FuNGI

A0A1Y1V631

Protein Details

Accession

A0A1Y1V631

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
464-493	VRAYIKKRIGSKQSSQHRQQQQQQMLQQRH	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto 4.5, cyto_mito 3.5, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR040662 Tfb2_C IPR004598 TFIIH_p52/Tfb2
Gene Ontology	GO:0000112 C:nucleotide-excision repair factor 3 complex GO:0000439 C:transcription factor TFIIH core complex GO:0005675 C:transcription factor TFIIH holo complex GO:0001671 F:ATPase activator activity GO:0003690 F:double-stranded DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0006289 P:nucleotide-excision repair GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF03849 Tfb2 PF18307 Tfb2_C

Amino Acid Sequences

MLYSANSTINNTASESIQGDVSVFLEKLSDREFQRLYTQPATCLAIFRLLPDLAKQFIMRLLYIKKDVPLEHIKGWCYEQYTDKVDDSLQRLYKLHICTKNENDEIRMSKVFQENLNNALIGSGNHTSFGSTSTSIDKHKVDIDFLDKHGTEQWEAVLHYMVGANIRKKPSPAVLKLLERSGLMAKKDDDVKDEFSVFTKVDINELQITNKGFQFLLQDVNTQVWAFLIQYLNMVDDLKMDLVEVLNFLFQLGSLQLGADYSVESLTPTQQQMLNDLKHLGIIYQRKRGSKRFYPTRLATSLTSGSMLISKPSTEDSGFIILETNSRIYAYTDSPLQISVLNLFVVLKARFANMVVGMITRDSIRSALNHGITADQIITYLRTHAHPEMKKNMPILPLTVVDQIRLWEMERNRLKDEKGYLYHEFARAEDFQEVLNYAKQYNVVKWSNVKKRMLVVTMEGHIKVRAYIKKRIGSKQSSQHRQQQQQQMLQQRH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.18
2	0.17
3	0.16
4	0.14
5	0.13
6	0.12
7	0.11
8	0.11
9	0.11
10	0.09
11	0.08
12	0.1
13	0.1
14	0.12
15	0.15
16	0.2
17	0.2
18	0.27
19	0.28
20	0.29
21	0.36
22	0.39
23	0.43
24	0.44
25	0.44
26	0.38
27	0.41
28	0.42
29	0.35
30	0.31
31	0.26
32	0.24
33	0.22
34	0.22
35	0.23
36	0.19
37	0.2
38	0.21
39	0.22
40	0.19
41	0.2
42	0.19
43	0.16
44	0.19
45	0.2
46	0.17
47	0.19
48	0.22
49	0.25
50	0.28
51	0.28
52	0.28
53	0.31
54	0.31
55	0.33
56	0.37
57	0.38
58	0.4
59	0.41
60	0.4
61	0.38
62	0.39
63	0.35
64	0.3
65	0.28
66	0.28
67	0.29
68	0.33
69	0.33
70	0.31
71	0.3
72	0.28
73	0.3
74	0.29
75	0.31
76	0.29
77	0.29
78	0.29
79	0.31
80	0.36
81	0.36
82	0.42
83	0.42
84	0.45
85	0.51
86	0.57
87	0.62
88	0.6
89	0.56
90	0.5
91	0.48
92	0.45
93	0.42
94	0.36
95	0.29
96	0.29
97	0.32
98	0.32
99	0.3
100	0.33
101	0.31
102	0.32
103	0.32
104	0.26
105	0.21
106	0.19
107	0.16
108	0.1
109	0.11
110	0.11
111	0.1
112	0.11
113	0.11
114	0.11
115	0.11
116	0.12
117	0.11
118	0.1
119	0.11
120	0.14
121	0.16
122	0.18
123	0.22
124	0.21
125	0.2
126	0.24
127	0.23
128	0.21
129	0.21
130	0.24
131	0.23
132	0.23
133	0.26
134	0.21
135	0.21
136	0.24
137	0.23
138	0.18
139	0.16
140	0.16
141	0.14
142	0.14
143	0.14
144	0.1
145	0.08
146	0.08
147	0.08
148	0.07
149	0.09
150	0.12
151	0.14
152	0.18
153	0.21
154	0.22
155	0.22
156	0.25
157	0.3
158	0.35
159	0.36
160	0.38
161	0.4
162	0.43
163	0.44
164	0.42
165	0.35
166	0.26
167	0.24
168	0.22
169	0.2
170	0.17
171	0.17
172	0.17
173	0.19
174	0.23
175	0.22
176	0.21
177	0.21
178	0.23
179	0.22
180	0.22
181	0.2
182	0.17
183	0.18
184	0.15
185	0.13
186	0.13
187	0.12
188	0.13
189	0.13
190	0.14
191	0.16
192	0.16
193	0.15
194	0.14
195	0.15
196	0.15
197	0.15
198	0.14
199	0.11
200	0.11
201	0.12
202	0.11
203	0.14
204	0.12
205	0.13
206	0.12
207	0.13
208	0.13
209	0.1
210	0.09
211	0.05
212	0.05
213	0.04
214	0.06
215	0.06
216	0.06
217	0.06
218	0.07
219	0.07
220	0.07
221	0.07
222	0.05
223	0.05
224	0.05
225	0.05
226	0.05
227	0.04
228	0.04
229	0.04
230	0.04
231	0.04
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.03
236	0.03
237	0.03
238	0.03
239	0.03
240	0.03
241	0.03
242	0.03
243	0.03
244	0.03
245	0.03
246	0.03
247	0.03
248	0.03
249	0.03
250	0.03
251	0.04
252	0.04
253	0.05
254	0.07
255	0.07
256	0.09
257	0.11
258	0.11
259	0.15
260	0.2
261	0.19
262	0.18
263	0.19
264	0.17
265	0.15
266	0.15
267	0.11
268	0.11
269	0.19
270	0.22
271	0.29
272	0.32
273	0.37
274	0.42
275	0.49
276	0.52
277	0.53
278	0.59
279	0.62
280	0.65
281	0.68
282	0.66
283	0.64
284	0.57
285	0.51
286	0.42
287	0.34
288	0.29
289	0.21
290	0.19
291	0.13
292	0.12
293	0.11
294	0.1
295	0.08
296	0.08
297	0.07
298	0.08
299	0.09
300	0.11
301	0.09
302	0.1
303	0.11
304	0.13
305	0.13
306	0.12
307	0.12
308	0.1
309	0.1
310	0.1
311	0.09
312	0.07
313	0.07
314	0.08
315	0.08
316	0.11
317	0.11
318	0.12
319	0.13
320	0.13
321	0.13
322	0.13
323	0.12
324	0.1
325	0.09
326	0.09
327	0.08
328	0.07
329	0.07
330	0.07
331	0.07
332	0.1
333	0.1
334	0.1
335	0.1
336	0.1
337	0.11
338	0.11
339	0.12
340	0.08
341	0.09
342	0.08
343	0.08
344	0.08
345	0.07
346	0.07
347	0.06
348	0.06
349	0.06
350	0.07
351	0.08
352	0.09
353	0.13
354	0.17
355	0.18
356	0.18
357	0.18
358	0.17
359	0.16
360	0.16
361	0.12
362	0.07
363	0.06
364	0.06
365	0.07
366	0.07
367	0.08
368	0.09
369	0.1
370	0.15
371	0.2
372	0.29
373	0.32
374	0.38
375	0.46
376	0.5
377	0.52
378	0.49
379	0.48
380	0.42
381	0.38
382	0.34
383	0.28
384	0.23
385	0.22
386	0.26
387	0.22
388	0.2
389	0.19
390	0.18
391	0.17
392	0.16
393	0.15
394	0.16
395	0.18
396	0.28
397	0.35
398	0.38
399	0.41
400	0.44
401	0.45
402	0.45
403	0.49
404	0.47
405	0.44
406	0.46
407	0.44
408	0.45
409	0.47
410	0.44
411	0.38
412	0.3
413	0.3
414	0.25
415	0.24
416	0.21
417	0.18
418	0.15
419	0.15
420	0.16
421	0.14
422	0.16
423	0.15
424	0.14
425	0.15
426	0.18
427	0.2
428	0.23
429	0.3
430	0.29
431	0.32
432	0.4
433	0.5
434	0.56
435	0.62
436	0.62
437	0.57
438	0.61
439	0.63
440	0.58
441	0.5
442	0.44
443	0.4
444	0.4
445	0.39
446	0.33
447	0.28
448	0.25
449	0.23
450	0.22
451	0.25
452	0.3
453	0.33
454	0.42
455	0.5
456	0.56
457	0.64
458	0.7
459	0.72
460	0.72
461	0.76
462	0.76
463	0.79
464	0.81
465	0.81
466	0.82
467	0.82
468	0.84
469	0.84
470	0.85
471	0.83
472	0.81
473	0.81

A0A1Y1V631

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer