Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VHI0

Protein Details
Accession A0A1Y1VHI0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
331-354AVKKDAKGDKGKDDKKKSAKGKKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
321-354AKKKAVKDATAVKKDAKGDKGKDDKKKSAKGKKK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032727  CLAMP  
Pfam View protein in Pfam  
PF14769  CLAMP  
Amino Acid Sequences MAYSMQWQDLSLKQINQFYDTVIQQNAISLIESWFPSDDSANKKRILYDFYYFILMFAKEIHLEPIQTSIFFSIMKKTHENCISSPYMKLDEDYALFQKLILDHSIDRPPFSKKYFTLDQITKITDYATNTYFRHYSMYKYTFTKQQKLTLNTVEIVKNLNTKEEDKDEQVIDSEEGNQQNDENIDSSDGTNNETINIVEIDKNIDKKDSSKEIEDIKDKIEEENITEQNNSNITTENNINSENATNQISSENENVDEESKEQNEEKLEEISPREKAIQELKILIENAISPKIQELKVSLTTMLTNSEDQLIKQIKKMDDAKKKAVKDATAVKKDAKGDKGKDDKKKSAKGKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.37
3 0.37
4 0.34
5 0.3
6 0.31
7 0.28
8 0.27
9 0.23
10 0.23
11 0.19
12 0.2
13 0.18
14 0.13
15 0.12
16 0.1
17 0.1
18 0.12
19 0.12
20 0.12
21 0.12
22 0.12
23 0.13
24 0.14
25 0.18
26 0.25
27 0.31
28 0.34
29 0.37
30 0.37
31 0.41
32 0.43
33 0.44
34 0.4
35 0.39
36 0.37
37 0.35
38 0.37
39 0.32
40 0.28
41 0.25
42 0.19
43 0.15
44 0.13
45 0.13
46 0.11
47 0.11
48 0.15
49 0.13
50 0.13
51 0.13
52 0.16
53 0.15
54 0.14
55 0.14
56 0.12
57 0.12
58 0.12
59 0.12
60 0.15
61 0.18
62 0.22
63 0.28
64 0.29
65 0.37
66 0.41
67 0.44
68 0.38
69 0.41
70 0.41
71 0.36
72 0.36
73 0.3
74 0.27
75 0.24
76 0.24
77 0.19
78 0.17
79 0.17
80 0.18
81 0.17
82 0.15
83 0.14
84 0.14
85 0.13
86 0.12
87 0.13
88 0.11
89 0.11
90 0.12
91 0.16
92 0.22
93 0.21
94 0.21
95 0.22
96 0.26
97 0.28
98 0.3
99 0.32
100 0.28
101 0.34
102 0.38
103 0.4
104 0.43
105 0.4
106 0.42
107 0.38
108 0.38
109 0.31
110 0.27
111 0.24
112 0.18
113 0.18
114 0.16
115 0.15
116 0.17
117 0.17
118 0.2
119 0.19
120 0.17
121 0.19
122 0.17
123 0.19
124 0.23
125 0.27
126 0.27
127 0.3
128 0.32
129 0.37
130 0.41
131 0.46
132 0.4
133 0.44
134 0.49
135 0.5
136 0.52
137 0.45
138 0.41
139 0.35
140 0.34
141 0.27
142 0.2
143 0.17
144 0.14
145 0.15
146 0.14
147 0.15
148 0.15
149 0.16
150 0.18
151 0.2
152 0.22
153 0.2
154 0.22
155 0.2
156 0.18
157 0.17
158 0.15
159 0.11
160 0.1
161 0.09
162 0.1
163 0.1
164 0.11
165 0.1
166 0.09
167 0.09
168 0.09
169 0.08
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.07
174 0.07
175 0.09
176 0.08
177 0.09
178 0.09
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.08
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.1
189 0.11
190 0.13
191 0.13
192 0.13
193 0.13
194 0.15
195 0.21
196 0.24
197 0.25
198 0.25
199 0.28
200 0.32
201 0.35
202 0.35
203 0.31
204 0.26
205 0.25
206 0.24
207 0.21
208 0.19
209 0.15
210 0.15
211 0.2
212 0.2
213 0.19
214 0.19
215 0.19
216 0.18
217 0.19
218 0.17
219 0.11
220 0.11
221 0.11
222 0.13
223 0.15
224 0.14
225 0.15
226 0.14
227 0.14
228 0.14
229 0.14
230 0.12
231 0.12
232 0.12
233 0.1
234 0.1
235 0.12
236 0.11
237 0.13
238 0.14
239 0.13
240 0.12
241 0.13
242 0.13
243 0.13
244 0.13
245 0.12
246 0.14
247 0.14
248 0.15
249 0.15
250 0.17
251 0.18
252 0.18
253 0.18
254 0.18
255 0.18
256 0.18
257 0.21
258 0.22
259 0.21
260 0.21
261 0.22
262 0.2
263 0.23
264 0.27
265 0.28
266 0.26
267 0.27
268 0.27
269 0.27
270 0.27
271 0.23
272 0.17
273 0.15
274 0.15
275 0.15
276 0.14
277 0.11
278 0.14
279 0.19
280 0.19
281 0.19
282 0.19
283 0.22
284 0.26
285 0.27
286 0.24
287 0.2
288 0.2
289 0.2
290 0.2
291 0.16
292 0.14
293 0.13
294 0.17
295 0.17
296 0.16
297 0.24
298 0.28
299 0.28
300 0.31
301 0.37
302 0.34
303 0.42
304 0.51
305 0.53
306 0.56
307 0.63
308 0.69
309 0.7
310 0.7
311 0.7
312 0.67
313 0.59
314 0.55
315 0.59
316 0.59
317 0.58
318 0.58
319 0.54
320 0.53
321 0.57
322 0.57
323 0.56
324 0.54
325 0.53
326 0.61
327 0.68
328 0.73
329 0.77
330 0.79
331 0.81
332 0.82
333 0.86
334 0.87