Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2EFR6

Protein Details
Accession A0A1Y2EFR6    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
76-102SSPDAFPKPPRGAKKKKAQLHTLAPRQHydrophilic
479-504GTGLEGRKDRKTRWRKVQDDLENNEDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
83-92KPPRGAKKKK
485-490RKDRKT
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 11, cyto 9.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039128  TRIP4-like  
IPR009349  Znf_C2HC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF06221  zf-C2HC5  
Amino Acid Sequences MSISQLSRLLPLPEDELKQVLDYAATLSKTEAVDHFGNLLGDSPGAVDFISSFNSRRQDPKSASSQATASTARQNSSPDAFPKPPRGAKKKKAQLHTLAPRQITNLGPAPGTAYNKKDSNDEFLARRPSPASTSSGSVSPAKAPPKSATPPPKVTRTAAGHLISDLPKPKTKSNPASQSSNPGPKTKINISGGTAMHGASTALSDLDAAIRALEMTTNPSKTNDDETRRCNCVAARHPLLAAAPNCLSCGKVICVKEGLGPCTFCGTPVLSTSEVQSMIQELKAERGREKMAADRQANKRPDVSRTPAPFTKPRENTDEPNSAEAKALEHRDRLLAFQSQNARRTTVRDEAADFDVAGAMAGTGGSMWSTPEERARELKRQQKIMREMEWNAKPEYEKMQQVVSIDLVGGKVVRKMAARQRPQSPDEQLDTAAPVLAETRGNRGSAGGRNVGGGSGGAFSQNPLLGGLIKPVFETKGKGTGLEGRKDRKTRWRKVQDDLENNEDVILDGGAYGRRGVEDQTVVANADEPGCG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.27
3 0.26
4 0.25
5 0.23
6 0.22
7 0.17
8 0.13
9 0.11
10 0.12
11 0.13
12 0.13
13 0.13
14 0.13
15 0.17
16 0.17
17 0.19
18 0.17
19 0.19
20 0.2
21 0.2
22 0.2
23 0.17
24 0.17
25 0.15
26 0.16
27 0.1
28 0.09
29 0.08
30 0.08
31 0.07
32 0.07
33 0.07
34 0.05
35 0.05
36 0.07
37 0.1
38 0.11
39 0.13
40 0.18
41 0.22
42 0.25
43 0.32
44 0.37
45 0.43
46 0.47
47 0.52
48 0.55
49 0.58
50 0.57
51 0.52
52 0.48
53 0.4
54 0.38
55 0.33
56 0.27
57 0.28
58 0.28
59 0.27
60 0.28
61 0.29
62 0.29
63 0.31
64 0.33
65 0.29
66 0.33
67 0.38
68 0.42
69 0.47
70 0.51
71 0.55
72 0.61
73 0.68
74 0.72
75 0.76
76 0.82
77 0.84
78 0.84
79 0.84
80 0.83
81 0.8
82 0.8
83 0.81
84 0.78
85 0.74
86 0.67
87 0.59
88 0.52
89 0.47
90 0.37
91 0.31
92 0.27
93 0.22
94 0.21
95 0.2
96 0.22
97 0.22
98 0.25
99 0.25
100 0.24
101 0.28
102 0.31
103 0.32
104 0.34
105 0.33
106 0.36
107 0.36
108 0.37
109 0.34
110 0.37
111 0.43
112 0.38
113 0.38
114 0.32
115 0.29
116 0.28
117 0.28
118 0.27
119 0.21
120 0.23
121 0.23
122 0.23
123 0.23
124 0.21
125 0.2
126 0.19
127 0.22
128 0.24
129 0.24
130 0.26
131 0.26
132 0.31
133 0.35
134 0.41
135 0.46
136 0.49
137 0.57
138 0.59
139 0.63
140 0.59
141 0.57
142 0.55
143 0.5
144 0.46
145 0.43
146 0.39
147 0.33
148 0.3
149 0.31
150 0.24
151 0.22
152 0.23
153 0.21
154 0.24
155 0.27
156 0.32
157 0.38
158 0.47
159 0.53
160 0.57
161 0.64
162 0.64
163 0.67
164 0.62
165 0.61
166 0.57
167 0.56
168 0.49
169 0.42
170 0.4
171 0.37
172 0.42
173 0.38
174 0.4
175 0.36
176 0.35
177 0.34
178 0.37
179 0.34
180 0.29
181 0.26
182 0.18
183 0.14
184 0.13
185 0.1
186 0.05
187 0.05
188 0.04
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.03
197 0.03
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.08
203 0.11
204 0.12
205 0.13
206 0.14
207 0.16
208 0.17
209 0.24
210 0.27
211 0.32
212 0.36
213 0.4
214 0.44
215 0.45
216 0.44
217 0.38
218 0.33
219 0.33
220 0.35
221 0.37
222 0.34
223 0.32
224 0.32
225 0.31
226 0.29
227 0.26
228 0.2
229 0.14
230 0.12
231 0.12
232 0.12
233 0.12
234 0.12
235 0.08
236 0.09
237 0.08
238 0.13
239 0.13
240 0.14
241 0.14
242 0.15
243 0.18
244 0.18
245 0.19
246 0.15
247 0.15
248 0.14
249 0.15
250 0.15
251 0.11
252 0.11
253 0.1
254 0.09
255 0.1
256 0.12
257 0.11
258 0.11
259 0.12
260 0.12
261 0.12
262 0.11
263 0.1
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.07
269 0.12
270 0.15
271 0.16
272 0.16
273 0.18
274 0.19
275 0.2
276 0.21
277 0.22
278 0.25
279 0.31
280 0.33
281 0.38
282 0.43
283 0.5
284 0.51
285 0.46
286 0.46
287 0.4
288 0.43
289 0.41
290 0.4
291 0.4
292 0.41
293 0.45
294 0.43
295 0.45
296 0.46
297 0.47
298 0.52
299 0.48
300 0.48
301 0.51
302 0.52
303 0.52
304 0.53
305 0.52
306 0.43
307 0.42
308 0.39
309 0.31
310 0.28
311 0.23
312 0.18
313 0.16
314 0.19
315 0.18
316 0.18
317 0.18
318 0.19
319 0.2
320 0.19
321 0.18
322 0.18
323 0.17
324 0.21
325 0.28
326 0.31
327 0.36
328 0.36
329 0.36
330 0.32
331 0.35
332 0.36
333 0.34
334 0.31
335 0.28
336 0.28
337 0.28
338 0.3
339 0.26
340 0.2
341 0.14
342 0.12
343 0.1
344 0.08
345 0.05
346 0.03
347 0.02
348 0.02
349 0.02
350 0.02
351 0.02
352 0.02
353 0.02
354 0.03
355 0.04
356 0.06
357 0.07
358 0.13
359 0.15
360 0.18
361 0.25
362 0.29
363 0.37
364 0.44
365 0.52
366 0.53
367 0.61
368 0.63
369 0.65
370 0.69
371 0.66
372 0.63
373 0.6
374 0.56
375 0.56
376 0.55
377 0.49
378 0.41
379 0.36
380 0.32
381 0.29
382 0.33
383 0.29
384 0.28
385 0.26
386 0.26
387 0.26
388 0.26
389 0.25
390 0.18
391 0.13
392 0.1
393 0.09
394 0.08
395 0.07
396 0.07
397 0.06
398 0.08
399 0.08
400 0.11
401 0.12
402 0.19
403 0.29
404 0.38
405 0.46
406 0.51
407 0.59
408 0.63
409 0.65
410 0.65
411 0.61
412 0.56
413 0.52
414 0.46
415 0.38
416 0.32
417 0.3
418 0.23
419 0.18
420 0.12
421 0.08
422 0.08
423 0.08
424 0.1
425 0.1
426 0.16
427 0.17
428 0.17
429 0.17
430 0.18
431 0.22
432 0.25
433 0.28
434 0.25
435 0.24
436 0.24
437 0.24
438 0.22
439 0.18
440 0.12
441 0.08
442 0.06
443 0.06
444 0.06
445 0.06
446 0.07
447 0.08
448 0.09
449 0.08
450 0.08
451 0.09
452 0.09
453 0.1
454 0.14
455 0.14
456 0.13
457 0.14
458 0.15
459 0.17
460 0.17
461 0.21
462 0.19
463 0.26
464 0.26
465 0.26
466 0.27
467 0.34
468 0.39
469 0.44
470 0.47
471 0.47
472 0.55
473 0.61
474 0.65
475 0.67
476 0.71
477 0.74
478 0.78
479 0.82
480 0.79
481 0.83
482 0.87
483 0.86
484 0.85
485 0.8
486 0.74
487 0.64
488 0.57
489 0.48
490 0.37
491 0.26
492 0.18
493 0.11
494 0.06
495 0.05
496 0.07
497 0.08
498 0.08
499 0.08
500 0.08
501 0.09
502 0.1
503 0.12
504 0.16
505 0.17
506 0.17
507 0.19
508 0.2
509 0.2
510 0.19
511 0.18
512 0.14