Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2D9I6

Protein Details
Accession A0A1Y2D9I6    Localization Confidence High Confidence Score 22.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
74-100QIAYSPPRKTKPVRKRVKSQAANDIEKHydrophilic
144-186LPKGRARKPAVKDKAAKKKHTENVSRHISKPEQKKKWSPVTGEHydrophilic
350-373FKANQPKKPAVKPRKTKKKTGTVEHydrophilic
643-683AELARKPRGRPRKDTRATTSPSSKTTKTKPKPKAKATLAVKHydrophilic
720-744EAPAPATLSRRKKPKQKVIEIMDSEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
81-89RKTKPVRKR
145-179PKGRARKPAVKDKAAKKKHTENVSRHISKPEQKKK
291-298KKVSAIKK
355-368PKKPAVKPRKTKKK
647-688RKPRGRPRKDTRATTSPSSKTTKTKPKPKAKATLAVKSSPKK
730-733RKKP
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027784  Slx4_ascomycetes  
IPR018574  Structure-sp_endonuc_su_Slx4  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
GO:0006996  P:organelle organization  
Pfam View protein in Pfam  
PF09494  Slx4  
CDD cd22999  SAP_SLX4  
Amino Acid Sequences MSSPARPVRFDNAIHSSSPDLPSLIDIFRKSPQKAPPLRTGSNATPMPTVARSTFTTAVNLLREAPEIDIETEQIAYSPPRKTKPVRKRVKSQAANDIEKELTKKTSSPIEIASSPQEKPWQKFKNISDSRHKTTHGDETQSELPKGRARKPAVKDKAAKKKHTENVSRHISKPEQKKKWSPVTGEEICGLQEAAMARRNDWTPPPEDQAEILGSESDTREITSPSRIAAVSKDIFSNLYDTYACKDSEKCSPGPSSAQSGEPVADVLGKRKRLDMILTGNNKPPRETSPKKVSAIKKKTRTITELATAPYAVPEIDLLAPGTKESLLNYFDSDGAVKALVEHQSALMDFKANQPKKPAVKPRKTKKKTGTVEQPILLSPSTALKTSRSQDFVFGTSSQLVLEESPTALRDLQMAIQASNQIDQDDPFVSSPALRATNKTGLWNAGSRDRNGELLNVELADLVDASAASISGESAPNEIDRPVSDKFPDNNDLDLGLSGSPAASPLPYSDGFIDINEIDLDYPHVTHVKKADPSSKPSLPSGTLSDASVSSITEMASTPRPNYELFTDVQLAKKITSFGFKAVKKRQAMIALLDQCWESQHPQISRVESSTRVATMSTSAASSAQVNTCLKKQQTAAAPIATAELARKPRGRPRKDTRATTSPSSKTTKTKPKPKAKATLAVKSSPKKPSAQSRDDSINTANSAWLTSPKAAASIIDTFEAPAPATLSRRKKPKQKVIEIMDSEDEAHLSPSPQTSPNQLFSSPPPLDLSISEVVDADMSLSLLDPAPGSNDATASQTQELSAYITKAIKSAPRSKDPTSPSWHEKMLLYDPIVLEELAAWLNSGELTRVGYDGEVSPGDVKKWCEAKSVICLWQVNLHGKERKRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.4
3 0.36
4 0.34
5 0.34
6 0.27
7 0.21
8 0.19
9 0.21
10 0.21
11 0.2
12 0.2
13 0.2
14 0.22
15 0.28
16 0.36
17 0.37
18 0.41
19 0.47
20 0.54
21 0.62
22 0.65
23 0.69
24 0.69
25 0.69
26 0.66
27 0.65
28 0.58
29 0.57
30 0.53
31 0.44
32 0.37
33 0.35
34 0.34
35 0.28
36 0.28
37 0.2
38 0.22
39 0.22
40 0.27
41 0.3
42 0.27
43 0.28
44 0.26
45 0.29
46 0.27
47 0.25
48 0.21
49 0.19
50 0.19
51 0.18
52 0.17
53 0.15
54 0.15
55 0.16
56 0.15
57 0.14
58 0.13
59 0.13
60 0.11
61 0.1
62 0.1
63 0.12
64 0.17
65 0.23
66 0.29
67 0.34
68 0.42
69 0.52
70 0.62
71 0.69
72 0.75
73 0.79
74 0.82
75 0.87
76 0.91
77 0.92
78 0.9
79 0.85
80 0.85
81 0.82
82 0.78
83 0.68
84 0.6
85 0.5
86 0.43
87 0.39
88 0.31
89 0.26
90 0.23
91 0.23
92 0.24
93 0.31
94 0.32
95 0.32
96 0.33
97 0.34
98 0.33
99 0.34
100 0.36
101 0.31
102 0.29
103 0.29
104 0.35
105 0.36
106 0.41
107 0.49
108 0.51
109 0.54
110 0.62
111 0.65
112 0.67
113 0.69
114 0.72
115 0.72
116 0.72
117 0.72
118 0.68
119 0.65
120 0.57
121 0.54
122 0.57
123 0.5
124 0.47
125 0.41
126 0.42
127 0.47
128 0.47
129 0.43
130 0.34
131 0.32
132 0.32
133 0.38
134 0.39
135 0.42
136 0.46
137 0.54
138 0.61
139 0.69
140 0.72
141 0.76
142 0.77
143 0.78
144 0.82
145 0.82
146 0.81
147 0.78
148 0.79
149 0.78
150 0.79
151 0.79
152 0.75
153 0.75
154 0.78
155 0.75
156 0.67
157 0.65
158 0.62
159 0.61
160 0.65
161 0.66
162 0.65
163 0.7
164 0.77
165 0.8
166 0.83
167 0.81
168 0.74
169 0.7
170 0.7
171 0.64
172 0.56
173 0.47
174 0.37
175 0.3
176 0.26
177 0.19
178 0.09
179 0.09
180 0.08
181 0.1
182 0.15
183 0.16
184 0.16
185 0.2
186 0.21
187 0.22
188 0.26
189 0.27
190 0.26
191 0.29
192 0.33
193 0.31
194 0.3
195 0.28
196 0.25
197 0.22
198 0.18
199 0.14
200 0.1
201 0.09
202 0.09
203 0.09
204 0.08
205 0.07
206 0.08
207 0.09
208 0.1
209 0.12
210 0.15
211 0.15
212 0.15
213 0.16
214 0.16
215 0.15
216 0.16
217 0.2
218 0.18
219 0.18
220 0.18
221 0.16
222 0.17
223 0.17
224 0.17
225 0.11
226 0.11
227 0.1
228 0.11
229 0.14
230 0.15
231 0.15
232 0.15
233 0.17
234 0.18
235 0.26
236 0.29
237 0.27
238 0.28
239 0.29
240 0.3
241 0.32
242 0.31
243 0.28
244 0.26
245 0.26
246 0.23
247 0.22
248 0.2
249 0.16
250 0.14
251 0.09
252 0.1
253 0.09
254 0.14
255 0.19
256 0.22
257 0.23
258 0.24
259 0.26
260 0.26
261 0.28
262 0.27
263 0.29
264 0.34
265 0.39
266 0.39
267 0.43
268 0.46
269 0.43
270 0.39
271 0.34
272 0.32
273 0.38
274 0.42
275 0.45
276 0.51
277 0.57
278 0.6
279 0.66
280 0.68
281 0.69
282 0.73
283 0.74
284 0.73
285 0.73
286 0.76
287 0.72
288 0.68
289 0.6
290 0.53
291 0.47
292 0.41
293 0.35
294 0.29
295 0.24
296 0.2
297 0.16
298 0.12
299 0.08
300 0.05
301 0.04
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.06
307 0.06
308 0.06
309 0.06
310 0.05
311 0.06
312 0.06
313 0.09
314 0.1
315 0.1
316 0.11
317 0.11
318 0.11
319 0.11
320 0.11
321 0.08
322 0.07
323 0.06
324 0.05
325 0.05
326 0.07
327 0.08
328 0.08
329 0.08
330 0.08
331 0.08
332 0.08
333 0.09
334 0.07
335 0.06
336 0.07
337 0.14
338 0.24
339 0.25
340 0.26
341 0.3
342 0.37
343 0.42
344 0.5
345 0.54
346 0.55
347 0.64
348 0.73
349 0.8
350 0.85
351 0.84
352 0.85
353 0.83
354 0.83
355 0.79
356 0.78
357 0.77
358 0.73
359 0.72
360 0.62
361 0.54
362 0.43
363 0.38
364 0.28
365 0.18
366 0.1
367 0.09
368 0.09
369 0.09
370 0.1
371 0.11
372 0.16
373 0.19
374 0.22
375 0.23
376 0.22
377 0.24
378 0.25
379 0.24
380 0.21
381 0.19
382 0.16
383 0.13
384 0.13
385 0.1
386 0.08
387 0.07
388 0.05
389 0.06
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.06
395 0.06
396 0.06
397 0.06
398 0.06
399 0.07
400 0.09
401 0.09
402 0.08
403 0.09
404 0.1
405 0.1
406 0.1
407 0.09
408 0.07
409 0.07
410 0.07
411 0.09
412 0.08
413 0.08
414 0.07
415 0.07
416 0.07
417 0.07
418 0.07
419 0.08
420 0.11
421 0.11
422 0.12
423 0.16
424 0.2
425 0.21
426 0.22
427 0.2
428 0.18
429 0.19
430 0.19
431 0.17
432 0.19
433 0.2
434 0.19
435 0.21
436 0.21
437 0.21
438 0.19
439 0.19
440 0.12
441 0.11
442 0.11
443 0.08
444 0.07
445 0.05
446 0.05
447 0.04
448 0.03
449 0.03
450 0.02
451 0.02
452 0.02
453 0.02
454 0.02
455 0.02
456 0.02
457 0.02
458 0.03
459 0.04
460 0.04
461 0.05
462 0.05
463 0.06
464 0.06
465 0.06
466 0.06
467 0.06
468 0.09
469 0.1
470 0.11
471 0.12
472 0.16
473 0.18
474 0.22
475 0.26
476 0.24
477 0.23
478 0.22
479 0.21
480 0.16
481 0.15
482 0.11
483 0.06
484 0.05
485 0.04
486 0.04
487 0.03
488 0.03
489 0.03
490 0.03
491 0.03
492 0.04
493 0.07
494 0.08
495 0.09
496 0.09
497 0.1
498 0.1
499 0.1
500 0.11
501 0.08
502 0.08
503 0.07
504 0.07
505 0.05
506 0.05
507 0.06
508 0.05
509 0.05
510 0.06
511 0.09
512 0.1
513 0.12
514 0.15
515 0.18
516 0.22
517 0.25
518 0.33
519 0.32
520 0.38
521 0.44
522 0.44
523 0.41
524 0.38
525 0.37
526 0.3
527 0.29
528 0.25
529 0.21
530 0.19
531 0.17
532 0.16
533 0.14
534 0.13
535 0.11
536 0.09
537 0.06
538 0.06
539 0.06
540 0.05
541 0.06
542 0.07
543 0.11
544 0.12
545 0.12
546 0.13
547 0.15
548 0.15
549 0.16
550 0.16
551 0.15
552 0.15
553 0.16
554 0.18
555 0.17
556 0.18
557 0.19
558 0.17
559 0.15
560 0.15
561 0.15
562 0.13
563 0.16
564 0.15
565 0.18
566 0.26
567 0.28
568 0.37
569 0.43
570 0.5
571 0.48
572 0.49
573 0.48
574 0.45
575 0.43
576 0.37
577 0.36
578 0.32
579 0.3
580 0.28
581 0.24
582 0.19
583 0.19
584 0.17
585 0.12
586 0.12
587 0.18
588 0.19
589 0.22
590 0.25
591 0.27
592 0.27
593 0.27
594 0.26
595 0.22
596 0.23
597 0.21
598 0.18
599 0.16
600 0.14
601 0.12
602 0.12
603 0.11
604 0.09
605 0.08
606 0.08
607 0.08
608 0.08
609 0.09
610 0.09
611 0.09
612 0.13
613 0.14
614 0.15
615 0.18
616 0.23
617 0.23
618 0.25
619 0.25
620 0.27
621 0.32
622 0.36
623 0.36
624 0.31
625 0.3
626 0.26
627 0.25
628 0.19
629 0.13
630 0.09
631 0.11
632 0.14
633 0.18
634 0.22
635 0.26
636 0.37
637 0.47
638 0.54
639 0.6
640 0.66
641 0.74
642 0.78
643 0.82
644 0.8
645 0.78
646 0.76
647 0.72
648 0.7
649 0.61
650 0.58
651 0.55
652 0.51
653 0.49
654 0.53
655 0.58
656 0.6
657 0.67
658 0.73
659 0.79
660 0.86
661 0.87
662 0.88
663 0.82
664 0.82
665 0.78
666 0.77
667 0.69
668 0.65
669 0.63
670 0.58
671 0.59
672 0.55
673 0.52
674 0.48
675 0.51
676 0.56
677 0.59
678 0.61
679 0.57
680 0.56
681 0.6
682 0.56
683 0.52
684 0.43
685 0.36
686 0.29
687 0.26
688 0.22
689 0.15
690 0.14
691 0.12
692 0.13
693 0.13
694 0.13
695 0.14
696 0.13
697 0.14
698 0.13
699 0.13
700 0.14
701 0.14
702 0.14
703 0.13
704 0.13
705 0.13
706 0.14
707 0.14
708 0.11
709 0.09
710 0.09
711 0.1
712 0.14
713 0.22
714 0.3
715 0.37
716 0.47
717 0.55
718 0.64
719 0.74
720 0.81
721 0.83
722 0.85
723 0.88
724 0.85
725 0.86
726 0.78
727 0.7
728 0.6
729 0.49
730 0.4
731 0.29
732 0.22
733 0.13
734 0.12
735 0.09
736 0.09
737 0.1
738 0.11
739 0.14
740 0.16
741 0.18
742 0.24
743 0.28
744 0.33
745 0.34
746 0.33
747 0.33
748 0.33
749 0.41
750 0.34
751 0.3
752 0.27
753 0.26
754 0.26
755 0.24
756 0.26
757 0.2
758 0.19
759 0.18
760 0.16
761 0.14
762 0.13
763 0.13
764 0.08
765 0.05
766 0.05
767 0.05
768 0.05
769 0.05
770 0.05
771 0.06
772 0.05
773 0.06
774 0.08
775 0.09
776 0.11
777 0.1
778 0.11
779 0.11
780 0.15
781 0.16
782 0.16
783 0.16
784 0.15
785 0.15
786 0.14
787 0.14
788 0.14
789 0.14
790 0.13
791 0.14
792 0.16
793 0.17
794 0.17
795 0.2
796 0.23
797 0.29
798 0.38
799 0.42
800 0.5
801 0.56
802 0.59
803 0.64
804 0.65
805 0.65
806 0.64
807 0.64
808 0.62
809 0.61
810 0.58
811 0.52
812 0.48
813 0.45
814 0.42
815 0.38
816 0.32
817 0.31
818 0.29
819 0.28
820 0.27
821 0.21
822 0.16
823 0.11
824 0.11
825 0.09
826 0.08
827 0.07
828 0.06
829 0.06
830 0.07
831 0.07
832 0.06
833 0.07
834 0.08
835 0.09
836 0.09
837 0.1
838 0.09
839 0.11
840 0.11
841 0.13
842 0.12
843 0.12
844 0.16
845 0.17
846 0.19
847 0.21
848 0.22
849 0.28
850 0.34
851 0.34
852 0.37
853 0.39
854 0.42
855 0.47
856 0.5
857 0.46
858 0.45
859 0.45
860 0.4
861 0.43
862 0.43
863 0.43
864 0.41
865 0.45
866 0.48