FuNGI

A0A1Y1VJH4

Protein Details

Accession

A0A1Y1VJH4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
36-60	NYNGNNNRRMDKKKQNNNNSNNGGN	Hydrophilic
187-206	QQNHQQRYSRHNNNRRSQGS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 26.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR002343 Hud_Sxl_RNA IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:1990904 C:ribonucleoprotein complex GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM

Amino Acid Sequences

MDSNKKQGGYMHNQPQHNNHYNNGNNRGYNNHHSNNYNGNNNRRMDKKKQNNNNSNNGGNNYQYAQNEAVQGNEQNANYYNNVEEQQTQQQQPQQNQPQQAVPAYHYYPVVQPQPIFYADPHYYSSSQPPPIQAAGSPTTVGMYPPSGVIVATTQNLQVPNRVMTAMHQIPMYPSNQIAGYVPQQGQQNHQQRYSRHNNNRRSQGSSPNGNGHSSTTTNIYISGLTSDVTDESFAEMCSSYGKIVSSKAIINTETNECKGFGFVMYENEEQARNAMDQLNKKGYHVSFAKDSLSARLKNLQDEESTNIYISNIPLSMTDEEFLELFAPHNVISHTILKDQNGVSRGVGFARFQTREIAKEIIEKYNNIKLEGSTNSLQVRFADSNAQKKLKEQVANKKYNSTPKIRYQNNMASPEQMITYQYYGSPVIPPTSPLPMPAQVPIISPNLYPGMFSPMMPPASPSLIYIDNMNDNSNMNEGYDSPSESMNSPVNTSSTSDPKVDKLSMNMQNKLRINDEMGN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.65
2	0.67
3	0.68
4	0.68
5	0.61
6	0.54
7	0.57
8	0.6
9	0.65
10	0.65
11	0.6
12	0.54
13	0.53
14	0.55
15	0.52
16	0.55
17	0.55
18	0.53
19	0.53
20	0.52
21	0.55
22	0.59
23	0.57
24	0.57
25	0.55
26	0.57
27	0.6
28	0.61
29	0.63
30	0.61
31	0.63
32	0.64
33	0.69
34	0.71
35	0.75
36	0.82
37	0.87
38	0.9
39	0.9
40	0.9
41	0.84
42	0.78
43	0.71
44	0.63
45	0.54
46	0.44
47	0.38
48	0.3
49	0.29
50	0.25
51	0.24
52	0.23
53	0.22
54	0.25
55	0.23
56	0.22
57	0.2
58	0.2
59	0.2
60	0.22
61	0.2
62	0.18
63	0.2
64	0.21
65	0.19
66	0.2
67	0.18
68	0.16
69	0.18
70	0.17
71	0.17
72	0.19
73	0.27
74	0.32
75	0.33
76	0.35
77	0.4
78	0.45
79	0.49
80	0.55
81	0.56
82	0.56
83	0.59
84	0.57
85	0.53
86	0.5
87	0.47
88	0.38
89	0.3
90	0.29
91	0.26
92	0.25
93	0.22
94	0.21
95	0.2
96	0.23
97	0.25
98	0.23
99	0.22
100	0.22
101	0.24
102	0.24
103	0.23
104	0.19
105	0.22
106	0.2
107	0.22
108	0.23
109	0.23
110	0.23
111	0.24
112	0.3
113	0.29
114	0.32
115	0.32
116	0.31
117	0.31
118	0.3
119	0.29
120	0.23
121	0.22
122	0.2
123	0.19
124	0.17
125	0.14
126	0.14
127	0.13
128	0.13
129	0.09
130	0.07
131	0.07
132	0.07
133	0.07
134	0.07
135	0.06
136	0.06
137	0.07
138	0.07
139	0.08
140	0.08
141	0.08
142	0.1
143	0.12
144	0.12
145	0.14
146	0.15
147	0.16
148	0.16
149	0.16
150	0.14
151	0.13
152	0.21
153	0.2
154	0.19
155	0.17
156	0.17
157	0.18
158	0.2
159	0.19
160	0.12
161	0.1
162	0.1
163	0.1
164	0.11
165	0.1
166	0.1
167	0.11
168	0.14
169	0.15
170	0.17
171	0.21
172	0.21
173	0.25
174	0.32
175	0.39
176	0.39
177	0.43
178	0.44
179	0.43
180	0.51
181	0.58
182	0.59
183	0.6
184	0.66
185	0.71
186	0.75
187	0.82
188	0.76
189	0.72
190	0.65
191	0.64
192	0.6
193	0.56
194	0.5
195	0.46
196	0.44
197	0.38
198	0.35
199	0.27
200	0.23
201	0.18
202	0.17
203	0.14
204	0.13
205	0.12
206	0.12
207	0.11
208	0.09
209	0.08
210	0.08
211	0.06
212	0.05
213	0.05
214	0.05
215	0.05
216	0.05
217	0.05
218	0.05
219	0.05
220	0.06
221	0.05
222	0.06
223	0.06
224	0.05
225	0.06
226	0.06
227	0.05
228	0.06
229	0.06
230	0.07
231	0.07
232	0.08
233	0.09
234	0.1
235	0.11
236	0.12
237	0.12
238	0.12
239	0.13
240	0.16
241	0.15
242	0.15
243	0.15
244	0.14
245	0.13
246	0.12
247	0.1
248	0.07
249	0.07
250	0.07
251	0.09
252	0.12
253	0.12
254	0.12
255	0.13
256	0.13
257	0.11
258	0.11
259	0.1
260	0.06
261	0.07
262	0.1
263	0.13
264	0.16
265	0.2
266	0.25
267	0.24
268	0.24
269	0.28
270	0.25
271	0.27
272	0.25
273	0.24
274	0.21
275	0.22
276	0.22
277	0.19
278	0.19
279	0.19
280	0.22
281	0.21
282	0.2
283	0.25
284	0.25
285	0.27
286	0.28
287	0.25
288	0.21
289	0.22
290	0.24
291	0.2
292	0.19
293	0.17
294	0.15
295	0.13
296	0.13
297	0.11
298	0.08
299	0.06
300	0.06
301	0.06
302	0.09
303	0.1
304	0.09
305	0.09
306	0.09
307	0.09
308	0.09
309	0.08
310	0.06
311	0.05
312	0.06
313	0.06
314	0.06
315	0.05
316	0.06
317	0.06
318	0.07
319	0.1
320	0.13
321	0.14
322	0.18
323	0.19
324	0.19
325	0.22
326	0.21
327	0.22
328	0.2
329	0.2
330	0.16
331	0.15
332	0.15
333	0.13
334	0.13
335	0.1
336	0.12
337	0.17
338	0.18
339	0.18
340	0.23
341	0.24
342	0.25
343	0.27
344	0.26
345	0.2
346	0.26
347	0.27
348	0.28
349	0.28
350	0.27
351	0.28
352	0.32
353	0.32
354	0.27
355	0.25
356	0.2
357	0.22
358	0.23
359	0.24
360	0.19
361	0.21
362	0.22
363	0.22
364	0.22
365	0.18
366	0.22
367	0.18
368	0.17
369	0.24
370	0.26
371	0.33
372	0.39
373	0.42
374	0.37
375	0.39
376	0.46
377	0.44
378	0.48
379	0.49
380	0.53
381	0.6
382	0.68
383	0.67
384	0.66
385	0.63
386	0.66
387	0.63
388	0.6
389	0.57
390	0.59
391	0.67
392	0.65
393	0.64
394	0.62
395	0.66
396	0.65
397	0.63
398	0.54
399	0.46
400	0.42
401	0.39
402	0.31
403	0.23
404	0.16
405	0.13
406	0.13
407	0.11
408	0.11
409	0.12
410	0.12
411	0.13
412	0.14
413	0.13
414	0.15
415	0.14
416	0.17
417	0.17
418	0.21
419	0.21
420	0.2
421	0.23
422	0.23
423	0.24
424	0.24
425	0.24
426	0.2
427	0.21
428	0.22
429	0.2
430	0.19
431	0.17
432	0.18
433	0.18
434	0.17
435	0.16
436	0.14
437	0.19
438	0.18
439	0.19
440	0.19
441	0.21
442	0.23
443	0.22
444	0.23
445	0.18
446	0.2
447	0.21
448	0.19
449	0.17
450	0.18
451	0.18
452	0.18
453	0.18
454	0.2
455	0.21
456	0.21
457	0.18
458	0.18
459	0.18
460	0.18
461	0.16
462	0.12
463	0.12
464	0.12
465	0.16
466	0.16
467	0.17
468	0.16
469	0.17
470	0.18
471	0.18
472	0.21
473	0.21
474	0.21
475	0.21
476	0.21
477	0.21
478	0.21
479	0.24
480	0.25
481	0.27
482	0.28
483	0.31
484	0.31
485	0.34
486	0.38
487	0.38
488	0.35
489	0.34
490	0.41
491	0.46
492	0.51
493	0.55
494	0.53
495	0.59
496	0.61
497	0.59
498	0.53
499	0.46

A0A1Y1VJH4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer