Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2DIH9

Protein Details
Accession A0A1Y2DIH9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
180-207PTAPSAPGARRKTRRKQKGSRSQPEGENHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
187-200GARRKTRRKQKGSR
385-385R
387-394STRRSRSR
Subcellular Location(s) extr 11, mito 5, plas 3, nucl 2, cyto 2, cyto_nucl 2, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025762  DFDF  
IPR019050  FDF_dom  
IPR004443  YjeF_N_dom  
IPR036652  YjeF_N_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000932  C:P-body  
Pfam View protein in Pfam  
PF09532  FDF  
PF03853  YjeF_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51512  DFDF  
PS51385  YJEF_N  
Amino Acid Sequences MADMFIGVRMTVVLRSGYSMTGVVAQIIPNQVLVLHQVHSNVGQYAETVHIDPNDIEDIFDSSRMPAVTNPSGAGPLGFTAPSANAIPAPIVPSSNTPTFQDPAILSMGRRPGPNIGEKRDPTPPAITKITSLVKTLEEAPGNDQHTPIKRLEESLGKLSIVPPGPETGPETGPEAEVTPTAPSAPGARRKTRRKQKGSRSQPEGENTPVTVKETDEAGGQGGSGSGWRQTPILQSTKSFQPFASLKRGQKPNADGWASEDVTDVQGAGDFDFEGNLTKFDKRNIFQEMRQQDKVDDAERLVSHNRLPRSKPGTAGGKNLHYSENVLDMPSTSSAAQAPGLVSKLKETPDDFWKSEADDTNMNGGERLSGREGSGRSSRLRGESRMSTRRSRSRKASATQSILGPSRINSGQPPPATAEGFYSMGSSRRVETVTHLQMLNLENIAHNEMGLTEDLMAENAGRSIAEVALSALNDPAVTLRNAAASPGPNTPTIVVMAGNNKSSVRAISAGRHLRNRGINVLVCVVGIEREKDLIEEVQKQIRLFRNFGGAVLSKTQLFKQLSKATTSLNSSPQISVTLIVDALLGLSIAFEELRKSDQASTYELMEWANRNEAFVMAVDVPSGIDPTAGKVNIIDGARLYVHPRYVIALGAPKQGLLRAMQIGYEEQADIAVEDWKLYLADIGLGASTIWRKAATKLRRGIGIDFGDKWVMEMRYQQQLDKPLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.12
3 0.13
4 0.13
5 0.13
6 0.13
7 0.12
8 0.14
9 0.13
10 0.12
11 0.12
12 0.12
13 0.14
14 0.15
15 0.15
16 0.12
17 0.12
18 0.11
19 0.1
20 0.13
21 0.13
22 0.12
23 0.13
24 0.14
25 0.15
26 0.17
27 0.18
28 0.15
29 0.14
30 0.13
31 0.11
32 0.12
33 0.14
34 0.14
35 0.13
36 0.14
37 0.14
38 0.16
39 0.15
40 0.16
41 0.17
42 0.15
43 0.14
44 0.13
45 0.16
46 0.15
47 0.15
48 0.13
49 0.11
50 0.14
51 0.14
52 0.14
53 0.13
54 0.2
55 0.23
56 0.23
57 0.23
58 0.21
59 0.22
60 0.21
61 0.18
62 0.11
63 0.09
64 0.09
65 0.08
66 0.08
67 0.08
68 0.08
69 0.11
70 0.11
71 0.11
72 0.1
73 0.1
74 0.11
75 0.1
76 0.12
77 0.1
78 0.1
79 0.11
80 0.14
81 0.19
82 0.22
83 0.23
84 0.23
85 0.26
86 0.27
87 0.26
88 0.26
89 0.21
90 0.2
91 0.21
92 0.19
93 0.16
94 0.19
95 0.25
96 0.24
97 0.24
98 0.24
99 0.26
100 0.3
101 0.4
102 0.42
103 0.43
104 0.49
105 0.51
106 0.53
107 0.54
108 0.52
109 0.46
110 0.47
111 0.44
112 0.41
113 0.43
114 0.4
115 0.34
116 0.38
117 0.39
118 0.32
119 0.3
120 0.26
121 0.22
122 0.23
123 0.24
124 0.23
125 0.19
126 0.19
127 0.21
128 0.25
129 0.27
130 0.25
131 0.25
132 0.26
133 0.29
134 0.31
135 0.29
136 0.29
137 0.27
138 0.29
139 0.32
140 0.33
141 0.32
142 0.33
143 0.32
144 0.27
145 0.27
146 0.25
147 0.26
148 0.21
149 0.18
150 0.15
151 0.16
152 0.16
153 0.17
154 0.19
155 0.16
156 0.16
157 0.16
158 0.18
159 0.16
160 0.16
161 0.15
162 0.14
163 0.11
164 0.11
165 0.1
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.08
170 0.07
171 0.11
172 0.17
173 0.26
174 0.32
175 0.41
176 0.51
177 0.61
178 0.72
179 0.78
180 0.84
181 0.85
182 0.89
183 0.91
184 0.93
185 0.94
186 0.93
187 0.89
188 0.84
189 0.78
190 0.72
191 0.64
192 0.56
193 0.45
194 0.36
195 0.3
196 0.25
197 0.22
198 0.18
199 0.14
200 0.12
201 0.12
202 0.12
203 0.11
204 0.1
205 0.09
206 0.08
207 0.07
208 0.06
209 0.05
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.06
214 0.06
215 0.07
216 0.07
217 0.09
218 0.13
219 0.18
220 0.22
221 0.22
222 0.23
223 0.26
224 0.33
225 0.34
226 0.31
227 0.25
228 0.27
229 0.29
230 0.32
231 0.37
232 0.37
233 0.39
234 0.47
235 0.53
236 0.5
237 0.53
238 0.54
239 0.5
240 0.5
241 0.47
242 0.37
243 0.35
244 0.37
245 0.31
246 0.27
247 0.22
248 0.15
249 0.14
250 0.14
251 0.1
252 0.05
253 0.06
254 0.06
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.06
262 0.06
263 0.07
264 0.08
265 0.11
266 0.12
267 0.17
268 0.23
269 0.22
270 0.26
271 0.33
272 0.35
273 0.34
274 0.42
275 0.44
276 0.45
277 0.45
278 0.42
279 0.34
280 0.34
281 0.33
282 0.25
283 0.19
284 0.13
285 0.15
286 0.14
287 0.16
288 0.14
289 0.14
290 0.16
291 0.2
292 0.24
293 0.25
294 0.28
295 0.34
296 0.4
297 0.4
298 0.39
299 0.39
300 0.44
301 0.41
302 0.44
303 0.39
304 0.35
305 0.34
306 0.34
307 0.29
308 0.2
309 0.2
310 0.15
311 0.15
312 0.11
313 0.1
314 0.09
315 0.09
316 0.09
317 0.08
318 0.09
319 0.06
320 0.06
321 0.07
322 0.07
323 0.07
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.08
331 0.1
332 0.1
333 0.12
334 0.13
335 0.15
336 0.22
337 0.27
338 0.26
339 0.25
340 0.24
341 0.23
342 0.24
343 0.22
344 0.16
345 0.13
346 0.13
347 0.14
348 0.14
349 0.12
350 0.1
351 0.09
352 0.09
353 0.08
354 0.09
355 0.08
356 0.08
357 0.08
358 0.11
359 0.12
360 0.14
361 0.17
362 0.18
363 0.18
364 0.19
365 0.21
366 0.23
367 0.25
368 0.24
369 0.25
370 0.29
371 0.35
372 0.4
373 0.43
374 0.44
375 0.48
376 0.55
377 0.58
378 0.58
379 0.59
380 0.61
381 0.64
382 0.62
383 0.65
384 0.61
385 0.58
386 0.53
387 0.46
388 0.39
389 0.33
390 0.29
391 0.2
392 0.15
393 0.14
394 0.13
395 0.13
396 0.12
397 0.15
398 0.19
399 0.19
400 0.2
401 0.19
402 0.2
403 0.19
404 0.18
405 0.16
406 0.12
407 0.13
408 0.12
409 0.1
410 0.09
411 0.11
412 0.12
413 0.11
414 0.1
415 0.11
416 0.12
417 0.12
418 0.16
419 0.22
420 0.23
421 0.25
422 0.24
423 0.22
424 0.24
425 0.25
426 0.21
427 0.13
428 0.11
429 0.09
430 0.09
431 0.11
432 0.08
433 0.07
434 0.06
435 0.06
436 0.06
437 0.06
438 0.05
439 0.04
440 0.04
441 0.05
442 0.05
443 0.05
444 0.04
445 0.04
446 0.04
447 0.03
448 0.03
449 0.03
450 0.04
451 0.04
452 0.04
453 0.04
454 0.05
455 0.06
456 0.06
457 0.06
458 0.05
459 0.05
460 0.05
461 0.05
462 0.05
463 0.05
464 0.06
465 0.06
466 0.07
467 0.08
468 0.08
469 0.09
470 0.1
471 0.1
472 0.12
473 0.14
474 0.16
475 0.15
476 0.15
477 0.15
478 0.14
479 0.13
480 0.11
481 0.09
482 0.09
483 0.13
484 0.14
485 0.14
486 0.14
487 0.13
488 0.13
489 0.14
490 0.13
491 0.1
492 0.12
493 0.13
494 0.16
495 0.25
496 0.31
497 0.34
498 0.39
499 0.39
500 0.41
501 0.44
502 0.43
503 0.38
504 0.34
505 0.32
506 0.28
507 0.28
508 0.22
509 0.17
510 0.15
511 0.11
512 0.09
513 0.09
514 0.09
515 0.08
516 0.09
517 0.09
518 0.09
519 0.11
520 0.12
521 0.14
522 0.17
523 0.2
524 0.24
525 0.26
526 0.26
527 0.31
528 0.36
529 0.37
530 0.35
531 0.34
532 0.35
533 0.33
534 0.33
535 0.31
536 0.24
537 0.21
538 0.22
539 0.21
540 0.16
541 0.17
542 0.17
543 0.21
544 0.23
545 0.24
546 0.3
547 0.37
548 0.37
549 0.39
550 0.39
551 0.34
552 0.35
553 0.38
554 0.32
555 0.29
556 0.3
557 0.29
558 0.28
559 0.26
560 0.24
561 0.19
562 0.17
563 0.13
564 0.11
565 0.09
566 0.09
567 0.08
568 0.06
569 0.06
570 0.04
571 0.04
572 0.03
573 0.03
574 0.03
575 0.03
576 0.03
577 0.03
578 0.05
579 0.06
580 0.09
581 0.1
582 0.12
583 0.15
584 0.2
585 0.22
586 0.25
587 0.25
588 0.25
589 0.25
590 0.23
591 0.2
592 0.18
593 0.19
594 0.16
595 0.2
596 0.18
597 0.18
598 0.18
599 0.18
600 0.16
601 0.14
602 0.15
603 0.1
604 0.1
605 0.09
606 0.08
607 0.08
608 0.08
609 0.08
610 0.05
611 0.06
612 0.06
613 0.09
614 0.14
615 0.14
616 0.14
617 0.13
618 0.14
619 0.18
620 0.19
621 0.16
622 0.11
623 0.13
624 0.14
625 0.15
626 0.17
627 0.16
628 0.17
629 0.17
630 0.17
631 0.18
632 0.18
633 0.17
634 0.16
635 0.2
636 0.21
637 0.25
638 0.24
639 0.22
640 0.22
641 0.23
642 0.22
643 0.17
644 0.18
645 0.17
646 0.17
647 0.17
648 0.18
649 0.17
650 0.17
651 0.16
652 0.13
653 0.09
654 0.09
655 0.09
656 0.08
657 0.07
658 0.09
659 0.08
660 0.08
661 0.08
662 0.08
663 0.08
664 0.08
665 0.08
666 0.06
667 0.07
668 0.07
669 0.07
670 0.06
671 0.06
672 0.06
673 0.08
674 0.09
675 0.09
676 0.1
677 0.11
678 0.13
679 0.2
680 0.31
681 0.38
682 0.46
683 0.53
684 0.56
685 0.61
686 0.62
687 0.58
688 0.56
689 0.52
690 0.46
691 0.39
692 0.37
693 0.32
694 0.29
695 0.28
696 0.25
697 0.21
698 0.19
699 0.25
700 0.27
701 0.36
702 0.37
703 0.39
704 0.39