Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1V6Z6

Protein Details
Accession A0A1Y1V6Z6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
420-452SDDESRAHPANKRRRRNRRNHRNSPNPESKHERBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
428-444PANKRRRRNRRNHRNSP
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 13, cyto 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000286  His_deacetylse  
IPR003084  His_deacetylse_1  
IPR023801  His_deacetylse_dom  
IPR037138  His_deacetylse_dom_sf  
IPR023696  Ureohydrolase_dom_sf  
Gene Ontology GO:1990483  C:Clr6 histone deacetylase complex I''  
GO:0033698  C:Rpd3L complex  
GO:0070210  C:Rpd3L-Expanded complex  
GO:0032221  C:Rpd3S/Clr6-CII complex  
GO:0031078  F:histone H3K14 deacetylase activity  
GO:0032129  F:histone H3K9 deacetylase activity  
GO:0034739  F:histone H4K16 deacetylase activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0031507  P:heterochromatin formation  
GO:0016575  P:histone deacetylation  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF00850  Hist_deacetyl  
Amino Acid Sequences MTSVSKRRVCYFYDSDVGAYQLAPGHPMKPHRVKMTHSLVVNYGMDKKMDVFVPTRATFREITKFHEDHYIDFLRRATPENLETFEKHKEMYGIWEDTPAFEGAYEFCSISAGGSIGAAKKLNGEADIGINWAGGLHHAKRGGASGFCYVNDIVLGILELLKTHNRVLYVDIDNHHGDGVEEAFYTTDRVMTCSFHKYGDEYFPGTGDIHDIGVGKGKYYSVNFPLRDGIDDDTFKSIFRPVITYIMNWYRPGAVVLQCGTDSLAGDRLGTANLSERGHGACAKFLRTFNVPMLLLGGGGYTPKNVSRAWCYETSVALGIELPQALPYNDYFEYFGPEYSIHVRPTNAENKNTREYLDKTTVHILENLRNISHAPSVQMQEVPVDHFSDEEDELEDDLDDRQSRVYHDTHIAYDNELDPSDDESRAHPANKRRRRNRRNHRNSPNPESKHERTTRHSNASATTTTNPKEDFGFKDERRDKETVIPFTAFSSKNETKSEK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.4
3 0.37
4 0.34
5 0.26
6 0.2
7 0.15
8 0.13
9 0.12
10 0.14
11 0.15
12 0.17
13 0.21
14 0.27
15 0.36
16 0.43
17 0.5
18 0.56
19 0.6
20 0.62
21 0.67
22 0.7
23 0.66
24 0.58
25 0.52
26 0.44
27 0.44
28 0.39
29 0.32
30 0.27
31 0.22
32 0.21
33 0.19
34 0.19
35 0.19
36 0.19
37 0.2
38 0.18
39 0.21
40 0.28
41 0.29
42 0.3
43 0.28
44 0.3
45 0.3
46 0.32
47 0.37
48 0.31
49 0.37
50 0.43
51 0.42
52 0.41
53 0.47
54 0.43
55 0.36
56 0.42
57 0.4
58 0.32
59 0.33
60 0.33
61 0.27
62 0.27
63 0.3
64 0.25
65 0.25
66 0.28
67 0.29
68 0.31
69 0.32
70 0.32
71 0.31
72 0.33
73 0.29
74 0.26
75 0.24
76 0.22
77 0.2
78 0.24
79 0.26
80 0.24
81 0.24
82 0.26
83 0.25
84 0.24
85 0.25
86 0.19
87 0.13
88 0.1
89 0.1
90 0.08
91 0.1
92 0.1
93 0.08
94 0.08
95 0.09
96 0.09
97 0.08
98 0.08
99 0.06
100 0.05
101 0.05
102 0.07
103 0.07
104 0.09
105 0.09
106 0.08
107 0.1
108 0.11
109 0.11
110 0.11
111 0.11
112 0.1
113 0.11
114 0.11
115 0.1
116 0.09
117 0.08
118 0.07
119 0.06
120 0.05
121 0.06
122 0.09
123 0.1
124 0.13
125 0.14
126 0.14
127 0.15
128 0.17
129 0.18
130 0.15
131 0.16
132 0.16
133 0.16
134 0.16
135 0.18
136 0.15
137 0.13
138 0.12
139 0.1
140 0.06
141 0.05
142 0.05
143 0.03
144 0.04
145 0.03
146 0.04
147 0.05
148 0.07
149 0.08
150 0.09
151 0.1
152 0.11
153 0.12
154 0.14
155 0.18
156 0.19
157 0.21
158 0.21
159 0.23
160 0.23
161 0.22
162 0.2
163 0.14
164 0.11
165 0.09
166 0.09
167 0.06
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.07
175 0.07
176 0.09
177 0.1
178 0.11
179 0.14
180 0.18
181 0.19
182 0.17
183 0.18
184 0.17
185 0.19
186 0.21
187 0.21
188 0.17
189 0.17
190 0.16
191 0.16
192 0.15
193 0.12
194 0.1
195 0.08
196 0.06
197 0.07
198 0.07
199 0.06
200 0.11
201 0.11
202 0.1
203 0.1
204 0.1
205 0.11
206 0.12
207 0.15
208 0.17
209 0.23
210 0.23
211 0.24
212 0.26
213 0.24
214 0.24
215 0.22
216 0.18
217 0.14
218 0.14
219 0.14
220 0.13
221 0.13
222 0.12
223 0.11
224 0.11
225 0.1
226 0.1
227 0.11
228 0.1
229 0.14
230 0.15
231 0.14
232 0.16
233 0.19
234 0.2
235 0.18
236 0.17
237 0.13
238 0.13
239 0.14
240 0.12
241 0.09
242 0.1
243 0.1
244 0.1
245 0.1
246 0.09
247 0.09
248 0.07
249 0.06
250 0.05
251 0.07
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.09
261 0.1
262 0.1
263 0.1
264 0.11
265 0.12
266 0.14
267 0.11
268 0.12
269 0.13
270 0.15
271 0.17
272 0.17
273 0.19
274 0.19
275 0.21
276 0.19
277 0.21
278 0.18
279 0.16
280 0.16
281 0.13
282 0.11
283 0.08
284 0.07
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.04
289 0.05
290 0.06
291 0.08
292 0.08
293 0.11
294 0.16
295 0.2
296 0.24
297 0.24
298 0.26
299 0.25
300 0.25
301 0.23
302 0.19
303 0.15
304 0.11
305 0.09
306 0.08
307 0.07
308 0.07
309 0.05
310 0.05
311 0.06
312 0.06
313 0.07
314 0.07
315 0.1
316 0.1
317 0.11
318 0.12
319 0.12
320 0.16
321 0.16
322 0.15
323 0.12
324 0.12
325 0.13
326 0.17
327 0.2
328 0.17
329 0.18
330 0.18
331 0.2
332 0.26
333 0.33
334 0.33
335 0.36
336 0.39
337 0.44
338 0.48
339 0.47
340 0.42
341 0.38
342 0.37
343 0.38
344 0.41
345 0.36
346 0.34
347 0.38
348 0.38
349 0.34
350 0.34
351 0.3
352 0.27
353 0.3
354 0.29
355 0.23
356 0.22
357 0.22
358 0.2
359 0.21
360 0.16
361 0.14
362 0.17
363 0.19
364 0.2
365 0.2
366 0.17
367 0.16
368 0.17
369 0.16
370 0.14
371 0.13
372 0.11
373 0.11
374 0.11
375 0.12
376 0.12
377 0.1
378 0.1
379 0.1
380 0.1
381 0.1
382 0.1
383 0.07
384 0.08
385 0.1
386 0.09
387 0.09
388 0.1
389 0.11
390 0.14
391 0.18
392 0.18
393 0.2
394 0.25
395 0.27
396 0.27
397 0.3
398 0.28
399 0.25
400 0.25
401 0.23
402 0.18
403 0.17
404 0.15
405 0.12
406 0.16
407 0.17
408 0.16
409 0.15
410 0.15
411 0.21
412 0.24
413 0.27
414 0.29
415 0.37
416 0.47
417 0.57
418 0.67
419 0.73
420 0.81
421 0.88
422 0.93
423 0.95
424 0.95
425 0.96
426 0.96
427 0.96
428 0.96
429 0.94
430 0.93
431 0.92
432 0.85
433 0.81
434 0.79
435 0.73
436 0.73
437 0.71
438 0.67
439 0.64
440 0.7
441 0.72
442 0.71
443 0.69
444 0.61
445 0.58
446 0.56
447 0.5
448 0.43
449 0.38
450 0.36
451 0.34
452 0.36
453 0.33
454 0.29
455 0.31
456 0.32
457 0.33
458 0.32
459 0.41
460 0.38
461 0.48
462 0.55
463 0.56
464 0.58
465 0.56
466 0.53
467 0.53
468 0.6
469 0.55
470 0.52
471 0.48
472 0.42
473 0.42
474 0.46
475 0.38
476 0.31
477 0.35
478 0.35
479 0.39