Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2DSQ0

Protein Details
Accession A0A1Y2DSQ0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
348-389PWGRTPAKGGFKTRRNNNPNKWVVVPKVRNHGKRRDKKGKQAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
99-130TFPKKGMGKGGRNHHGRITVRHRGGGAKRRIR
332-389HGGGRGKSKSNRHPVSPWGRTPAKGGFKTRRNNNPNKWVVVPKVRNHGKRRDKKGKQA
Subcellular Location(s) mito 25.5, cyto_mito 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR022666  Rbsml_prot_L2_RNA-bd_dom  
IPR014722  Rib_L2_dom2  
IPR002171  Ribosomal_L2  
IPR005880  Ribosomal_L2_bac/org-type  
IPR022669  Ribosomal_L2_C  
IPR022671  Ribosomal_L2_CS  
IPR014726  Ribosomal_L2_dom3  
IPR008991  Translation_prot_SH3-like_sf  
Gene Ontology GO:0015934  C:large ribosomal subunit  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0016740  F:transferase activity  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00181  Ribosomal_L2  
PF03947  Ribosomal_L2_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00467  RIBOSOMAL_L2  
Amino Acid Sequences MMMLRPRLFARPAVRALAACQSSPAAFIRRYAAVQTGSEAVTTTVPSPSSRTAERPQGAKDKQSTVIMRTYKPRTPGLRHLKRPINDHLWKGRPFLPLTFPKKGMGKGGRNHHGRITVRHRGGGAKRRIRTVDFHRWNPGPHTVERIEYDPNRSAHIALLNEDATGTKSYIIAPDGTRAGDVVQSYRSGIPQDLLDSMGGVIDPGILAAKTAHRGNCLPLHLIPVGTPVYNVGSHPKGGAVFCRSAGTHALVDSKEEETREDGIRVFTGKYVNVRLQSGEVRRCSKDACATIGVASNPHHQYRQLGKAGRSRWLNIRPTVRGVAMNKVDHPHGGGRGKSKSNRHPVSPWGRTPAKGGFKTRRNNNPNKWVVVPKVRNHGKRRDKKGKQA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.38
3 0.38
4 0.39
5 0.34
6 0.26
7 0.24
8 0.22
9 0.2
10 0.22
11 0.22
12 0.19
13 0.18
14 0.2
15 0.23
16 0.24
17 0.25
18 0.25
19 0.26
20 0.24
21 0.23
22 0.23
23 0.22
24 0.19
25 0.18
26 0.16
27 0.13
28 0.11
29 0.12
30 0.11
31 0.11
32 0.12
33 0.12
34 0.16
35 0.2
36 0.24
37 0.26
38 0.31
39 0.36
40 0.45
41 0.48
42 0.48
43 0.5
44 0.56
45 0.56
46 0.56
47 0.55
48 0.5
49 0.49
50 0.51
51 0.48
52 0.41
53 0.45
54 0.42
55 0.41
56 0.45
57 0.48
58 0.45
59 0.47
60 0.51
61 0.51
62 0.55
63 0.62
64 0.65
65 0.69
66 0.73
67 0.78
68 0.79
69 0.75
70 0.73
71 0.71
72 0.7
73 0.65
74 0.63
75 0.63
76 0.62
77 0.59
78 0.58
79 0.54
80 0.49
81 0.45
82 0.41
83 0.4
84 0.42
85 0.48
86 0.49
87 0.45
88 0.44
89 0.46
90 0.44
91 0.45
92 0.45
93 0.45
94 0.47
95 0.55
96 0.6
97 0.6
98 0.61
99 0.55
100 0.53
101 0.48
102 0.49
103 0.49
104 0.5
105 0.47
106 0.47
107 0.45
108 0.44
109 0.5
110 0.51
111 0.52
112 0.51
113 0.52
114 0.55
115 0.57
116 0.53
117 0.52
118 0.51
119 0.52
120 0.51
121 0.52
122 0.53
123 0.52
124 0.52
125 0.48
126 0.46
127 0.39
128 0.32
129 0.36
130 0.3
131 0.3
132 0.3
133 0.28
134 0.26
135 0.24
136 0.28
137 0.27
138 0.26
139 0.26
140 0.25
141 0.24
142 0.2
143 0.21
144 0.17
145 0.13
146 0.15
147 0.12
148 0.12
149 0.11
150 0.1
151 0.08
152 0.08
153 0.07
154 0.06
155 0.06
156 0.07
157 0.08
158 0.08
159 0.09
160 0.08
161 0.1
162 0.1
163 0.1
164 0.09
165 0.09
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.08
173 0.09
174 0.09
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.07
183 0.06
184 0.06
185 0.05
186 0.04
187 0.03
188 0.03
189 0.02
190 0.02
191 0.02
192 0.02
193 0.02
194 0.02
195 0.03
196 0.04
197 0.07
198 0.1
199 0.1
200 0.12
201 0.13
202 0.16
203 0.19
204 0.19
205 0.19
206 0.17
207 0.19
208 0.17
209 0.17
210 0.14
211 0.13
212 0.12
213 0.1
214 0.1
215 0.07
216 0.08
217 0.08
218 0.09
219 0.11
220 0.11
221 0.11
222 0.12
223 0.12
224 0.12
225 0.12
226 0.15
227 0.14
228 0.14
229 0.14
230 0.15
231 0.15
232 0.15
233 0.16
234 0.15
235 0.12
236 0.12
237 0.14
238 0.12
239 0.13
240 0.14
241 0.14
242 0.13
243 0.13
244 0.13
245 0.13
246 0.16
247 0.16
248 0.16
249 0.15
250 0.14
251 0.15
252 0.15
253 0.13
254 0.12
255 0.12
256 0.13
257 0.15
258 0.18
259 0.21
260 0.21
261 0.22
262 0.21
263 0.22
264 0.26
265 0.3
266 0.32
267 0.34
268 0.37
269 0.37
270 0.38
271 0.37
272 0.35
273 0.36
274 0.32
275 0.31
276 0.28
277 0.27
278 0.26
279 0.28
280 0.24
281 0.18
282 0.18
283 0.21
284 0.23
285 0.24
286 0.24
287 0.23
288 0.29
289 0.35
290 0.41
291 0.41
292 0.43
293 0.47
294 0.53
295 0.54
296 0.55
297 0.51
298 0.46
299 0.48
300 0.51
301 0.52
302 0.52
303 0.56
304 0.52
305 0.53
306 0.52
307 0.45
308 0.42
309 0.38
310 0.39
311 0.38
312 0.36
313 0.34
314 0.34
315 0.34
316 0.29
317 0.29
318 0.24
319 0.26
320 0.29
321 0.3
322 0.34
323 0.4
324 0.47
325 0.52
326 0.58
327 0.62
328 0.68
329 0.7
330 0.69
331 0.67
332 0.69
333 0.72
334 0.71
335 0.65
336 0.63
337 0.6
338 0.56
339 0.56
340 0.55
341 0.54
342 0.53
343 0.57
344 0.59
345 0.64
346 0.73
347 0.78
348 0.8
349 0.81
350 0.85
351 0.86
352 0.87
353 0.85
354 0.8
355 0.75
356 0.71
357 0.69
358 0.69
359 0.67
360 0.63
361 0.67
362 0.72
363 0.76
364 0.78
365 0.8
366 0.81
367 0.83
368 0.88
369 0.88