FuNGI

A0A1Y2EBF2

Protein Details

Accession

A0A1Y2EBF2

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
8-34	PIAAITSHKKEKKSKKRNRDLDGELEA	Hydrophilic
63-90	TELDGDGKKEKKKKKRPRHSEAGAESQL	Basic
111-139	VPDTDAAKIEKKKKKKDKRRNSIAEPIET	Hydrophilic
150-175	EVTIEENKSKKHKKKHQNSDVNESQE	Hydrophilic
180-205	GVVQEAEKKKKKRNRKEKHEDTINTP	Basic
487-506	MEHLRQRKLKGARSFHKRLP	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
15-42	HKKEKKSKKRNRDLDGELEADRKHKKSK
70-81	KKEKKKKKRPRH
118-130	KIEKKKKKKDKRR
158-164	SKKHKKK
187-197	KKKKKRNRKEK

Subcellular Location(s)

nucl 14, cyto_nucl 11.499, mito_nucl 10.499, cyto_mito 7.666, cyto 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB

Amino Acid Sequences

MPSSTAEPIAAITSHKKEKKSKKRNRDLDGELEADRKHKKSKSMAKTEEDNAVDIKATPAVDTELDGDGKKEKKKKKRPRHSEAGAESQLADDAAMPDATTSDLRAKAEEVPDTDAAKIEKKKKKKDKRRNSIAEPIETPPAAVDDVNVEVTIEENKSKKHKKKHQNSDVNESQEVEVVGVVQEAEKKKKKRNRKEKHEDTINTPTATMYTDAMDIDSPAKAPKSQAFGSSAEKPYPFFTQTISLYLPLFPSGMIEPVEGFADQHLKPLLNRYVPNLKGVLLAYRNPRVGERPGKGSLTEKSEGTADEAMLESVDEYAVVFGWLTVEVDIFKPARGAWLEGAINLQSEGHLGVVCWEMFNASIEAARLPQGWQWVDLMSDKGSTKTRAKHITFEDEAQLPTPESANEDEDEVAAVPDNDADVDGDVTQTQLHTTGYWVDEKGQKVRGKLRFRVKNYEVGVSGDYGYLSIEGTMLDEEAEKQKVTDEMEHLRQRKLKGARSFHKRLPEFSMTKFGADEEQEDESKRAEVWKGSQPANETAE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.34
2	0.39
3	0.46
4	0.55
5	0.66
6	0.75
7	0.8
8	0.84
9	0.86
10	0.92
11	0.95
12	0.92
13	0.9
14	0.85
15	0.82
16	0.75
17	0.66
18	0.56
19	0.49
20	0.42
21	0.38
22	0.38
23	0.34
24	0.38
25	0.4
26	0.47
27	0.55
28	0.65
29	0.7
30	0.75
31	0.79
32	0.77
33	0.78
34	0.73
35	0.69
36	0.59
37	0.5
38	0.39
39	0.32
40	0.26
41	0.2
42	0.18
43	0.12
44	0.11
45	0.1
46	0.1
47	0.12
48	0.11
49	0.12
50	0.13
51	0.12
52	0.14
53	0.14
54	0.14
55	0.18
56	0.24
57	0.31
58	0.38
59	0.47
60	0.57
61	0.68
62	0.79
63	0.84
64	0.9
65	0.93
66	0.94
67	0.95
68	0.91
69	0.9
70	0.85
71	0.82
72	0.72
73	0.61
74	0.51
75	0.4
76	0.32
77	0.21
78	0.15
79	0.07
80	0.06
81	0.07
82	0.06
83	0.06
84	0.06
85	0.06
86	0.08
87	0.07
88	0.08
89	0.12
90	0.14
91	0.15
92	0.16
93	0.17
94	0.2
95	0.23
96	0.24
97	0.21
98	0.23
99	0.25
100	0.25
101	0.23
102	0.21
103	0.2
104	0.23
105	0.29
106	0.35
107	0.42
108	0.51
109	0.62
110	0.71
111	0.82
112	0.86
113	0.91
114	0.92
115	0.95
116	0.96
117	0.95
118	0.91
119	0.9
120	0.83
121	0.76
122	0.67
123	0.58
124	0.49
125	0.39
126	0.31
127	0.21
128	0.17
129	0.13
130	0.1
131	0.08
132	0.07
133	0.08
134	0.08
135	0.08
136	0.07
137	0.06
138	0.07
139	0.08
140	0.08
141	0.1
142	0.11
143	0.15
144	0.25
145	0.35
146	0.43
147	0.53
148	0.62
149	0.71
150	0.81
151	0.89
152	0.9
153	0.91
154	0.88
155	0.86
156	0.81
157	0.73
158	0.63
159	0.52
160	0.41
161	0.32
162	0.26
163	0.17
164	0.1
165	0.07
166	0.06
167	0.05
168	0.05
169	0.04
170	0.08
171	0.11
172	0.19
173	0.26
174	0.33
175	0.42
176	0.51
177	0.63
178	0.7
179	0.79
180	0.82
181	0.86
182	0.92
183	0.93
184	0.93
185	0.92
186	0.83
187	0.78
188	0.76
189	0.67
190	0.55
191	0.45
192	0.35
193	0.25
194	0.23
195	0.17
196	0.09
197	0.07
198	0.07
199	0.07
200	0.08
201	0.07
202	0.07
203	0.07
204	0.06
205	0.06
206	0.06
207	0.07
208	0.07
209	0.09
210	0.12
211	0.17
212	0.18
213	0.19
214	0.21
215	0.23
216	0.26
217	0.3
218	0.28
219	0.24
220	0.24
221	0.23
222	0.22
223	0.22
224	0.2
225	0.14
226	0.14
227	0.17
228	0.17
229	0.19
230	0.17
231	0.15
232	0.14
233	0.14
234	0.13
235	0.09
236	0.08
237	0.06
238	0.06
239	0.06
240	0.07
241	0.07
242	0.06
243	0.06
244	0.06
245	0.07
246	0.06
247	0.05
248	0.05
249	0.09
250	0.08
251	0.1
252	0.1
253	0.1
254	0.1
255	0.16
256	0.19
257	0.18
258	0.19
259	0.22
260	0.28
261	0.29
262	0.3
263	0.25
264	0.22
265	0.2
266	0.19
267	0.18
268	0.12
269	0.15
270	0.17
271	0.19
272	0.2
273	0.19
274	0.2
275	0.2
276	0.25
277	0.29
278	0.28
279	0.3
280	0.31
281	0.31
282	0.31
283	0.31
284	0.27
285	0.25
286	0.24
287	0.19
288	0.18
289	0.18
290	0.17
291	0.17
292	0.14
293	0.09
294	0.08
295	0.08
296	0.07
297	0.06
298	0.06
299	0.04
300	0.03
301	0.03
302	0.03
303	0.02
304	0.03
305	0.03
306	0.03
307	0.03
308	0.02
309	0.03
310	0.03
311	0.04
312	0.04
313	0.04
314	0.04
315	0.05
316	0.07
317	0.07
318	0.07
319	0.07
320	0.07
321	0.1
322	0.1
323	0.11
324	0.1
325	0.14
326	0.14
327	0.13
328	0.14
329	0.11
330	0.1
331	0.09
332	0.08
333	0.04
334	0.05
335	0.05
336	0.04
337	0.04
338	0.04
339	0.05
340	0.07
341	0.07
342	0.06
343	0.06
344	0.06
345	0.06
346	0.07
347	0.06
348	0.05
349	0.06
350	0.06
351	0.07
352	0.07
353	0.08
354	0.07
355	0.07
356	0.09
357	0.13
358	0.13
359	0.14
360	0.14
361	0.13
362	0.14
363	0.14
364	0.14
365	0.1
366	0.12
367	0.11
368	0.13
369	0.16
370	0.2
371	0.25
372	0.3
373	0.38
374	0.45
375	0.47
376	0.51
377	0.53
378	0.56
379	0.52
380	0.48
381	0.43
382	0.35
383	0.33
384	0.27
385	0.23
386	0.16
387	0.14
388	0.12
389	0.09
390	0.1
391	0.12
392	0.12
393	0.12
394	0.13
395	0.12
396	0.12
397	0.12
398	0.1
399	0.08
400	0.06
401	0.06
402	0.05
403	0.05
404	0.05
405	0.04
406	0.04
407	0.05
408	0.05
409	0.05
410	0.05
411	0.06
412	0.06
413	0.06
414	0.06
415	0.06
416	0.06
417	0.06
418	0.06
419	0.06
420	0.07
421	0.1
422	0.12
423	0.14
424	0.14
425	0.17
426	0.22
427	0.25
428	0.28
429	0.33
430	0.35
431	0.38
432	0.47
433	0.53
434	0.57
435	0.62
436	0.68
437	0.7
438	0.74
439	0.78
440	0.72
441	0.71
442	0.65
443	0.61
444	0.51
445	0.44
446	0.38
447	0.29
448	0.26
449	0.18
450	0.15
451	0.1
452	0.09
453	0.07
454	0.06
455	0.05
456	0.05
457	0.04
458	0.05
459	0.06
460	0.05
461	0.05
462	0.06
463	0.08
464	0.12
465	0.14
466	0.13
467	0.13
468	0.14
469	0.17
470	0.2
471	0.22
472	0.23
473	0.29
474	0.38
475	0.46
476	0.47
477	0.51
478	0.53
479	0.51
480	0.55
481	0.57
482	0.57
483	0.59
484	0.67
485	0.7
486	0.75
487	0.8
488	0.77
489	0.79
490	0.72
491	0.67
492	0.65
493	0.64
494	0.58
495	0.54
496	0.57
497	0.47
498	0.45
499	0.41
500	0.34
501	0.28
502	0.26
503	0.24
504	0.18
505	0.21
506	0.22
507	0.24
508	0.24
509	0.21
510	0.2
511	0.19
512	0.2
513	0.21
514	0.24
515	0.27
516	0.36
517	0.41
518	0.43
519	0.46
520	0.46

A0A1Y2EBF2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer