Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H0EIE1

Protein Details
Accession H0EIE1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
25-54VAPPAERKMKKIIRKKKRPARPQIDPSMMKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
30-45ERKMKKIIRKKKRPAR
Subcellular Location(s) nucl 9, cyto 8, pero 5, cysk 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039171  Cwc2/Slt11  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR032297  Torus  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF16131  Torus  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MSDNETPPQNVEATSTEVALTGGEVAPPAERKMKKIIRKKKRPARPQIDPSMMKSEPPPQTGTIFNIWYNKWSGGDREDKYLSKTAAAGRCNVALDTGYTKADKVPGSYFCLFFARGICPKGQECEYLHRLPGIHDHFNPNIDVFGRDKHSDYRDDMGGVGSFMRQNRTIYVGRIHVTDDIEEVVARHFAEWGQVERSK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.19
3 0.17
4 0.16
5 0.16
6 0.13
7 0.11
8 0.06
9 0.06
10 0.05
11 0.06
12 0.06
13 0.08
14 0.09
15 0.12
16 0.19
17 0.2
18 0.24
19 0.34
20 0.43
21 0.5
22 0.6
23 0.69
24 0.71
25 0.82
26 0.9
27 0.9
28 0.92
29 0.93
30 0.93
31 0.92
32 0.91
33 0.89
34 0.86
35 0.84
36 0.75
37 0.68
38 0.63
39 0.53
40 0.44
41 0.37
42 0.36
43 0.32
44 0.32
45 0.31
46 0.25
47 0.28
48 0.28
49 0.29
50 0.24
51 0.21
52 0.21
53 0.21
54 0.2
55 0.19
56 0.2
57 0.17
58 0.16
59 0.16
60 0.16
61 0.17
62 0.25
63 0.24
64 0.27
65 0.29
66 0.28
67 0.3
68 0.31
69 0.27
70 0.2
71 0.21
72 0.21
73 0.23
74 0.23
75 0.22
76 0.19
77 0.2
78 0.2
79 0.18
80 0.13
81 0.08
82 0.08
83 0.08
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.08
88 0.08
89 0.11
90 0.11
91 0.11
92 0.13
93 0.14
94 0.2
95 0.21
96 0.21
97 0.19
98 0.2
99 0.18
100 0.16
101 0.16
102 0.13
103 0.15
104 0.16
105 0.15
106 0.17
107 0.17
108 0.2
109 0.19
110 0.19
111 0.19
112 0.25
113 0.3
114 0.29
115 0.28
116 0.26
117 0.25
118 0.23
119 0.28
120 0.26
121 0.24
122 0.25
123 0.29
124 0.29
125 0.3
126 0.3
127 0.22
128 0.18
129 0.14
130 0.15
131 0.11
132 0.14
133 0.17
134 0.18
135 0.2
136 0.24
137 0.27
138 0.28
139 0.3
140 0.31
141 0.28
142 0.27
143 0.25
144 0.21
145 0.18
146 0.14
147 0.11
148 0.09
149 0.1
150 0.11
151 0.14
152 0.15
153 0.16
154 0.18
155 0.23
156 0.24
157 0.25
158 0.28
159 0.29
160 0.28
161 0.27
162 0.27
163 0.24
164 0.23
165 0.21
166 0.17
167 0.14
168 0.13
169 0.12
170 0.11
171 0.1
172 0.1
173 0.09
174 0.09
175 0.08
176 0.08
177 0.13
178 0.16
179 0.18