Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VHI6

Protein Details
Accession A0A1Y1VHI6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
265-291KSENPKYKGKWTPKKIKNPEYKGKWIQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
272-281KGKWTPKKIK
362-388ERKKIMDEKNKRAAKKAEEMNEKRRKL
Subcellular Location(s) nucl 7, cyto_mito 7, mito 6.5, cyto 6.5, vacu 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001580  Calret/calnex  
IPR018124  Calret/calnex_CS  
IPR009169  Calreticulin  
IPR009033  Calreticulin/calnexin_P_dom_sf  
IPR013320  ConA-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005788  C:endoplasmic reticulum lumen  
GO:0005509  F:calcium ion binding  
GO:0051082  F:unfolded protein binding  
GO:0006457  P:protein folding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00262  Calreticulin  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00803  CALRETICULIN_1  
PS00805  CALRETICULIN_REPEAT  
Amino Acid Sequences MRFGTTLAILSFCAAAFGKVYFHETFDDDSWEKHWVQSTYKDDYGKFKISNGKEFRADPVKSRGLQTSQNAKFYSISAPFDEAFNNKEKDLIVQFSVRHEQNIDCGGGYIKVLPPNIDPKEFNGETPYNIMFGSDICGANKKTHLILSYKGKNHLIKKEIPTEDDTYTHLYTLVIKPDQTYSVSIDNVEKASGSFEDWDFLEPKTIPDPEKTKPADWVDDEYIDDPNDKKPDDWDEDEPQYIDDPEAEKPEDWDDDMDGEWEAPKSENPKYKGKWTPKKIKNPEYKGKWIQPEIPNPDYFDDKEIYVYDSGFVGFDLWQVKAGSIFDDIVVTDDAEEAKTFATEVMDKIKAEKEDEEKVAAERKKIMDEKNKRAAKKAEEMNEKRRKLERENHPEAYADEEESNDDSEEEMEETKEEEKEEVKEETKEETKEEAKEEEKKENVKDEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.09
3 0.09
4 0.1
5 0.11
6 0.11
7 0.17
8 0.15
9 0.17
10 0.19
11 0.2
12 0.23
13 0.23
14 0.28
15 0.24
16 0.24
17 0.24
18 0.26
19 0.24
20 0.23
21 0.28
22 0.25
23 0.29
24 0.37
25 0.41
26 0.44
27 0.48
28 0.49
29 0.45
30 0.49
31 0.51
32 0.48
33 0.43
34 0.41
35 0.46
36 0.47
37 0.55
38 0.54
39 0.53
40 0.51
41 0.51
42 0.53
43 0.52
44 0.49
45 0.44
46 0.46
47 0.48
48 0.46
49 0.47
50 0.46
51 0.41
52 0.46
53 0.48
54 0.51
55 0.49
56 0.52
57 0.5
58 0.46
59 0.43
60 0.38
61 0.36
62 0.29
63 0.27
64 0.23
65 0.25
66 0.24
67 0.24
68 0.24
69 0.19
70 0.18
71 0.22
72 0.22
73 0.19
74 0.2
75 0.2
76 0.22
77 0.24
78 0.24
79 0.2
80 0.22
81 0.23
82 0.26
83 0.32
84 0.28
85 0.26
86 0.25
87 0.23
88 0.23
89 0.25
90 0.21
91 0.15
92 0.15
93 0.14
94 0.13
95 0.12
96 0.11
97 0.1
98 0.13
99 0.14
100 0.14
101 0.16
102 0.25
103 0.27
104 0.29
105 0.27
106 0.27
107 0.36
108 0.35
109 0.33
110 0.3
111 0.28
112 0.26
113 0.28
114 0.25
115 0.17
116 0.16
117 0.16
118 0.1
119 0.09
120 0.11
121 0.1
122 0.1
123 0.1
124 0.14
125 0.15
126 0.17
127 0.19
128 0.18
129 0.16
130 0.18
131 0.2
132 0.19
133 0.23
134 0.31
135 0.37
136 0.38
137 0.41
138 0.44
139 0.47
140 0.51
141 0.53
142 0.49
143 0.48
144 0.5
145 0.55
146 0.51
147 0.48
148 0.45
149 0.41
150 0.37
151 0.31
152 0.28
153 0.23
154 0.22
155 0.19
156 0.16
157 0.12
158 0.14
159 0.15
160 0.18
161 0.14
162 0.14
163 0.15
164 0.16
165 0.17
166 0.15
167 0.14
168 0.13
169 0.14
170 0.14
171 0.14
172 0.14
173 0.14
174 0.13
175 0.11
176 0.09
177 0.07
178 0.08
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.08
184 0.08
185 0.1
186 0.09
187 0.09
188 0.11
189 0.1
190 0.11
191 0.12
192 0.14
193 0.14
194 0.17
195 0.21
196 0.2
197 0.29
198 0.3
199 0.28
200 0.32
201 0.32
202 0.31
203 0.28
204 0.3
205 0.23
206 0.22
207 0.21
208 0.16
209 0.15
210 0.12
211 0.12
212 0.09
213 0.11
214 0.12
215 0.12
216 0.12
217 0.13
218 0.18
219 0.22
220 0.25
221 0.26
222 0.28
223 0.29
224 0.29
225 0.27
226 0.22
227 0.18
228 0.14
229 0.1
230 0.07
231 0.07
232 0.08
233 0.1
234 0.1
235 0.1
236 0.1
237 0.12
238 0.12
239 0.11
240 0.1
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.05
249 0.06
250 0.06
251 0.07
252 0.11
253 0.16
254 0.23
255 0.27
256 0.36
257 0.38
258 0.46
259 0.55
260 0.61
261 0.66
262 0.69
263 0.76
264 0.77
265 0.86
266 0.87
267 0.88
268 0.87
269 0.86
270 0.86
271 0.82
272 0.82
273 0.78
274 0.74
275 0.69
276 0.61
277 0.61
278 0.57
279 0.58
280 0.56
281 0.52
282 0.46
283 0.42
284 0.41
285 0.35
286 0.3
287 0.24
288 0.18
289 0.15
290 0.16
291 0.15
292 0.15
293 0.13
294 0.12
295 0.1
296 0.09
297 0.09
298 0.08
299 0.07
300 0.06
301 0.05
302 0.07
303 0.08
304 0.08
305 0.1
306 0.1
307 0.1
308 0.11
309 0.11
310 0.1
311 0.1
312 0.1
313 0.08
314 0.08
315 0.08
316 0.08
317 0.09
318 0.07
319 0.06
320 0.06
321 0.07
322 0.07
323 0.07
324 0.06
325 0.05
326 0.05
327 0.06
328 0.06
329 0.07
330 0.08
331 0.09
332 0.14
333 0.16
334 0.16
335 0.18
336 0.22
337 0.22
338 0.23
339 0.27
340 0.26
341 0.3
342 0.32
343 0.31
344 0.27
345 0.28
346 0.34
347 0.31
348 0.29
349 0.28
350 0.29
351 0.35
352 0.4
353 0.46
354 0.49
355 0.57
356 0.65
357 0.7
358 0.75
359 0.69
360 0.71
361 0.7
362 0.66
363 0.65
364 0.63
365 0.62
366 0.67
367 0.73
368 0.75
369 0.78
370 0.73
371 0.7
372 0.69
373 0.66
374 0.65
375 0.68
376 0.68
377 0.69
378 0.76
379 0.74
380 0.67
381 0.61
382 0.53
383 0.49
384 0.39
385 0.3
386 0.22
387 0.18
388 0.19
389 0.19
390 0.19
391 0.13
392 0.12
393 0.1
394 0.1
395 0.11
396 0.1
397 0.1
398 0.09
399 0.09
400 0.11
401 0.13
402 0.14
403 0.13
404 0.14
405 0.16
406 0.19
407 0.22
408 0.26
409 0.26
410 0.28
411 0.28
412 0.34
413 0.37
414 0.35
415 0.35
416 0.36
417 0.38
418 0.39
419 0.41
420 0.39
421 0.4
422 0.47
423 0.49
424 0.51
425 0.52
426 0.55
427 0.57