.4
237	0.35
238	0.31
239	0.28
240	0.23
241	0.21
242	0.2
243	0.18
244	0.17
245	0.14
246	0.14
247	0.11
248	0.1
249	0.08
250	0.08
251	0.07
252	0.06
253	0.07
254	0.07
255	0.08
256	0.11
257	0.13
258	0.15
259	0.16
260	0.17
261	0.17
262	0.17
263	0.17
264	0.15
265	0.15
266	0.13
267	0.11
268	0.11
269	0.11
270	0.1
271	0.11
272	0.09
273	0.09
274	0.09
275	0.1
276	0.14
277	0.14
278	0.13
279	0.16
280	0.16
281	0.18
282	0.21
283	0.26
284	0.23
285	0.3
286	0.35
287	0.36
288	0.4
289	0.39
290	0.38
291	0.35
292	0.4
293	0.34
294	0.31
295	0.26
296	0.23
297	0.23
298	0.24
299	0.23
300	0.22
301	0.22
302	0.21
303	0.2
304	0.19
305	0.19
306	0.18
307	0.21
308	0.17
309	0.19
310	0.26
311	0.28
312	0.32
313	0.32
314	0.3
315	0.25
316	0.23
317	0.23
318	0.15
319	0.13
320	0.1
321	0.1
322	0.1
323	0.1
324	0.1
325	0.09
326	0.08
327	0.09
328	0.09
329	0.09
330	0.09
331	0.1
332	0.11
333	0.1
334	0.1
335	0.1
336	0.09
337	0.09
338	0.08
339	0.08
340	0.07
341	0.07
342	0.06
343	0.06
344	0.06
345	0.06
346	0.05
347	0.04
348	0.04
349	0.07
350	0.1
351	0.13
352	0.15
353	0.17
354	0.23
355	0.27
356	0.29
357	0.27
358	0.33
359	0.34
360	0.34
361	0.36
362	0.34
363	0.3
364	0.32
365	0.32
366	0.24
367	0.2
368	0.18
369	0.14
370	0.1
371	0.09
372	0.07
373	0.05
374	0.05
375	0.06
376	0.06
377	0.05
378	0.05
379	0.05
380	0.04
381	0.05
382	0.06
383	0.06
384	0.06
385	0.05
386	0.05
387	0.05
388	0.05
389	0.06
390	0.05
391	0.05
392	0.05
393	0.06
394	0.06
395	0.08
396	0.1
397	0.08
398	0.09
399	0.11
400	0.13
401	0.13
402	0.14
403	0.16
404	0.15
405	0.16
406	0.17
407	0.15
408	0.15
409	0.14
410	0.12
411	0.1
412	0.11
413	0.1
414	0.1
415	0.1
416	0.09
417	0.09
418	0.09
419	0.09
420	0.08
421	0.08
422	0.08
423	0.06
424	0.06
425	0.07
426	0.06
427	0.08
428	0.08
429	0.09
430	0.09
431	0.08
432	0.09
433	0.08
434	0.08
435	0.09
436	0.08
437	0.08
438	0.07
439	0.08
440	0.08
441	0.08
442	0.08
443	0.06
444	0.06
445	0.06
446	0.06
447	0.06
448	0.06
449	0.06
450	0.11
451	0.17
452	0.21
453	0.3
454	0.33
455	0.37
456	0.43
457	0.44
458	0.4
459	0.36
460	0.33
461	0.28
462	0.24
463	0.21
464	0.14
465	0.14
466	0.13
467	0.11
468	0.1
469	0.07
470	0.06
471	0.06
472	0.08
473	0.09
474	0.07
475	0.09
476	0.12
477	0.16
478	0.2
479	0.22
480	0.24
481	0.26
482	0.36
483	0.38
484	0.45
485	0.48
486	0.52
487	0.51
488	0.55
489	0.58
490	0.51
491	0.55
492	0.46
493	0.43
494	0.42
495	0.42
496	0.38
497	0.34
498	0.39
499	0.33
500	0.31
501	0.27
502	0.21
503	0.2
504	0.19
505	0.19
506	0.12
507	0.12
508	0.12
509	0.12
510	0.22
511	0.25
512	0.34
513	0.34
514	0.35
515	0.37
516	0.39
517	0.46
518	0.46
519	0.44
520	0.45
521	0.48
522	0.53
523	0.6
524	0.63
525	0.57
526	0.51
527	0.48
528	0.4
529	0.36
530	0.3
531	0.22
532	0.17
533	0.16
534	0.13
535	0.12
536	0.13
537	0.18
538	0.18
539	0.22
540	0.23
541	0.25
542	0.25
543	0.26
544	0.27
545	0.29
546	0.33
547	0.35
548	0.39
549	0.37
550	0.37
551	0.36
552	0.34
553	0.3
554	0.29
555	0.25
556	0.24
557	0.33
558	0.37
559	0.46
560	0.46
561	0.43
562	0.43
563	0.4
564	0.37
565	0.31
566	0.33
567	0.26
568	0.28
569	0.35
570	0.35
571	0.34
572	0.33
573	0.29
574	0.23
575	0.24
576	0.23
577	0.16
578	0.14
579	0.14
580	0.15
581	0.18
582	0.19
583	0.2
584	0.19
585	0.18
586	0.18
587	0.19
588	0.17
589	0.14
590	0.15
591	0.18
592	0.2
593	0.21
594	0.22
595	0.21
596	0.21
597	0.24
598	0.21
599	0.19
600	0.21
601	0.22
602	0.22
603	0.26
604	0.28
605	0.25
606	0.26
607	0.29
608	0.25
609	0.3
610	0.37
611	0.34
612	0.34
613	0.4
614	0.46
615	0.44
616	0.44
617	0.42
618	0.35
619	0.35
620	0.33
621	0.3
622	0.31
623	0.36
624	0.42
625	0.41
626	0.41
627	0.4
628	0.43
629	0.45
630	0.42
631	0.4
632	0.35
633	0.39
634	0.39
635	0.41
636	0.4
637	0.36
638	0.3
639	0.24
640	0.25
641	0.19
642	0.18
643	0.17
644	0.13
645	0.12
646	0.12
647	0.13
648	0.09
649	0.09
650	0.09
651	0.09
652	0.09
653	0.11
654	0.13
655	0.13
656	0.14
657	0.15
658	0.19
659	0.21
660	0.25
661	0.27
662	0.27
663	0.26
664	0.29
665	0.29
666	0.24
667	0.22
668	0.19
669	0.15
670	0.13
671	0.12
672	0.08
673	0.07
674	0.07
675	0.07
676	0.06
677	0.06
678	0.07
679	0.09
680	0.08
681	0.09
682	0.11
683	0.11
684	0.12
685	0.13
686	0.16
687	0.17
688	0.2
689	0.21
690	0.2
691	0.25
692	0.31
693	0.33
694	0.36
695	0.36
696	0.39
697	0.43
698	0.45
699	0.45
700	0.47
701	0.49
702	0.53
703	0.6
704	0.57
705	0.53
706	0.54
707	0.54
708	0.49
709	0.42
710	0.35
711	0.26
712	0.24
713	0.28
714	0.27
715	0.24
716	0.24
717	0.24
718	0.23
719	0.26
720	0.26
721	0.27
722	0.29
723	0.3
724	0.29
725	0.35
726	0.38
727	0.35
728	0.39
729	0.38
730	0.35
731	0.36
732	0.4
733	0.34
734	0.3
735	0.3
736	0.27
737	0.24
738	0.23
739	0.22
740	0.17
741	0.19
742	0.21
743	0.21
744	0.19
745	0.18
746	0.17
747	0.15
748	0.18
749	0.22
750	0.28
751	0.28
752	0.27
753	0.26
754	0.27
755	0.26
756	0.25
757	0.21
758	0.15
759	0.15
760	0.22
761	0.25
762	0.31
763	0.34
764	0.4
765	0.46
766	0.47
767	0.57
768	0.6
769	0.68
770	0.64
771	0.65
772	0.65
773	0.62
774	0.66
775	0.57
776	0.47
777	0.38
778	0.35
779	0.31
780	0.23
781	0.18
782	0.12
783	0.11
784	0.11
785	0.11
786	0.11
787	0.12

A0A1Y1VN60

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer