Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2EJW0

Protein Details
Accession A0A1Y2EJW0    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
37-57TGTTPKRGRGRPPKNGVSKVVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
14-18EPRKA
40-141TPKRGRGRPPKNGVSKVVKPSTGRGRGRPPKDPAEKAATAAKAAATKAKAAATKVPGRGRGRPRKSDASTAAATPKKAAATPKKTASANKSSTGKPRGRPRK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 12, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000116  HMGA  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
Amino Acid Sequences MAPTQTRGRPTGREPRKAATAAAAKKDAPITAAESGTGTTPKRGRGRPPKNGVSKVVKPSTGRGRGRPPKDPAEKAATAAKAAATKAKAAATKVPGRGRGRPRKSDASTAAATPKKAAATPKKTASANKSSTGKPRGRPRKSQVTEKSDASGPEEEEVEVPEIVADAEADDANSDSDSKLGAEADIEVGAAPGDEEMPVVGDIDPELSSIGKLGWPQTGLLNRNASQLLAEISGVQGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.64
3 0.66
4 0.62
5 0.54
6 0.51
7 0.51
8 0.46
9 0.47
10 0.44
11 0.37
12 0.38
13 0.38
14 0.3
15 0.22
16 0.19
17 0.17
18 0.18
19 0.18
20 0.16
21 0.15
22 0.15
23 0.15
24 0.16
25 0.13
26 0.17
27 0.19
28 0.27
29 0.35
30 0.39
31 0.49
32 0.58
33 0.67
34 0.72
35 0.78
36 0.8
37 0.81
38 0.81
39 0.77
40 0.74
41 0.7
42 0.68
43 0.62
44 0.56
45 0.48
46 0.51
47 0.54
48 0.55
49 0.52
50 0.49
51 0.57
52 0.63
53 0.67
54 0.68
55 0.64
56 0.64
57 0.69
58 0.66
59 0.6
60 0.57
61 0.52
62 0.46
63 0.44
64 0.35
65 0.27
66 0.24
67 0.2
68 0.14
69 0.14
70 0.15
71 0.11
72 0.12
73 0.13
74 0.15
75 0.15
76 0.15
77 0.19
78 0.21
79 0.26
80 0.31
81 0.32
82 0.37
83 0.39
84 0.46
85 0.52
86 0.58
87 0.6
88 0.61
89 0.65
90 0.66
91 0.66
92 0.64
93 0.57
94 0.51
95 0.45
96 0.38
97 0.38
98 0.3
99 0.27
100 0.21
101 0.19
102 0.14
103 0.15
104 0.21
105 0.24
106 0.3
107 0.34
108 0.37
109 0.39
110 0.4
111 0.43
112 0.42
113 0.41
114 0.38
115 0.38
116 0.38
117 0.37
118 0.43
119 0.47
120 0.45
121 0.44
122 0.52
123 0.58
124 0.61
125 0.68
126 0.69
127 0.72
128 0.72
129 0.75
130 0.74
131 0.71
132 0.69
133 0.6
134 0.55
135 0.45
136 0.41
137 0.34
138 0.26
139 0.18
140 0.15
141 0.15
142 0.13
143 0.11
144 0.12
145 0.1
146 0.08
147 0.07
148 0.06
149 0.06
150 0.05
151 0.05
152 0.04
153 0.03
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.06
165 0.05
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.05
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.05
175 0.05
176 0.04
177 0.04
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.05
185 0.05
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.07
191 0.07
192 0.06
193 0.07
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.07
198 0.07
199 0.09
200 0.1
201 0.12
202 0.13
203 0.14
204 0.19
205 0.26
206 0.28
207 0.32
208 0.36
209 0.34
210 0.37
211 0.36
212 0.31
213 0.24
214 0.22
215 0.19
216 0.13
217 0.13
218 0.09