Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VB98

Protein Details
Accession A0A1Y1VB98    Localization Confidence Low Confidence Score 7.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-47WNIFCKFYKSRMKTNKIPYKHHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 10.833, cyto 8, cyto_mito 6.833, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045867  DNA-dir_RpoC_beta_prime  
IPR007083  RNA_pol_Rpb1_4  
IPR007081  RNA_pol_Rpb1_5  
IPR038120  Rpb1_funnel_sf  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003899  F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF05000  RNA_pol_Rpb1_4  
PF04998  RNA_pol_Rpb1_5  
Amino Acid Sequences MTNDQHIVEPHIIENICEKLKISKKEWNIFCKFYKSRMKTNKIPYKHLLSLLLPKTLTLKNGNEILVDRGILLHTISGENQKILLNSITHYGNDFYLKFMRDVQRTAHEYNLFHIINLFLPTLSLSNLDSSILNQSKSISNNRLKNRRYSDYKLLEKLSESINNHLTNIVNSGSKGKIDNIIQILMSVGVQAVLPKCYIKSSYFIGLIAKELFVHSKSDRVGIISTSLNTSSTGYLQREPAKSMEDLITDKTGVVYDYNDDEIYYYPFSTNIPDINDSFLEYAFAMSLTNNK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.22
3 0.21
4 0.21
5 0.21
6 0.25
7 0.34
8 0.41
9 0.43
10 0.47
11 0.55
12 0.65
13 0.72
14 0.72
15 0.7
16 0.68
17 0.67
18 0.68
19 0.61
20 0.6
21 0.64
22 0.6
23 0.64
24 0.69
25 0.74
26 0.73
27 0.81
28 0.82
29 0.77
30 0.78
31 0.73
32 0.71
33 0.66
34 0.6
35 0.52
36 0.45
37 0.48
38 0.43
39 0.4
40 0.31
41 0.27
42 0.29
43 0.28
44 0.28
45 0.25
46 0.25
47 0.26
48 0.29
49 0.29
50 0.25
51 0.25
52 0.24
53 0.19
54 0.17
55 0.13
56 0.1
57 0.1
58 0.09
59 0.08
60 0.05
61 0.06
62 0.06
63 0.07
64 0.11
65 0.12
66 0.11
67 0.12
68 0.13
69 0.13
70 0.14
71 0.14
72 0.11
73 0.11
74 0.14
75 0.13
76 0.12
77 0.13
78 0.13
79 0.12
80 0.13
81 0.13
82 0.12
83 0.14
84 0.15
85 0.15
86 0.2
87 0.25
88 0.25
89 0.27
90 0.27
91 0.31
92 0.35
93 0.35
94 0.34
95 0.31
96 0.29
97 0.29
98 0.33
99 0.25
100 0.21
101 0.2
102 0.16
103 0.14
104 0.15
105 0.13
106 0.06
107 0.06
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.06
112 0.05
113 0.06
114 0.06
115 0.07
116 0.06
117 0.07
118 0.12
119 0.13
120 0.13
121 0.12
122 0.13
123 0.15
124 0.18
125 0.22
126 0.24
127 0.29
128 0.37
129 0.44
130 0.52
131 0.51
132 0.57
133 0.59
134 0.58
135 0.59
136 0.58
137 0.59
138 0.58
139 0.6
140 0.55
141 0.5
142 0.43
143 0.37
144 0.32
145 0.24
146 0.21
147 0.18
148 0.18
149 0.21
150 0.21
151 0.21
152 0.2
153 0.18
154 0.14
155 0.14
156 0.12
157 0.08
158 0.08
159 0.11
160 0.1
161 0.11
162 0.11
163 0.11
164 0.14
165 0.14
166 0.17
167 0.16
168 0.16
169 0.15
170 0.14
171 0.14
172 0.09
173 0.09
174 0.05
175 0.04
176 0.03
177 0.03
178 0.05
179 0.06
180 0.06
181 0.07
182 0.07
183 0.08
184 0.09
185 0.12
186 0.12
187 0.14
188 0.16
189 0.2
190 0.2
191 0.2
192 0.19
193 0.17
194 0.17
195 0.15
196 0.12
197 0.09
198 0.09
199 0.1
200 0.1
201 0.13
202 0.12
203 0.16
204 0.16
205 0.18
206 0.18
207 0.18
208 0.18
209 0.15
210 0.17
211 0.14
212 0.14
213 0.14
214 0.14
215 0.12
216 0.12
217 0.13
218 0.11
219 0.12
220 0.17
221 0.18
222 0.19
223 0.24
224 0.3
225 0.31
226 0.32
227 0.31
228 0.3
229 0.28
230 0.28
231 0.25
232 0.2
233 0.2
234 0.2
235 0.2
236 0.17
237 0.17
238 0.15
239 0.13
240 0.11
241 0.11
242 0.09
243 0.1
244 0.12
245 0.14
246 0.13
247 0.13
248 0.13
249 0.14
250 0.16
251 0.15
252 0.13
253 0.12
254 0.12
255 0.13
256 0.16
257 0.17
258 0.17
259 0.19
260 0.22
261 0.22
262 0.25
263 0.25
264 0.23
265 0.21
266 0.18
267 0.16
268 0.13
269 0.12
270 0.09
271 0.09
272 0.07