FuNGI

A0A1Y2DQX5

Protein Details

Accession

A0A1Y2DQX5

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
38-59	GTSTMAKKDKKSSKPTTVPVAK	Hydrophilic
369-391	ESEDGKPKKSKVKKIKGLNGTGS	Hydrophilic
471-499	LIVTKGKGFTKEKNKKKRGAYKGGPLDVH	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
97-119	KHRAKKGWKGNDDAAGKKKQKKA
374-384	KPKKSKVKKIK
477-491	KGFTKEKNKKKRGAY

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 12.333, cyto_mito 4.999, mito 4.5, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007718 Srp40_C
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus
Pfam	View protein in Pfam PF05022 SRP40_C

Amino Acid Sequences

MPRASTKSASSSTSTQAAPAWLFSNNSTSSSTKQPTAGTSTMAKKDKKSSKPTTVPVAKATIATTSTDDVPPAQLMDLVETFLSDQGFDNAHREFQKHRAKKGWKGNDDAAGKKKQKKAHHSLVSVFQTWETFSTKDSTPVVKEKVQVTTVSSSSESDSSSDSSDSSSDSDGDSEDVDMADAPAADDSSSESSSSSSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDEEEEEEEEETTLAPKASAPAAINPLKRKAESSDNSSSSSSSDEDMSDSSSDSSSEDEKPKTKKAKTVAAAASESDSSSDSDSSCSEGEGATKKTKAPKVAVATSSSDSDSDSSSSSSSNSDSDSDSEAEEAAKVALPDSDSSSDSSSSESDSESEDGKPKKSKVKKIKGLNGTGSDTSATLEKTSPEFQPVAKFVAPPLPPDPTSDQKKNNRGGKNGRPQNVPFSRIKADVNVDPRLSSNAFIEHGYGQRAHEDLIVTKGKGFTKEKNKKKRGAYKGGPLDVHMSRSVKFED

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.34
2	0.28
3	0.27
4	0.27
5	0.22
6	0.21
7	0.19
8	0.16
9	0.18
10	0.18
11	0.22
12	0.2
13	0.22
14	0.24
15	0.25
16	0.26
17	0.33
18	0.36
19	0.34
20	0.35
21	0.35
22	0.35
23	0.39
24	0.37
25	0.31
26	0.34
27	0.38
28	0.43
29	0.49
30	0.49
31	0.47
32	0.56
33	0.63
34	0.67
35	0.7
36	0.72
37	0.75
38	0.81
39	0.81
40	0.82
41	0.79
42	0.72
43	0.65
44	0.59
45	0.49
46	0.41
47	0.36
48	0.27
49	0.21
50	0.19
51	0.18
52	0.16
53	0.18
54	0.17
55	0.17
56	0.15
57	0.15
58	0.14
59	0.13
60	0.11
61	0.1
62	0.1
63	0.12
64	0.12
65	0.11
66	0.1
67	0.1
68	0.1
69	0.09
70	0.09
71	0.07
72	0.07
73	0.09
74	0.11
75	0.11
76	0.14
77	0.13
78	0.18
79	0.19
80	0.2
81	0.22
82	0.31
83	0.42
84	0.46
85	0.52
86	0.58
87	0.65
88	0.72
89	0.79
90	0.8
91	0.74
92	0.74
93	0.71
94	0.69
95	0.65
96	0.61
97	0.57
98	0.55
99	0.57
100	0.58
101	0.61
102	0.6
103	0.66
104	0.7
105	0.74
106	0.76
107	0.77
108	0.73
109	0.7
110	0.7
111	0.64
112	0.55
113	0.45
114	0.35
115	0.26
116	0.23
117	0.21
118	0.16
119	0.13
120	0.12
121	0.16
122	0.16
123	0.19
124	0.21
125	0.21
126	0.23
127	0.28
128	0.31
129	0.31
130	0.34
131	0.33
132	0.34
133	0.33
134	0.3
135	0.27
136	0.26
137	0.24
138	0.21
139	0.19
140	0.16
141	0.16
142	0.16
143	0.14
144	0.11
145	0.12
146	0.11
147	0.12
148	0.11
149	0.1
150	0.1
151	0.1
152	0.1
153	0.09
154	0.09
155	0.08
156	0.08
157	0.08
158	0.08
159	0.08
160	0.07
161	0.06
162	0.06
163	0.05
164	0.05
165	0.05
166	0.04
167	0.04
168	0.04
169	0.04
170	0.03
171	0.04
172	0.03
173	0.04
174	0.05
175	0.07
176	0.08
177	0.08
178	0.08
179	0.08
180	0.09
181	0.1
182	0.09
183	0.07
184	0.07
185	0.08
186	0.09
187	0.1
188	0.1
189	0.1
190	0.1
191	0.1
192	0.1
193	0.09
194	0.08
195	0.08
196	0.07
197	0.06
198	0.06
199	0.06
200	0.06
201	0.06
202	0.06
203	0.06
204	0.06
205	0.06
206	0.06
207	0.06
208	0.06
209	0.06
210	0.05
211	0.05
212	0.05
213	0.05
214	0.05
215	0.05
216	0.05
217	0.05
218	0.06
219	0.06
220	0.08
221	0.07
222	0.09
223	0.14
224	0.18
225	0.21
226	0.22
227	0.27
228	0.26
229	0.26
230	0.26
231	0.24
232	0.29
233	0.29
234	0.34
235	0.36
236	0.36
237	0.38
238	0.36
239	0.33
240	0.24
241	0.23
242	0.16
243	0.11
244	0.1
245	0.08
246	0.08
247	0.08
248	0.09
249	0.07
250	0.07
251	0.07
252	0.06
253	0.06
254	0.06
255	0.07
256	0.08
257	0.12
258	0.15
259	0.17
260	0.22
261	0.25
262	0.33
263	0.4
264	0.4
265	0.43
266	0.45
267	0.52
268	0.49
269	0.54
270	0.48
271	0.43
272	0.4
273	0.34
274	0.3
275	0.21
276	0.18
277	0.11
278	0.09
279	0.07
280	0.07
281	0.08
282	0.07
283	0.08
284	0.08
285	0.09
286	0.08
287	0.08
288	0.07
289	0.07
290	0.09
291	0.12
292	0.14
293	0.15
294	0.17
295	0.19
296	0.26
297	0.3
298	0.32
299	0.32
300	0.36
301	0.39
302	0.43
303	0.42
304	0.37
305	0.36
306	0.32
307	0.3
308	0.24
309	0.18
310	0.14
311	0.13
312	0.11
313	0.09
314	0.09
315	0.08
316	0.08
317	0.09
318	0.09
319	0.09
320	0.1
321	0.09
322	0.1
323	0.11
324	0.11
325	0.12
326	0.14
327	0.14
328	0.13
329	0.12
330	0.11
331	0.1
332	0.09
333	0.08
334	0.05
335	0.06
336	0.05
337	0.05
338	0.06
339	0.06
340	0.07
341	0.1
342	0.11
343	0.12
344	0.13
345	0.14
346	0.14
347	0.14
348	0.14
349	0.12
350	0.11
351	0.11
352	0.1
353	0.1
354	0.11
355	0.12
356	0.12
357	0.13
358	0.19
359	0.2
360	0.25
361	0.3
362	0.33
363	0.42
364	0.5
365	0.59
366	0.64
367	0.73
368	0.77
369	0.82
370	0.87
371	0.85
372	0.82
373	0.77
374	0.69
375	0.62
376	0.53
377	0.43
378	0.33
379	0.25
380	0.19
381	0.16
382	0.12
383	0.1
384	0.1
385	0.11
386	0.14
387	0.17
388	0.17
389	0.19
390	0.2
391	0.2
392	0.25
393	0.25
394	0.27
395	0.25
396	0.24
397	0.22
398	0.28
399	0.27
400	0.25
401	0.26
402	0.27
403	0.26
404	0.31
405	0.36
406	0.36
407	0.45
408	0.49
409	0.56
410	0.61
411	0.69
412	0.74
413	0.76
414	0.75
415	0.75
416	0.77
417	0.78
418	0.8
419	0.8
420	0.77
421	0.74
422	0.7
423	0.71
424	0.67
425	0.61
426	0.54
427	0.5
428	0.48
429	0.45
430	0.44
431	0.38
432	0.37
433	0.38
434	0.4
435	0.39
436	0.36
437	0.33
438	0.33
439	0.33
440	0.29
441	0.24
442	0.2
443	0.18
444	0.19
445	0.18
446	0.19
447	0.18
448	0.19
449	0.2
450	0.2
451	0.18
452	0.19
453	0.2
454	0.18
455	0.17
456	0.17
457	0.16
458	0.21
459	0.24
460	0.22
461	0.23
462	0.27
463	0.28
464	0.34
465	0.37
466	0.41
467	0.49
468	0.59
469	0.68
470	0.75
471	0.81
472	0.83
473	0.89
474	0.9
475	0.89
476	0.89
477	0.87
478	0.87
479	0.87
480	0.84
481	0.73
482	0.64
483	0.6
484	0.5
485	0.45
486	0.39
487	0.31
488	0.27

A0A1Y2DQX5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer