Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H0EFE3

Protein Details
Accession H0EFE3    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
348-373AYPPPAAKVKKEKKDKGDPAKRAAAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
353-376AAKVKKEKKDKGDPAKRAAAAEAR
Subcellular Location(s) cyto 17, cyto_nucl 12.5, nucl 6, mito 2, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002305  aa-tRNA-synth_Ic  
IPR014729  Rossmann-like_a/b/a_fold  
IPR002307  Tyr-tRNA-ligase  
IPR023617  Tyr-tRNA-ligase_arc/euk-type  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0004831  F:tyrosine-tRNA ligase activity  
GO:0006437  P:tyrosyl-tRNA aminoacylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00579  tRNA-synt_1b  
Amino Acid Sequences MAPQMSPEDSIALIKANLQEVLNPEIIDNVILKEKRPLKVYWGTAPTGKPHCGYFVPMMKIAELLAAGCEVKVLLADIHAFLDTSIIPLEQVAARAKYYEFVIKALLTAVGVDISRLIFVLGSSYQYSMEYTRDRFKLDAVTRYHTALKAGSEVVKTSAEGATIGGLQYPGMQSLDEEYLGVDAQFGGVDQRKIFVFAIENLHIVGYKLRAHLMNAMVPGLGDAVKMSASDADSKIDLLDNSADVAKKLKKAKCEPKTVEGNGVVAFVEHVILRALKLKNAGPFIVERRDQEPLSYESADKLKEDYTADVLTPQLLKAAVTVQLNNLLAPIIQAFQESKEWQDVEKVAYPPPAAKVKKEKKDKGDPAKRAAAAEARKLALGEGGVEKVVEDVKKLDV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.15
3 0.15
4 0.16
5 0.15
6 0.18
7 0.19
8 0.24
9 0.22
10 0.2
11 0.18
12 0.17
13 0.17
14 0.15
15 0.13
16 0.1
17 0.17
18 0.17
19 0.18
20 0.26
21 0.33
22 0.36
23 0.4
24 0.39
25 0.4
26 0.48
27 0.53
28 0.52
29 0.5
30 0.47
31 0.48
32 0.48
33 0.47
34 0.44
35 0.42
36 0.34
37 0.31
38 0.33
39 0.29
40 0.32
41 0.32
42 0.34
43 0.34
44 0.36
45 0.35
46 0.31
47 0.3
48 0.26
49 0.19
50 0.12
51 0.09
52 0.06
53 0.06
54 0.06
55 0.05
56 0.05
57 0.05
58 0.04
59 0.04
60 0.05
61 0.04
62 0.05
63 0.06
64 0.06
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.06
69 0.07
70 0.06
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.06
75 0.05
76 0.07
77 0.07
78 0.09
79 0.12
80 0.12
81 0.13
82 0.14
83 0.14
84 0.14
85 0.15
86 0.18
87 0.15
88 0.15
89 0.16
90 0.15
91 0.15
92 0.14
93 0.12
94 0.07
95 0.07
96 0.06
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.06
108 0.06
109 0.07
110 0.08
111 0.09
112 0.09
113 0.09
114 0.11
115 0.1
116 0.13
117 0.15
118 0.17
119 0.23
120 0.24
121 0.25
122 0.25
123 0.25
124 0.31
125 0.31
126 0.35
127 0.32
128 0.35
129 0.35
130 0.37
131 0.37
132 0.28
133 0.26
134 0.19
135 0.17
136 0.13
137 0.13
138 0.13
139 0.12
140 0.12
141 0.12
142 0.11
143 0.11
144 0.1
145 0.1
146 0.08
147 0.08
148 0.07
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.05
153 0.04
154 0.04
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.04
161 0.07
162 0.07
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.04
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.03
174 0.04
175 0.06
176 0.07
177 0.07
178 0.08
179 0.08
180 0.1
181 0.1
182 0.09
183 0.09
184 0.1
185 0.13
186 0.13
187 0.13
188 0.11
189 0.11
190 0.1
191 0.09
192 0.08
193 0.07
194 0.07
195 0.08
196 0.09
197 0.1
198 0.1
199 0.13
200 0.14
201 0.14
202 0.13
203 0.12
204 0.11
205 0.1
206 0.09
207 0.06
208 0.05
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.04
215 0.04
216 0.05
217 0.07
218 0.08
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.08
225 0.07
226 0.07
227 0.06
228 0.07
229 0.08
230 0.08
231 0.07
232 0.12
233 0.13
234 0.19
235 0.27
236 0.29
237 0.37
238 0.47
239 0.58
240 0.62
241 0.7
242 0.69
243 0.68
244 0.73
245 0.66
246 0.6
247 0.5
248 0.43
249 0.32
250 0.28
251 0.2
252 0.12
253 0.11
254 0.06
255 0.05
256 0.04
257 0.04
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.12
262 0.13
263 0.14
264 0.17
265 0.2
266 0.23
267 0.25
268 0.25
269 0.2
270 0.22
271 0.25
272 0.28
273 0.28
274 0.26
275 0.26
276 0.31
277 0.29
278 0.27
279 0.27
280 0.23
281 0.25
282 0.24
283 0.22
284 0.2
285 0.23
286 0.22
287 0.19
288 0.18
289 0.15
290 0.16
291 0.17
292 0.16
293 0.16
294 0.16
295 0.16
296 0.15
297 0.14
298 0.13
299 0.13
300 0.11
301 0.09
302 0.08
303 0.08
304 0.08
305 0.1
306 0.12
307 0.13
308 0.14
309 0.13
310 0.18
311 0.18
312 0.17
313 0.15
314 0.12
315 0.1
316 0.1
317 0.1
318 0.06
319 0.06
320 0.07
321 0.08
322 0.1
323 0.14
324 0.15
325 0.16
326 0.2
327 0.21
328 0.2
329 0.25
330 0.24
331 0.25
332 0.3
333 0.29
334 0.27
335 0.3
336 0.3
337 0.27
338 0.31
339 0.36
340 0.32
341 0.38
342 0.47
343 0.54
344 0.64
345 0.73
346 0.77
347 0.77
348 0.86
349 0.89
350 0.89
351 0.89
352 0.87
353 0.84
354 0.83
355 0.75
356 0.64
357 0.58
358 0.54
359 0.48
360 0.47
361 0.44
362 0.36
363 0.35
364 0.34
365 0.3
366 0.24
367 0.19
368 0.15
369 0.13
370 0.13
371 0.12
372 0.12
373 0.12
374 0.11
375 0.15
376 0.12
377 0.12