Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2EJB9

Protein Details
Accession A0A1Y2EJB9    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
96-117TGVWVIRKQTRRKRANEEDEITHydrophilic
295-324KTPKTPTSGPGSKPKRKKSKAGTTPGTTPTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
294-315DKTPKTPTSGPGSKPKRKKSKA
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007018  Mediator_Med6  
IPR038566  Mediator_Med6_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF04934  Med6  
Amino Acid Sequences MAGAPPPLDETQWRDPHTAASMQGIHSNSVLHYFAASPFSDPTSNNAVIITQSQWNRDMHQYLVTRDAFEGRLKTMSGLEYIVAQEPSVMGPGAGTGVWVIRKQTRRKRANEEDEITVHSSYFVVGDNIYMAPTLADIMSYRMATVESKLRKCFPVASEVSTWSPAAGHAYTIPTTSSNPRERTSTSKEATPMPDGESHTSKAAGVSESKKPGQSTMLDARLAEQSFTIHMQYGSEYMDENPITGKPGEFHLSSTGRKDRMVQAPGNMPSLTTSFKSPTVPDLGGKRDVTGKGDKTPKTPTSGPGSKPKRKKSKAGTTPGTTPTAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.4
3 0.42
4 0.42
5 0.37
6 0.29
7 0.27
8 0.26
9 0.25
10 0.29
11 0.26
12 0.23
13 0.21
14 0.21
15 0.16
16 0.17
17 0.17
18 0.12
19 0.11
20 0.11
21 0.12
22 0.15
23 0.15
24 0.13
25 0.14
26 0.17
27 0.18
28 0.17
29 0.21
30 0.25
31 0.25
32 0.23
33 0.22
34 0.2
35 0.19
36 0.2
37 0.17
38 0.16
39 0.18
40 0.2
41 0.23
42 0.24
43 0.26
44 0.3
45 0.3
46 0.25
47 0.3
48 0.31
49 0.29
50 0.35
51 0.32
52 0.28
53 0.27
54 0.27
55 0.22
56 0.22
57 0.22
58 0.17
59 0.18
60 0.17
61 0.17
62 0.16
63 0.15
64 0.13
65 0.12
66 0.1
67 0.1
68 0.11
69 0.11
70 0.1
71 0.09
72 0.08
73 0.08
74 0.08
75 0.07
76 0.06
77 0.04
78 0.04
79 0.04
80 0.05
81 0.04
82 0.04
83 0.03
84 0.05
85 0.06
86 0.07
87 0.09
88 0.15
89 0.24
90 0.34
91 0.44
92 0.54
93 0.61
94 0.69
95 0.77
96 0.81
97 0.83
98 0.81
99 0.74
100 0.67
101 0.59
102 0.53
103 0.44
104 0.33
105 0.24
106 0.15
107 0.12
108 0.09
109 0.08
110 0.06
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.03
123 0.03
124 0.03
125 0.05
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.07
131 0.07
132 0.08
133 0.14
134 0.19
135 0.22
136 0.24
137 0.26
138 0.26
139 0.27
140 0.29
141 0.23
142 0.25
143 0.24
144 0.25
145 0.24
146 0.25
147 0.24
148 0.21
149 0.2
150 0.12
151 0.1
152 0.08
153 0.09
154 0.07
155 0.06
156 0.06
157 0.07
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.07
162 0.09
163 0.12
164 0.19
165 0.24
166 0.27
167 0.28
168 0.3
169 0.32
170 0.37
171 0.41
172 0.42
173 0.37
174 0.37
175 0.38
176 0.38
177 0.37
178 0.33
179 0.26
180 0.2
181 0.21
182 0.2
183 0.22
184 0.22
185 0.2
186 0.19
187 0.18
188 0.16
189 0.14
190 0.13
191 0.11
192 0.12
193 0.14
194 0.18
195 0.22
196 0.23
197 0.25
198 0.24
199 0.25
200 0.24
201 0.22
202 0.24
203 0.26
204 0.28
205 0.26
206 0.26
207 0.26
208 0.26
209 0.25
210 0.19
211 0.13
212 0.1
213 0.11
214 0.12
215 0.11
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.12
226 0.11
227 0.11
228 0.11
229 0.1
230 0.13
231 0.12
232 0.12
233 0.09
234 0.13
235 0.16
236 0.15
237 0.17
238 0.21
239 0.24
240 0.25
241 0.31
242 0.34
243 0.32
244 0.32
245 0.35
246 0.37
247 0.41
248 0.45
249 0.41
250 0.39
251 0.45
252 0.46
253 0.44
254 0.36
255 0.28
256 0.24
257 0.23
258 0.22
259 0.16
260 0.17
261 0.17
262 0.19
263 0.21
264 0.21
265 0.23
266 0.25
267 0.25
268 0.27
269 0.29
270 0.32
271 0.35
272 0.34
273 0.32
274 0.32
275 0.33
276 0.33
277 0.36
278 0.35
279 0.38
280 0.46
281 0.47
282 0.46
283 0.54
284 0.52
285 0.52
286 0.51
287 0.48
288 0.5
289 0.55
290 0.56
291 0.58
292 0.65
293 0.67
294 0.75
295 0.8
296 0.81
297 0.82
298 0.88
299 0.88
300 0.89
301 0.89
302 0.9
303 0.88
304 0.82
305 0.81
306 0.74