Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H0EXE1

Protein Details
Accession H0EXE1    Localization Confidence High Confidence Score 19.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
239-262CDIFQRYTRRIHKKNTPKDPNFLEHydrophilic
899-924KTPEPEPEPKAKPKRRTRKEMDSAAABasic
981-1008SDRWNDKWNGRKDFKKFRRQGAAPKRDHBasic
1065-1088DALESNHRRRPRPKLISGNQSEDDHydrophilic
1139-1163KRSAEKEAAKPPPKRVKQTTLDVGGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
867-917RLKKRRLEEAAERRSRGESTQPSRPAPEPVKEKTPEPEPEPKAKPKRRTRK
990-1008GRKDFKKFRRQGAAPKRDH
1135-1155AKGTKRSAEKEAAKPPPKRVK
Subcellular Location(s) cyto 13, cyto_nucl 11.5, nucl 8, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025110  AMP-bd_C  
IPR045851  AMP-bd_C_sf  
IPR000873  AMP-dep_Synth/Lig_com  
IPR008949  Isoprenoid_synthase_dom_sf  
IPR032429  Nibrin_BRCT2  
IPR043014  Nibrin_BRCT2_sf  
IPR002060  Squ/phyt_synthse  
IPR006449  Squal_synth-like  
IPR019845  Squalene/phytoene_synthase_CS  
IPR044844  Trans_IPPS_euk-type  
Gene Ontology GO:0004310  F:farnesyl-diphosphate farnesyltransferase activity  
GO:0051996  F:squalene synthase activity  
GO:0016126  P:sterol biosynthetic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00501  AMP-binding  
PF13193  AMP-binding_C  
PF16508  NIBRIN_BRCT_II  
PF00494  SQS_PSY  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01044  SQUALEN_PHYTOEN_SYN_1  
PS01045  SQUALEN_PHYTOEN_SYN_2  
Amino Acid Sequences METLARSQNGPDEKDRELLVHFDCVLKEFKLLKPQYQKVISEYTKKMGNGMADYANNAEHNIHGVQSTKDYELYCHYVAGLVGAGLTRLFVDAELANPALLKRPELSESMGQFLQKTNIIRDLREDFDDKRRFYPKEIWSKHVDNFDDLFVPANIDKALATTSEMVLNALDNVPQCLFYMAGIKDQSVFNFVAIPQVMAIATLEAVFRNPKVTTGVVKITKGDACKLMMESSQNLRTVCDIFQRYTRRIHKKNTPKDPNFLEISIACGQSGISPSNLRLNISGSAALPTPTKKAWTDLSNGNVILERYGMTEVGMALSCGLSNSDRVDGSVGWPLPTVEVRLVDIETGEIIQHGEETDSSGRERDGEIQLRGPTIFKEYWRNPEATAKEHVGGEDGKGRWFKTGDVAVRRAVPTAGQNKYQADWASGPLYFIRGRLSSDIIKSGGEKVSALEVERELLSLPQIEEAAVVAVPSGKWGQKVGAVVMLKKGMEMSPRGNGRVWGPLDMRNAMKSRLAGYKIPQVMRVVEEIERNAMGKSKQLWLRPGKKFLFGRTSGALIKATTPNENGIVPIEDDFKNFPDPLHFLPPRGAELTDRDATAYSPDDRRRDMFDGYTFIFYDETQYENLSTTIFAGKGKALHQRVVPEETSVLDFVRYVKNVAGEKGLGEFEDGSEGKGVVVVKYEPQKGVHIAWHNQFAVDVALSLDQRLVGQGEFLDVILGCDPSVLRRALEESPPSTMASHAPPAAQPVQPSQATPPEAPAESISQPARKGRGRRAAVPVFKGFEDDEWATPAVKLNSIPESNSMDIDHAPAPESQSLFVSQQEPSIDVDRDVSEPPVAQPRMSRKRAAPLIDDQELINTLAPNAARLKKRRLEEAAERRSRGESTQPSRPAPEPVKEKTPEPEPEPKAKPKRRTRKEMDSAAALIDARNAEDADEAELHEPDVIDYSSIDVDAVRNAIEVFEIAVTRKPSTRRAAQADESDRWNDKWNGRKDFKKFRRQGAAPKRDHGRVIVPLEEAKKKDYGLGDEYWGEDPITNESQRASKKTRKDKAVVEEVQQNDSSDSDALESNHRRRPRPKLISGNQSEDDAIVIPSSDVEIEQDPRLTFARKDTTTQGTTQSSSLNDKTAATRNIPAKGTKRSAEKEAAKPPPKRVKQTTLDVGGRARGRRTVEDSEDSDDMGFGFRRRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.4
3 0.34
4 0.3
5 0.3
6 0.25
7 0.24
8 0.23
9 0.22
10 0.22
11 0.22
12 0.24
13 0.2
14 0.24
15 0.24
16 0.28
17 0.36
18 0.4
19 0.46
20 0.54
21 0.59
22 0.63
23 0.65
24 0.63
25 0.57
26 0.63
27 0.59
28 0.58
29 0.55
30 0.5
31 0.49
32 0.47
33 0.45
34 0.38
35 0.36
36 0.3
37 0.3
38 0.29
39 0.24
40 0.25
41 0.24
42 0.22
43 0.19
44 0.17
45 0.14
46 0.11
47 0.14
48 0.13
49 0.12
50 0.12
51 0.14
52 0.15
53 0.19
54 0.21
55 0.19
56 0.22
57 0.22
58 0.23
59 0.26
60 0.31
61 0.27
62 0.24
63 0.23
64 0.21
65 0.2
66 0.19
67 0.13
68 0.07
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.05
73 0.05
74 0.04
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.07
79 0.07
80 0.09
81 0.11
82 0.11
83 0.1
84 0.11
85 0.11
86 0.16
87 0.16
88 0.17
89 0.17
90 0.2
91 0.23
92 0.24
93 0.29
94 0.28
95 0.29
96 0.32
97 0.31
98 0.28
99 0.26
100 0.26
101 0.25
102 0.22
103 0.23
104 0.22
105 0.3
106 0.31
107 0.31
108 0.35
109 0.36
110 0.35
111 0.37
112 0.37
113 0.32
114 0.41
115 0.48
116 0.45
117 0.47
118 0.52
119 0.5
120 0.53
121 0.58
122 0.58
123 0.62
124 0.64
125 0.62
126 0.61
127 0.64
128 0.63
129 0.61
130 0.53
131 0.46
132 0.42
133 0.39
134 0.33
135 0.28
136 0.25
137 0.17
138 0.18
139 0.14
140 0.13
141 0.11
142 0.1
143 0.1
144 0.09
145 0.09
146 0.07
147 0.09
148 0.09
149 0.1
150 0.11
151 0.12
152 0.11
153 0.1
154 0.1
155 0.1
156 0.09
157 0.1
158 0.08
159 0.1
160 0.1
161 0.11
162 0.11
163 0.1
164 0.1
165 0.09
166 0.15
167 0.14
168 0.18
169 0.18
170 0.18
171 0.19
172 0.2
173 0.2
174 0.17
175 0.17
176 0.12
177 0.14
178 0.13
179 0.16
180 0.15
181 0.14
182 0.11
183 0.11
184 0.11
185 0.09
186 0.09
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.06
193 0.08
194 0.08
195 0.11
196 0.11
197 0.13
198 0.16
199 0.18
200 0.21
201 0.23
202 0.31
203 0.31
204 0.31
205 0.31
206 0.31
207 0.32
208 0.3
209 0.28
210 0.23
211 0.21
212 0.22
213 0.22
214 0.2
215 0.19
216 0.2
217 0.21
218 0.24
219 0.26
220 0.28
221 0.26
222 0.25
223 0.26
224 0.25
225 0.23
226 0.25
227 0.24
228 0.24
229 0.31
230 0.37
231 0.38
232 0.45
233 0.54
234 0.57
235 0.62
236 0.69
237 0.72
238 0.77
239 0.85
240 0.87
241 0.88
242 0.81
243 0.81
244 0.77
245 0.71
246 0.63
247 0.53
248 0.44
249 0.32
250 0.33
251 0.27
252 0.23
253 0.17
254 0.14
255 0.14
256 0.13
257 0.15
258 0.11
259 0.1
260 0.11
261 0.13
262 0.2
263 0.2
264 0.2
265 0.18
266 0.2
267 0.19
268 0.2
269 0.19
270 0.13
271 0.13
272 0.13
273 0.13
274 0.12
275 0.12
276 0.14
277 0.14
278 0.17
279 0.16
280 0.19
281 0.24
282 0.25
283 0.29
284 0.31
285 0.33
286 0.32
287 0.31
288 0.28
289 0.24
290 0.21
291 0.16
292 0.12
293 0.09
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.04
307 0.06
308 0.05
309 0.06
310 0.08
311 0.1
312 0.1
313 0.1
314 0.12
315 0.11
316 0.12
317 0.16
318 0.15
319 0.13
320 0.14
321 0.13
322 0.13
323 0.13
324 0.13
325 0.09
326 0.09
327 0.1
328 0.11
329 0.11
330 0.09
331 0.09
332 0.08
333 0.06
334 0.06
335 0.05
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.05
342 0.04
343 0.07
344 0.08
345 0.09
346 0.1
347 0.1
348 0.1
349 0.11
350 0.12
351 0.14
352 0.19
353 0.22
354 0.23
355 0.26
356 0.26
357 0.26
358 0.26
359 0.21
360 0.16
361 0.16
362 0.17
363 0.16
364 0.24
365 0.27
366 0.35
367 0.37
368 0.37
369 0.34
370 0.4
371 0.4
372 0.34
373 0.34
374 0.28
375 0.27
376 0.26
377 0.24
378 0.19
379 0.17
380 0.14
381 0.17
382 0.15
383 0.17
384 0.18
385 0.18
386 0.19
387 0.19
388 0.19
389 0.18
390 0.24
391 0.26
392 0.3
393 0.32
394 0.3
395 0.32
396 0.32
397 0.27
398 0.21
399 0.17
400 0.18
401 0.24
402 0.25
403 0.25
404 0.27
405 0.27
406 0.28
407 0.3
408 0.24
409 0.19
410 0.17
411 0.16
412 0.16
413 0.14
414 0.14
415 0.11
416 0.13
417 0.11
418 0.11
419 0.12
420 0.11
421 0.12
422 0.13
423 0.17
424 0.16
425 0.17
426 0.18
427 0.16
428 0.16
429 0.15
430 0.16
431 0.14
432 0.12
433 0.11
434 0.1
435 0.11
436 0.11
437 0.11
438 0.09
439 0.08
440 0.09
441 0.09
442 0.08
443 0.07
444 0.06
445 0.06
446 0.06
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.06
451 0.05
452 0.05
453 0.05
454 0.04
455 0.04
456 0.03
457 0.03
458 0.03
459 0.04
460 0.06
461 0.07
462 0.07
463 0.08
464 0.09
465 0.11
466 0.12
467 0.11
468 0.14
469 0.14
470 0.14
471 0.14
472 0.15
473 0.12
474 0.11
475 0.12
476 0.08
477 0.1
478 0.12
479 0.13
480 0.17
481 0.19
482 0.2
483 0.2
484 0.2
485 0.19
486 0.23
487 0.22
488 0.19
489 0.2
490 0.22
491 0.24
492 0.25
493 0.24
494 0.2
495 0.21
496 0.19
497 0.19
498 0.15
499 0.16
500 0.19
501 0.21
502 0.19
503 0.21
504 0.27
505 0.29
506 0.29
507 0.28
508 0.25
509 0.23
510 0.22
511 0.21
512 0.15
513 0.12
514 0.13
515 0.11
516 0.11
517 0.1
518 0.1
519 0.09
520 0.1
521 0.09
522 0.1
523 0.12
524 0.17
525 0.21
526 0.23
527 0.31
528 0.37
529 0.47
530 0.49
531 0.55
532 0.5
533 0.53
534 0.53
535 0.49
536 0.47
537 0.39
538 0.37
539 0.3
540 0.31
541 0.24
542 0.23
543 0.19
544 0.13
545 0.13
546 0.14
547 0.14
548 0.13
549 0.13
550 0.13
551 0.13
552 0.13
553 0.11
554 0.09
555 0.08
556 0.07
557 0.08
558 0.1
559 0.09
560 0.1
561 0.1
562 0.11
563 0.12
564 0.11
565 0.11
566 0.1
567 0.12
568 0.14
569 0.22
570 0.21
571 0.2
572 0.22
573 0.23
574 0.22
575 0.2
576 0.19
577 0.11
578 0.14
579 0.17
580 0.16
581 0.15
582 0.14
583 0.13
584 0.13
585 0.13
586 0.12
587 0.09
588 0.14
589 0.18
590 0.2
591 0.21
592 0.23
593 0.26
594 0.27
595 0.26
596 0.23
597 0.2
598 0.2
599 0.2
600 0.19
601 0.15
602 0.13
603 0.12
604 0.1
605 0.11
606 0.09
607 0.09
608 0.08
609 0.09
610 0.09
611 0.09
612 0.09
613 0.07
614 0.06
615 0.06
616 0.06
617 0.07
618 0.06
619 0.06
620 0.07
621 0.08
622 0.11
623 0.18
624 0.18
625 0.2
626 0.22
627 0.24
628 0.26
629 0.27
630 0.25
631 0.18
632 0.17
633 0.15
634 0.14
635 0.12
636 0.09
637 0.06
638 0.06
639 0.07
640 0.09
641 0.09
642 0.09
643 0.1
644 0.14
645 0.14
646 0.15
647 0.14
648 0.12
649 0.12
650 0.12
651 0.11
652 0.07
653 0.07
654 0.06
655 0.05
656 0.08
657 0.08
658 0.07
659 0.07
660 0.07
661 0.06
662 0.08
663 0.08
664 0.06
665 0.07
666 0.07
667 0.1
668 0.14
669 0.16
670 0.15
671 0.16
672 0.18
673 0.18
674 0.19
675 0.21
676 0.21
677 0.24
678 0.25
679 0.27
680 0.25
681 0.23
682 0.22
683 0.18
684 0.14
685 0.1
686 0.08
687 0.04
688 0.05
689 0.05
690 0.06
691 0.05
692 0.05
693 0.05
694 0.05
695 0.06
696 0.04
697 0.05
698 0.04
699 0.05
700 0.05
701 0.05
702 0.05
703 0.04
704 0.04
705 0.05
706 0.05
707 0.04
708 0.04
709 0.04
710 0.05
711 0.08
712 0.08
713 0.08
714 0.08
715 0.12
716 0.14
717 0.17
718 0.19
719 0.17
720 0.19
721 0.2
722 0.2
723 0.17
724 0.15
725 0.14
726 0.13
727 0.14
728 0.12
729 0.12
730 0.11
731 0.15
732 0.17
733 0.16
734 0.15
735 0.15
736 0.19
737 0.19
738 0.19
739 0.18
740 0.2
741 0.22
742 0.21
743 0.21
744 0.18
745 0.18
746 0.18
747 0.17
748 0.16
749 0.14
750 0.17
751 0.17
752 0.17
753 0.18
754 0.2
755 0.25
756 0.28
757 0.33
758 0.39
759 0.47
760 0.49
761 0.53
762 0.59
763 0.61
764 0.6
765 0.58
766 0.51
767 0.43
768 0.39
769 0.34
770 0.26
771 0.18
772 0.19
773 0.16
774 0.14
775 0.14
776 0.15
777 0.14
778 0.14
779 0.16
780 0.12
781 0.12
782 0.12
783 0.12
784 0.16
785 0.16
786 0.17
787 0.17
788 0.2
789 0.2
790 0.2
791 0.18
792 0.14
793 0.14
794 0.16
795 0.14
796 0.1
797 0.11
798 0.11
799 0.12
800 0.13
801 0.14
802 0.12
803 0.12
804 0.13
805 0.13
806 0.14
807 0.13
808 0.12
809 0.13
810 0.13
811 0.13
812 0.14
813 0.16
814 0.15
815 0.14
816 0.15
817 0.14
818 0.15
819 0.15
820 0.13
821 0.11
822 0.11
823 0.12
824 0.19
825 0.19
826 0.18
827 0.22
828 0.32
829 0.41
830 0.45
831 0.48
832 0.42
833 0.51
834 0.56
835 0.54
836 0.48
837 0.45
838 0.47
839 0.44
840 0.41
841 0.32
842 0.27
843 0.24
844 0.21
845 0.14
846 0.09
847 0.07
848 0.09
849 0.09
850 0.1
851 0.14
852 0.2
853 0.26
854 0.31
855 0.4
856 0.44
857 0.47
858 0.53
859 0.54
860 0.55
861 0.59
862 0.65
863 0.67
864 0.66
865 0.64
866 0.57
867 0.54
868 0.48
869 0.39
870 0.37
871 0.36
872 0.36
873 0.44
874 0.48
875 0.47
876 0.5
877 0.5
878 0.49
879 0.44
880 0.46
881 0.44
882 0.43
883 0.49
884 0.47
885 0.48
886 0.44
887 0.46
888 0.44
889 0.43
890 0.49
891 0.46
892 0.53
893 0.57
894 0.63
895 0.67
896 0.71
897 0.76
898 0.77
899 0.84
900 0.85
901 0.89
902 0.88
903 0.89
904 0.89
905 0.86
906 0.78
907 0.7
908 0.6
909 0.5
910 0.41
911 0.3
912 0.2
913 0.14
914 0.11
915 0.08
916 0.08
917 0.08
918 0.07
919 0.08
920 0.08
921 0.09
922 0.09
923 0.09
924 0.1
925 0.1
926 0.1
927 0.09
928 0.09
929 0.07
930 0.09
931 0.08
932 0.07
933 0.07
934 0.08
935 0.07
936 0.07
937 0.07
938 0.06
939 0.06
940 0.07
941 0.07
942 0.06
943 0.06
944 0.06
945 0.06
946 0.06
947 0.05
948 0.05
949 0.06
950 0.06
951 0.07
952 0.11
953 0.13
954 0.14
955 0.19
956 0.22
957 0.29
958 0.36
959 0.43
960 0.48
961 0.53
962 0.58
963 0.59
964 0.64
965 0.62
966 0.58
967 0.53
968 0.48
969 0.43
970 0.38
971 0.4
972 0.37
973 0.38
974 0.44
975 0.51
976 0.57
977 0.62
978 0.69
979 0.71
980 0.77
981 0.8
982 0.82
983 0.81
984 0.8
985 0.83
986 0.81
987 0.83
988 0.83
989 0.83
990 0.76
991 0.76
992 0.72
993 0.65
994 0.61
995 0.53
996 0.47
997 0.43
998 0.42
999 0.36
1000 0.32
1001 0.32
1002 0.36
1003 0.38
1004 0.34
1005 0.3
1006 0.28
1007 0.27
1008 0.29
1009 0.28
1010 0.28
1011 0.28
1012 0.28
1013 0.28
1014 0.26
1015 0.28
1016 0.25
1017 0.22
1018 0.18
1019 0.14
1020 0.13
1021 0.16
1022 0.2
1023 0.19
1024 0.18
1025 0.19
1026 0.25
1027 0.29
1028 0.36
1029 0.38
1030 0.42
1031 0.52
1032 0.63
1033 0.7
1034 0.73
1035 0.75
1036 0.77
1037 0.77
1038 0.8
1039 0.73
1040 0.66
1041 0.64
1042 0.57
1043 0.53
1044 0.45
1045 0.37
1046 0.27
1047 0.24
1048 0.21
1049 0.14
1050 0.12
1051 0.11
1052 0.12
1053 0.13
1054 0.2
1055 0.28
1056 0.33
1057 0.4
1058 0.47
1059 0.53
1060 0.6
1061 0.69
1062 0.72
1063 0.74
1064 0.78
1065 0.81
1066 0.84
1067 0.87
1068 0.85
1069 0.81
1070 0.7
1071 0.61
1072 0.51
1073 0.4
1074 0.32
1075 0.22
1076 0.16
1077 0.09
1078 0.08
1079 0.06
1080 0.06
1081 0.07
1082 0.06
1083 0.05
1084 0.07
1085 0.1
1086 0.13
1087 0.15
1088 0.18
1089 0.17
1090 0.19
1091 0.22
1092 0.23
1093 0.22
1094 0.27
1095 0.34
1096 0.33
1097 0.37
1098 0.41
1099 0.46
1100 0.46
1101 0.46
1102 0.45
1103 0.39
1104 0.39
1105 0.36
1106 0.33
1107 0.28
1108 0.31
1109 0.31
1110 0.27
1111 0.25
1112 0.25
1113 0.29
1114 0.34
1115 0.35
1116 0.32
1117 0.38
1118 0.4
1119 0.45
1120 0.46
1121 0.48
1122 0.47
1123 0.52
1124 0.56
1125 0.55
1126 0.59
1127 0.58
1128 0.62
1129 0.65
1130 0.66
1131 0.66
1132 0.69
1133 0.74
1134 0.74
1135 0.74
1136 0.78
1137 0.79
1138 0.8
1139 0.81
1140 0.8
1141 0.79
1142 0.78
1143 0.82
1144 0.81
1145 0.78
1146 0.72
1147 0.64
1148 0.57
1149 0.54
1150 0.51
1151 0.45
1152 0.39
1153 0.36
1154 0.38
1155 0.42
1156 0.47
1157 0.48
1158 0.49
1159 0.52
1160 0.52
1161 0.52
1162 0.47
1163 0.41
1164 0.34
1165 0.27
1166 0.2
1167 0.17
1168 0.16