Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2DDH2

Protein Details
Accession A0A1Y2DDH2    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-32SIGQHKPHAFHQRRRFDLTEHydrophilic
73-95LPPTTPPRRRKMIGHRRRVEDEGBasic
232-252GAPQERRRREHDEYRRKRDEDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
80-88RRRKMIGHR
282-289RGGRGGRG
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 11.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018545  Btz_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0035145  C:exon-exon junction complex  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0051028  P:mRNA transport  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
GO:0006417  P:regulation of translation  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF09405  Btz  
Amino Acid Sequences MTYRCSASKAPPSIGQHKPHAFHQRRRFDLTEIVDSGHRAHSYVAACWKLNDASSTASIKHGPSNHRSMLHLLPPTTPPRRRKMIGHRRRVEDEGEEDGGVDHLDVDDDSLTEGSLASDDHDPADDSDTSNIDEASPTSPAVRKATGRANNGNGAAKRAKAPASADAAKPAKLGAAADTEFMLNRLSISDQQPPESVKEMDLDNAAESESPSKSSAPIVVSSSSAVMDQPQGAPQERRRREHDEYRRKRDEDPSFVPNRGAFFMHDHRHAGPAANGFRPFGRGGRGGRGRGGAIGGPFTPFSHQLHNPADPITNSPWAHDMHETVAAEPIHFRHPRHIAPLADDGPPNGDGFIPTCPSNSTPINRTLSTEKRLGNVQIRVYIPPLKEPIVFSGIPIKQYTKLPDHRPPLRRDKPVRISLPNFAPRYIFPATDRSFIFIPRAMRPNQQRMRGKPRSGLGSIGGFSRRTSVFGGSYYNGSNYSPSIALSRRSSIAPDMGRDFIVSPTGSAISRPPMPLDAPRPVVRLPPRVEPQLPAVNGTPGEGPPAFGQTAINELPQPQTHPLPQKPTFQENKSVPIPMHQPRPQKTVSLENIESPTMQQHPQSYQQAFHHQVPVQVSNGFGQESHACHPSYPSHHSTGTPLSQIPERAIHAAPFQPTQYSQQSFYPPYQVMPSQQNFYYPPPAPYAAGAPPFVPGAQQGQPQNDANQANSQTASGSNLVAQEVNGMVYYYDATQLPPPPPPPPMAAYPPYSAPQGYPAPGGVMSLNGIVTPSPDGFYYPQPGVYYPQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.63
3 0.62
4 0.64
5 0.63
6 0.65
7 0.69
8 0.69
9 0.71
10 0.75
11 0.76
12 0.75
13 0.8
14 0.74
15 0.67
16 0.66
17 0.61
18 0.57
19 0.48
20 0.43
21 0.36
22 0.34
23 0.32
24 0.28
25 0.22
26 0.17
27 0.16
28 0.2
29 0.21
30 0.25
31 0.29
32 0.29
33 0.3
34 0.3
35 0.33
36 0.28
37 0.28
38 0.25
39 0.2
40 0.19
41 0.22
42 0.24
43 0.21
44 0.23
45 0.24
46 0.24
47 0.28
48 0.31
49 0.34
50 0.39
51 0.46
52 0.48
53 0.48
54 0.48
55 0.47
56 0.46
57 0.46
58 0.43
59 0.37
60 0.34
61 0.37
62 0.43
63 0.48
64 0.51
65 0.52
66 0.56
67 0.64
68 0.65
69 0.71
70 0.74
71 0.76
72 0.78
73 0.82
74 0.82
75 0.81
76 0.82
77 0.75
78 0.67
79 0.6
80 0.53
81 0.46
82 0.39
83 0.31
84 0.26
85 0.23
86 0.19
87 0.14
88 0.1
89 0.06
90 0.04
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.07
105 0.08
106 0.09
107 0.09
108 0.1
109 0.11
110 0.11
111 0.15
112 0.13
113 0.13
114 0.14
115 0.15
116 0.15
117 0.14
118 0.14
119 0.1
120 0.1
121 0.1
122 0.1
123 0.1
124 0.1
125 0.12
126 0.15
127 0.18
128 0.21
129 0.24
130 0.24
131 0.28
132 0.38
133 0.43
134 0.47
135 0.49
136 0.5
137 0.5
138 0.5
139 0.51
140 0.42
141 0.39
142 0.35
143 0.3
144 0.29
145 0.28
146 0.28
147 0.24
148 0.26
149 0.26
150 0.31
151 0.33
152 0.31
153 0.35
154 0.35
155 0.33
156 0.3
157 0.25
158 0.18
159 0.15
160 0.15
161 0.09
162 0.12
163 0.12
164 0.12
165 0.13
166 0.12
167 0.11
168 0.12
169 0.1
170 0.06
171 0.06
172 0.07
173 0.08
174 0.12
175 0.16
176 0.23
177 0.24
178 0.25
179 0.27
180 0.28
181 0.29
182 0.28
183 0.26
184 0.18
185 0.19
186 0.18
187 0.17
188 0.16
189 0.14
190 0.11
191 0.1
192 0.09
193 0.08
194 0.08
195 0.09
196 0.09
197 0.1
198 0.1
199 0.11
200 0.11
201 0.12
202 0.15
203 0.14
204 0.16
205 0.16
206 0.16
207 0.16
208 0.15
209 0.15
210 0.12
211 0.1
212 0.08
213 0.07
214 0.07
215 0.08
216 0.08
217 0.1
218 0.12
219 0.15
220 0.2
221 0.27
222 0.37
223 0.43
224 0.48
225 0.52
226 0.59
227 0.64
228 0.7
229 0.73
230 0.74
231 0.77
232 0.82
233 0.84
234 0.77
235 0.74
236 0.73
237 0.7
238 0.66
239 0.61
240 0.59
241 0.54
242 0.52
243 0.49
244 0.4
245 0.34
246 0.26
247 0.22
248 0.15
249 0.18
250 0.24
251 0.26
252 0.27
253 0.27
254 0.26
255 0.27
256 0.27
257 0.22
258 0.18
259 0.2
260 0.21
261 0.22
262 0.21
263 0.2
264 0.2
265 0.21
266 0.19
267 0.15
268 0.16
269 0.17
270 0.19
271 0.27
272 0.32
273 0.3
274 0.31
275 0.31
276 0.27
277 0.23
278 0.22
279 0.15
280 0.1
281 0.1
282 0.09
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.09
287 0.1
288 0.11
289 0.16
290 0.17
291 0.23
292 0.26
293 0.27
294 0.26
295 0.24
296 0.24
297 0.19
298 0.21
299 0.17
300 0.2
301 0.19
302 0.19
303 0.2
304 0.2
305 0.21
306 0.19
307 0.17
308 0.12
309 0.15
310 0.15
311 0.13
312 0.15
313 0.13
314 0.12
315 0.12
316 0.12
317 0.16
318 0.18
319 0.18
320 0.22
321 0.26
322 0.28
323 0.32
324 0.36
325 0.3
326 0.31
327 0.35
328 0.3
329 0.27
330 0.25
331 0.2
332 0.17
333 0.16
334 0.13
335 0.09
336 0.07
337 0.06
338 0.07
339 0.08
340 0.08
341 0.07
342 0.08
343 0.09
344 0.1
345 0.13
346 0.15
347 0.17
348 0.18
349 0.24
350 0.27
351 0.26
352 0.28
353 0.3
354 0.32
355 0.33
356 0.35
357 0.3
358 0.28
359 0.29
360 0.3
361 0.29
362 0.28
363 0.25
364 0.24
365 0.24
366 0.23
367 0.24
368 0.24
369 0.19
370 0.18
371 0.19
372 0.16
373 0.16
374 0.16
375 0.16
376 0.16
377 0.16
378 0.14
379 0.2
380 0.19
381 0.2
382 0.2
383 0.19
384 0.17
385 0.19
386 0.23
387 0.22
388 0.28
389 0.34
390 0.41
391 0.47
392 0.53
393 0.58
394 0.61
395 0.64
396 0.66
397 0.69
398 0.68
399 0.7
400 0.7
401 0.71
402 0.69
403 0.64
404 0.59
405 0.53
406 0.54
407 0.51
408 0.43
409 0.36
410 0.32
411 0.26
412 0.29
413 0.26
414 0.2
415 0.15
416 0.22
417 0.23
418 0.25
419 0.25
420 0.22
421 0.21
422 0.21
423 0.21
424 0.16
425 0.17
426 0.18
427 0.22
428 0.22
429 0.28
430 0.34
431 0.43
432 0.46
433 0.53
434 0.55
435 0.59
436 0.68
437 0.69
438 0.65
439 0.59
440 0.57
441 0.52
442 0.46
443 0.4
444 0.31
445 0.24
446 0.22
447 0.18
448 0.16
449 0.12
450 0.11
451 0.13
452 0.11
453 0.12
454 0.13
455 0.13
456 0.13
457 0.13
458 0.16
459 0.13
460 0.15
461 0.13
462 0.12
463 0.11
464 0.11
465 0.1
466 0.08
467 0.09
468 0.08
469 0.08
470 0.1
471 0.11
472 0.15
473 0.16
474 0.17
475 0.17
476 0.17
477 0.18
478 0.17
479 0.21
480 0.18
481 0.19
482 0.19
483 0.18
484 0.18
485 0.17
486 0.16
487 0.11
488 0.12
489 0.1
490 0.08
491 0.08
492 0.09
493 0.09
494 0.08
495 0.09
496 0.1
497 0.12
498 0.13
499 0.13
500 0.13
501 0.15
502 0.19
503 0.22
504 0.24
505 0.26
506 0.27
507 0.29
508 0.28
509 0.33
510 0.34
511 0.37
512 0.35
513 0.39
514 0.41
515 0.44
516 0.44
517 0.39
518 0.4
519 0.38
520 0.35
521 0.3
522 0.26
523 0.23
524 0.22
525 0.21
526 0.16
527 0.1
528 0.13
529 0.11
530 0.11
531 0.1
532 0.13
533 0.12
534 0.11
535 0.11
536 0.08
537 0.12
538 0.12
539 0.12
540 0.1
541 0.11
542 0.13
543 0.13
544 0.16
545 0.15
546 0.18
547 0.23
548 0.31
549 0.34
550 0.41
551 0.44
552 0.5
553 0.51
554 0.58
555 0.59
556 0.53
557 0.58
558 0.51
559 0.53
560 0.47
561 0.44
562 0.35
563 0.32
564 0.37
565 0.34
566 0.41
567 0.41
568 0.48
569 0.51
570 0.56
571 0.54
572 0.5
573 0.48
574 0.48
575 0.47
576 0.45
577 0.41
578 0.38
579 0.39
580 0.35
581 0.32
582 0.23
583 0.21
584 0.16
585 0.17
586 0.16
587 0.18
588 0.21
589 0.28
590 0.35
591 0.34
592 0.35
593 0.38
594 0.44
595 0.45
596 0.44
597 0.43
598 0.37
599 0.39
600 0.38
601 0.36
602 0.29
603 0.25
604 0.23
605 0.18
606 0.18
607 0.15
608 0.11
609 0.12
610 0.13
611 0.15
612 0.17
613 0.19
614 0.18
615 0.18
616 0.21
617 0.24
618 0.28
619 0.32
620 0.34
621 0.35
622 0.36
623 0.36
624 0.37
625 0.37
626 0.34
627 0.29
628 0.26
629 0.24
630 0.25
631 0.26
632 0.24
633 0.21
634 0.21
635 0.22
636 0.22
637 0.21
638 0.21
639 0.23
640 0.23
641 0.22
642 0.21
643 0.2
644 0.21
645 0.25
646 0.3
647 0.29
648 0.29
649 0.32
650 0.37
651 0.38
652 0.38
653 0.38
654 0.31
655 0.3
656 0.31
657 0.29
658 0.28
659 0.34
660 0.35
661 0.33
662 0.33
663 0.34
664 0.33
665 0.35
666 0.38
667 0.31
668 0.3
669 0.31
670 0.32
671 0.3
672 0.28
673 0.28
674 0.24
675 0.25
676 0.23
677 0.19
678 0.18
679 0.18
680 0.17
681 0.14
682 0.11
683 0.13
684 0.16
685 0.22
686 0.25
687 0.27
688 0.32
689 0.33
690 0.34
691 0.35
692 0.33
693 0.3
694 0.32
695 0.3
696 0.28
697 0.26
698 0.25
699 0.19
700 0.18
701 0.19
702 0.14
703 0.13
704 0.12
705 0.13
706 0.13
707 0.13
708 0.12
709 0.1
710 0.09
711 0.09
712 0.08
713 0.07
714 0.06
715 0.07
716 0.08
717 0.07
718 0.09
719 0.09
720 0.11
721 0.15
722 0.2
723 0.21
724 0.26
725 0.28
726 0.3
727 0.32
728 0.34
729 0.34
730 0.33
731 0.37
732 0.38
733 0.4
734 0.4
735 0.4
736 0.4
737 0.38
738 0.35
739 0.3
740 0.24
741 0.25
742 0.25
743 0.24
744 0.23
745 0.21
746 0.21
747 0.2
748 0.2
749 0.14
750 0.11
751 0.11
752 0.1
753 0.1
754 0.08
755 0.08
756 0.07
757 0.08
758 0.1
759 0.1
760 0.11
761 0.11
762 0.14
763 0.17
764 0.21
765 0.26
766 0.24
767 0.26
768 0.26