Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2ED75

Protein Details
Accession A0A1Y2ED75    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MPPAKKRKTGKRANASASAQHydrophilic
260-281MKKAEDARMRKRRERMAQNGDDBasic
286-305YINEKNKQFNQKLNRFYNKYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-12KKRKTGKR
269-271RKR
Subcellular Location(s) nucl 21, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MPPAKKRKTGKRANASASAQTPTEASQPAEVPEVSGPAPTEDGDADMPEAPADTNSAAKESSKSPKPAAADTSAKAEDRLARFRALQARAKKSSDQNLAEATKESQRLATDPSALTALNRKRDVAQHKLLKAETEEAGDDFERKRAWDWTAEESERWDKRLKKRAAARDNNAFKDYRVEGNKVYKRQLRDMAPDMDKYEKDKMAAIEKAAASGGLDIVETEDGELIAVDKDGSFYSTADSTSFVEHKADKGAVDRLVAEMKKAEDARMRKRRERMAQNGDDGDVTYINEKNKQFNQKLNRFYNKYTAEIRDSFERGTMI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.77
3 0.72
4 0.64
5 0.55
6 0.44
7 0.35
8 0.29
9 0.22
10 0.22
11 0.19
12 0.17
13 0.17
14 0.18
15 0.19
16 0.21
17 0.19
18 0.17
19 0.16
20 0.17
21 0.14
22 0.14
23 0.13
24 0.11
25 0.12
26 0.11
27 0.12
28 0.1
29 0.12
30 0.11
31 0.11
32 0.11
33 0.11
34 0.1
35 0.09
36 0.09
37 0.07
38 0.07
39 0.08
40 0.08
41 0.09
42 0.09
43 0.11
44 0.11
45 0.12
46 0.14
47 0.18
48 0.26
49 0.31
50 0.34
51 0.35
52 0.39
53 0.41
54 0.42
55 0.41
56 0.38
57 0.35
58 0.32
59 0.35
60 0.33
61 0.3
62 0.27
63 0.25
64 0.24
65 0.25
66 0.29
67 0.26
68 0.26
69 0.27
70 0.32
71 0.38
72 0.37
73 0.41
74 0.44
75 0.5
76 0.52
77 0.55
78 0.55
79 0.53
80 0.57
81 0.57
82 0.5
83 0.44
84 0.45
85 0.43
86 0.38
87 0.33
88 0.26
89 0.22
90 0.21
91 0.19
92 0.16
93 0.16
94 0.16
95 0.19
96 0.18
97 0.17
98 0.15
99 0.16
100 0.15
101 0.14
102 0.13
103 0.17
104 0.2
105 0.24
106 0.25
107 0.25
108 0.26
109 0.34
110 0.39
111 0.39
112 0.44
113 0.44
114 0.45
115 0.47
116 0.45
117 0.39
118 0.34
119 0.28
120 0.2
121 0.14
122 0.13
123 0.1
124 0.11
125 0.1
126 0.1
127 0.08
128 0.09
129 0.09
130 0.09
131 0.1
132 0.12
133 0.14
134 0.17
135 0.19
136 0.23
137 0.26
138 0.26
139 0.25
140 0.25
141 0.31
142 0.26
143 0.26
144 0.26
145 0.29
146 0.38
147 0.48
148 0.49
149 0.49
150 0.57
151 0.66
152 0.71
153 0.72
154 0.68
155 0.68
156 0.69
157 0.64
158 0.57
159 0.47
160 0.36
161 0.32
162 0.29
163 0.25
164 0.23
165 0.23
166 0.24
167 0.33
168 0.38
169 0.37
170 0.42
171 0.4
172 0.4
173 0.44
174 0.47
175 0.41
176 0.42
177 0.44
178 0.43
179 0.41
180 0.39
181 0.35
182 0.31
183 0.28
184 0.25
185 0.25
186 0.2
187 0.19
188 0.21
189 0.21
190 0.23
191 0.24
192 0.21
193 0.2
194 0.19
195 0.19
196 0.16
197 0.14
198 0.09
199 0.08
200 0.08
201 0.04
202 0.04
203 0.03
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.05
218 0.05
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.08
223 0.09
224 0.09
225 0.09
226 0.1
227 0.1
228 0.12
229 0.13
230 0.12
231 0.14
232 0.14
233 0.15
234 0.17
235 0.17
236 0.15
237 0.17
238 0.2
239 0.19
240 0.19
241 0.18
242 0.16
243 0.21
244 0.2
245 0.18
246 0.16
247 0.16
248 0.21
249 0.21
250 0.23
251 0.25
252 0.33
253 0.44
254 0.51
255 0.59
256 0.61
257 0.69
258 0.76
259 0.78
260 0.81
261 0.81
262 0.82
263 0.79
264 0.77
265 0.69
266 0.6
267 0.5
268 0.4
269 0.3
270 0.2
271 0.15
272 0.12
273 0.14
274 0.16
275 0.22
276 0.24
277 0.3
278 0.38
279 0.48
280 0.51
281 0.57
282 0.66
283 0.68
284 0.77
285 0.79
286 0.81
287 0.76
288 0.75
289 0.75
290 0.68
291 0.63
292 0.6
293 0.56
294 0.52
295 0.49
296 0.49
297 0.45
298 0.44
299 0.4