Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1V8F6

Protein Details
Accession A0A1Y1V8F6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-52QNKGNNKKTTTKGKFQDKNNNGGVKKSNNNSKDFTKNKNNNKKASAVHydrophilic
67-87NSIFGKRSNNYQRNNNKNSSFHydrophilic
133-155KGGSPFSKNNGRNNQRNNKSPFTHydrophilic
307-330NEWTTITSRKQKKNSKNGAEKVKQHydrophilic
779-800KFWALLHYRKDKKKLTIKPELEHydrophilic
809-831IEEFRKLRKYYPRHGNNNTLPNNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 12, cyto 6.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006607  DM15  
IPR045180  La_dom_prot  
IPR006630  La_HTH  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF05383  La  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
CDD cd07323  LAM  
Amino Acid Sequences MEGDNQNKGNNKKTTTKGKFQDKNNNGGVKKSNNNSKDFTKNKNNNKKASAVTTNAVATGTTASSANSIFGKRSNNYQRNNNKNSSFFNSSSSNNPFSSSYNSNDNPFSKNSFGSGKSPFSSSYDRSYFNKNKGGSPFSKNNGRNNQRNNKSPFTFNQNTNNVDGLVDINSLDSSKLDMLTMKTYLKQQIEYYFSVENLCKDMYMRQQMDKDGYVHLSTLLKFKRTKSLIDIAKDVDKKSGSEATYDDVWESNLIVDSLDNGDVVEIKKNENEIKLRKKYDWKNWLNPDLTEDKNEDDINVLGDEDNEWTTITSRKQKKNSKNGAEKVKQSNNDDDLFQFDEEWNEEGNNEKDIKKSAIEWSDDENDDINLNETEDQEEDESEYEIDDDQINGLMLVLPRPRQSSGQNSASGSGAFSSSYNRKYGRSFGKSNDMNQVINDGLVFYENNLNRKGSNNQFKTGSSNNSSFKIDDKNKAFSSIQQQRSNLSSNLKKSSYSTSFNDKKNNNSLTNDSKDHSLNSKKDYFKGYSSSPKNINGNKKNQKRLFVPESPAVHSEYLGSTPSPIGYLMTNEAPSKSARSSRNNNAISGPPPSTSVPIAYSLGRPGTSSGLDIPRNSFNRSGILGSSYNNNNNSFGAKNGGQSASSSLGASFKEFPAFQHPSYEILKENGFIQHKYTKFHAKAIKERQLAGIGHSQEMNTMFRFWSHFLRERFNANMYNEFKKLALEDAEAGYRYGLECLFRFYSYGLEVHFRQDIFDDFQTVTLEDYLEKDKLYGLEKFWALLHYRKDKKKLTIKPELEEILKKFPTIEEFRKLRKYYPRHGNNNTLPNNGNGSSNPAPVSSSFTNTPAINLEMDMDLNTMTMDPTLSSADLLGTSTE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.7
3 0.76
4 0.76
5 0.8
6 0.82
7 0.83
8 0.85
9 0.8
10 0.8
11 0.78
12 0.76
13 0.66
14 0.64
15 0.61
16 0.58
17 0.6
18 0.6
19 0.62
20 0.6
21 0.64
22 0.64
23 0.63
24 0.66
25 0.64
26 0.65
27 0.67
28 0.71
29 0.77
30 0.83
31 0.85
32 0.83
33 0.81
34 0.78
35 0.72
36 0.7
37 0.65
38 0.58
39 0.51
40 0.46
41 0.41
42 0.35
43 0.29
44 0.21
45 0.15
46 0.12
47 0.1
48 0.08
49 0.08
50 0.08
51 0.09
52 0.1
53 0.11
54 0.12
55 0.13
56 0.14
57 0.18
58 0.24
59 0.24
60 0.35
61 0.44
62 0.51
63 0.57
64 0.66
65 0.72
66 0.77
67 0.83
68 0.81
69 0.75
70 0.71
71 0.7
72 0.67
73 0.63
74 0.54
75 0.5
76 0.45
77 0.42
78 0.44
79 0.44
80 0.4
81 0.33
82 0.35
83 0.32
84 0.31
85 0.35
86 0.32
87 0.3
88 0.34
89 0.36
90 0.37
91 0.4
92 0.4
93 0.37
94 0.36
95 0.37
96 0.31
97 0.3
98 0.3
99 0.3
100 0.31
101 0.32
102 0.34
103 0.34
104 0.32
105 0.33
106 0.32
107 0.32
108 0.35
109 0.33
110 0.36
111 0.36
112 0.38
113 0.39
114 0.48
115 0.5
116 0.51
117 0.55
118 0.49
119 0.52
120 0.54
121 0.59
122 0.54
123 0.55
124 0.55
125 0.54
126 0.63
127 0.61
128 0.65
129 0.69
130 0.72
131 0.73
132 0.76
133 0.81
134 0.78
135 0.83
136 0.8
137 0.78
138 0.72
139 0.69
140 0.62
141 0.61
142 0.6
143 0.56
144 0.58
145 0.55
146 0.54
147 0.5
148 0.46
149 0.37
150 0.3
151 0.25
152 0.17
153 0.12
154 0.1
155 0.08
156 0.07
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.06
161 0.07
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.1
166 0.12
167 0.14
168 0.16
169 0.16
170 0.17
171 0.21
172 0.27
173 0.27
174 0.28
175 0.28
176 0.31
177 0.35
178 0.34
179 0.33
180 0.27
181 0.25
182 0.26
183 0.24
184 0.19
185 0.16
186 0.15
187 0.12
188 0.12
189 0.17
190 0.22
191 0.3
192 0.31
193 0.33
194 0.36
195 0.39
196 0.41
197 0.39
198 0.32
199 0.25
200 0.25
201 0.2
202 0.18
203 0.17
204 0.16
205 0.15
206 0.21
207 0.21
208 0.24
209 0.27
210 0.29
211 0.37
212 0.37
213 0.4
214 0.39
215 0.46
216 0.46
217 0.46
218 0.46
219 0.38
220 0.43
221 0.42
222 0.36
223 0.31
224 0.26
225 0.23
226 0.25
227 0.28
228 0.21
229 0.21
230 0.21
231 0.2
232 0.2
233 0.2
234 0.17
235 0.12
236 0.12
237 0.1
238 0.09
239 0.07
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.05
244 0.06
245 0.07
246 0.07
247 0.06
248 0.05
249 0.05
250 0.07
251 0.08
252 0.12
253 0.11
254 0.12
255 0.14
256 0.17
257 0.2
258 0.23
259 0.3
260 0.34
261 0.43
262 0.5
263 0.53
264 0.56
265 0.63
266 0.68
267 0.71
268 0.73
269 0.71
270 0.72
271 0.76
272 0.77
273 0.69
274 0.59
275 0.53
276 0.47
277 0.4
278 0.32
279 0.26
280 0.21
281 0.22
282 0.21
283 0.17
284 0.13
285 0.12
286 0.11
287 0.1
288 0.08
289 0.06
290 0.06
291 0.07
292 0.06
293 0.07
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.07
298 0.11
299 0.15
300 0.23
301 0.33
302 0.41
303 0.51
304 0.6
305 0.7
306 0.77
307 0.83
308 0.84
309 0.85
310 0.84
311 0.84
312 0.79
313 0.76
314 0.73
315 0.69
316 0.63
317 0.56
318 0.54
319 0.47
320 0.43
321 0.37
322 0.29
323 0.25
324 0.22
325 0.19
326 0.14
327 0.11
328 0.1
329 0.11
330 0.11
331 0.09
332 0.07
333 0.07
334 0.1
335 0.11
336 0.12
337 0.13
338 0.12
339 0.13
340 0.16
341 0.17
342 0.15
343 0.16
344 0.19
345 0.21
346 0.22
347 0.23
348 0.24
349 0.26
350 0.25
351 0.24
352 0.19
353 0.15
354 0.14
355 0.12
356 0.1
357 0.07
358 0.07
359 0.07
360 0.07
361 0.08
362 0.07
363 0.08
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.06
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.06
384 0.08
385 0.09
386 0.1
387 0.12
388 0.14
389 0.15
390 0.19
391 0.25
392 0.31
393 0.33
394 0.34
395 0.32
396 0.32
397 0.3
398 0.26
399 0.18
400 0.11
401 0.07
402 0.06
403 0.06
404 0.08
405 0.11
406 0.13
407 0.16
408 0.17
409 0.18
410 0.2
411 0.27
412 0.33
413 0.35
414 0.37
415 0.36
416 0.45
417 0.44
418 0.44
419 0.44
420 0.36
421 0.3
422 0.27
423 0.25
424 0.16
425 0.15
426 0.13
427 0.06
428 0.04
429 0.05
430 0.05
431 0.04
432 0.09
433 0.11
434 0.13
435 0.14
436 0.15
437 0.15
438 0.18
439 0.23
440 0.26
441 0.35
442 0.35
443 0.37
444 0.38
445 0.38
446 0.4
447 0.37
448 0.33
449 0.26
450 0.28
451 0.27
452 0.27
453 0.28
454 0.24
455 0.23
456 0.27
457 0.27
458 0.31
459 0.32
460 0.35
461 0.35
462 0.38
463 0.36
464 0.31
465 0.37
466 0.39
467 0.44
468 0.43
469 0.43
470 0.41
471 0.43
472 0.43
473 0.35
474 0.32
475 0.29
476 0.29
477 0.33
478 0.32
479 0.3
480 0.28
481 0.33
482 0.32
483 0.32
484 0.3
485 0.36
486 0.42
487 0.45
488 0.51
489 0.46
490 0.47
491 0.5
492 0.53
493 0.46
494 0.42
495 0.43
496 0.41
497 0.44
498 0.4
499 0.33
500 0.3
501 0.28
502 0.27
503 0.28
504 0.29
505 0.28
506 0.31
507 0.38
508 0.37
509 0.39
510 0.43
511 0.39
512 0.34
513 0.35
514 0.33
515 0.35
516 0.38
517 0.4
518 0.38
519 0.4
520 0.44
521 0.47
522 0.54
523 0.52
524 0.59
525 0.64
526 0.7
527 0.76
528 0.73
529 0.72
530 0.66
531 0.67
532 0.64
533 0.58
534 0.55
535 0.5
536 0.49
537 0.45
538 0.42
539 0.35
540 0.27
541 0.22
542 0.18
543 0.13
544 0.11
545 0.1
546 0.09
547 0.07
548 0.07
549 0.07
550 0.07
551 0.06
552 0.06
553 0.06
554 0.07
555 0.08
556 0.09
557 0.11
558 0.11
559 0.11
560 0.11
561 0.12
562 0.13
563 0.14
564 0.2
565 0.26
566 0.33
567 0.41
568 0.49
569 0.59
570 0.57
571 0.56
572 0.51
573 0.47
574 0.4
575 0.36
576 0.28
577 0.18
578 0.19
579 0.19
580 0.18
581 0.16
582 0.15
583 0.13
584 0.14
585 0.15
586 0.13
587 0.13
588 0.13
589 0.14
590 0.13
591 0.12
592 0.11
593 0.12
594 0.11
595 0.11
596 0.13
597 0.17
598 0.19
599 0.19
600 0.21
601 0.26
602 0.28
603 0.3
604 0.28
605 0.24
606 0.25
607 0.26
608 0.24
609 0.17
610 0.19
611 0.17
612 0.16
613 0.2
614 0.2
615 0.23
616 0.25
617 0.25
618 0.23
619 0.23
620 0.24
621 0.2
622 0.17
623 0.18
624 0.16
625 0.17
626 0.18
627 0.18
628 0.16
629 0.16
630 0.18
631 0.15
632 0.15
633 0.13
634 0.11
635 0.12
636 0.12
637 0.14
638 0.13
639 0.12
640 0.14
641 0.14
642 0.15
643 0.22
644 0.26
645 0.24
646 0.27
647 0.27
648 0.29
649 0.31
650 0.31
651 0.24
652 0.21
653 0.22
654 0.18
655 0.18
656 0.2
657 0.21
658 0.2
659 0.23
660 0.28
661 0.3
662 0.32
663 0.36
664 0.4
665 0.39
666 0.46
667 0.49
668 0.49
669 0.57
670 0.64
671 0.69
672 0.61
673 0.6
674 0.55
675 0.53
676 0.46
677 0.39
678 0.35
679 0.27
680 0.26
681 0.25
682 0.22
683 0.19
684 0.2
685 0.19
686 0.13
687 0.13
688 0.12
689 0.13
690 0.16
691 0.17
692 0.22
693 0.27
694 0.34
695 0.36
696 0.43
697 0.44
698 0.46
699 0.46
700 0.43
701 0.42
702 0.37
703 0.43
704 0.4
705 0.42
706 0.38
707 0.36
708 0.32
709 0.27
710 0.25
711 0.2
712 0.17
713 0.14
714 0.15
715 0.16
716 0.17
717 0.17
718 0.16
719 0.13
720 0.11
721 0.1
722 0.09
723 0.09
724 0.1
725 0.09
726 0.15
727 0.17
728 0.16
729 0.17
730 0.16
731 0.18
732 0.17
733 0.18
734 0.14
735 0.17
736 0.17
737 0.19
738 0.22
739 0.19
740 0.18
741 0.19
742 0.2
743 0.21
744 0.21
745 0.21
746 0.18
747 0.19
748 0.2
749 0.18
750 0.16
751 0.11
752 0.11
753 0.09
754 0.12
755 0.14
756 0.14
757 0.13
758 0.13
759 0.14
760 0.16
761 0.2
762 0.2
763 0.19
764 0.24
765 0.24
766 0.25
767 0.24
768 0.24
769 0.24
770 0.27
771 0.33
772 0.38
773 0.48
774 0.55
775 0.63
776 0.68
777 0.75
778 0.8
779 0.81
780 0.8
781 0.82
782 0.79
783 0.74
784 0.72
785 0.66
786 0.59
787 0.55
788 0.49
789 0.46
790 0.41
791 0.37
792 0.32
793 0.3
794 0.34
795 0.36
796 0.39
797 0.41
798 0.47
799 0.54
800 0.63
801 0.63
802 0.63
803 0.66
804 0.68
805 0.69
806 0.73
807 0.76
808 0.77
809 0.83
810 0.85
811 0.83
812 0.85
813 0.78
814 0.71
815 0.62
816 0.54
817 0.52
818 0.42
819 0.35
820 0.25
821 0.3
822 0.28
823 0.29
824 0.27
825 0.22
826 0.23
827 0.22
828 0.29
829 0.23
830 0.25
831 0.25
832 0.26
833 0.29
834 0.28
835 0.28
836 0.24
837 0.23
838 0.19
839 0.17
840 0.17
841 0.14
842 0.14
843 0.13
844 0.11
845 0.09
846 0.08
847 0.08
848 0.07
849 0.06
850 0.06
851 0.06
852 0.06
853 0.07
854 0.09
855 0.09
856 0.09
857 0.09
858 0.1
859 0.09