Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H0EFN3

Protein Details
Accession H0EFN3    Localization Confidence Low Confidence Score 7.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
312-332SSQARLVPTSQRKNQMQCRAAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 9, cyto_nucl 8, nucl 7.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MYAQLGAPKLIDSCTRACIKNIRSLTDIGDFEYRQIKNILDRIDSPEQLHQIEINSPQIRGEDAELWQKFIARDIPNWKQKNWAPKNPTKWYEVYVKYKKDQAQEIARDEEILRNAMMGLKKHKAGNVSQIVSIRDRTLPKLPRDPRMIANNGGVPLKGKTPPSSLNWTAGSKTKMSDPKGVLARARREAAQIAQMGKLATPTHQLGQRKNQIRQAPAGMANEYRLAAQPALKILSGKRKTTGSYSGGVAGPSLEEREAKLRALTGHAGATANYVGSSDDDDDDILAGGYEYDQDEEEEDGDDLFDEKPERSSQARLVPTSQRKNQMQCRAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.29
3 0.3
4 0.34
5 0.41
6 0.42
7 0.47
8 0.49
9 0.47
10 0.44
11 0.44
12 0.43
13 0.4
14 0.37
15 0.3
16 0.3
17 0.26
18 0.25
19 0.32
20 0.28
21 0.24
22 0.26
23 0.25
24 0.27
25 0.32
26 0.33
27 0.28
28 0.3
29 0.36
30 0.39
31 0.39
32 0.35
33 0.35
34 0.34
35 0.31
36 0.3
37 0.23
38 0.19
39 0.21
40 0.21
41 0.24
42 0.23
43 0.22
44 0.22
45 0.21
46 0.21
47 0.19
48 0.2
49 0.14
50 0.15
51 0.24
52 0.23
53 0.25
54 0.24
55 0.25
56 0.22
57 0.22
58 0.27
59 0.21
60 0.26
61 0.33
62 0.42
63 0.5
64 0.53
65 0.51
66 0.52
67 0.54
68 0.59
69 0.6
70 0.61
71 0.6
72 0.66
73 0.75
74 0.75
75 0.75
76 0.68
77 0.6
78 0.54
79 0.54
80 0.52
81 0.53
82 0.51
83 0.53
84 0.51
85 0.56
86 0.56
87 0.53
88 0.51
89 0.48
90 0.49
91 0.5
92 0.5
93 0.46
94 0.41
95 0.37
96 0.32
97 0.28
98 0.2
99 0.16
100 0.12
101 0.1
102 0.1
103 0.12
104 0.13
105 0.13
106 0.17
107 0.18
108 0.21
109 0.23
110 0.24
111 0.24
112 0.24
113 0.31
114 0.32
115 0.31
116 0.3
117 0.31
118 0.3
119 0.29
120 0.28
121 0.2
122 0.18
123 0.18
124 0.19
125 0.25
126 0.3
127 0.34
128 0.43
129 0.45
130 0.49
131 0.53
132 0.52
133 0.49
134 0.49
135 0.47
136 0.39
137 0.36
138 0.31
139 0.26
140 0.24
141 0.18
142 0.13
143 0.11
144 0.11
145 0.12
146 0.12
147 0.13
148 0.16
149 0.19
150 0.22
151 0.28
152 0.28
153 0.28
154 0.29
155 0.28
156 0.26
157 0.26
158 0.24
159 0.17
160 0.17
161 0.2
162 0.23
163 0.26
164 0.31
165 0.28
166 0.32
167 0.35
168 0.36
169 0.33
170 0.33
171 0.34
172 0.31
173 0.31
174 0.26
175 0.24
176 0.24
177 0.22
178 0.21
179 0.19
180 0.17
181 0.16
182 0.16
183 0.15
184 0.13
185 0.13
186 0.1
187 0.08
188 0.1
189 0.11
190 0.13
191 0.18
192 0.22
193 0.25
194 0.34
195 0.43
196 0.46
197 0.49
198 0.53
199 0.54
200 0.52
201 0.5
202 0.44
203 0.38
204 0.34
205 0.31
206 0.26
207 0.21
208 0.2
209 0.17
210 0.15
211 0.12
212 0.1
213 0.1
214 0.09
215 0.11
216 0.11
217 0.12
218 0.13
219 0.12
220 0.13
221 0.15
222 0.25
223 0.28
224 0.29
225 0.3
226 0.31
227 0.33
228 0.36
229 0.4
230 0.32
231 0.3
232 0.29
233 0.29
234 0.27
235 0.25
236 0.2
237 0.13
238 0.11
239 0.09
240 0.09
241 0.07
242 0.07
243 0.08
244 0.13
245 0.14
246 0.14
247 0.15
248 0.15
249 0.16
250 0.19
251 0.19
252 0.16
253 0.15
254 0.16
255 0.16
256 0.14
257 0.14
258 0.11
259 0.09
260 0.08
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.09
265 0.09
266 0.09
267 0.09
268 0.1
269 0.09
270 0.09
271 0.09
272 0.07
273 0.05
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.05
278 0.05
279 0.06
280 0.07
281 0.07
282 0.08
283 0.09
284 0.1
285 0.1
286 0.09
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.08
292 0.09
293 0.1
294 0.1
295 0.13
296 0.15
297 0.2
298 0.22
299 0.26
300 0.31
301 0.38
302 0.43
303 0.43
304 0.46
305 0.52
306 0.6
307 0.65
308 0.66
309 0.67
310 0.69
311 0.76
312 0.8