Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2DFN3

Protein Details
Accession A0A1Y2DFN3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1199-1226QSTLNKRRVPNAGDKHRKREQGHRRRHRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
1204-1226KRRVPNAGDKHRKREQGHRRRHR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR003890  MIF4G-like_typ-3  
IPR039762  Nmd2/UPF2  
IPR007193  Upf2/Nmd2_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF02854  MIF4G  
PF04050  Upf2  
Amino Acid Sequences MDRSRKRNLRAQNERAWDGEKDIFPVGKSLDSSLKKNTAFIKRLRTAISPATLNTFLQEIKTLSLLKYLSEIISACYEGLCKLKSPGEIEAGVEIVSALHQRFGPVDFTEYLGWLLGKGMATPDKSLLKTLSPDVREKEEKERLVRQRALLRVVTELWLVGVLRTLDNVKPDDATRGATGKDLGLKMKPSSSSKGGSAEPFPLEVLKDLLGHDREHANLPLLVIFVKAFSWDLLGVKATGADGRKLVEEDGAMKSTDNGVEPVNGTDGANDQTEDPPFTSPELQERFKNILKRYFDDVKAHLIRDQKNIVAQKGRNSEAYVKSGEVFEDRQANFEKQLKAQERLVSNAQIIAEAVGVDMPDLKDSGDSLAAINGSIGLVKTGEYLRGQSDGSGIWEDDDERRFYENLVDLKGKVPGILLEDGKKKKSESDEQVGKKFDTPETPEAPKPNDPNDDQSTAIANKTIGAQVDALLTRLPELTNKDVIDETAIDFCFLNSKASRNRLIKALTEVPKGRTDLLPCWSRLVATLGRYMPDVPKGVVEYLDAEFRSLQRRKEKDFLGQVRLSNIRYLAELTKFGIVPEHVVFHCLKVSLDDFSRMNIEIICNLLENCGRYLLRSADTSPRMATFLETLQRKKSVQHIGQPERMLIENAIYYVDPPQRASIQQKERTPTELFIRKLIYVDMTKRNYTKILKQIRRLHWEEPEVVAILAKVFSKPGKVKYGSIHILAILLSAIYRYHPEFVVKVIDNVIESVCFGLEQNDFKFNQRRLAEVKYLGELYNYRMLEHPVIFETMYKVMTFGHGGPPIPSRLNPFDMPDDYFRIRLVATILETCGMFFIRGAAGKKLDYFLSFLQYYIHTKGPLPMDIEFIVQDTYSLTRPQWKLATNLEEAAKAFQLAILQDQKNAGIDKTVDQDQEDASSSSSSDEEDVEGDGDEVLPAANGEEGSDSEEDDLEDIENHQGSTRDSESEEEAIVVTRKAEKVEPADEADFEREYAKMMAESLDSRKFERKPLFDVPLPVRPKNREPSTTAHAHDTDDADGDAAPNMMAFSLLTKKGNRQQTRTVALPSDSTFAVAMKNQQQAEREEQQRIKNLVLNYDLRESEEQDGDTNSMPLQPNTTIHKSNPAGHERTPTYHLNRTDKIGKERGGQRVRRLQMNDLDWYDRFPENNQTLNREPEANSPSAGDTYRSNSPAPNPVEQSTLNKRRVPNAGDKHRKREQGHRRRHR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.69
3 0.62
4 0.52
5 0.46
6 0.43
7 0.35
8 0.3
9 0.31
10 0.29
11 0.26
12 0.28
13 0.24
14 0.2
15 0.2
16 0.21
17 0.27
18 0.3
19 0.34
20 0.38
21 0.44
22 0.42
23 0.46
24 0.51
25 0.52
26 0.55
27 0.58
28 0.61
29 0.59
30 0.63
31 0.62
32 0.56
33 0.52
34 0.51
35 0.49
36 0.41
37 0.36
38 0.37
39 0.35
40 0.32
41 0.27
42 0.23
43 0.18
44 0.17
45 0.19
46 0.14
47 0.14
48 0.17
49 0.18
50 0.16
51 0.21
52 0.2
53 0.18
54 0.19
55 0.19
56 0.16
57 0.16
58 0.16
59 0.14
60 0.15
61 0.15
62 0.13
63 0.12
64 0.12
65 0.12
66 0.16
67 0.15
68 0.15
69 0.19
70 0.23
71 0.26
72 0.29
73 0.31
74 0.31
75 0.3
76 0.29
77 0.26
78 0.22
79 0.18
80 0.15
81 0.11
82 0.06
83 0.07
84 0.09
85 0.08
86 0.09
87 0.1
88 0.11
89 0.12
90 0.14
91 0.17
92 0.15
93 0.19
94 0.18
95 0.2
96 0.2
97 0.19
98 0.17
99 0.15
100 0.13
101 0.1
102 0.1
103 0.09
104 0.08
105 0.08
106 0.11
107 0.15
108 0.16
109 0.18
110 0.22
111 0.25
112 0.25
113 0.28
114 0.26
115 0.25
116 0.27
117 0.32
118 0.35
119 0.34
120 0.39
121 0.4
122 0.46
123 0.49
124 0.49
125 0.53
126 0.54
127 0.56
128 0.57
129 0.63
130 0.64
131 0.68
132 0.69
133 0.65
134 0.64
135 0.63
136 0.62
137 0.54
138 0.46
139 0.39
140 0.36
141 0.31
142 0.23
143 0.18
144 0.13
145 0.12
146 0.11
147 0.08
148 0.09
149 0.09
150 0.08
151 0.1
152 0.13
153 0.13
154 0.17
155 0.19
156 0.17
157 0.18
158 0.19
159 0.22
160 0.21
161 0.22
162 0.2
163 0.21
164 0.2
165 0.2
166 0.2
167 0.17
168 0.21
169 0.2
170 0.2
171 0.21
172 0.24
173 0.25
174 0.27
175 0.31
176 0.3
177 0.34
178 0.36
179 0.36
180 0.35
181 0.37
182 0.36
183 0.34
184 0.32
185 0.29
186 0.26
187 0.23
188 0.21
189 0.18
190 0.16
191 0.14
192 0.13
193 0.1
194 0.1
195 0.11
196 0.16
197 0.17
198 0.17
199 0.19
200 0.19
201 0.2
202 0.23
203 0.23
204 0.19
205 0.18
206 0.18
207 0.16
208 0.14
209 0.13
210 0.1
211 0.09
212 0.07
213 0.06
214 0.07
215 0.07
216 0.06
217 0.07
218 0.08
219 0.09
220 0.09
221 0.1
222 0.09
223 0.09
224 0.09
225 0.08
226 0.1
227 0.11
228 0.11
229 0.11
230 0.12
231 0.13
232 0.14
233 0.14
234 0.12
235 0.11
236 0.13
237 0.14
238 0.15
239 0.14
240 0.13
241 0.13
242 0.14
243 0.14
244 0.12
245 0.11
246 0.1
247 0.11
248 0.12
249 0.12
250 0.12
251 0.11
252 0.1
253 0.09
254 0.1
255 0.11
256 0.11
257 0.1
258 0.1
259 0.12
260 0.13
261 0.14
262 0.14
263 0.13
264 0.14
265 0.15
266 0.17
267 0.16
268 0.23
269 0.27
270 0.29
271 0.3
272 0.33
273 0.37
274 0.39
275 0.45
276 0.42
277 0.45
278 0.47
279 0.48
280 0.51
281 0.52
282 0.52
283 0.49
284 0.46
285 0.47
286 0.44
287 0.41
288 0.38
289 0.38
290 0.38
291 0.39
292 0.39
293 0.32
294 0.35
295 0.38
296 0.38
297 0.39
298 0.37
299 0.4
300 0.43
301 0.43
302 0.39
303 0.38
304 0.41
305 0.36
306 0.38
307 0.31
308 0.26
309 0.25
310 0.24
311 0.21
312 0.17
313 0.15
314 0.14
315 0.2
316 0.19
317 0.21
318 0.25
319 0.25
320 0.27
321 0.32
322 0.32
323 0.27
324 0.37
325 0.39
326 0.39
327 0.41
328 0.42
329 0.38
330 0.39
331 0.39
332 0.31
333 0.27
334 0.25
335 0.21
336 0.16
337 0.14
338 0.1
339 0.07
340 0.06
341 0.05
342 0.04
343 0.04
344 0.03
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.06
352 0.07
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.07
357 0.07
358 0.07
359 0.06
360 0.05
361 0.04
362 0.04
363 0.04
364 0.03
365 0.04
366 0.04
367 0.06
368 0.06
369 0.08
370 0.08
371 0.1
372 0.1
373 0.12
374 0.12
375 0.1
376 0.11
377 0.09
378 0.1
379 0.1
380 0.09
381 0.08
382 0.08
383 0.09
384 0.11
385 0.13
386 0.12
387 0.13
388 0.15
389 0.14
390 0.15
391 0.17
392 0.19
393 0.19
394 0.21
395 0.21
396 0.19
397 0.2
398 0.22
399 0.18
400 0.13
401 0.12
402 0.1
403 0.12
404 0.14
405 0.14
406 0.16
407 0.23
408 0.26
409 0.27
410 0.28
411 0.25
412 0.28
413 0.33
414 0.38
415 0.39
416 0.46
417 0.53
418 0.56
419 0.6
420 0.57
421 0.51
422 0.44
423 0.39
424 0.31
425 0.26
426 0.28
427 0.29
428 0.31
429 0.34
430 0.34
431 0.35
432 0.38
433 0.38
434 0.35
435 0.35
436 0.35
437 0.33
438 0.37
439 0.38
440 0.37
441 0.32
442 0.29
443 0.27
444 0.23
445 0.21
446 0.15
447 0.11
448 0.09
449 0.1
450 0.1
451 0.08
452 0.08
453 0.08
454 0.07
455 0.09
456 0.08
457 0.08
458 0.07
459 0.07
460 0.06
461 0.07
462 0.06
463 0.07
464 0.11
465 0.14
466 0.17
467 0.17
468 0.18
469 0.17
470 0.17
471 0.16
472 0.12
473 0.1
474 0.09
475 0.09
476 0.09
477 0.08
478 0.08
479 0.1
480 0.1
481 0.12
482 0.11
483 0.16
484 0.21
485 0.25
486 0.33
487 0.33
488 0.34
489 0.35
490 0.37
491 0.33
492 0.33
493 0.37
494 0.33
495 0.34
496 0.35
497 0.32
498 0.33
499 0.32
500 0.29
501 0.23
502 0.22
503 0.21
504 0.24
505 0.25
506 0.23
507 0.24
508 0.22
509 0.2
510 0.19
511 0.19
512 0.16
513 0.14
514 0.18
515 0.16
516 0.16
517 0.17
518 0.17
519 0.14
520 0.14
521 0.14
522 0.1
523 0.11
524 0.11
525 0.11
526 0.1
527 0.09
528 0.09
529 0.08
530 0.1
531 0.09
532 0.09
533 0.09
534 0.1
535 0.18
536 0.19
537 0.24
538 0.32
539 0.37
540 0.42
541 0.48
542 0.49
543 0.47
544 0.53
545 0.52
546 0.49
547 0.47
548 0.42
549 0.39
550 0.39
551 0.32
552 0.24
553 0.2
554 0.14
555 0.12
556 0.13
557 0.12
558 0.11
559 0.11
560 0.11
561 0.12
562 0.11
563 0.11
564 0.1
565 0.08
566 0.09
567 0.09
568 0.1
569 0.09
570 0.11
571 0.11
572 0.1
573 0.11
574 0.09
575 0.09
576 0.08
577 0.09
578 0.09
579 0.09
580 0.11
581 0.1
582 0.11
583 0.12
584 0.11
585 0.1
586 0.09
587 0.09
588 0.07
589 0.07
590 0.07
591 0.06
592 0.05
593 0.06
594 0.06
595 0.07
596 0.07
597 0.08
598 0.08
599 0.08
600 0.1
601 0.11
602 0.12
603 0.12
604 0.14
605 0.18
606 0.19
607 0.2
608 0.18
609 0.17
610 0.16
611 0.15
612 0.14
613 0.09
614 0.09
615 0.14
616 0.16
617 0.17
618 0.19
619 0.21
620 0.21
621 0.22
622 0.28
623 0.31
624 0.32
625 0.38
626 0.45
627 0.48
628 0.51
629 0.5
630 0.42
631 0.34
632 0.31
633 0.25
634 0.15
635 0.1
636 0.06
637 0.06
638 0.06
639 0.05
640 0.05
641 0.08
642 0.11
643 0.1
644 0.11
645 0.12
646 0.13
647 0.16
648 0.2
649 0.25
650 0.32
651 0.38
652 0.41
653 0.43
654 0.43
655 0.45
656 0.42
657 0.35
658 0.33
659 0.34
660 0.31
661 0.29
662 0.29
663 0.26
664 0.25
665 0.23
666 0.18
667 0.14
668 0.18
669 0.23
670 0.24
671 0.26
672 0.26
673 0.28
674 0.3
675 0.31
676 0.33
677 0.35
678 0.43
679 0.46
680 0.55
681 0.64
682 0.66
683 0.7
684 0.68
685 0.61
686 0.55
687 0.52
688 0.44
689 0.35
690 0.29
691 0.22
692 0.17
693 0.14
694 0.09
695 0.07
696 0.06
697 0.05
698 0.05
699 0.05
700 0.06
701 0.11
702 0.14
703 0.18
704 0.25
705 0.27
706 0.3
707 0.31
708 0.38
709 0.35
710 0.33
711 0.29
712 0.21
713 0.2
714 0.17
715 0.14
716 0.07
717 0.04
718 0.03
719 0.03
720 0.03
721 0.03
722 0.05
723 0.06
724 0.07
725 0.08
726 0.09
727 0.1
728 0.11
729 0.16
730 0.14
731 0.14
732 0.13
733 0.13
734 0.12
735 0.12
736 0.11
737 0.06
738 0.05
739 0.05
740 0.04
741 0.04
742 0.04
743 0.06
744 0.07
745 0.1
746 0.11
747 0.14
748 0.15
749 0.19
750 0.27
751 0.26
752 0.32
753 0.31
754 0.33
755 0.33
756 0.37
757 0.37
758 0.32
759 0.31
760 0.25
761 0.25
762 0.22
763 0.19
764 0.15
765 0.14
766 0.18
767 0.17
768 0.16
769 0.16
770 0.18
771 0.19
772 0.19
773 0.17
774 0.12
775 0.13
776 0.12
777 0.12
778 0.11
779 0.1
780 0.1
781 0.09
782 0.08
783 0.08
784 0.09
785 0.09
786 0.09
787 0.12
788 0.13
789 0.13
790 0.14
791 0.16
792 0.18
793 0.18
794 0.18
795 0.19
796 0.21
797 0.25
798 0.24
799 0.25
800 0.26
801 0.27
802 0.28
803 0.25
804 0.26
805 0.23
806 0.23
807 0.2
808 0.17
809 0.15
810 0.13
811 0.12
812 0.09
813 0.09
814 0.09
815 0.09
816 0.09
817 0.09
818 0.08
819 0.08
820 0.07
821 0.05
822 0.05
823 0.05
824 0.06
825 0.09
826 0.11
827 0.13
828 0.14
829 0.14
830 0.15
831 0.16
832 0.15
833 0.13
834 0.14
835 0.13
836 0.16
837 0.16
838 0.15
839 0.15
840 0.16
841 0.18
842 0.19
843 0.2
844 0.16
845 0.16
846 0.21
847 0.22
848 0.22
849 0.21
850 0.19
851 0.2
852 0.19
853 0.19
854 0.15
855 0.13
856 0.11
857 0.09
858 0.08
859 0.06
860 0.07
861 0.08
862 0.1
863 0.1
864 0.18
865 0.19
866 0.24
867 0.27
868 0.28
869 0.31
870 0.35
871 0.39
872 0.32
873 0.34
874 0.3
875 0.26
876 0.25
877 0.22
878 0.16
879 0.12
880 0.1
881 0.08
882 0.08
883 0.07
884 0.11
885 0.17
886 0.17
887 0.18
888 0.19
889 0.19
890 0.2
891 0.2
892 0.16
893 0.11
894 0.12
895 0.13
896 0.16
897 0.18
898 0.17
899 0.16
900 0.17
901 0.16
902 0.16
903 0.16
904 0.13
905 0.11
906 0.1
907 0.1
908 0.1
909 0.1
910 0.09
911 0.08
912 0.08
913 0.07
914 0.08
915 0.08
916 0.07
917 0.07
918 0.07
919 0.06
920 0.06
921 0.05
922 0.04
923 0.04
924 0.03
925 0.03
926 0.03
927 0.04
928 0.03
929 0.04
930 0.05
931 0.05
932 0.08
933 0.08
934 0.08
935 0.08
936 0.08
937 0.08
938 0.08
939 0.08
940 0.06
941 0.06
942 0.07
943 0.08
944 0.08
945 0.08
946 0.09
947 0.1
948 0.11
949 0.15
950 0.16
951 0.15
952 0.16
953 0.18
954 0.19
955 0.19
956 0.18
957 0.14
958 0.12
959 0.12
960 0.12
961 0.1
962 0.09
963 0.11
964 0.12
965 0.14
966 0.15
967 0.19
968 0.23
969 0.25
970 0.26
971 0.27
972 0.27
973 0.25
974 0.25
975 0.23
976 0.19
977 0.17
978 0.15
979 0.11
980 0.12
981 0.12
982 0.11
983 0.09
984 0.09
985 0.1
986 0.1
987 0.13
988 0.16
989 0.21
990 0.22
991 0.24
992 0.31
993 0.32
994 0.4
995 0.46
996 0.45
997 0.47
998 0.53
999 0.57
1000 0.52
1001 0.57
1002 0.54
1003 0.54
1004 0.55
1005 0.52
1006 0.51
1007 0.51
1008 0.56
1009 0.6
1010 0.62
1011 0.58
1012 0.56
1013 0.59
1014 0.59
1015 0.59
1016 0.53
1017 0.48
1018 0.41
1019 0.38
1020 0.36
1021 0.31
1022 0.25
1023 0.2
1024 0.17
1025 0.13
1026 0.12
1027 0.11
1028 0.08
1029 0.07
1030 0.06
1031 0.05
1032 0.05
1033 0.04
1034 0.04
1035 0.04
1036 0.06
1037 0.11
1038 0.14
1039 0.17
1040 0.2
1041 0.27
1042 0.35
1043 0.46
1044 0.51
1045 0.52
1046 0.6
1047 0.65
1048 0.69
1049 0.64
1050 0.6
1051 0.52
1052 0.46
1053 0.42
1054 0.34
1055 0.28
1056 0.22
1057 0.19
1058 0.16
1059 0.13
1060 0.14
1061 0.13
1062 0.17
1063 0.21
1064 0.27
1065 0.28
1066 0.31
1067 0.34
1068 0.37
1069 0.43
1070 0.46
1071 0.44
1072 0.47
1073 0.52
1074 0.54
1075 0.59
1076 0.57
1077 0.52
1078 0.48
1079 0.45
1080 0.4
1081 0.4
1082 0.38
1083 0.32
1084 0.34
1085 0.32
1086 0.3
1087 0.3
1088 0.29
1089 0.28
1090 0.26
1091 0.24
1092 0.21
1093 0.22
1094 0.2
1095 0.19
1096 0.17
1097 0.13
1098 0.16
1099 0.17
1100 0.16
1101 0.18
1102 0.19
1103 0.22
1104 0.29
1105 0.35
1106 0.34
1107 0.33
1108 0.43
1109 0.43
1110 0.47
1111 0.52
1112 0.52
1113 0.5
1114 0.5
1115 0.57
1116 0.5
1117 0.51
1118 0.49
1119 0.49
1120 0.47
1121 0.51
1122 0.56
1123 0.55
1124 0.55
1125 0.57
1126 0.61
1127 0.6
1128 0.62
1129 0.61
1130 0.57
1131 0.58
1132 0.63
1133 0.66
1134 0.68
1135 0.67
1136 0.69
1137 0.71
1138 0.73
1139 0.72
1140 0.68
1141 0.65
1142 0.63
1143 0.61
1144 0.57
1145 0.5
1146 0.49
1147 0.41
1148 0.4
1149 0.36
1150 0.3
1151 0.28
1152 0.25
1153 0.31
1154 0.32
1155 0.4
1156 0.4
1157 0.44
1158 0.46
1159 0.51
1160 0.5
1161 0.44
1162 0.41
1163 0.42
1164 0.44
1165 0.38
1166 0.33
1167 0.29
1168 0.28
1169 0.27
1170 0.26
1171 0.2
1172 0.18
1173 0.21
1174 0.27
1175 0.28
1176 0.28
1177 0.29
1178 0.33
1179 0.4
1180 0.42
1181 0.43
1182 0.42
1183 0.41
1184 0.44
1185 0.43
1186 0.46
1187 0.48
1188 0.53
1189 0.53
1190 0.54
1191 0.56
1192 0.59
1193 0.65
1194 0.64
1195 0.64
1196 0.65
1197 0.7
1198 0.76
1199 0.8
1200 0.82
1201 0.82
1202 0.85
1203 0.8
1204 0.8
1205 0.8
1206 0.8