FuNGI

A0A1Y1V338

Protein Details

Accession

A0A1Y1V338

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
27-47	DGVAPRAKMNQQRSRRFRAAL	Hydrophilic
312-345	DQTFRERRKKEERYREMAKKRRHDQRKRELGIKD	Basic
384-409	NSSNNNKSKKEKEKEKEKGKEKDKEK	Basic
879-898	NNNRNNRRFNNNNNNNNNNN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
317-339	ERRKKEERYREMAKKRRHDQRKR
390-411	KSKKEKEKEKEKGKEKDKEKEK

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, mito_nucl 11.333, cyto 5.5, cyto_mito 5.333

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MLIEVFKYIDRLMNMVRPRKLLYLAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRAALDAIKKNEEEERKREEMEKRGETIIEPTKEKVNFDSNCITPGTPFMDKLSRYLKYYINDRLNNNPGWKGLKVILSDAGVPGEGEHKIMDFIRRQRNSEGYDPNTHHVMYGLDADLIMLSMATHEPHFKIIREDVFYQQTKNEYRNQYADPTRQDETSIVEDKPKPFLFFHINILKEYLEAELKIDNLPFQYDVERIIDDWVFLCFFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDVLIKIYRRLLPSFGGYITDSGEINLDHVKEIMIELGELEDQTFRERRKKEERYREMAKKRRHDQRKRELGIKDDYMDKYNKNRIDYSKRDDDLRDDIPVLLKQNEVFIENPNSSNNNKSKKEKEKEKEKGKEKDKEKEKESPIENQNLPELIELGNNITSNREIIKRKKESLKASAEQNRDIVAQKRANRLRNQAAAAELRSGINNFKPQNDLNENKRKYSDDSSSTSYSLSTDSALSIKKPRIDDEDDSENSEPEPEDDIKLWEAGWKERYYKNKFGVEIDDIDFRNKVVEAYTEGLCWVLKYYYQGCQSWNWYYPYHYSPFASDYCNVKSFKIKFKLGEPFKPFEQLMGVLPAASGSHIPKAFRHLMTDADSSIIEYYPEEFRIDMNGKKQSWLGVALLPFIDEKRLLKALEPYYPQLTEEEKERNSRGHEILYVDSSNLLYETIESLYKNKKTYELTKENSKNLNGSLDILKKNYYLPGDVFISPLKEYDLPDLKDIQTIGAIYTNPSYEEGYVFKSHLLPNVELPAPVLNPNDIYMARKRGKNNRNKLNMDAANRMMRNGYNNNNNYGYNNNNYNNYNNNSRSGNSYNHRNDATQKFYGDSLNNNRNNRRFNNNNNNNNNNNNNNNNKYRNYGGGYFNNYNSNNNSNYQNSYFNNNMNNINSNINNNMNNNMNNNMNNFMNMMNQSSFTNNNNNNNNTSLMNYNNFNSMNNMGSMNNMNNNMNINMNMNMNTNNMGMNMNNMSMNNINMNNMSSMNMNNMNMNMNMNMNMNNMSLSNMNMNNMNMNSMNMNNMNMNNMNINNMNINSMNSMNSMNSMNNMNMNVNMNNMNNMSNMNNMNSFNNFNFSMNNMNGQMSYLFNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNSNTNINLNQNFSWNNMQNYS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.35
2	0.42
3	0.44
4	0.44
5	0.46
6	0.47
7	0.47
8	0.44
9	0.4
10	0.4
11	0.37
12	0.34
13	0.32
14	0.29
15	0.28
16	0.26
17	0.21
18	0.14
19	0.17
20	0.24
21	0.31
22	0.42
23	0.49
24	0.57
25	0.68
26	0.76
27	0.81
28	0.82
29	0.77
30	0.69
31	0.69
32	0.68
33	0.67
34	0.67
35	0.65
36	0.61
37	0.61
38	0.58
39	0.51
40	0.49
41	0.5
42	0.48
43	0.47
44	0.52
45	0.52
46	0.55
47	0.6
48	0.6
49	0.59
50	0.62
51	0.6
52	0.55
53	0.53
54	0.51
55	0.44
56	0.44
57	0.43
58	0.38
59	0.35
60	0.34
61	0.39
62	0.4
63	0.41
64	0.38
65	0.39
66	0.36
67	0.39
68	0.43
69	0.37
70	0.37
71	0.37
72	0.32
73	0.23
74	0.25
75	0.25
76	0.2
77	0.21
78	0.23
79	0.28
80	0.28
81	0.33
82	0.37
83	0.35
84	0.36
85	0.4
86	0.41
87	0.4
88	0.46
89	0.51
90	0.53
91	0.56
92	0.56
93	0.6
94	0.61
95	0.6
96	0.56
97	0.49
98	0.43
99	0.41
100	0.38
101	0.32
102	0.3
103	0.3
104	0.28
105	0.28
106	0.27
107	0.24
108	0.24
109	0.21
110	0.17
111	0.13
112	0.11
113	0.1
114	0.1
115	0.09
116	0.09
117	0.08
118	0.08
119	0.1
120	0.12
121	0.17
122	0.22
123	0.31
124	0.41
125	0.45
126	0.48
127	0.52
128	0.58
129	0.58
130	0.59
131	0.59
132	0.54
133	0.58
134	0.57
135	0.55
136	0.5
137	0.44
138	0.36
139	0.28
140	0.23
141	0.16
142	0.15
143	0.12
144	0.1
145	0.1
146	0.1
147	0.08
148	0.08
149	0.06
150	0.04
151	0.03
152	0.04
153	0.05
154	0.06
155	0.07
156	0.09
157	0.11
158	0.16
159	0.19
160	0.19
161	0.23
162	0.28
163	0.31
164	0.34
165	0.36
166	0.36
167	0.41
168	0.41
169	0.38
170	0.35
171	0.37
172	0.36
173	0.37
174	0.41
175	0.4
176	0.43
177	0.47
178	0.47
179	0.49
180	0.51
181	0.54
182	0.51
183	0.5
184	0.46
185	0.42
186	0.4
187	0.33
188	0.3
189	0.29
190	0.27
191	0.23
192	0.27
193	0.31
194	0.31
195	0.38
196	0.35
197	0.32
198	0.3
199	0.34
200	0.35
201	0.34
202	0.4
203	0.39
204	0.39
205	0.37
206	0.38
207	0.32
208	0.25
209	0.23
210	0.17
211	0.12
212	0.11
213	0.11
214	0.1
215	0.11
216	0.12
217	0.12
218	0.11
219	0.1
220	0.12
221	0.11
222	0.11
223	0.12
224	0.12
225	0.13
226	0.14
227	0.14
228	0.13
229	0.14
230	0.13
231	0.11
232	0.11
233	0.1
234	0.09
235	0.08
236	0.08
237	0.06
238	0.06
239	0.07
240	0.08
241	0.07
242	0.08
243	0.09
244	0.09
245	0.1
246	0.1
247	0.1
248	0.09
249	0.1
250	0.13
251	0.15
252	0.15
253	0.14
254	0.14
255	0.14
256	0.13
257	0.12
258	0.08
259	0.06
260	0.07
261	0.09
262	0.08
263	0.09
264	0.12
265	0.15
266	0.18
267	0.2
268	0.2
269	0.21
270	0.23
271	0.25
272	0.22
273	0.2
274	0.17
275	0.16
276	0.15
277	0.14
278	0.11
279	0.09
280	0.1
281	0.08
282	0.09
283	0.1
284	0.09
285	0.08
286	0.09
287	0.08
288	0.08
289	0.08
290	0.08
291	0.06
292	0.05
293	0.05
294	0.05
295	0.05
296	0.05
297	0.05
298	0.05
299	0.06
300	0.09
301	0.13
302	0.16
303	0.25
304	0.27
305	0.36
306	0.46
307	0.57
308	0.64
309	0.72
310	0.78
311	0.77
312	0.85
313	0.86
314	0.86
315	0.84
316	0.83
317	0.81
318	0.81
319	0.84
320	0.85
321	0.86
322	0.87
323	0.89
324	0.9
325	0.85
326	0.83
327	0.75
328	0.69
329	0.64
330	0.55
331	0.46
332	0.39
333	0.36
334	0.32
335	0.32
336	0.29
337	0.31
338	0.36
339	0.38
340	0.37
341	0.4
342	0.45
343	0.52
344	0.56
345	0.57
346	0.58
347	0.56
348	0.55
349	0.51
350	0.47
351	0.43
352	0.37
353	0.31
354	0.23
355	0.22
356	0.21
357	0.21
358	0.19
359	0.15
360	0.14
361	0.12
362	0.14
363	0.14
364	0.13
365	0.13
366	0.14
367	0.17
368	0.18
369	0.18
370	0.18
371	0.2
372	0.2
373	0.27
374	0.31
375	0.35
376	0.4
377	0.46
378	0.55
379	0.63
380	0.71
381	0.75
382	0.77
383	0.8
384	0.84
385	0.88
386	0.88
387	0.87
388	0.87
389	0.85
390	0.84
391	0.8
392	0.79
393	0.79
394	0.76
395	0.72
396	0.71
397	0.67
398	0.65
399	0.61
400	0.6
401	0.55
402	0.54
403	0.5
404	0.41
405	0.38
406	0.31
407	0.28
408	0.19
409	0.15
410	0.09
411	0.08
412	0.07
413	0.07
414	0.08
415	0.07
416	0.07
417	0.08
418	0.07
419	0.08
420	0.1
421	0.15
422	0.21
423	0.28
424	0.38
425	0.44
426	0.5
427	0.58
428	0.64
429	0.64
430	0.66
431	0.67
432	0.6
433	0.62
434	0.63
435	0.57
436	0.51
437	0.45
438	0.37
439	0.3
440	0.29
441	0.24
442	0.24
443	0.27
444	0.3
445	0.39
446	0.45
447	0.5
448	0.53
449	0.57
450	0.56
451	0.55
452	0.52
453	0.43
454	0.39
455	0.34
456	0.29
457	0.22
458	0.16
459	0.12
460	0.11
461	0.11
462	0.1
463	0.11
464	0.16
465	0.16
466	0.17
467	0.2
468	0.2
469	0.27
470	0.32
471	0.34
472	0.37
473	0.47
474	0.47
475	0.46
476	0.47
477	0.42
478	0.4
479	0.4
480	0.37
481	0.31
482	0.34
483	0.37
484	0.36
485	0.35
486	0.3
487	0.25
488	0.19
489	0.15
490	0.12
491	0.08
492	0.07
493	0.07
494	0.08
495	0.09
496	0.1
497	0.14
498	0.16
499	0.19
500	0.2
501	0.21
502	0.26
503	0.3
504	0.31
505	0.32
506	0.36
507	0.32
508	0.34
509	0.32
510	0.26
511	0.21
512	0.19
513	0.14
514	0.09
515	0.11
516	0.09
517	0.1
518	0.1
519	0.11
520	0.11
521	0.11
522	0.1
523	0.1
524	0.1
525	0.12
526	0.15
527	0.15
528	0.19
529	0.23
530	0.33
531	0.37
532	0.43
533	0.47
534	0.47
535	0.47
536	0.44
537	0.43
538	0.36
539	0.31
540	0.25
541	0.22
542	0.18
543	0.18
544	0.16
545	0.13
546	0.12
547	0.09
548	0.08
549	0.06
550	0.06
551	0.08
552	0.1
553	0.1
554	0.1
555	0.1
556	0.1
557	0.09
558	0.08
559	0.07
560	0.04
561	0.05
562	0.07
563	0.09
564	0.14
565	0.17
566	0.18
567	0.19
568	0.2
569	0.23
570	0.24
571	0.25
572	0.23
573	0.2
574	0.21
575	0.23
576	0.24
577	0.23
578	0.21
579	0.18
580	0.17
581	0.19
582	0.18
583	0.17
584	0.16
585	0.17
586	0.18
587	0.22
588	0.21
589	0.19
590	0.25
591	0.27
592	0.33
593	0.37
594	0.37
595	0.34
596	0.39
597	0.48
598	0.45
599	0.49
600	0.45
601	0.42
602	0.4
603	0.41
604	0.36
605	0.26
606	0.23
607	0.16
608	0.12
609	0.11
610	0.1
611	0.07
612	0.07
613	0.06
614	0.05
615	0.05
616	0.05
617	0.04
618	0.08
619	0.09
620	0.1
621	0.1
622	0.16
623	0.2
624	0.2
625	0.21
626	0.19
627	0.2
628	0.23
629	0.23
630	0.17
631	0.14
632	0.14
633	0.11
634	0.11
635	0.09
636	0.05
637	0.05
638	0.06
639	0.07
640	0.07
641	0.08
642	0.07
643	0.07
644	0.11
645	0.14
646	0.14
647	0.18
648	0.23
649	0.23
650	0.24
651	0.24
652	0.21
653	0.2
654	0.19
655	0.16
656	0.12
657	0.12
658	0.11
659	0.11
660	0.1
661	0.09
662	0.07
663	0.07
664	0.06
665	0.06
666	0.09
667	0.11
668	0.11
669	0.12
670	0.19
671	0.2
672	0.24
673	0.25
674	0.25
675	0.24
676	0.24
677	0.23
678	0.18
679	0.18
680	0.14
681	0.16
682	0.19
683	0.19
684	0.22
685	0.23
686	0.23
687	0.25
688	0.28
689	0.26
690	0.22
691	0.22
692	0.21
693	0.21
694	0.2
695	0.17
696	0.13
697	0.12
698	0.1
699	0.09
700	0.07
701	0.06
702	0.04
703	0.04
704	0.05
705	0.06
706	0.06
707	0.07
708	0.1
709	0.16
710	0.2
711	0.21
712	0.21
713	0.25
714	0.29
715	0.37
716	0.43
717	0.46
718	0.47
719	0.55
720	0.58
721	0.59
722	0.58
723	0.51
724	0.43
725	0.35
726	0.33
727	0.23
728	0.2
729	0.19
730	0.2
731	0.21
732	0.2
733	0.2
734	0.18
735	0.19
736	0.2
737	0.17
738	0.14
739	0.13
740	0.15
741	0.17
742	0.17
743	0.17
744	0.14
745	0.15
746	0.13
747	0.13
748	0.12
749	0.1
750	0.11
751	0.16
752	0.22
753	0.22
754	0.23
755	0.25
756	0.23
757	0.24
758	0.23
759	0.17
760	0.11
761	0.1
762	0.09
763	0.08
764	0.08
765	0.08
766	0.08
767	0.08
768	0.08
769	0.09
770	0.1
771	0.08
772	0.09
773	0.1
774	0.12
775	0.13
776	0.13
777	0.12
778	0.15
779	0.15
780	0.19
781	0.2
782	0.18
783	0.19
784	0.22
785	0.21
786	0.19
787	0.18
788	0.15
789	0.12
790	0.13
791	0.13
792	0.09
793	0.09
794	0.1
795	0.12
796	0.11
797	0.13
798	0.15
799	0.23
800	0.28
801	0.32
802	0.39
803	0.48
804	0.57
805	0.65
806	0.71
807	0.73
808	0.78
809	0.76
810	0.72
811	0.71
812	0.66
813	0.6
814	0.53
815	0.46
816	0.42
817	0.38
818	0.35
819	0.27
820	0.23
821	0.24
822	0.26
823	0.29
824	0.33
825	0.35
826	0.38
827	0.39
828	0.39
829	0.35
830	0.33
831	0.3
832	0.25
833	0.29
834	0.27
835	0.29
836	0.3
837	0.31
838	0.33
839	0.34
840	0.37
841	0.32
842	0.34
843	0.32
844	0.31
845	0.34
846	0.32
847	0.36
848	0.33
849	0.42
850	0.42
851	0.45
852	0.45
853	0.41
854	0.45
855	0.45
856	0.46
857	0.38
858	0.35
859	0.32
860	0.31
861	0.33
862	0.26
863	0.27
864	0.3
865	0.37
866	0.43
867	0.47
868	0.53
869	0.56
870	0.62
871	0.6
872	0.6
873	0.59
874	0.64
875	0.7
876	0.73
877	0.77
878	0.78
879	0.8
880	0.75
881	0.72
882	0.67
883	0.62
884	0.57
885	0.54
886	0.54
887	0.53
888	0.56
889	0.56
890	0.52
891	0.5
892	0.47
893	0.44
894	0.41
895	0.39
896	0.38
897	0.38
898	0.43
899	0.41
900	0.4
901	0.42
902	0.39
903	0.37
904	0.34
905	0.33
906	0.28
907	0.29
908	0.31
909	0.27
910	0.3
911	0.3
912	0.32
913	0.3
914	0.33
915	0.33
916	0.33
917	0.34
918	0.33
919	0.33
920	0.29
921	0.31
922	0.27
923	0.28
924	0.25
925	0.24
926	0.24
927	0.25
928	0.26
929	0.24
930	0.25
931	0.26
932	0.26
933	0.26
934	0.25
935	0.25
936	0.24
937	0.24
938	0.24
939	0.2
940	0.19
941	0.18
942	0.16
943	0.15
944	0.15
945	0.16
946	0.13
947	0.14
948	0.15
949	0.16
950	0.19
951	0.18
952	0.27
953	0.3
954	0.38
955	0.44
956	0.46
957	0.46
958	0.45
959	0.44
960	0.35
961	0.32
962	0.26
963	0.22
964	0.22
965	0.22
966	0.21
967	0.23
968	0.23
969	0.21
970	0.22
971	0.2
972	0.19
973	0.18
974	0.18
975	0.14
976	0.15
977	0.17
978	0.16
979	0.18
980	0.19
981	0.19
982	0.19
983	0.21
984	0.2
985	0.19
986	0.17
987	0.16
988	0.15
989	0.16
990	0.16
991	0.15
992	0.15
993	0.15
994	0.16
995	0.14
996	0.13
997	0.12
998	0.12
999	0.11
1000	0.13
1001	0.13
1002	0.12
1003	0.12
1004	0.12
1005	0.14
1006	0.14
1007	0.15
1008	0.16
1009	0.15
1010	0.15
1011	0.15
1012	0.16
1013	0.15
1014	0.14
1015	0.14
1016	0.12
1017	0.12
1018	0.15
1019	0.17
1020	0.16
1021	0.16
1022	0.17
1023	0.18
1024	0.17
1025	0.18
1026	0.15
1027	0.13
1028	0.14
1029	0.14
1030	0.14
1031	0.13
1032	0.14
1033	0.13
1034	0.12
1035	0.11
1036	0.12
1037	0.11
1038	0.11
1039	0.15
1040	0.15
1041	0.16
1042	0.17
1043	0.18
1044	0.2
1045	0.19
1046	0.21
1047	0.16
1048	0.16
1049	0.17
1050	0.15
1051	0.18
1052	0.15
1053	0.17
1054	0.17
1055	0.17
1056	0.2
1057	0.19
1058	0.19
1059	0.19
1060	0.18
1061	0.2
1062	0.19
1063	0.2
1064	0.18
1065	0.18
1066	0.19
1067	0.17
1068	0.17
1069	0.17
1070	0.16
1071	0.16
1072	0.14
1073	0.15
1074	0.13
1075	0.14
1076	0.15
1077	0.13
1078	0.14
1079	0.16
1080	0.16
1081	0.17
1082	0.18
1083	0.17
1084	0.18
1085	0.21
1086	0.19
1087	0.19
1088	0.22
1089	0.2
1090	0.21
1091	0.21
1092	0.2
1093	0.17
1094	0.18
1095	0.17
1096	0.18
1097	0.19
1098	0.19
1099	0.21
1100	0.22
1101	0.24
1102	0.25
1103	0.28
1104	0.24
1105	0.26
1106	0.26
1107	0.23
1108	0.23
1109	0.22
1110	0.26
1111	0.23
1112	0.26
1113	0.23
1114	0.22
1115	0.21
1116	0.22
1117	0.2
1118	0.16
1119	0.17
1120	0.17
1121	0.19
1122	0.22
1123	0.31
1124	0.35
1125	0.42
1126	0.45
1127	0.47
1128	0.47
1129	0.5
1130	0.52
1131	0.49
1132	0.5
1133	0.47
1134	0.48
1135	0.5
1136	0.52
1137	0.52
1138	0.52
1139	0.52
1140	0.52
1141	0.52
1142	0.52
1143	0.52
1144	0.52
1145	0.52
1146	0.52
1147	0.52
1148	0.52
1149	0.52
1150	0.52
1151	0.52
1152	0.52
1153	0.52
1154	0.52
1155	0.53
1156	0.52
1157	0.51
1158	0.48
1159	0.45
1160	0.43
1161	0.39
1162	0.39
1163	0.37
1164	0.39
1165	0.38
1166	0.39
1167	0.37
1168	0.39
1169	0.37
1170	0.36
1171	0.41
1172	0.38

A0A1Y1V338

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer