Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2E2D4

Protein Details
Accession A0A1Y2E2D4    Localization Confidence Low Confidence Score 9.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-26MRGKRLHALKRPKLRQSWNKYNLYNFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 9, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022801  Ribosomal_S4/S9  
IPR002942  S4_RNA-bd  
IPR036986  S4_RNA-bd_sf  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0015935  C:small ribosomal subunit  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF01479  S4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50889  S4  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd00165  S4  
Amino Acid Sequences MRGKRLHALKRPKLRQSWNKYNLYNFWRQRDPKIGLKDDETFFQQKWRAKGLLRSYHGEHVRERDWERMFSRRLLSVANMDARYMAEWDGSEQAAGRGSGQDKRPNWNAPDVKPMTLTPYMNMAFAPLERRLDVAVFRALFASSARQARGMCVHGHVKVNGKVTPHPTYKLNPGDMISVNPDIVMFATGRPKGKAYVEPTPSGTASAAKNKKLRELYERGVCYACRKPGHLAAHCPGAGASEQELSVAEAESDATVSAQQAAAEQDPDTTDAPEAPVEDMKPTREAIQSLMSQAKLVLAAEAPTLKVKQKRDLRSFIKQAKPLLSRAGRPSATPSDIASELTKMVSELNLVDISNDTQEAAAQEAASSSETREPPKSIDDLTTDERKALERLIREEEENPIDPSKPYATPWRPRSYMAPFAFIPKYLEVNQNVCSAVYLRHPVARVGRAEVPTPYGYRINQLAFNWYLRRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.88
2 0.89
3 0.88
4 0.89
5 0.88
6 0.87
7 0.81
8 0.78
9 0.75
10 0.72
11 0.72
12 0.67
13 0.65
14 0.66
15 0.66
16 0.67
17 0.68
18 0.67
19 0.65
20 0.68
21 0.67
22 0.6
23 0.61
24 0.6
25 0.52
26 0.49
27 0.45
28 0.39
29 0.33
30 0.36
31 0.39
32 0.37
33 0.41
34 0.44
35 0.43
36 0.45
37 0.53
38 0.56
39 0.6
40 0.59
41 0.59
42 0.56
43 0.6
44 0.61
45 0.55
46 0.49
47 0.45
48 0.44
49 0.45
50 0.44
51 0.43
52 0.41
53 0.44
54 0.44
55 0.46
56 0.46
57 0.44
58 0.44
59 0.39
60 0.37
61 0.32
62 0.31
63 0.27
64 0.29
65 0.3
66 0.27
67 0.24
68 0.23
69 0.22
70 0.2
71 0.17
72 0.13
73 0.08
74 0.08
75 0.1
76 0.11
77 0.11
78 0.1
79 0.09
80 0.09
81 0.1
82 0.1
83 0.09
84 0.11
85 0.13
86 0.19
87 0.24
88 0.32
89 0.33
90 0.4
91 0.46
92 0.49
93 0.49
94 0.54
95 0.54
96 0.48
97 0.56
98 0.51
99 0.46
100 0.41
101 0.38
102 0.33
103 0.32
104 0.3
105 0.2
106 0.23
107 0.23
108 0.22
109 0.21
110 0.16
111 0.13
112 0.13
113 0.16
114 0.12
115 0.13
116 0.13
117 0.14
118 0.14
119 0.14
120 0.14
121 0.13
122 0.15
123 0.14
124 0.14
125 0.14
126 0.13
127 0.12
128 0.12
129 0.13
130 0.13
131 0.16
132 0.16
133 0.18
134 0.18
135 0.19
136 0.22
137 0.21
138 0.18
139 0.19
140 0.22
141 0.22
142 0.25
143 0.25
144 0.27
145 0.29
146 0.31
147 0.29
148 0.28
149 0.29
150 0.32
151 0.37
152 0.33
153 0.32
154 0.32
155 0.33
156 0.39
157 0.4
158 0.36
159 0.3
160 0.29
161 0.29
162 0.26
163 0.24
164 0.19
165 0.14
166 0.13
167 0.11
168 0.1
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.05
173 0.05
174 0.1
175 0.13
176 0.14
177 0.15
178 0.16
179 0.17
180 0.2
181 0.24
182 0.25
183 0.31
184 0.33
185 0.33
186 0.34
187 0.33
188 0.31
189 0.25
190 0.2
191 0.15
192 0.14
193 0.22
194 0.24
195 0.27
196 0.31
197 0.31
198 0.37
199 0.38
200 0.39
201 0.38
202 0.41
203 0.41
204 0.44
205 0.44
206 0.39
207 0.36
208 0.33
209 0.3
210 0.27
211 0.27
212 0.22
213 0.23
214 0.24
215 0.3
216 0.37
217 0.35
218 0.35
219 0.31
220 0.33
221 0.32
222 0.29
223 0.22
224 0.15
225 0.13
226 0.09
227 0.08
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.06
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.04
236 0.03
237 0.04
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.05
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.07
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.07
258 0.07
259 0.08
260 0.07
261 0.08
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.09
266 0.1
267 0.11
268 0.12
269 0.12
270 0.14
271 0.14
272 0.15
273 0.14
274 0.17
275 0.17
276 0.18
277 0.19
278 0.16
279 0.15
280 0.14
281 0.12
282 0.09
283 0.08
284 0.06
285 0.05
286 0.05
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.07
291 0.09
292 0.13
293 0.19
294 0.22
295 0.31
296 0.4
297 0.49
298 0.55
299 0.63
300 0.65
301 0.69
302 0.74
303 0.74
304 0.72
305 0.66
306 0.62
307 0.6
308 0.56
309 0.49
310 0.48
311 0.42
312 0.4
313 0.4
314 0.44
315 0.37
316 0.35
317 0.39
318 0.35
319 0.33
320 0.3
321 0.26
322 0.22
323 0.22
324 0.23
325 0.18
326 0.14
327 0.12
328 0.12
329 0.11
330 0.08
331 0.08
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.07
336 0.08
337 0.08
338 0.08
339 0.09
340 0.09
341 0.09
342 0.09
343 0.07
344 0.06
345 0.07
346 0.07
347 0.08
348 0.07
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.08
353 0.08
354 0.08
355 0.08
356 0.14
357 0.16
358 0.2
359 0.23
360 0.24
361 0.26
362 0.29
363 0.3
364 0.25
365 0.26
366 0.25
367 0.27
368 0.31
369 0.34
370 0.3
371 0.29
372 0.28
373 0.27
374 0.25
375 0.25
376 0.24
377 0.23
378 0.28
379 0.34
380 0.35
381 0.35
382 0.35
383 0.35
384 0.35
385 0.33
386 0.31
387 0.26
388 0.25
389 0.23
390 0.25
391 0.24
392 0.21
393 0.22
394 0.3
395 0.38
396 0.47
397 0.55
398 0.6
399 0.59
400 0.6
401 0.65
402 0.61
403 0.63
404 0.54
405 0.5
406 0.42
407 0.46
408 0.44
409 0.38
410 0.33
411 0.25
412 0.27
413 0.26
414 0.32
415 0.31
416 0.33
417 0.34
418 0.33
419 0.31
420 0.27
421 0.25
422 0.19
423 0.18
424 0.2
425 0.23
426 0.22
427 0.26
428 0.27
429 0.31
430 0.36
431 0.39
432 0.37
433 0.36
434 0.41
435 0.39
436 0.4
437 0.37
438 0.35
439 0.32
440 0.31
441 0.3
442 0.28
443 0.27
444 0.3
445 0.33
446 0.32
447 0.34
448 0.33
449 0.36
450 0.34
451 0.38