Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2DHP2

Protein Details
Accession A0A1Y2DHP2    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
510-530ATTSARRPGRGSRRHQRFGGKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
515-530RRPGRGSRRHQRFGGK
Subcellular Location(s) extr 26
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000743  Glyco_hydro_28  
IPR012334  Pectin_lyas_fold  
IPR011050  Pectin_lyase_fold/virulence  
Gene Ontology GO:0016829  F:lyase activity  
GO:0004650  F:polygalacturonase activity  
GO:0005975  P:carbohydrate metabolic process  
GO:0071555  P:cell wall organization  
Pfam View protein in Pfam  
PF00295  Glyco_hydro_28  
Amino Acid Sequences MAAFITALLATASYILPAAAQLSGSVGPTSSTADKVAKICNIMDYGGVASATEDNGAAIQSAWDDCKTGGQVYIPEGDYGLSTWLTLKNGANNSFNLEGTLYRVGTDGGNMIMIRDTHDFEFYSATSKGGMQGYGYEFLKDDTYGPRLLRFYKCTDFSVHDIALVDSPAFHLSLDTCTNGELYNMIIRGANRGGLDGIDVWGTNIWIHDIEVTNKDECVTVKDPSANILVEQVHCNWSGGCAMGSLASGIDIHDIEYNNIYTHHANQMFMIKSNGGSGNVYNLAFNNFVGHSNAYTLDFDSAWSSMSTVDGDGIQYSNVSFRGWRGTCSDGTERGPVKVLCPAGMPCTDISIDDFHVWTESGDEVYHACYNAYGSGSCLEDGDATTTYTSTVTLTTETSYSYATMADELTTGLGLSAPIAVPTMPASFFPGLAPISAILNGASAAVASSVPAVTASSSSSALASPTSVTETAAAVTATEATEAEEVASSTNSPITSAPTVTSAAVATQVATTSARRPGRGSRRHQRFGGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.05
3 0.05
4 0.06
5 0.07
6 0.06
7 0.06
8 0.06
9 0.08
10 0.08
11 0.09
12 0.09
13 0.08
14 0.09
15 0.09
16 0.14
17 0.13
18 0.14
19 0.16
20 0.19
21 0.22
22 0.24
23 0.28
24 0.27
25 0.28
26 0.27
27 0.27
28 0.26
29 0.23
30 0.2
31 0.16
32 0.14
33 0.12
34 0.11
35 0.08
36 0.08
37 0.08
38 0.08
39 0.07
40 0.07
41 0.06
42 0.06
43 0.07
44 0.06
45 0.05
46 0.05
47 0.06
48 0.07
49 0.09
50 0.09
51 0.1
52 0.1
53 0.13
54 0.15
55 0.14
56 0.15
57 0.15
58 0.16
59 0.18
60 0.21
61 0.19
62 0.17
63 0.16
64 0.15
65 0.14
66 0.12
67 0.12
68 0.07
69 0.07
70 0.09
71 0.11
72 0.12
73 0.15
74 0.16
75 0.21
76 0.26
77 0.3
78 0.31
79 0.29
80 0.32
81 0.31
82 0.29
83 0.23
84 0.18
85 0.15
86 0.16
87 0.18
88 0.13
89 0.12
90 0.12
91 0.12
92 0.12
93 0.12
94 0.09
95 0.07
96 0.08
97 0.07
98 0.08
99 0.08
100 0.08
101 0.1
102 0.11
103 0.14
104 0.13
105 0.15
106 0.15
107 0.14
108 0.16
109 0.14
110 0.16
111 0.14
112 0.13
113 0.13
114 0.12
115 0.15
116 0.14
117 0.14
118 0.1
119 0.13
120 0.15
121 0.18
122 0.18
123 0.15
124 0.14
125 0.14
126 0.15
127 0.13
128 0.12
129 0.12
130 0.14
131 0.17
132 0.17
133 0.19
134 0.21
135 0.26
136 0.29
137 0.29
138 0.33
139 0.36
140 0.38
141 0.37
142 0.38
143 0.36
144 0.35
145 0.36
146 0.29
147 0.24
148 0.22
149 0.2
150 0.18
151 0.14
152 0.11
153 0.06
154 0.07
155 0.07
156 0.06
157 0.05
158 0.05
159 0.06
160 0.09
161 0.1
162 0.1
163 0.1
164 0.1
165 0.1
166 0.1
167 0.09
168 0.07
169 0.06
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.09
174 0.09
175 0.11
176 0.12
177 0.13
178 0.1
179 0.11
180 0.1
181 0.09
182 0.09
183 0.07
184 0.07
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.04
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.06
196 0.07
197 0.09
198 0.12
199 0.14
200 0.13
201 0.13
202 0.14
203 0.13
204 0.12
205 0.16
206 0.16
207 0.15
208 0.16
209 0.18
210 0.18
211 0.18
212 0.2
213 0.14
214 0.11
215 0.12
216 0.12
217 0.11
218 0.12
219 0.11
220 0.11
221 0.11
222 0.12
223 0.09
224 0.09
225 0.08
226 0.07
227 0.06
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.04
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.06
241 0.07
242 0.07
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.08
247 0.09
248 0.08
249 0.09
250 0.15
251 0.15
252 0.14
253 0.15
254 0.19
255 0.18
256 0.18
257 0.17
258 0.11
259 0.11
260 0.12
261 0.12
262 0.08
263 0.08
264 0.07
265 0.08
266 0.1
267 0.1
268 0.08
269 0.08
270 0.09
271 0.09
272 0.08
273 0.08
274 0.07
275 0.08
276 0.09
277 0.09
278 0.08
279 0.08
280 0.09
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.07
286 0.07
287 0.08
288 0.07
289 0.07
290 0.06
291 0.06
292 0.05
293 0.06
294 0.06
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.05
305 0.05
306 0.06
307 0.06
308 0.06
309 0.15
310 0.15
311 0.17
312 0.19
313 0.22
314 0.23
315 0.27
316 0.29
317 0.23
318 0.25
319 0.29
320 0.27
321 0.24
322 0.26
323 0.22
324 0.2
325 0.21
326 0.2
327 0.15
328 0.15
329 0.16
330 0.15
331 0.15
332 0.15
333 0.11
334 0.12
335 0.12
336 0.1
337 0.11
338 0.1
339 0.11
340 0.1
341 0.1
342 0.09
343 0.09
344 0.09
345 0.08
346 0.07
347 0.07
348 0.06
349 0.06
350 0.07
351 0.06
352 0.08
353 0.09
354 0.08
355 0.08
356 0.08
357 0.08
358 0.09
359 0.1
360 0.08
361 0.08
362 0.09
363 0.1
364 0.1
365 0.09
366 0.08
367 0.08
368 0.08
369 0.09
370 0.08
371 0.08
372 0.08
373 0.08
374 0.08
375 0.08
376 0.08
377 0.06
378 0.06
379 0.07
380 0.07
381 0.08
382 0.09
383 0.09
384 0.09
385 0.1
386 0.1
387 0.09
388 0.08
389 0.08
390 0.07
391 0.08
392 0.07
393 0.07
394 0.06
395 0.06
396 0.06
397 0.05
398 0.05
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.04
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.05
407 0.05
408 0.05
409 0.07
410 0.08
411 0.07
412 0.08
413 0.12
414 0.12
415 0.13
416 0.13
417 0.14
418 0.13
419 0.12
420 0.13
421 0.09
422 0.09
423 0.09
424 0.09
425 0.06
426 0.06
427 0.06
428 0.06
429 0.05
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.04
434 0.04
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.05
439 0.05
440 0.05
441 0.06
442 0.07
443 0.08
444 0.09
445 0.09
446 0.1
447 0.1
448 0.1
449 0.09
450 0.09
451 0.08
452 0.08
453 0.11
454 0.11
455 0.11
456 0.11
457 0.11
458 0.11
459 0.11
460 0.1
461 0.07
462 0.07
463 0.08
464 0.07
465 0.07
466 0.06
467 0.07
468 0.07
469 0.07
470 0.07
471 0.07
472 0.07
473 0.08
474 0.08
475 0.07
476 0.08
477 0.1
478 0.1
479 0.1
480 0.11
481 0.15
482 0.17
483 0.17
484 0.18
485 0.18
486 0.19
487 0.18
488 0.18
489 0.13
490 0.11
491 0.12
492 0.11
493 0.09
494 0.08
495 0.08
496 0.09
497 0.1
498 0.12
499 0.15
500 0.24
501 0.27
502 0.29
503 0.33
504 0.42
505 0.52
506 0.6
507 0.66
508 0.69
509 0.76
510 0.82