Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1U7V6

Protein Details
Accession A0A1Y1U7V6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
278-301YYNPDTRKFSRKPKSSKSQRGFVHHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035647  EFG_III/V  
IPR000640  EFG_V-like  
IPR004161  EFTu-like_2  
IPR031950  EFTUD2_N  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR020568  Ribosomal_S5_D2-typ_fold  
IPR014721  Ribosomal_S5_D2-typ_fold_subgr  
IPR000795  T_Tr_GTP-bd_dom  
IPR009000  Transl_B-barrel_sf  
IPR005517  Transl_elong_EFG/EF2_IV  
IPR035655  U5-116kDa_C  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005525  F:GTP binding  
GO:0003924  F:GTPase activity  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00679  EFG_C  
PF03764  EFG_IV  
PF16004  EFTUD2  
PF00009  GTP_EFTU  
PF03144  GTP_EFTU_D2  
CDD cd04098  eEF2_C_snRNP  
cd04090  EF2_II_snRNP  
cd01683  EF2_IV_snRNP  
Amino Acid Sequences SDYEEETQNIPQPEIAEEKDQDEEDEEKDENEMDTDDVQMGEGLDGMQLIKVDENPSMEVVLHEDKSYYPSAEEVYGKDVENLVQEEDTQPLSEPIIAPIRAKKFQIQEKNLPQTNYSKTQRYTDIHILERQRGLSIKSHANFSDEVTAALRVADGVVIVVDAVEGVMSQTERLIRHACREKLAITLVISKFDRLIVELKLPPTDAYFKLKHTIEEVNSILCEYNEDNRVSPEKGNVAFSSAEMRWCFTLDTFAQMYSDMYGGIDVDKFVQRLWGDIYYNPDTRKFSRKPKSSKSQRGFVHFILEPLYKLYAQIIGEDEDTLKHTLASLGIYLKASEYKLDVKPLLRLVCQKFFGIATGFTDMCIKKIPSPIENAKNKIEHTYTGPMDSPIAESMKECDPNGPLMIQIVKLYNSENYTGFDVFGRIMSGRVSVGQRVRILGEKYSLDDEEDMTIKEIKDVWIYESRYKIKVDSVIAGNWVLLGGIDQSIMKTATITNIASSSEDEEIIAVEPVNPTELPKMLEGLRKINKSYPITTTKVEESGEHIILGTGELFLDCALHDLRKLYSEIDIKVADPVVKFCETVVETSSIKCYAETPNKKNKLTMIAEPLEKDVADDIENLKINIKWPAKKLSDHFVNNYDWDVLASRNIWAFGPDDNGPNVLINDTLPSETDKKLLYSVKDSIVQGFQWGAREGPLCDEAIRNVKFRLLDTTLAQEPLYRGGGQIIPTARRVSYSAFLMATPRLMEPVYFVEIQSPADCVSSVYTVLARRRGHVVEDIPKPGSPLYTVKAYLPAIDSPGQAFCQQIFDHWQMVPGDPLDKSIVLRPLEPSPESHLARDFMVKTRRRKGLSEDVAIEKFFDDPMISSILNDLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.25
3 0.25
4 0.25
5 0.27
6 0.28
7 0.27
8 0.25
9 0.24
10 0.23
11 0.19
12 0.21
13 0.19
14 0.17
15 0.17
16 0.17
17 0.14
18 0.13
19 0.12
20 0.11
21 0.11
22 0.11
23 0.11
24 0.1
25 0.1
26 0.09
27 0.09
28 0.07
29 0.07
30 0.06
31 0.05
32 0.06
33 0.06
34 0.06
35 0.06
36 0.06
37 0.07
38 0.09
39 0.11
40 0.13
41 0.15
42 0.16
43 0.16
44 0.16
45 0.15
46 0.13
47 0.17
48 0.19
49 0.18
50 0.17
51 0.17
52 0.17
53 0.2
54 0.22
55 0.18
56 0.14
57 0.15
58 0.16
59 0.19
60 0.2
61 0.18
62 0.2
63 0.21
64 0.21
65 0.21
66 0.2
67 0.17
68 0.18
69 0.18
70 0.16
71 0.14
72 0.14
73 0.14
74 0.15
75 0.15
76 0.12
77 0.12
78 0.11
79 0.12
80 0.12
81 0.12
82 0.14
83 0.19
84 0.19
85 0.21
86 0.27
87 0.33
88 0.35
89 0.37
90 0.4
91 0.43
92 0.52
93 0.61
94 0.62
95 0.66
96 0.72
97 0.79
98 0.77
99 0.7
100 0.62
101 0.59
102 0.57
103 0.56
104 0.52
105 0.49
106 0.48
107 0.51
108 0.56
109 0.52
110 0.54
111 0.53
112 0.52
113 0.49
114 0.53
115 0.51
116 0.48
117 0.48
118 0.4
119 0.34
120 0.31
121 0.29
122 0.29
123 0.31
124 0.35
125 0.34
126 0.37
127 0.35
128 0.36
129 0.34
130 0.3
131 0.31
132 0.22
133 0.21
134 0.18
135 0.18
136 0.15
137 0.14
138 0.12
139 0.06
140 0.06
141 0.05
142 0.04
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.02
149 0.02
150 0.02
151 0.02
152 0.02
153 0.02
154 0.03
155 0.04
156 0.04
157 0.05
158 0.09
159 0.1
160 0.13
161 0.19
162 0.2
163 0.29
164 0.39
165 0.4
166 0.4
167 0.42
168 0.4
169 0.38
170 0.38
171 0.3
172 0.22
173 0.28
174 0.25
175 0.27
176 0.26
177 0.23
178 0.21
179 0.2
180 0.19
181 0.13
182 0.16
183 0.13
184 0.18
185 0.2
186 0.21
187 0.2
188 0.21
189 0.19
190 0.19
191 0.22
192 0.19
193 0.23
194 0.24
195 0.25
196 0.31
197 0.32
198 0.3
199 0.29
200 0.33
201 0.28
202 0.31
203 0.29
204 0.23
205 0.22
206 0.22
207 0.18
208 0.12
209 0.13
210 0.1
211 0.14
212 0.17
213 0.18
214 0.19
215 0.21
216 0.25
217 0.25
218 0.24
219 0.22
220 0.23
221 0.23
222 0.25
223 0.22
224 0.22
225 0.2
226 0.19
227 0.21
228 0.17
229 0.19
230 0.16
231 0.17
232 0.15
233 0.16
234 0.16
235 0.11
236 0.15
237 0.12
238 0.16
239 0.15
240 0.15
241 0.14
242 0.14
243 0.14
244 0.1
245 0.1
246 0.06
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.04
253 0.06
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.12
258 0.11
259 0.13
260 0.15
261 0.16
262 0.16
263 0.17
264 0.24
265 0.24
266 0.27
267 0.27
268 0.27
269 0.29
270 0.31
271 0.4
272 0.4
273 0.46
274 0.54
275 0.63
276 0.69
277 0.75
278 0.82
279 0.84
280 0.88
281 0.83
282 0.82
283 0.76
284 0.74
285 0.68
286 0.57
287 0.51
288 0.41
289 0.35
290 0.3
291 0.26
292 0.19
293 0.15
294 0.16
295 0.1
296 0.1
297 0.1
298 0.1
299 0.1
300 0.1
301 0.1
302 0.1
303 0.11
304 0.11
305 0.1
306 0.08
307 0.1
308 0.1
309 0.08
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.08
314 0.08
315 0.07
316 0.07
317 0.07
318 0.08
319 0.08
320 0.07
321 0.09
322 0.08
323 0.08
324 0.09
325 0.13
326 0.14
327 0.17
328 0.19
329 0.18
330 0.21
331 0.24
332 0.24
333 0.21
334 0.27
335 0.28
336 0.31
337 0.31
338 0.29
339 0.25
340 0.24
341 0.23
342 0.17
343 0.13
344 0.1
345 0.11
346 0.1
347 0.1
348 0.14
349 0.12
350 0.12
351 0.14
352 0.14
353 0.15
354 0.2
355 0.22
356 0.2
357 0.27
358 0.33
359 0.4
360 0.44
361 0.45
362 0.43
363 0.43
364 0.41
365 0.38
366 0.32
367 0.24
368 0.23
369 0.25
370 0.22
371 0.21
372 0.21
373 0.18
374 0.17
375 0.16
376 0.13
377 0.08
378 0.08
379 0.07
380 0.07
381 0.09
382 0.12
383 0.13
384 0.12
385 0.12
386 0.12
387 0.13
388 0.14
389 0.11
390 0.09
391 0.08
392 0.09
393 0.08
394 0.07
395 0.07
396 0.07
397 0.07
398 0.08
399 0.09
400 0.1
401 0.11
402 0.11
403 0.11
404 0.12
405 0.12
406 0.12
407 0.1
408 0.09
409 0.08
410 0.07
411 0.07
412 0.05
413 0.05
414 0.05
415 0.06
416 0.05
417 0.07
418 0.08
419 0.1
420 0.12
421 0.14
422 0.14
423 0.14
424 0.15
425 0.16
426 0.16
427 0.14
428 0.15
429 0.13
430 0.13
431 0.14
432 0.13
433 0.1
434 0.1
435 0.09
436 0.08
437 0.08
438 0.07
439 0.07
440 0.09
441 0.08
442 0.08
443 0.08
444 0.08
445 0.09
446 0.09
447 0.11
448 0.16
449 0.18
450 0.2
451 0.25
452 0.27
453 0.28
454 0.28
455 0.26
456 0.22
457 0.23
458 0.22
459 0.19
460 0.18
461 0.16
462 0.16
463 0.15
464 0.13
465 0.09
466 0.08
467 0.05
468 0.03
469 0.03
470 0.03
471 0.03
472 0.03
473 0.03
474 0.03
475 0.04
476 0.05
477 0.04
478 0.05
479 0.05
480 0.06
481 0.08
482 0.08
483 0.07
484 0.08
485 0.08
486 0.08
487 0.08
488 0.09
489 0.08
490 0.08
491 0.07
492 0.07
493 0.07
494 0.06
495 0.06
496 0.04
497 0.04
498 0.05
499 0.05
500 0.06
501 0.05
502 0.06
503 0.07
504 0.08
505 0.09
506 0.09
507 0.11
508 0.12
509 0.16
510 0.17
511 0.23
512 0.28
513 0.28
514 0.29
515 0.32
516 0.36
517 0.36
518 0.38
519 0.36
520 0.36
521 0.37
522 0.37
523 0.36
524 0.3
525 0.28
526 0.26
527 0.2
528 0.18
529 0.19
530 0.18
531 0.15
532 0.14
533 0.12
534 0.11
535 0.11
536 0.07
537 0.03
538 0.03
539 0.03
540 0.03
541 0.03
542 0.03
543 0.03
544 0.05
545 0.05
546 0.06
547 0.06
548 0.08
549 0.08
550 0.1
551 0.11
552 0.1
553 0.14
554 0.17
555 0.18
556 0.19
557 0.19
558 0.17
559 0.17
560 0.17
561 0.14
562 0.11
563 0.11
564 0.12
565 0.12
566 0.12
567 0.11
568 0.15
569 0.14
570 0.15
571 0.15
572 0.15
573 0.15
574 0.15
575 0.17
576 0.13
577 0.13
578 0.12
579 0.12
580 0.18
581 0.28
582 0.37
583 0.43
584 0.53
585 0.61
586 0.61
587 0.61
588 0.56
589 0.54
590 0.49
591 0.46
592 0.42
593 0.38
594 0.38
595 0.37
596 0.34
597 0.26
598 0.22
599 0.18
600 0.11
601 0.09
602 0.08
603 0.09
604 0.09
605 0.12
606 0.13
607 0.13
608 0.13
609 0.13
610 0.14
611 0.22
612 0.26
613 0.27
614 0.31
615 0.39
616 0.41
617 0.46
618 0.48
619 0.48
620 0.51
621 0.5
622 0.5
623 0.45
624 0.43
625 0.39
626 0.36
627 0.28
628 0.19
629 0.16
630 0.13
631 0.1
632 0.1
633 0.09
634 0.09
635 0.1
636 0.1
637 0.1
638 0.1
639 0.1
640 0.1
641 0.13
642 0.13
643 0.14
644 0.14
645 0.15
646 0.14
647 0.14
648 0.13
649 0.1
650 0.09
651 0.07
652 0.08
653 0.08
654 0.08
655 0.08
656 0.11
657 0.14
658 0.14
659 0.17
660 0.16
661 0.16
662 0.21
663 0.24
664 0.23
665 0.25
666 0.28
667 0.28
668 0.32
669 0.31
670 0.29
671 0.26
672 0.24
673 0.2
674 0.18
675 0.16
676 0.14
677 0.15
678 0.12
679 0.13
680 0.14
681 0.14
682 0.16
683 0.16
684 0.14
685 0.14
686 0.15
687 0.16
688 0.23
689 0.25
690 0.23
691 0.23
692 0.25
693 0.25
694 0.25
695 0.29
696 0.24
697 0.24
698 0.24
699 0.28
700 0.27
701 0.27
702 0.26
703 0.2
704 0.18
705 0.19
706 0.19
707 0.14
708 0.12
709 0.14
710 0.17
711 0.16
712 0.2
713 0.2
714 0.2
715 0.22
716 0.24
717 0.21
718 0.21
719 0.22
720 0.21
721 0.21
722 0.21
723 0.21
724 0.2
725 0.2
726 0.21
727 0.19
728 0.17
729 0.14
730 0.12
731 0.12
732 0.11
733 0.11
734 0.11
735 0.14
736 0.17
737 0.16
738 0.16
739 0.17
740 0.17
741 0.19
742 0.17
743 0.14
744 0.11
745 0.11
746 0.11
747 0.1
748 0.11
749 0.11
750 0.11
751 0.1
752 0.13
753 0.17
754 0.22
755 0.29
756 0.28
757 0.29
758 0.34
759 0.35
760 0.35
761 0.37
762 0.39
763 0.4
764 0.43
765 0.45
766 0.41
767 0.39
768 0.38
769 0.32
770 0.27
771 0.22
772 0.21
773 0.21
774 0.24
775 0.25
776 0.24
777 0.29
778 0.28
779 0.26
780 0.25
781 0.22
782 0.21
783 0.22
784 0.22
785 0.18
786 0.2
787 0.2
788 0.18
789 0.18
790 0.15
791 0.17
792 0.16
793 0.17
794 0.22
795 0.23
796 0.25
797 0.24
798 0.28
799 0.25
800 0.26
801 0.26
802 0.2
803 0.2
804 0.17
805 0.19
806 0.17
807 0.17
808 0.17
809 0.2
810 0.26
811 0.25
812 0.26
813 0.27
814 0.3
815 0.34
816 0.34
817 0.31
818 0.33
819 0.4
820 0.4
821 0.39
822 0.37
823 0.34
824 0.35
825 0.38
826 0.32
827 0.32
828 0.4
829 0.45
830 0.51
831 0.6
832 0.67
833 0.65
834 0.68
835 0.68
836 0.7
837 0.7
838 0.67
839 0.63
840 0.6
841 0.57
842 0.52
843 0.44
844 0.33
845 0.25
846 0.19
847 0.15
848 0.1
849 0.09
850 0.11
851 0.14
852 0.14
853 0.13